Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397GSV4

Protein Details
Accession A0A397GSV4    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-46ISAPTKQSYRSFKKKYAKLKVKFELGMHydrophilic
317-336GSSRPSKKKKDDTNSNAKRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
301-329KGKRKRDDDTGYRPKGGSSRPSKKKKDDT
333-335AKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026699  Exosome_RNA_bind1/RRP40/RRP4  
IPR032742  Iec3  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR022967  S1_dom  
Gene Ontology GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0031011  C:Ino80 complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF14612  Ino80_Iec3  
CDD cd22525  KH-I_Rrp4_eukar  
cd05789  S1_Rrp4  
Amino Acid Sequences MSQENEDSRSVAESLPDEAISAPTKQSYRSFKKKYAKLKVKFELGMKESESLIREELRIEDLSKRIQEQNDQLLEVLLEFNESLHIPANQRYDLSAPGDSSFLPTPERSPMSIDSAKARSILKDAEAQMAAGSMTLEAYRTLEDDIKRGNAFAPHMHYTTLKKVPHTGVPPVRHDSSTDISLEEKLGYLTPEHETEYYLSMDAKLGDEAAALELSRIPEKPSFSERERELALRNPVSVYNWLRRNQPHIFLQDNENASEKSGSRPTNVRASKRATQPRKEEEAYDEDGILMDTGPTPGSTKGKRKRDDDTGYRPKGGSSRPSKKKKDDTNSNAKRTSKRGHGTYSNPLSTSIIATVAGTVQKTNKLLSVQPLRARYIPEIGDLVVGRIVEVQSRRWKVDIAAPLLAQLPLSAINLPGGILRRRTSADELQIRAFFSEGDLVVAEVQSVHSDGSASLHTRSLKYGKLRNGVFLAVAGTGGSGASSSTVKGGHGAGAASAGAMGTSGTGGVVRARRQQWTVNTANGGGEVNIILGVNGYIWIAKHADGAAAASSTTENISITRMEEMVSSSIYSSQNDEIPPQTRREIARLAQCIRVLVQGGVRVDEETVMRAYDASLQVDLEIGDDEDEDERGREGREYLEGDKASGILALVVEQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.16
4 0.14
5 0.14
6 0.16
7 0.16
8 0.16
9 0.15
10 0.18
11 0.2
12 0.23
13 0.31
14 0.39
15 0.47
16 0.57
17 0.63
18 0.69
19 0.78
20 0.83
21 0.86
22 0.87
23 0.87
24 0.86
25 0.88
26 0.86
27 0.83
28 0.78
29 0.72
30 0.7
31 0.61
32 0.56
33 0.47
34 0.41
35 0.34
36 0.32
37 0.29
38 0.22
39 0.21
40 0.19
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.19
45 0.19
46 0.19
47 0.21
48 0.23
49 0.28
50 0.29
51 0.31
52 0.34
53 0.36
54 0.41
55 0.43
56 0.49
57 0.45
58 0.43
59 0.39
60 0.34
61 0.3
62 0.24
63 0.17
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.09
72 0.12
73 0.13
74 0.19
75 0.23
76 0.22
77 0.23
78 0.23
79 0.23
80 0.24
81 0.24
82 0.21
83 0.17
84 0.17
85 0.18
86 0.16
87 0.18
88 0.17
89 0.15
90 0.16
91 0.16
92 0.17
93 0.23
94 0.25
95 0.22
96 0.25
97 0.26
98 0.31
99 0.33
100 0.32
101 0.32
102 0.32
103 0.32
104 0.3
105 0.29
106 0.22
107 0.23
108 0.23
109 0.2
110 0.24
111 0.24
112 0.26
113 0.25
114 0.23
115 0.2
116 0.18
117 0.16
118 0.09
119 0.08
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.09
129 0.13
130 0.14
131 0.16
132 0.19
133 0.21
134 0.21
135 0.21
136 0.21
137 0.19
138 0.2
139 0.21
140 0.24
141 0.24
142 0.25
143 0.25
144 0.26
145 0.27
146 0.32
147 0.36
148 0.32
149 0.31
150 0.35
151 0.37
152 0.41
153 0.42
154 0.43
155 0.44
156 0.47
157 0.5
158 0.5
159 0.49
160 0.43
161 0.4
162 0.36
163 0.31
164 0.28
165 0.24
166 0.19
167 0.18
168 0.18
169 0.17
170 0.13
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.09
177 0.1
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.15
184 0.13
185 0.12
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.1
205 0.13
206 0.15
207 0.19
208 0.23
209 0.28
210 0.29
211 0.35
212 0.34
213 0.35
214 0.35
215 0.33
216 0.3
217 0.3
218 0.33
219 0.27
220 0.26
221 0.24
222 0.23
223 0.23
224 0.26
225 0.24
226 0.25
227 0.31
228 0.32
229 0.37
230 0.39
231 0.44
232 0.42
233 0.42
234 0.4
235 0.39
236 0.39
237 0.35
238 0.37
239 0.35
240 0.32
241 0.28
242 0.25
243 0.21
244 0.19
245 0.19
246 0.15
247 0.14
248 0.19
249 0.19
250 0.19
