Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397GHQ1

Protein Details
Accession A0A397GHQ1    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-55MAPDKKDKKRKAATTVAADSPAKKTKKVEAKPSEAPKEAPKSILKKNKKDAPATEHydrophilic
97-123KADIEEKKQPSKKKSKKEDGTPAPATKBasic
200-227VPKIPDSKKAKRKILKKQKKHGEPEEPGBasic
314-338KGANRRFKRTPWNRIEKKRLEKGKTBasic
412-440ETTVDETPKKSKKEKKGSQSTPKQETPKQHydrophilic
460-480TKVGAKDKKAEKAKGKAKVKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-77KKDKKRKAATTVAADSPAKKTKKVEAKPSEAPKEAPKSILKKNKKDAPATEEKSASKLKLNGEPARQVKPRKR
103-138KKQPSKKKSKKEDGTPAPATKAKTRAAASKPKAKKP
205-220DSKKAKRKILKKQKKH
315-359GANRRFKRTPWNRIEKKRLEKGKTREQWSERIDREQKRRLAKAEK
420-480KKSKKEKKGSQSTPKQETPKQAGEKALAKKGVNGAAASPATKVGAKDKKAEKAKGKAKVKA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDKKDKKRKAATTVAADSPAKKTKKVEAKPSEAPKEAPKSILKKNKKDAPATEEKSASKLKLNGEPARQVKPRKRAADFLSDDENEPEVAATEPKADIEEKKQPSKKKSKKEDGTPAPATKAKTRAAASKPKAKKPEPVVEKSDDEDNEEVPVVSEDSSEDEEDGVLDDQTAALIKGFESSGDEDESGDEGFDPDQPVPKIPDSKKAKRKILKKQKKHGEPEEPGTVYIGRIPHGFYEHQMRAYFSQFGDITRLRLSRNRITGRSKHYAFVEFASNTVAKIVAETMDNYLMYGHILKCKYVPSEQLHPEVWKGANRRFKRTPWNRIEKKRLEKGKTREQWSERIDREQKRRLAKAEKLKALGYEFELPQLKSVDEVPVQEQTKAIEAADATADEPVKAIEAPSAQESKEETTVDETPKKSKKEKKGSQSTPKQETPKQAGEKALAKKGVNGAAASPATKVGAKDKKAEKAKGKAKVKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.79
3 0.7
4 0.64
5 0.56
6 0.49
7 0.45
8 0.45
9 0.39
10 0.37
11 0.4
12 0.45
13 0.55
14 0.61
15 0.66
16 0.66
17 0.72
18 0.78
19 0.83
20 0.8
21 0.72
22 0.66
23 0.64
24 0.62
25 0.56
26 0.52
27 0.5
28 0.5
29 0.57
30 0.65
31 0.66
32 0.68
33 0.77
34 0.8
35 0.8
36 0.81
37 0.78
38 0.76
39 0.76
40 0.71
41 0.67
42 0.62
43 0.55
44 0.52
45 0.49
46 0.41
47 0.36
48 0.36
49 0.36
50 0.39
51 0.46
52 0.48
53 0.49
54 0.56
55 0.54
56 0.58
57 0.6
58 0.62
59 0.63
60 0.67
61 0.71
62 0.71
63 0.71
64 0.71
65 0.7
66 0.71
67 0.65
68 0.59
69 0.56
70 0.48
71 0.45
72 0.38
73 0.33
74 0.22
75 0.19
76 0.15
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.11
85 0.12
86 0.14
87 0.19
88 0.28
89 0.33
90 0.43
91 0.49
92 0.56
93 0.64
94 0.73
95 0.76
96 0.78
97 0.83
98 0.85
99 0.87
100 0.89
101 0.9
102 0.87
103 0.86
104 0.81
105 0.71
106 0.64
107 0.58
108 0.51
109 0.45
110 0.42
111 0.35
112 0.35
113 0.36
114 0.4
115 0.44
116 0.52
117 0.53
118 0.58
119 0.63
120 0.65
121 0.71
122 0.66
123 0.67
124 0.65
125 0.7
126 0.67
127 0.66
128 0.64
129 0.59
130 0.57
131 0.5
132 0.47
133 0.36
134 0.31
135 0.26
136 0.21
137 0.17
138 0.16
139 0.14
140 0.1
141 0.1
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.04
