FuNGI

A0A397HT71

Protein Details

Accession

A0A397HT71

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
95-114	SPVGERRRSQRGKKDLHGSE	Basic
142-162	FGWSQSQKKRKQSYFGKKSDS	Hydrophilic
317-338	PDALRKFRAQPKQRIREQQRFC	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MVTPTSKPNSSFSKVYLTKSNYSGRSLHPNAKRSEKRDEGSKKEEDIKDVGGFEADWDERIVDNEDITAEPASSPISSFDDQENDVPPGFEDFDSPVGERRRSQRGKKDLHGSESPIFGRKRNADDMARRAQTDAEKEDYVFGWSQSQKKRKQSYFGKKSDSSLWKAQGSRTTPSRSKSPPSSSASESKADHSSQKTKPESKKKAADKAPSFMVPPDIDEILPPSSGTRTKPEFIVPPSLPNDTISSSSGVTSSAQISHFFDSDDDGSSGTSLSSVPENLLEEFSQMEDVLLSDMDDSGNAELEPSLCPWCKKAVDPDALRKFRAQPKQRIREQQRFCELHQKETAEKEWKERGYPDIDWDTFDERISGHFDDLDKILVPESTSYYRNVLDTMLKSGKAKNFRLTFAGDALETICCGYYGTRGANKMYSLLVTSSSSNVVVLLTKSLDRLQALTARFSRKLRRLAAEDHIVKKAGPVIYAQAVLVPELAVRLVKEDMGVDVDSARQILRESIEIGEKLNFAPNDVVPIPVEPENA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.49
3	0.52
4	0.5
5	0.49
6	0.52
7	0.58
8	0.5
9	0.5
10	0.5
11	0.45
12	0.5
13	0.51
14	0.55
15	0.55
16	0.59
17	0.61
18	0.68
19	0.72
20	0.67
21	0.72
22	0.71
23	0.67
24	0.7
25	0.74
26	0.71
27	0.7
28	0.7
29	0.64
30	0.65
31	0.63
32	0.56
33	0.5
34	0.45
35	0.39
36	0.35
37	0.3
38	0.21
39	0.18
40	0.15
41	0.16
42	0.13
43	0.11
44	0.11
45	0.12
46	0.11
47	0.14
48	0.17
49	0.13
50	0.13
51	0.12
52	0.13
53	0.12
54	0.14
55	0.12
56	0.08
57	0.08
58	0.08
59	0.09
60	0.08
61	0.08
62	0.09
63	0.14
64	0.15
65	0.17
66	0.19
67	0.2
68	0.22
69	0.23
70	0.24
71	0.2
72	0.19
73	0.18
74	0.16
75	0.16
76	0.16
77	0.14
78	0.13
79	0.13
80	0.15
81	0.16
82	0.16
83	0.2
84	0.23
85	0.26
86	0.29
87	0.33
88	0.42
89	0.5
90	0.59
91	0.63
92	0.68
93	0.74
94	0.77
95	0.82
96	0.75
97	0.73
98	0.67
99	0.62
100	0.53
101	0.49
102	0.42
103	0.39
104	0.35
105	0.31
106	0.35
107	0.34
108	0.38
109	0.39
110	0.44
111	0.45
112	0.5
113	0.55
114	0.56
115	0.53
116	0.48
117	0.43
118	0.4
119	0.37
120	0.35
121	0.31
122	0.27
123	0.26
124	0.25
125	0.26
126	0.23
127	0.22
128	0.17
129	0.14
130	0.16
131	0.19
132	0.26
133	0.34
134	0.43
135	0.48
136	0.58
137	0.68
138	0.66
139	0.73
140	0.77
141	0.79
142	0.81
143	0.8
144	0.78
145	0.69
146	0.67
147	0.67
148	0.61
149	0.55
150	0.5
151	0.47
152	0.44
153	0.44
154	0.43
155	0.41
156	0.38
157	0.38
158	0.37
159	0.4
160	0.4
161	0.42
162	0.47
163	0.44
164	0.48
165	0.51
166	0.52
167	0.52
168	0.54
169	0.55
170	0.51
171	0.52
172	0.48
173	0.43
174	0.38
175	0.33
176	0.31
177	0.28
178	0.28
179	0.28
180	0.34
181	0.34
182	0.42
183	0.46
184	0.51
185	0.6
186	0.67
187	0.7
188	0.71
189	0.76
190	0.75
191	0.78
192	0.77
193	0.77
194	0.69
195	0.63
196	0.57
197	0.48
198	0.41
199	0.32
200	0.28
201	0.18
202	0.16
203	0.14
204	0.12
205	0.11
206	0.1
207	0.12
208	0.1
209	0.09
210	0.08
211	0.07
212	0.09
213	0.11
214	0.13
215	0.16
216	0.19
217	0.2
218	0.21
219	0.23
