Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397FZ55

Protein Details
Accession A0A397FZ55    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
286-308HDDRCKPRRSKSMKYLNRNGDRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
310-315SRALRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MRAPTIMDHGTPPATDQVPDAGASALRSANAVLFIGNVGFNVSEKTIRDVFAAKGFLVDVHLPLDAETRKHAGFGYLHFPSIHAARAALDALQGTHIDGHSINLELSDHSPITSLHPGQLPEWSHARRPSELHSSVNPSLGTKPERCEIGQDDENEESIAAKEKRPVPLSVADLCSGDKGTDQEPKGNKVLITTPDDFPHLTRDLEQSRFPPMSQVDAHVLTHRRRDPNTPIWGASAPERHGNHGNDVAGRSYQLQSTPGSFPDDDSDETRSGPSLEPAQISGTGHDDRCKPRRSKSMKYLNRNGDRSPSRALRRRATERHSLRHGSQNSFGGFYDEGCAYDNYSNTFGHSRPRSQPSSQEEISIPDENEQQPDPRQSAIDDCVVSLIGLGYENTLEGGIQRIAVYAAAADGKISDAIEMIEEERKAYEQQGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.19
4 0.19
5 0.18
6 0.19
7 0.18
8 0.13
9 0.13
10 0.13
11 0.14
12 0.11
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.08
20 0.07
21 0.08
22 0.08
23 0.07
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.07
28 0.08
29 0.09
30 0.12
31 0.13
32 0.18
33 0.19
34 0.2
35 0.22
36 0.22
37 0.23
38 0.25
39 0.26
40 0.2
41 0.19
42 0.18
43 0.16
44 0.16
45 0.15
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.1
50 0.1
51 0.15
52 0.14
53 0.15
54 0.17
55 0.2
56 0.19
57 0.2
58 0.2
59 0.19
60 0.19
61 0.21
62 0.25
63 0.22
64 0.24
65 0.23
66 0.23
67 0.21
68 0.2
69 0.19
70 0.12
71 0.12
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.1
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.08
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.11
95 0.1
96 0.09
97 0.1
98 0.11
99 0.15
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.2
104 0.21
105 0.21
106 0.26
107 0.23
108 0.21
109 0.28
110 0.27
111 0.3
112 0.34
113 0.36
114 0.33
115 0.34
116 0.37
117 0.39
118 0.39
119 0.37
120 0.35
121 0.39
122 0.38
123 0.37
124 0.32
125 0.24
126 0.23
127 0.25
128 0.26
129 0.21
130 0.23
131 0.24
132 0.26
133 0.25
134 0.27
135 0.26
136 0.29
137 0.3
138 0.29
139 0.29
140 0.27
141 0.27
142 0.23
143 0.19
144 0.12
145 0.09
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.19
150 0.22
151 0.28
152 0.3
153 0.3
154 0.27
155 0.3
156 0.32
157 0.3
158 0.28
159 0.23
160 0.21
161 0.2
162 0.17
163 0.13
164 0.1
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.15
169 0.16
170 0.21
171 0.23
172 0.27
173 0.27
174 0.27
175 0.25
176 0.2
177 0.23
178 0.21
179 0.24
180 0.23
181 0.23
182 0.22
183 0.23
184 0.22
185 0.19
186 0.19
187 0.15
188 0.13
189 0.13
190 0.17
191 0.2
192 0.21
193 0.22
194 0.19
195 0.22
196 0.22
197 0.21
198 0.19
199 0.16
200 0.18
201 0.17
202 0.17
203 0.15
204 0.16
205 0.16
206 0.16
207 0.2
208 0.18
209 0.24
210 0.27
211 0.29
212 0.3
213 0.36
214 0.4
215 0.44
216 0.49
217 0.44
218 0.4
219 0.37
220 0.36
221 0.31
222 0.26
223 0.21
224 0.15
225 0.2
226 0.2
227 0.21
228 0.26
229 0.27
230 0.26
231 0.26
232 0.25
233 0.2
234 0.2
235 0.18
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.14
245 0.14
246 0.13
247 0.16
248 0.15
249 0.15
250 0.16
251 0.17
252 0.16
253 0.16
254 0.18
255 0.15
256 0.16
257 0.15
258 0.13
259 0.13
260 0.12
261 0.11
262 0.12
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.14
267 0.13
268 0.13
269 0.12
270 0.13
271 0.14
272 0.14
273 0.17
274 0.21
275 0.27
276 0.35
277 0.43
278 0.44
279 0.5
280 0.6
281 0.65
282 0.7
283 0.73
284 0.77
285 0.78
286 0.83
287 0.84
288 0.84
289 0.84
290 0.77
291 0.68
292 0.66
293 0.59
294 0.53
295 0.5
296 0.48
297 0.48
298 0.54
299 0.59
300 0.58
301 0.63
302 0.7
303 0.71
304 0.69
305 0.71
306 0.7
307 0.71
308 0.7
309 0.65
310 0.59
311 0.6
312 0.6
313 0.53
314 0.5
315 0.46
316 0.4
317 0.37
318 0.33
319 0.27
320 0.22
321 0.18
322 0.17
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.14
329 0.14
330 0.14
331 0.16
332 0.16
333 0.17
334 0.19
335 0.18
336 0.25
337 0.3
338 0.34
339 0.4
340 0.48
341 0.51
342 0.51
343 0.6
344 0.58
345 0.61
346 0.55
347 0.5
348 0.43
349 0.41
350 0.42
351 0.36
352 0.29
353 0.23
354 0.27
355 0.25
356 0.27
357 0.24
358 0.24
359 0.25
360 0.3
361 0.29
362 0.26
363 0.26
364 0.25
365 0.28
366 0.27
367 0.27
368 0.22
369 0.2
370 0.19
371 0.18
372 0.16
373 0.12
374 0.09
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.06
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.07
403 0.06
404 0.07
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.13
409 0.13
410 0.14
411 0.15
412 0.16
413 0.17