Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HGC3

Protein Details
Accession A0A397HGC3    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAKARTKKRTHVRAQNASATAHydrophilic
360-398EVKSLDKNWAKKKKEKEERKKQQRENIEKKKQEKAKARABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
225-246GVSKRIRRLDPKEIRSREKRKS
368-401WAKKKKEKEERKKQQRENIEKKKQEKAKARAEGK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAKARTKKRTHVRAQNASATAKSSMSKTPKSMVIRVGAAQVGSSVSQLVKDVRLMMEPDTAVRLKERKSNRLRDYTAMTGPLGVTHLMLFSKSATGNTNMRLALTPRGPTLHFKVENYSLCRDVEKALKRPRGGGQDHKTPPLLVMNNFNSPNATEDSKVPKRLESLTTTIFQSLFPPINPQATPLSSIRRVMLLNRELTAGSDEEEDSYVLNLRHYAISTKKTGVSKRIRRLDPKEIRSREKRKSAVPNLGKLEDAADYLLDPSAAGYTSASETELDTDAEVEIAESTTKKVLTKRELQRMKSGEKAKAQKANAPEVEKRAVKLVELGPRMKLRLIKVEEGLCEGRVMWHDYIQKSEEEVKSLDKNWAKKKKEKEERKKQQRENIEKKKQEKAKARAEGKGGEDDEDEEDVDMDDEDEWLSDDLEGDEEGIQAQDDDDDDESMEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.85
3 0.78
4 0.69
5 0.59
6 0.51
7 0.42
8 0.33
9 0.28
10 0.23
11 0.27
12 0.33
13 0.37
14 0.38
15 0.41
16 0.47
17 0.51
18 0.53
19 0.5
20 0.46
21 0.44
22 0.41
23 0.39
24 0.32
25 0.26
26 0.21
27 0.16
28 0.12
29 0.1
30 0.09
31 0.08
32 0.07
33 0.08
34 0.1
35 0.11
36 0.12
37 0.13
38 0.15
39 0.14
40 0.17
41 0.18
42 0.18
43 0.19
44 0.17
45 0.17
46 0.19
47 0.19
48 0.17
49 0.21
50 0.24
51 0.24
52 0.33
53 0.4
54 0.47
55 0.56
56 0.66
57 0.7
58 0.75
59 0.75
60 0.71
61 0.69
62 0.64
63 0.56
64 0.47
65 0.38
66 0.29
67 0.25
68 0.21
69 0.16
70 0.1
71 0.08
72 0.07
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.09
79 0.09
80 0.11
81 0.12
82 0.16
83 0.19
84 0.21
85 0.24
86 0.21
87 0.22
88 0.22
89 0.21
90 0.23
91 0.23
92 0.22
93 0.2
94 0.22
95 0.23
96 0.26
97 0.3
98 0.33
99 0.32
100 0.32
101 0.35
102 0.39
103 0.43
104 0.42
105 0.4
106 0.32
107 0.31
108 0.31
109 0.27
110 0.24
111 0.27
112 0.3
113 0.36
114 0.43
115 0.49
116 0.49
117 0.52
118 0.55
119 0.55
120 0.54
121 0.56
122 0.52
123 0.56
124 0.58
125 0.57
126 0.51
127 0.42
128 0.38
129 0.34
130 0.3
131 0.21
132 0.26
133 0.26
134 0.3
135 0.31
136 0.29
137 0.24
138 0.21
139 0.22
140 0.18
141 0.16
142 0.13
143 0.16
144 0.25
145 0.29
146 0.34
147 0.32
148 0.31
149 0.32
150 0.34
151 0.34
152 0.3
153 0.29
154 0.26
155 0.27
156 0.26
157 0.24
158 0.21
159 0.18
160 0.15
161 0.14
162 0.12
163 0.11
164 0.14
165 0.15
166 0.17
167 0.17
168 0.18
169 0.17
170 0.17
171 0.2
172 0.17
173 0.21
174 0.2
175 0.21
176 0.19
177 0.18
178 0.18
179 0.18
180 0.23
181 0.21
182 0.21
183 0.2
184 0.21
185 0.19
186 0.19
187 0.18
188 0.11
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.11
205 0.12
206 0.15
207 0.16
208 0.17
209 0.2
210 0.24
211 0.26
212 0.33
213 0.4
214 0.46
215 0.53
216 0.61
217 0.62
218 0.66
219 0.7
220 0.72
221 0.71
222 0.7
223 0.7
224 0.67
225 0.7
226 0.72
227 0.74
228 0.71
229 0.7
230 0.66
231 0.64
232 0.69
233 0.68
234 0.68
235 0.64
236 0.62
237 0.56
238 0.53
239 0.45
240 0.35
241 0.29
242 0.19
243 0.15
244 0.09
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.03
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.07
277 0.08
278 0.1
279 0.14
280 0.21
281 0.28
282 0.37
283 0.45
284 0.55
285 0.61
286 0.62
287 0.66
288 0.64
289 0.61
290 0.59
291 0.56
292 0.51
293 0.52
294 0.57
295 0.55
296 0.57
297 0.55
298 0.51
299 0.5
300 0.52
301 0.48
302 0.46
303 0.42
304 0.39
305 0.43
306 0.39
307 0.36
308 0.32
309 0.28
310 0.23
311 0.26
312 0.26
313 0.28
314 0.31
315 0.31
316 0.3
317 0.32
318 0.33
319 0.3
320 0.3
321 0.25
322 0.31
323 0.34
324 0.34
325 0.36
326 0.37
327 0.35
328 0.35
329 0.33
330 0.24
331 0.19
332 0.16
333 0.14
334 0.14
335 0.18
336 0.14
337 0.19
338 0.24
339 0.25
340 0.28
341 0.28
342 0.26
343 0.25
344 0.32
345 0.27
346 0.25
347 0.25
348 0.26
349 0.28
350 0.29
351 0.34
352 0.32
353 0.39
354 0.47
355 0.56
356 0.59
357 0.64
358 0.74
359 0.77
360 0.83
361 0.86
362 0.87
363 0.89
364 0.93
365 0.96
366 0.96
367 0.94
368 0.92
369 0.92
370 0.91
371 0.91
372 0.91
373 0.9
374 0.88
375 0.85
376 0.86
377 0.82
378 0.81
379 0.81
380 0.79
381 0.79
382 0.8
383 0.79
384 0.75
385 0.71
386 0.65
387 0.58
388 0.55
389 0.45
390 0.37
391 0.32
392 0.29
393 0.26
394 0.22
395 0.19
396 0.12
397 0.12
398 0.11
399 0.1
400 0.08
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.08
425 0.09
426 0.09