220	0.25
221	0.25
222	0.31
223	0.25
224	0.26
225	0.27
226	0.27
227	0.24
228	0.22
229	0.21
230	0.15
231	0.16
232	0.13
233	0.12
234	0.11
235	0.11
236	0.1
237	0.09
238	0.08
239	0.08
240	0.07
241	0.08
242	0.08
243	0.09
244	0.11
245	0.11
246	0.11
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.1
252	0.08
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.05
258	0.05
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.06
267	0.07
268	0.07
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.05
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.04
285	0.03
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.05
292	0.06
293	0.08
294	0.09
295	0.1
296	0.11
297	0.16
298	0.16
299	0.18
300	0.25
301	0.29
302	0.37
303	0.4
304	0.49
305	0.54
306	0.54
307	0.53
308	0.47
309	0.47
310	0.47
311	0.54
312	0.53
313	0.54
314	0.63
315	0.72
316	0.77
317	0.81
318	0.81
319	0.81
320	0.79
321	0.76
322	0.75
323	0.68
324	0.62
325	0.62
326	0.54
327	0.49
328	0.47
329	0.41
330	0.34
331	0.34
332	0.38
333	0.36
334	0.36
335	0.36
336	0.38
337	0.37
338	0.37
339	0.35
340	0.34
341	0.31
342	0.3
343	0.3
344	0.29
345	0.28
346	0.27
347	0.28
348	0.26
349	0.22
350	0.21
351	0.16
352	0.11
353	0.12
354	0.15
355	0.13
356	0.11
357	0.12
358	0.13
359	0.14
360	0.14
361	0.14
362	0.1
363	0.1
364	0.1
365	0.09
366	0.08
367	0.08
368	0.11
369	0.13
370	0.14
371	0.15
372	0.17
373	0.17
374	0.17
375	0.17
376	0.15
377	0.16
378	0.16
379	0.21
380	0.21
381	0.21
382	0.22
383	0.27
384	0.32
385	0.36
386	0.38
387	0.41
388	0.42
389	0.43
390	0.45
391	0.42
392	0.38
393	0.31
394	0.28
395	0.19
396	0.16
397	0.15
398	0.12
399	0.09
400	0.07
401	0.06
402	0.05
403	0.06
404	0.06
405	0.08
406	0.11
407	0.15
408	0.18
409	0.21
410	0.22
411	0.24
412	0.24
413	0.23
414	0.2
415	0.17
416	0.14
417	0.13
418	0.13
419	0.12
420	0.13
421	0.13
422	0.13
423	0.12
424	0.11
425	0.1
426	0.09
427	0.09
428	0.09
429	0.09
430	0.09
431	0.1
432	0.11
433	0.13
434	0.15
435	0.14
436	0.15
437	0.16
438	0.21
439	0.21
440	0.26
441	0.3
442	0.33
443	0.37
444	0.41
445	0.48
446	0.5
447	0.57
448	0.58
449	0.6
450	0.6
451	0.61
452	0.63
453	0.63
454	0.61
455	0.56
456	0.52
457	0.45
458	0.4
459	0.35
460	0.34
461	0.25
462	0.2
463	0.17
464	0.19
465	0.2
466	0.21
467	0.19
468	0.16
469	0.15
470	0.14
471	0.13
472	0.09
473	0.07
474	0.07
475	0.08
476	0.06
477	0.06
478	0.09
479	0.09
480	0.09
481	0.1
482	0.1
483	0.11
484	0.13
485	0.13
486	0.1
487	0.1
488	0.11
489	0.11
490	0.11
491	0.1
492	0.08
493	0.09
494	0.11
495	0.13
496	0.14
497	0.15
498	0.17
499	0.22
500	0.21
501	0.22
502	0.21
503	0.2
504	0.19
505	0.24
506	0.22
507	0.19
508	0.22
509	0.21
510	0.26
511	0.25
512	0.25
513	0.19
514	0.21
515	0.22

A0A397HT71

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer