Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CTB2

Protein Details
Accession A0A0D1CTB2    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-128AVDAKMDSRRKKFREARQKEERDRARAEBasic
159-179SVTGKRRKAAAKREARNTRSFHydrophilic
895-916LLWPQIRKDPKYKDRTNVDVLKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-127RRKKFREARQKEERDRARA
163-172KRRKAAAKRE
Subcellular Location(s) nucl 9cyto_mito 9, mito 8.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000244  P:spliceosomal tri-snRNP complex assembly  
KEGG uma:UMAG_02281  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
Amino Acid Sequences MSDKPNKLAFLSMQAPAGYVAGLGRGASGFTTRADIGPARLTASSSEHRSNGNADDADDPDDDGPGDEEQARFQDPENETGLFAGAVYEKDDQEADRIWEAVDAKMDSRRKKFREARQKEERDRARAEKPLISAQFADLKRGLSSVTEDQWAALTESGSVTGKRRKAAAKREARNTRSFAISDTILVGNRDRNAVVSALTPDQMQDADQDAGGTITSLTEIGEARNKILSHQLDQASASGTATSIDPKGYLTELSSTVIKSDAEIGDIKKARSLLDSVIKTNPSHAPGWIAAARVEEVAGKMSNARKIIQQGCDHCPRSQDIWLEAARLNTKDNAKVILARSIAHVSQSVPIWLKAVELETDSESKKRVLRKSLEYIPASVKLWKELVNLEENPEDARILLSGAVAAVPLSVELWLALARLSAPEEAKKVLNEARKTIPTSHEIWIAAARLIEETEADEVKVEKTVVAAVRALRKAGVELSRDQWMAEAEQVERQGSPMVCGAIVKATIELDVDEEDRRAVWVGDAATALEKGCVEVARSILAYTLRVFPDRPAIWTQAVALEQQHGSQENVIALLERAVTSCAKAEDLWLALATVHRDAGDTAAARQTLIRAFDANIGSEKISLAAAQLESSQGQLVAARRLLERARVEVGSARVWMKSAQFERDHGYTSTALSLIDEALVQFPQFAKLYMMGAQLSQHLFSGEESVKKAREYLGRGIRWSPNCDALWILAARLEACAGLTIRSRALLERARLSNPSSPLIWYESITIELSSSPPNPTQARTLLSRALQVLPDSGLLWVLAIALEPRAGRKTKMTDALRKTADDSYVLATVAQQFWLEGKPAQARKWFQRATHAAPNIGDHYAIWYKFEQQHGTQHHIDTLHTLVLDAKPKYGLLWPQIRKDPKYKDRTNVDVLKLVADKIVPLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.21
4 0.2
5 0.12
6 0.09
7 0.07
8 0.06
9 0.07
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.07
15 0.08
16 0.09
17 0.09
18 0.13
19 0.13
20 0.14
21 0.17
22 0.18
23 0.19
24 0.22
25 0.22
26 0.21
27 0.2
28 0.21
29 0.19
30 0.24
31 0.27
32 0.29
33 0.33
34 0.33
35 0.34
36 0.35
37 0.36
38 0.33
39 0.33
40 0.27
41 0.25
42 0.26
43 0.25
44 0.26
45 0.23
46 0.21
47 0.15
48 0.15
49 0.13
50 0.11
51 0.12
52 0.09
53 0.11
54 0.12
55 0.12
56 0.13
57 0.16
58 0.17
59 0.16
60 0.17
61 0.24
62 0.24
63 0.27
64 0.28
65 0.27
66 0.25
67 0.24
68 0.23
69 0.14
70 0.12
71 0.09
72 0.07
73 0.07
74 0.1
75 0.12
76 0.11
77 0.13
78 0.14
79 0.13
80 0.15
81 0.17
82 0.17
83 0.16
84 0.17
85 0.16
86 0.18
87 0.18
88 0.17
89 0.18
90 0.16
91 0.16
92 0.24
93 0.3
94 0.36
95 0.44
96 0.53
97 0.54
98 0.64
99 0.72
100 0.76
101 0.8
102 0.82
103 0.83
104 0.84
105 0.9
106 0.88
107 0.89
108 0.85
109 0.81
110 0.79
111 0.75
112 0.7
113 0.67
114 0.63
115 0.56
116 0.52
117 0.53
118 0.47
119 0.43
120 0.37
121 0.32
122 0.36
123 0.31
124 0.32
125 0.25
126 0.24
127 0.23
128 0.22
129 0.2
130 0.13
131 0.18
132 0.18
133 0.19
134 0.19
135 0.19
136 0.19
137 0.19
138 0.19
139 0.15
140 0.12
141 0.1
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.16
148 0.22
149 0.26
150 0.27
151 0.33
152 0.4
153 0.48
154 0.57
155 0.62
156 0.66
157 0.71
158 0.79
159 0.84
160 0.81
161 0.78
162 0.72
163 0.64
164 0.57
165 0.49
166 0.4
167 0.33
168 0.28
169 0.22
170 0.2
171 0.18
172 0.15
173 0.16
174 0.15
175 0.15
176 0.16
177 0.17
178 0.15
179 0.15
180 0.15
181 0.15
182 0.14
183 0.12
184 0.14
185 0.13
186 0.14
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.09
192 0.08
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.04
202 0.03
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.07
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.17
213 0.17
214 0.17
215 0.25
216 0.26
217 0.23
218 0.3
219 0.3
220 0.27
221 0.28
222 0.27
223 0.21
224 0.19
225 0.15
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.13
243 0.12
244 0.11
245 0.12
246 0.11
247 0.09
248 0.12
249 0.1
250 0.11
251 0.13
252 0.13
253 0.2
254 0.22
255 0.22
256 0.2
257 0.21
258 0.2
259 0.19
260 0.2
261 0.18
262 0.24
263 0.25
264 0.26
265 0.28
266 0.29
267 0.27
268 0.29
269 0.28
270 0.23
271 0.22
272 0.2
273 0.19
274 0.18
275 0.21
276 0.19
277 0.17
278 0.14
279 0.14
280 0.14
281 0.11
282 0.11
283 0.08
284 0.07
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.1
289 0.13
290 0.16
291 0.17
292 0.18
293 0.19
294 0.26
295 0.3
296 0.33
297 0.36
298 0.37
299 0.42
300 0.49
301 0.49
302 0.43
303 0.4
304 0.37
305 0.35
306 0.34
307 0.31
308 0.24
309 0.26
310 0.25
311 0.25
312 0.23
313 0.22
314 0.19
315 0.18
316 0.18
317 0.17
318 0.19
319 0.19
320 0.19
321 0.19
322 0.18
323 0.2
324 0.2
325 0.21
326 0.19
327 0.17
328 0.18
329 0.18
330 0.17
331 0.15
332 0.14
333 0.1
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.08
343 0.09
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.11
349 0.12
350 0.12
351 0.13
352 0.15
353 0.18
354 0.24
355 0.28
356 0.34
357 0.4
358 0.46
359 0.52
360 0.56
361 0.59
362 0.53
363 0.49
364 0.43
365 0.39
366 0.33
367 0.28
368 0.21
369 0.16
370 0.16
371 0.16
372 0.15
373 0.14
374 0.16
375 0.17
376 0.17
377 0.18
378 0.17
379 0.16
380 0.15
381 0.13
382 0.11
383 0.07
384 0.07
385 0.05
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.02
395 0.02
396 0.02
397 0.02
398 0.02
399 0.02
400 0.02
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.04
408 0.05
409 0.06
410 0.06
411 0.08
412 0.09
413 0.1
414 0.11
415 0.11
416 0.12
417 0.16
418 0.21
419 0.21
420 0.24
421 0.26
422 0.28
423 0.29
424 0.29
425 0.27
426 0.24
427 0.27
428 0.25
429 0.23
430 0.21
431 0.19
432 0.18
433 0.16
434 0.13
435 0.09
436 0.08
437 0.06
438 0.06
439 0.05
440 0.04
441 0.04
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.08
456 0.09
457 0.14
458 0.14
459 0.14
460 0.12
461 0.12
462 0.12
463 0.14
464 0.15
465 0.13
466 0.14
467 0.16
468 0.18
469 0.18
470 0.17
471 0.15
472 0.12
473 0.1
474 0.1
475 0.09
476 0.07
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.08
482 0.1
483 0.09
484 0.1
485 0.09
486 0.09
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.06
491 0.06
492 0.05
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.05
497 0.04
498 0.04
499 0.05
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.05
508 0.04
509 0.06
510 0.06
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.05
518 0.04
519 0.04
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.06
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.11
533 0.11
534 0.12
535 0.13
536 0.12
537 0.2
538 0.19
539 0.21
540 0.2
541 0.22
542 0.22
543 0.21
544 0.21
545 0.15
546 0.15
547 0.13
548 0.1
549 0.09
550 0.09
551 0.09
552 0.1
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.09
557 0.07
