Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HHX9

Protein Details
Accession A0A397HHX9    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
456-476TMSNAKPRPHHQRQRSNIQLVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MSSNNGIIDTFSLGAASTNTSSRSTSTVRPRTRRLISVDDVTDEDYGRPMQSTGLSTTTLSGESSAIRSRGATPSPHTSRGASPLPMRHPSRATESFNRDNLNGFGVPLGGLGQTGKAQTKFSDSSRAAVDFLDVSWTSLQSLASSFLGSDIARSESNGTARTHSRKPSRPDPCMRATPKIPSAWGPSAPSTSEIGAGTKEERQAMLQAKKREALLLADTGLVSNRDTRHKRRDSCDQTGHSAIDPKQDEDALAYIHHVQPNDSITGVAIKYGCQPAIFRKANGFWPSDSIQSRKTVLLPVASCSVKGRPVRAQPEVDLLSGSVSNRDSLEDLSGSSIAPAPSSGTRASSAEGEASTELPLEGEADRIWKHQSWVQIDGFPAPVEIGRVPRRALGFFPRTRRKSLSYTDSEPRSSISGRERTATLSSTLSSPTESPSSQAFTAQNRSTTDPSRSRTMSNAKPRPHHQRQRSNIQLVGTGVGTLDRSAMAPGPALDGLSKFVAQHLPNLAPAPAPPSLGRTPSEYASATASTASTSLDNIGGAVEGWVRKMTTRAKAGLSDLQQGAQSYQGNSRAGTRRGMGDLIELNDGLESRNSSGLLAGSLRKPDLSRSGSNLHDASSLRGRFSSPSSSGTSRTRTGGSNLGYGDRVKDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.11
4 0.11
5 0.12
6 0.14
7 0.16
8 0.17
9 0.18
10 0.22
11 0.24
12 0.31
13 0.4
14 0.49
15 0.57
16 0.65
17 0.71
18 0.76
19 0.78
20 0.76
21 0.72
22 0.7
23 0.65
24 0.63
25 0.57
26 0.49
27 0.43
28 0.38
29 0.32
30 0.25
31 0.2
32 0.15
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.11
37 0.12
38 0.14
39 0.16
40 0.17
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.19
45 0.18
46 0.16
47 0.14
48 0.12
49 0.1
50 0.11
51 0.14
52 0.16
53 0.16
54 0.15
55 0.17
56 0.19
57 0.24
58 0.27
59 0.28
60 0.29
61 0.39
62 0.44
63 0.47
64 0.46
65 0.43
66 0.42
67 0.45
68 0.43
69 0.38
70 0.37
71 0.4
72 0.44
73 0.5
74 0.51
75 0.49
76 0.48
77 0.47
78 0.51
79 0.51
80 0.52
81 0.53
82 0.57
83 0.59
84 0.59
85 0.59
86 0.5
87 0.46
88 0.39
89 0.34
90 0.26
91 0.19
92 0.15
93 0.13
94 0.12
95 0.1
96 0.09
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.07
102 0.09
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.16
107 0.22
108 0.25
109 0.25
110 0.33
111 0.3
112 0.32
113 0.33
114 0.33
115 0.27
116 0.24
117 0.23
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.13
143 0.14
144 0.16
145 0.19
146 0.19
147 0.21
148 0.27
149 0.32
150 0.36
151 0.42
152 0.5
153 0.54
154 0.61
155 0.68
156 0.71
157 0.74
158 0.77
159 0.75
160 0.73
161 0.74
162 0.7
163 0.66
164 0.59
165 0.57
166 0.53
167 0.48
168 0.42
169 0.36
170 0.38
171 0.35
172 0.34
173 0.29
174 0.26
175 0.26
176 0.25
177 0.24
178 0.18
179 0.15
180 0.15
181 0.13
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.13
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.17
192 0.24
193 0.3
194 0.34
195 0.37
196 0.39
197 0.4
198 0.4
199 0.36
200 0.29
201 0.24
202 0.2
203 0.16
204 0.14
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.07
211 0.1
212 0.12
213 0.2
214 0.27
215 0.35
216 0.45
217 0.54
218 0.6
219 0.63
220 0.72
221 0.71
222 0.74
223 0.74
224 0.66
225 0.61
226 0.56
227 0.5
228 0.4
229 0.36
230 0.28
231 0.27
232 0.25
233 0.22
234 0.21
235 0.2
236 0.19
237 0.15
238 0.15
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.1
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.14
249 0.13
250 0.12
251 0.1
252 0.08
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.07
257 0.07
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.09