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.08
177 0.07
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.07
183 0.06
184 0.1
185 0.11
186 0.12
187 0.14
188 0.17
189 0.24
190 0.24
191 0.34
192 0.39
193 0.49
194 0.57
195 0.63
196 0.7
197 0.69
198 0.78
199 0.79
200 0.82
201 0.83
202 0.84
203 0.86
204 0.87
205 0.88
206 0.87
207 0.84
208 0.81
209 0.74
210 0.68
211 0.62
212 0.52
213 0.43
214 0.35
215 0.27
216 0.18
217 0.16
218 0.11
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.1
224 0.11
225 0.1
226 0.17
227 0.17
228 0.19
229 0.19
230 0.19
231 0.18
232 0.2
233 0.2
234 0.13
235 0.15
236 0.13
237 0.13
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.16
242 0.17
243 0.15
244 0.19
245 0.25
246 0.26
247 0.35
248 0.38
249 0.41
250 0.46
251 0.52
252 0.55
253 0.57
254 0.52
255 0.46
256 0.43
257 0.41
258 0.35
259 0.3
260 0.26
261 0.18
262 0.17
263 0.17
264 0.15
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.08
282 0.07
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.16
288 0.18
289 0.18
290 0.25
291 0.25
292 0.33
293 0.35
294 0.38
295 0.37
296 0.35
297 0.33
298 0.3
299 0.26
300 0.22
301 0.24
302 0.28
303 0.36
304 0.39
305 0.47
306 0.49
307 0.54
308 0.61
309 0.66
310 0.7
311 0.71
312 0.79
313 0.8
314 0.84
315 0.89
316 0.87
317 0.86
318 0.85
319 0.84
320 0.8
321 0.8
322 0.78
323 0.79
324 0.77
325 0.74
326 0.73
327 0.67
328 0.69
329 0.65
330 0.66
331 0.57
332 0.58
333 0.61
334 0.61
335 0.66
336 0.66
337 0.67
338 0.66
339 0.69
340 0.68
341 0.68
342 0.68
343 0.69
344 0.7
345 0.68
346 0.63
347 0.58
348 0.52
349 0.45
350 0.38
351 0.3
352 0.25
353 0.2
354 0.22
355 0.25
356 0.23
357 0.23
358 0.23
359 0.2
360 0.16
361 0.17
362 0.17
363 0.15
364 0.16
365 0.16
366 0.22
367 0.23
368 0.22
369 0.22
370 0.19
371 0.2
372 0.19
373 0.17
374 0.11
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.1
379 0.08
380 0.09
381 0.1
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.11
391 0.14
392 0.16
393 0.15
394 0.17
395 0.19
396 0.2
397 0.22
398 0.21
399 0.18
400 0.21
401 0.26
402 0.3
403 0.34
404 0.32
405 0.39
406 0.46
407 0.51
408 0.56
409 0.62
410 0.67
411 0.73
412 0.81
413 0.83
414 0.87
415 0.91
416 0.92
417 0.93
418 0.91
419 0.88
420 0.86
421 0.82
422 0.77
423 0.76
424 0.73
425 0.72
426 0.69
427 0.64
428 0.61
429 0.58
430 0.6
431 0.57
432 0.56
433 0.52
434 0.45
435 0.45
436 0.47
437 0.46
438 0.4
439 0.34
440 0.28
441 0.28
442 0.29
443 0.25
444 0.2
445 0.16
446 0.16
447 0.17
448 0.18
449 0.22
450 0.31
451 0.33
452 0.42
453 0.49
454 0.57
455 0.65
456 0.73
457 0.72
458 0.74
459 0.79
460 0.8