558 0.07
559 0.07
560 0.06
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.04
565 0.05
566 0.06
567 0.06
568 0.06
569 0.07
570 0.08
571 0.08
572 0.08
573 0.09
574 0.09
575 0.09
576 0.09
577 0.07
578 0.07
579 0.07
580 0.08
581 0.08
582 0.07
583 0.06
584 0.06
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.08
589 0.08
590 0.08
591 0.1
592 0.1
593 0.1
594 0.1
595 0.1
596 0.1
597 0.12
598 0.11
599 0.1
600 0.11
601 0.16
602 0.16
603 0.15
604 0.14
605 0.14
606 0.13
607 0.12
608 0.11
609 0.08
610 0.07
611 0.06
612 0.06
613 0.06
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.07
621 0.05
622 0.05
623 0.07
624 0.09
625 0.11
626 0.12
627 0.13
628 0.13
629 0.16
630 0.17
631 0.21
632 0.21
633 0.21
634 0.23
635 0.21
636 0.22
637 0.22
638 0.23
639 0.18
640 0.18
641 0.16
642 0.14
643 0.14
644 0.15
645 0.14
646 0.19
647 0.21
648 0.25
649 0.26
650 0.28
651 0.31
652 0.31
653 0.32
654 0.26
655 0.25
656 0.2
657 0.19
658 0.18
659 0.13
660 0.12
661 0.09
662 0.09
663 0.06
664 0.06
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.06
669 0.05
670 0.06
671 0.06
672 0.09
673 0.09
674 0.1
675 0.1
676 0.11
677 0.12
678 0.14
679 0.15
680 0.12
681 0.12
682 0.12
683 0.13
684 0.13
685 0.12
686 0.1
687 0.09
688 0.09
689 0.09
690 0.14
691 0.13
692 0.15
693 0.17
694 0.2
695 0.21
696 0.21
697 0.22
698 0.21
699 0.25
700 0.28
701 0.36
702 0.42
703 0.42
704 0.44
705 0.48
706 0.5
707 0.48
708 0.48
709 0.41
710 0.38
711 0.36
712 0.35
713 0.31
714 0.24
715 0.24
716 0.19
717 0.16
718 0.11
719 0.11
720 0.11
721 0.1
722 0.1
723 0.06
724 0.06
725 0.08
726 0.06
727 0.08
728 0.1
729 0.11
730 0.11
731 0.12
732 0.13
733 0.13
734 0.19
735 0.23
736 0.25
737 0.31
738 0.33
739 0.35
740 0.36
741 0.38
742 0.38
743 0.35
744 0.34
745 0.27
746 0.25
747 0.25
748 0.27
749 0.24
750 0.19
751 0.18
752 0.16
753 0.17
754 0.17
755 0.15
756 0.11
757 0.11
758 0.11
759 0.13
760 0.13
761 0.15
762 0.15
763 0.21
764 0.23
765 0.24
766 0.28
767 0.29
768 0.31
769 0.31
770 0.34
771 0.33
772 0.32
773 0.32
774 0.3
775 0.28
776 0.25
777 0.22
778 0.2
779 0.16
780 0.15
781 0.13
782 0.11
783 0.09
784 0.08
785 0.07
786 0.06
787 0.05
788 0.04
789 0.04
790 0.04
791 0.05
792 0.06
793 0.07
794 0.09
795 0.15
796 0.17
797 0.19
798 0.26
799 0.32
800 0.38
801 0.47
802 0.53
803 0.57
804 0.62
805 0.68
806 0.64
807 0.58
808 0.54
809 0.48
810 0.41
811 0.33
812 0.28
813 0.22
814 0.2
815 0.19
816 0.16
817 0.14
818 0.15
819 0.15
820 0.14
821 0.11
822 0.1
823 0.12
824 0.13
825 0.14
826 0.12
827 0.17
828 0.25
829 0.3
830 0.35
831 0.41
832 0.47
833 0.54
834 0.63
835 0.63
836 0.56
837 0.62
838 0.65
839 0.64
840 0.67
841 0.61
842 0.53
843 0.49
844 0.5
845 0.42
846 0.35
847 0.27
848 0.17
849 0.2
850 0.23
851 0.23
852 0.22
853 0.21
854 0.27
855 0.32
856 0.37
857 0.37
858 0.34
859 0.44
860 0.46
861 0.52
862 0.49
863 0.45
864 0.43
865 0.39
866 0.36
867 0.29
868 0.26
869 0.2
870 0.17
871 0.16
872 0.15
873 0.18
874 0.25
875 0.23
876 0.22
877 0.22
878 0.22
879 0.23
880 0.26
881 0.29
882 0.3
883 0.4
884 0.44
885 0.51
886 0.6
887 0.66
888 0.67
889 0.7
890 0.73
891 0.73
892 0.78
893 0.79
894 0.79
895 0.8
896 0.81
897 0.81
898 0.78
899 0.71
900 0.65
901 0.57
902 0.52
903 0.45
904 0.38
905 0.29
906 0.21