251 0.23
252 0.25
253 0.34
254 0.38
255 0.39
256 0.38
257 0.43
258 0.48
259 0.53
260 0.61
261 0.59
262 0.62
263 0.66
264 0.68
265 0.68
266 0.62
267 0.54
268 0.47
269 0.44
270 0.39
271 0.32
272 0.25
273 0.18
274 0.17
275 0.15
276 0.12
277 0.07
278 0.03
279 0.03
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.07
285 0.12
286 0.17
287 0.27
288 0.36
289 0.45
290 0.51
291 0.53
292 0.57
293 0.62
294 0.65
295 0.63
296 0.65
297 0.66
298 0.62
299 0.59
300 0.53
301 0.45
302 0.4
303 0.35
304 0.33
305 0.33
306 0.42
307 0.51
308 0.61
309 0.67
310 0.71
311 0.78
312 0.79
313 0.79
314 0.8
315 0.78
316 0.79
317 0.81
318 0.78
319 0.73
320 0.67
321 0.6
322 0.55
323 0.52
324 0.49
325 0.46
326 0.44
327 0.44
328 0.46
329 0.47
330 0.5
331 0.49
332 0.41
333 0.36
334 0.33
335 0.28
336 0.23
337 0.19
338 0.11
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.09
349 0.1
350 0.1
351 0.11
352 0.12
353 0.13
354 0.2
355 0.26
356 0.27
357 0.31
358 0.33
359 0.33
360 0.33
361 0.34
362 0.28
363 0.25
364 0.21
365 0.18
366 0.16
367 0.14
368 0.14
369 0.12
370 0.11
371 0.08
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.08
378 0.13
379 0.2
380 0.23
381 0.24
382 0.24
383 0.25
384 0.24
385 0.29
386 0.3
387 0.25
388 0.24
389 0.23
390 0.23
391 0.23
392 0.21
393 0.15
394 0.09
395 0.06
396 0.05
397 0.06
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.07
404 0.09
405 0.1
406 0.13
407 0.13
408 0.15
409 0.17
410 0.2
411 0.24
412 0.25
413 0.32
414 0.35
415 0.36
416 0.36
417 0.35
418 0.32
419 0.27
420 0.23
421 0.15
422 0.1
423 0.1
424 0.07
425 0.07
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.06
440 0.08
441 0.09
442 0.09
443 0.13
444 0.14
445 0.15
446 0.18
447 0.2
448 0.23
449 0.29
450 0.35
451 0.39
452 0.45
453 0.45
454 0.45
455 0.43
456 0.39
457 0.32
458 0.25
459 0.18
460 0.11
461 0.1
462 0.06
463 0.05
464 0.04
465 0.04
466 0.03
467 0.02
468 0.02
469 0.04
470 0.04
471 0.05
472 0.06
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.06
484 0.05
485 0.04
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.02
490 0.02
491 0.02
492 0.03
493 0.03
494 0.03
495 0.07
496 0.11
497 0.14
498 0.22
499 0.25
500 0.28
501 0.32
502 0.38
503 0.41
504 0.45
505 0.45
506 0.41
507 0.4
508 0.36
509 0.33
510 0.27
511 0.21
512 0.13
513 0.1
514 0.07
515 0.06
516 0.05
517 0.05
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.03
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.06
527 0.07
528 0.08
529 0.09
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.1
534 0.09
535 0.08
536 0.07
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.07
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.08
545 0.08
546 0.09
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.1
551 0.12
552 0.12
553 0.12
554 0.11
555 0.1
556 0.14
557 0.15
558 0.16
559 0.17
560 0.17
561 0.2
562 0.21
563 0.23
564 0.23
565 0.27
566 0.29
567 0.3
568 0.31
569 0.33
570 0.35
571 0.37
572 0.39
573 0.4
574 0.46
575 0.5
576 0.5
577 0.49
578 0.47
579 0.43
580 0.38
581 0.34
582 0.27
583 0.21
584 0.2
585 0.2
586 0.2
587 0.2
588 0.19
589 0.17
590 0.16
591 0.16
592 0.14
593 0.12
594 0.12
595 0.11
596 0.1
597 0.1
598 0.1
599 0.15
600 0.16
601 0.16
602 0.16
603 0.15
604 0.15
605 0.16
606 0.15
607 0.1
608 0.08
609 0.07
610 0.06
611 0.06
612 0.08
613 0.08
614 0.09
615 0.09
616 0.09
617 0.1
618 0.11
619 0.12
620 0.13
621 0.14
622 0.16
623 0.2
624 0.24
625 0.25
626 0.31
627 0.3
628 0.28
629 0.27
630 0.25
631 0.2
632 0.16
633 0.14
634 0.07
635 0.07