262 0.1
263 0.14
264 0.24
265 0.25
266 0.23
267 0.24
268 0.26
269 0.32
270 0.34
271 0.31
272 0.21
273 0.23
274 0.24
275 0.26
276 0.26
277 0.22
278 0.21
279 0.21
280 0.23
281 0.2
282 0.19
283 0.17
284 0.16
285 0.18
286 0.16
287 0.16
288 0.18
289 0.17
290 0.16
291 0.15
292 0.15
293 0.18
294 0.19
295 0.2
296 0.22
297 0.29
298 0.34
299 0.36
300 0.36
301 0.31
302 0.35
303 0.32
304 0.27
305 0.2
306 0.15
307 0.12
308 0.11
309 0.1
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.06
329 0.07
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.05
349 0.04
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.07
354 0.08
355 0.11
356 0.1
357 0.12
358 0.14
359 0.2
360 0.21
361 0.25
362 0.25
363 0.24
364 0.24
365 0.23
366 0.21
367 0.15
368 0.12
369 0.08
370 0.07
371 0.06
372 0.07
373 0.12
374 0.15
375 0.17
376 0.17
377 0.2
378 0.21
379 0.21
380 0.23
381 0.25
382 0.3
383 0.33
384 0.42
385 0.49
386 0.51
387 0.55
388 0.56
389 0.53
390 0.51
391 0.53
392 0.52
393 0.48
394 0.5
395 0.52
396 0.51
397 0.46
398 0.4
399 0.34
400 0.28
401 0.23
402 0.22
403 0.23
404 0.26
405 0.26
406 0.28
407 0.28
408 0.28
409 0.29
410 0.26
411 0.2
412 0.15
413 0.15
414 0.14
415 0.14
416 0.12
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.13
421 0.12
422 0.13
423 0.14
424 0.16
425 0.15
426 0.18
427 0.19
428 0.19
429 0.26
430 0.26
431 0.28
432 0.27
433 0.31
434 0.32
435 0.33
436 0.37
437 0.36
438 0.38
439 0.41
440 0.4
441 0.38
442 0.41
443 0.46
444 0.47
445 0.52
446 0.57
447 0.57
448 0.61
449 0.67
450 0.72
451 0.74
452 0.76
453 0.75
454 0.78
455 0.8
456 0.84
457 0.85
458 0.78
459 0.69
460 0.6
461 0.51
462 0.41
463 0.34
464 0.23
465 0.14
466 0.1
467 0.08
468 0.07
469 0.06
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.09
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.08
483 0.09
484 0.1
485 0.1
486 0.08
487 0.1
488 0.15
489 0.15
490 0.19
491 0.2
492 0.2
493 0.21
494 0.22
495 0.21
496 0.15
497 0.15
498 0.15
499 0.12
500 0.13
501 0.12
502 0.17
503 0.19
504 0.22
505 0.23
506 0.24
507 0.26
508 0.25
509 0.28
510 0.23
511 0.21
512 0.21
513 0.2
514 0.16
515 0.14
516 0.12
517 0.1
518 0.09
519 0.09
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.07
531 0.07
532 0.08
533 0.09
534 0.09
535 0.1
536 0.16
537 0.23
538 0.28
539 0.33
540 0.36
541 0.38
542 0.39
543 0.43
544 0.43
545 0.39
546 0.38
547 0.33
548 0.3
549 0.28
550 0.27
551 0.24
552 0.21
553 0.2
554 0.16
555 0.2
556 0.24
557 0.24
558 0.24
559 0.31
560 0.35
561 0.35
562 0.37
563 0.34
564 0.32
565 0.33
566 0.34
567 0.26
568 0.22
569 0.23
570 0.22
571 0.21
572 0.17
573 0.15
574 0.14
575 0.14
576 0.12
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.12
581 0.12
582 0.12
583 0.13
584 0.12
585 0.12
586 0.13
587 0.15
588 0.17
589 0.19
590 0.2
591 0.21
592 0.21
593 0.25
594 0.32
595 0.34
596 0.35
597 0.38
598 0.43
599 0.43
600 0.47
601 0.43
602 0.35
603 0.33
604 0.29
605 0.29
606 0.32
607 0.32
608 0.28
609 0.28
610 0.28
611 0.27
612 0.31
613 0.33
614 0.27
615 0.3
616 0.35
617 0.37
618 0.41
619 0.44
620 0.45
621 0.41
622 0.41
623 0.39
624 0.36
625 0.38
626 0.4
627 0.36
628 0.35
629 0.33
630 0.32
631 0.31
632 0.29