Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8PDA7

Protein Details
Accession B8PDA7    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
274-298IPPPLSRLRVKRQGKAKQRRWGRSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-297KERKEKERQMKAVPIPPPLSRLRVKRQGKAKQRRWGRS
Subcellular Location(s) mito 12, cyto 8, mito_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG ppl:POSPLDRAFT_92122  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSSTLPFLDQFNAPSTKGGKRISIYTPKHTHVGDSTLLTLLLKNPTDVFNKLKAHNPEATNATDRAALEVYLSACRDYDEAVKAADEAIDHHKRLLCQQDDRVLTELIRLNNLKVAHRFQPLLSRSIRARHNKFIPCAIPNAYLPLPAPLPTSAFRRPLIPSPFLQAMPRSTTIPADWQPNPGWTPKGSCRRCGSSRHWVRDCPDVQCAGCGKEAPGHLERECGTRPMKRHVSAPPEEPARRVGVVVDNVFLEGIINEAKERKEKERQMKAVPIPPPLSRLRVKRQGKAKQRRWGRST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.29
4 0.35
5 0.36
6 0.36
7 0.37
8 0.41
9 0.47
10 0.53
11 0.53
12 0.56
13 0.59
14 0.57
15 0.59
16 0.53
17 0.48
18 0.4
19 0.39
20 0.31
21 0.26
22 0.25
23 0.2
24 0.2
25 0.17
26 0.15
27 0.14
28 0.16
29 0.15
30 0.15
31 0.15
32 0.19
33 0.23
34 0.25
35 0.27
36 0.3
37 0.35
38 0.36
39 0.43
40 0.44
41 0.46
42 0.49
43 0.46
44 0.43
45 0.41
46 0.42
47 0.37
48 0.32
49 0.28
50 0.23
51 0.22
52 0.19
53 0.17
54 0.13
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.1
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.12
72 0.11
73 0.08
74 0.08
75 0.15
76 0.18
77 0.18
78 0.21
79 0.22
80 0.23
81 0.27
82 0.34
83 0.3
84 0.31
85 0.34
86 0.39
87 0.39
88 0.4
89 0.38
90 0.3
91 0.25
92 0.25
93 0.25
94 0.18
95 0.2
96 0.18
97 0.16
98 0.19
99 0.21
100 0.19
101 0.19
102 0.22
103 0.23
104 0.25
105 0.26
106 0.23
107 0.3
108 0.29
109 0.3
110 0.27
111 0.26
112 0.25
113 0.3
114 0.37
115 0.38
116 0.41
117 0.45
118 0.52
119 0.53
120 0.53
121 0.51
122 0.46
123 0.38
124 0.36
125 0.3
126 0.24
127 0.19
128 0.21
129 0.17
130 0.15
131 0.14
132 0.12
133 0.11
134 0.09
135 0.1
136 0.07
137 0.09
138 0.11
139 0.15
140 0.17
141 0.2
142 0.2
143 0.21
144 0.23
145 0.28
146 0.3
147 0.28
148 0.26
149 0.27
150 0.28
151 0.26
152 0.25
153 0.19
154 0.17
155 0.18
156 0.18
157 0.16
158 0.14
159 0.15
160 0.14
161 0.17
162 0.18
163 0.2
164 0.19
165 0.21
166 0.22
167 0.23
168 0.24
169 0.21
170 0.21
171 0.16
172 0.21
173 0.26
174 0.36
175 0.36
176 0.41
177 0.45
178 0.5
179 0.54
180 0.56
181 0.54
182 0.55
183 0.62
184 0.65
185 0.63
186 0.6
187 0.58
188 0.6
189 0.55
190 0.46
191 0.4
192 0.33
193 0.29
194 0.29
195 0.28
196 0.2
197 0.19
198 0.16
199 0.14
200 0.16
201 0.17
202 0.19
203 0.2
204 0.22
205 0.22
206 0.24
207 0.24
208 0.24
209 0.25
210 0.24
211 0.25
212 0.26
213 0.3
214 0.37
215 0.44
216 0.42
217 0.46
218 0.49
219 0.54
220 0.53
221 0.53
222 0.5
223 0.5
224 0.49
225 0.45
226 0.4
227 0.34
228 0.3
229 0.27
230 0.22
231 0.19
232 0.23
233 0.22
234 0.21
235 0.17
236 0.17
237 0.17
238 0.15
239 0.1
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.1
246 0.13
247 0.19
248 0.24
249 0.3
250 0.4
251 0.5
252 0.59
253 0.67
254 0.73
255 0.74
256 0.78
257 0.78
258 0.75
259 0.69
260 0.64
261 0.57
262 0.51
263 0.49
264 0.44
265 0.43
266 0.43
267 0.48
268 0.52
269 0.59
270 0.65
271 0.68
272 0.75
273 0.79
274 0.83
275 0.85
276 0.85
277 0.85
278 0.88