Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397GD06

Protein Details
Accession A0A397GD06    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-51IAPEGKKLKQEKSKGERKEKKEKKEKKSKAKDVVEDVKIBasic
56-103APEDSKPEKEDKKDKKEKKDKKEKNEKKEKKEKKEKKEKKDKDEAEEMBasic
129-163ESDGPEKKEEKKDKKSKKDKKSKKEKKEKESANESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-43KKRKLAEEAIAPEGKKLKQEKSKGERKEKKEKKEKKSKAK
61-97KPEKEDKKDKKEKKDKKEKNEKKEKKEKKEKKEKKDK
134-157EKKEEKKDKKSKKDKKSKKEKKEK
279-291EHRRAKIETKNRK
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGDKKRKLAEEAIAPEGKKLKQEKSKGERKEKKEKKEKKSKAKDVVEDVKIEDVAAPEDSKPEKEDKKDKKEKKDKKEKNEKKEKKEKKEKKEKKDKDEAEEMPSTQTAAADAMDVDGDVKPTEKQEAESDGPEKKEEKKDKKSKKDKKSKKEKKEKESANESQEQPEQSTETAPGEDHSQHHQKNARFICFVGNLPYSATADSLRKHFEKNPPSSVRVATEKDKPTKCRGFGFIEFDNYDRMKTCLKLYHHSTFDDGKYPPRRINVELTAGGGGGKSEHRRAKIETKNRKLNEERQLQAKDIQKEKKTHARGNGDEGADEWAGIHPSRRARMA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.44
3 0.43
4 0.38
5 0.37
6 0.38
7 0.42
8 0.48
9 0.57
10 0.65
11 0.7
12 0.79
13 0.81
14 0.87
15 0.87
16 0.86
17 0.89
18 0.87
19 0.88
20 0.9
21 0.9
22 0.9
23 0.91
24 0.93
25 0.93
26 0.95
27 0.94
28 0.93
29 0.91
30 0.87
31 0.85
32 0.83
33 0.74
34 0.64
35 0.54
36 0.45
37 0.36
38 0.29
39 0.21
40 0.13
41 0.12
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.14
46 0.16
47 0.16
48 0.18
49 0.24
50 0.3
51 0.37
52 0.48
53 0.55
54 0.64
55 0.74
56 0.81
57 0.84
58 0.89
59 0.91
60 0.91
61 0.92
62 0.91
63 0.92
64 0.94
65 0.93
66 0.93
67 0.94
68 0.93
69 0.92
70 0.93
71 0.92
72 0.92
73 0.93
74 0.93
75 0.92
76 0.94
77 0.94
78 0.94
79 0.95
80 0.93
81 0.91
82 0.92
83 0.85
84 0.81
85 0.79
86 0.69
87 0.63
88 0.55
89 0.46
90 0.36
91 0.3
92 0.24
93 0.15
94 0.13
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.07
110 0.1
111 0.1
112 0.11
113 0.13
114 0.18
115 0.19
116 0.2
117 0.22
118 0.22
119 0.22
120 0.22
121 0.22
122 0.22
123 0.31
124 0.39
125 0.46
126 0.55
127 0.65
128 0.74
129 0.83
130 0.89
131 0.9
132 0.91
133 0.92
134 0.92
135 0.92
136 0.93
137 0.93
138 0.93
139 0.94
140 0.93
141 0.9
142 0.9
143 0.86
144 0.82
145 0.79
146 0.73
147 0.67
148 0.62
149 0.53
150 0.46
151 0.41
152 0.33
153 0.25
154 0.21
155 0.16
156 0.12
157 0.11
158 0.1
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.1
166 0.15
167 0.21
168 0.22
169 0.27
170 0.32
171 0.32
172 0.4
173 0.42
174 0.39
175 0.33
176 0.33
177 0.32
178 0.27
179 0.26
180 0.21
181 0.17
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.12
186 0.1
187 0.1
188 0.08
189 0.1
190 0.11
191 0.13
192 0.16
193 0.17
194 0.2
195 0.25
196 0.33
197 0.4
198 0.45
199 0.52
200 0.52
201 0.53
202 0.53
203 0.48
204 0.42
205 0.38
206 0.35
207 0.3
208 0.34
209 0.38
210 0.44
211 0.48
212 0.49
213 0.54
214 0.58
215 0.57
216 0.53
217 0.51
218 0.49
219 0.48
220 0.49
221 0.41
222 0.38
223 0.36
224 0.32
225 0.31
226 0.25
227 0.21
228 0.17
229 0.17
230 0.16
231 0.17
232 0.2
233 0.23
234 0.27
235 0.34
236 0.4
237 0.46
238 0.46
239 0.45
240 0.45
241 0.42
242 0.39
243 0.37
244 0.31
245 0.32
246 0.37
247 0.4
248 0.4
249 0.42
250 0.44
251 0.43
252 0.5
253 0.45
254 0.43
255 0.4
256 0.37
257 0.31
258 0.27
259 0.23
260 0.16
261 0.11
262 0.07
263 0.11
264 0.13
265 0.21
266 0.26
267 0.3
268 0.34
269 0.4
270 0.49
271 0.55
272 0.62
273 0.66
274 0.71
275 0.78
276 0.77
277 0.8
278 0.77
279 0.76
280 0.75
281 0.73
282 0.67
283 0.65
284 0.65
285 0.58
286 0.57
287 0.55
288 0.53
289 0.53
290 0.59
291 0.57
292 0.61
293 0.66
294 0.7
295 0.71
296 0.71
297 0.72
298 0.72
299 0.69
300 0.71
301 0.69
302 0.6
303 0.51
304 0.44
305 0.38
306 0.28
307 0.24
308 0.17
309 0.12
310 0.13
311 0.14
312 0.16
313 0.17
314 0.24