Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HQP5

Protein Details
Accession A0A397HQP5    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-57TLDAPVSPPRRRSRNRKVPDDQPLPSHydrophilic
281-308NLDFAKPSTRIPRKRRRRAIHSSSTRPDHydrophilic
389-414AKANAGPGKKRWARKRNVRTGQELGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
289-299TRIPRKRRRRA
394-404GPGKKRWARKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MKRSLNGENKQLQSCSTSDQVLEDRKPCLLSTLDAPVSPPRRRSRNRKVPDDQPLPSLSSGKQTNGADSKRPGSEPSLAAIEAGTIEVTDHLKIFSSRLGRCARPVAPQVPRLPIRDWMNLYERNLHPNGRHFVIHQHDHPIAGPHYDLRLQFSETSSVSWSIMYGLPGDPNSRRLNRNATETRVHCFWNHLVETASARTGSMIIWDTGEYEILPSLSEPEMAETDDSRSELSDASLHSPVDKKTESEKLREAFRNHKIRLRLHGTRLPKNYTIILRLDKNLDFAKPSTRIPRKRRRRAIHSSSTRPDPSTSSDSQISDGEPRDQSADAKADIGTTPMASHSDSESAIDHQIRVNNAYPGSTNTIGSVHQRRWFATLDRVNSGFVPENAKANAGPGKKRWARKRNVRTGQELGFEPFYVRGPEVERSVVTGRLGKDVLEDEGVRDFVPRRGWRAVVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.35
3 0.29
4 0.25
5 0.22
6 0.24
7 0.29
8 0.32
9 0.36
10 0.34
11 0.33
12 0.34
13 0.35
14 0.31
15 0.29
16 0.24
17 0.21
18 0.22
19 0.28
20 0.27
21 0.25
22 0.27
23 0.32
24 0.38
25 0.41
26 0.46
27 0.47
28 0.57
29 0.67
30 0.76
31 0.79
32 0.83
33 0.88
34 0.9
35 0.88
36 0.87
37 0.88
38 0.85
39 0.75
40 0.68
41 0.6
42 0.52
43 0.45
44 0.38
45 0.28
46 0.28
47 0.28
48 0.26
49 0.3
50 0.28
51 0.33
52 0.38
53 0.4
54 0.39
55 0.4
56 0.43
57 0.4
58 0.4
59 0.36
60 0.33
61 0.36
62 0.31
63 0.3
64 0.27
65 0.24
66 0.23
67 0.2
68 0.15
69 0.1
70 0.09
71 0.06
72 0.04
73 0.04
74 0.05
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.14
83 0.2
84 0.2
85 0.27
86 0.32
87 0.32
88 0.36
89 0.41
90 0.38
91 0.38
92 0.43
93 0.44
94 0.44
95 0.49
96 0.49
97 0.5
98 0.52
99 0.48
100 0.44
101 0.44
102 0.43
103 0.43
104 0.42
105 0.38
106 0.41
107 0.41
108 0.41
109 0.42
110 0.37
111 0.37
112 0.37
113 0.35
114 0.32
115 0.36
116 0.38
117 0.32
118 0.32
119 0.27
120 0.32
121 0.36
122 0.38
123 0.32
124 0.33
125 0.31
126 0.31
127 0.31
128 0.27
129 0.21
130 0.17
131 0.16
132 0.12
133 0.13
134 0.16
135 0.15
136 0.16
137 0.16
138 0.17
139 0.18
140 0.18
141 0.19
142 0.17
143 0.18
144 0.15
145 0.14
146 0.13
147 0.11
148 0.1
149 0.09
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.12
157 0.11
158 0.16
159 0.21
160 0.25
161 0.27
162 0.3
163 0.38
164 0.38
165 0.46
166 0.45
167 0.44
168 0.46
169 0.45
170 0.44
171 0.37
172 0.36
173 0.27
174 0.26
175 0.24
176 0.22
177 0.21
178 0.19
179 0.18
180 0.17
181 0.18
182 0.16
183 0.15
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.03
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.05
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.13
227 0.13
228 0.15
229 0.15
230 0.14
231 0.17
232 0.26
233 0.28
234 0.29
235 0.34
236 0.32
237 0.38
238 0.42
239 0.42
240 0.41
241 0.48
242 0.53
243 0.5
244 0.52
245 0.52
246 0.5
247 0.54
248 0.54
249 0.5
250 0.47
251 0.51
252 0.53
253 0.54
254 0.56
255 0.52
256 0.46
257 0.43
258 0.4
259 0.36
260 0.32
261 0.28
262 0.27
263 0.24
264 0.24
265 0.26
266 0.22
267 0.24
268 0.22
269 0.19
270 0.17
271 0.16
272 0.2
273 0.19
274 0.22
275 0.29
276 0.38
277 0.47
278 0.56
279 0.66
280 0.72
281 0.81
282 0.89
283 0.89
284 0.89
285 0.9
286 0.89
287 0.89
288 0.86
289 0.84
290 0.77
291 0.74
292 0.65
293 0.56
294 0.48
295 0.39
296 0.36
297 0.34
298 0.31
299 0.29
300 0.3
301 0.29
302 0.29
303 0.27
304 0.22
305 0.2
306 0.19
307 0.19
308 0.17
309 0.17
310 0.17
311 0.17
312 0.17
313 0.16
314 0.17
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.13
319 0.12
320 0.12
321 0.09
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.12
333 0.12
334 0.15
335 0.15
336 0.14
337 0.15
338 0.18
339 0.18
340 0.2
341 0.21
342 0.21
343 0.2
344 0.2
345 0.19
346 0.19
347 0.24
348 0.21
349 0.19
350 0.17
351 0.18
352 0.18
353 0.24
354 0.28
355 0.27
356 0.31
357 0.33
358 0.33
359 0.35
360 0.37
361 0.34
362 0.38
363 0.4
364 0.38
365 0.4
366 0.4
367 0.38
368 0.34
369 0.34
370 0.27
371 0.22
372 0.24
373 0.21
374 0.24
375 0.23
376 0.24
377 0.2
378 0.21
379 0.27
380 0.25
381 0.29
382 0.3
383 0.4
384 0.46
385 0.56
386 0.64
387 0.68
388 0.74
389 0.8
390 0.88
391 0.89
392 0.92
393 0.88
394 0.85
395 0.81
396 0.74
397 0.66
398 0.57
399 0.49
400 0.4
401 0.34
402 0.27
403 0.22
404 0.2
405 0.18
406 0.17
407 0.15
408 0.18
409 0.21
410 0.23
411 0.24
412 0.22
413 0.24
414 0.26
415 0.26
416 0.24
417 0.26
418 0.24
419 0.26
420 0.26
421 0.22
422 0.23
423 0.22
424 0.22
425 0.2
426 0.19
427 0.16
428 0.19
429 0.19
430 0.16
431 0.18
432 0.18
433 0.19
434 0.28
435 0.31
436 0.35
437 0.4