Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HIV6

Protein Details
Accession A0A397HIV6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-189EDAAPSKGKKSKKTRKDKKKQKGGATAEEBasic
485-505ASPVDKRPPKADRPSSRGFRAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-183SKGKKSKKTRKDKKKQKG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 16, nucl 15, cyto 11
Family & Domain DBs
Amino Acid Sequences MNSGLTRESKHHIAVLEEEDVETFVAFCEYAYTGDYSVPPPGSREDEKDDAIDDTAFKGMFSNPFASTVPPPAPSPPPSLKLPNRDLDVPDRGDSETARNEELTQPQKEGESVKDGNNDVGEDVAAPDDPPQDPASACDEPSEQPLATPAAEEGDPWGFGEDAAPSKGKKSKKTRKDKKKQKGGATAEEPMSNLTPPTTPPPGNPNDQIDNNLTVETTAMLDDPIPVTEHIKVGEVAEVVEVPEPTGADESIDPAAPSLDTESWDRATSVPPKVKDTLNENVKLEHNSQKEDEIKEEVVSPRSQMKAFIDTSFAKQLFPSRRPTGVGLWDKFMSLDYLDHPSTYGTRPLTPVSTHSDSSKSDLPYLVFHAKLYVFAVRYLIPALAQLCLRKLHADLLCLAFPGPKDGEREEERAALTATKARMVLDLLHYTYTKTTRLEPISPTSATQLRDNELRKLVIHYAACKVRELAEYCPTMESMVSSPLASPVDKRPPKADRPSSRGFRALLDSTTELASDLVFRMM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.32
3 0.28
4 0.24
5 0.22
6 0.19
7 0.18
8 0.16
9 0.11
10 0.08
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.05
15 0.07
16 0.08
17 0.09
18 0.1
19 0.11
20 0.11
21 0.13
22 0.15
23 0.14
24 0.18
25 0.19
26 0.17
27 0.19
28 0.22
29 0.27
30 0.3
31 0.34
32 0.37
33 0.39
34 0.4
35 0.39
36 0.36
37 0.3
38 0.28
39 0.22
40 0.16
41 0.13
42 0.13
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.12
47 0.15
48 0.17
49 0.19
50 0.18
51 0.21
52 0.22
53 0.23
54 0.23
55 0.25
56 0.24
57 0.23
58 0.24
59 0.25
60 0.3
61 0.31
62 0.36
63 0.36
64 0.38
65 0.41
66 0.5
67 0.53
68 0.56
69 0.59
70 0.57
71 0.55
72 0.54
73 0.52
74 0.49
75 0.48
76 0.42
77 0.37
78 0.33
79 0.29
80 0.28
81 0.25
82 0.24
83 0.23
84 0.23
85 0.23
86 0.21
87 0.22
88 0.25
89 0.32
90 0.33
91 0.3
92 0.29
93 0.28
94 0.28
95 0.28
96 0.27
97 0.22
98 0.23
99 0.23
100 0.25
101 0.28
102 0.28
103 0.28
104 0.26
105 0.24
106 0.16
107 0.14
108 0.11
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.14
122 0.19
123 0.18
124 0.18
125 0.17
126 0.18
127 0.18
128 0.21
129 0.21
130 0.14
131 0.13
132 0.15
133 0.15
134 0.13
135 0.12
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.14
154 0.2
155 0.25
156 0.34
157 0.44
158 0.53
159 0.63
160 0.75
161 0.82
162 0.87
163 0.93
164 0.95
165 0.94
166 0.95
167 0.93
168 0.9
169 0.89
170 0.84
171 0.8
172 0.72
173 0.64
174 0.54
175 0.45
176 0.36
177 0.26
178 0.21
179 0.14
180 0.1
181 0.08
182 0.07
183 0.08
184 0.13
185 0.16
186 0.16
187 0.18
188 0.25
189 0.27
190 0.31
191 0.33
192 0.32
193 0.31
194 0.31
195 0.33
196 0.28
197 0.26
198 0.22
199 0.19
200 0.15
201 0.11
202 0.1
203 0.08
204 0.06
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.06
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.08
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.11
253 0.1
254 0.13
255 0.16
256 0.21
257 0.24
258 0.25
259 0.27
260 0.3
261 0.3
262 0.29
263 0.3
264 0.33
265 0.33
266 0.35
267 0.32
268 0.32
269 0.32
270 0.32
271 0.29
272 0.28
273 0.24
274 0.23
275 0.24
276 0.25
277 0.28
278 0.27
279 0.25
280 0.21
281 0.2
282 0.18
283 0.2
284 0.18
285 0.16
286 0.16
287 0.15
288 0.16
289 0.17
290 0.17
291 0.17
292 0.17
293 0.2
294 0.21
295 0.2
296 0.2
297 0.2
298 0.22
299 0.25
300 0.23
301 0.18
302 0.17
303 0.24
304 0.27
305 0.29
306 0.35
307 0.33
308 0.34
309 0.36
310 0.38
311 0.34
312 0.36
313 0.4
314 0.34
315 0.33
316 0.31
317 0.29
318 0.27
319 0.24
320 0.16
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.13
325 0.13
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.14
330 0.15
331 0.17
332 0.14
333 0.16
334 0.18
335 0.19
336 0.2
337 0.19
338 0.2
339 0.24
340 0.25
341 0.25
342 0.25
343 0.26
344 0.25
345 0.29
346 0.31
347 0.24
348 0.22
349 0.23
350 0.22
351 0.21
352 0.25
353 0.24
354 0.19
355 0.18
356 0.18
357 0.17
358 0.17
359 0.17
360 0.15
361 0.12
362 0.12
363 0.14
364 0.12
365 0.13
366 0.13
367 0.11
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.1
373 0.1
374 0.12
375 0.13
376 0.14
377 0.14
378 0.14
379 0.2
380 0.2
381 0.21
382 0.21
383 0.23
384 0.22
385 0.21
386 0.2
387 0.15
388 0.13
389 0.16
390 0.15
391 0.14
392 0.17
393 0.19
394 0.25
395 0.28
396 0.32
397 0.3
398 0.3
399 0.28
400 0.26
401 0.25
402 0.19
403 0.17
404 0.17
405 0.16
406 0.16
407 0.16
408 0.15
409 0.15
410 0.16
411 0.17
412 0.17
413 0.19
414 0.18
415 0.19
416 0.19
417 0.19
418 0.22
419 0.22
420 0.2
421 0.19
422 0.22
423 0.28
424 0.33
425 0.36
426 0.37
427 0.41
428 0.42
429 0.41
430 0.38
431 0.35
432 0.34
433 0.32
434 0.33
435 0.3
436 0.29
437 0.36
438 0.37
439 0.38
440 0.37
441 0.37
442 0.33
443 0.34
444 0.34
445 0.32
446 0.32
447 0.29
448 0.33
449 0.37
450 0.37
451 0.34
452 0.32
453 0.3
454 0.33
455 0.33
456 0.3
457 0.32
458 0.33
459 0.32
460 0.32
461 0.29
462 0.23
463 0.2
464 0.18
465 0.12
466 0.14
467 0.13
468 0.13
469 0.13
470 0.15
471 0.17
472 0.15
473 0.17
474 0.23
475 0.33
476 0.38
477 0.41
478 0.47
479 0.54
480 0.63
481 0.71
482 0.74
483 0.73
484 0.76
485 0.82
486 0.82
487 0.78
488 0.73
489 0.64
490 0.56
491 0.53
492 0.48
493 0.39
494 0.36
495 0.32
496 0.29
497 0.28
498 0.24
499 0.18
500 0.15
501 0.13
502 0.1