Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HDQ4

Protein Details
Accession A0A397HDQ4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MSHVDHQSPRSKRRKIDHGNETENVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 10.5, cyto 7, mito 4, plas 1, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR032436  NopRA1_C  
IPR021714  Npa1_N  
IPR039844  URB1  
Pfam View protein in Pfam  
PF16201  NopRA1  
PF11707  Npa1  
Amino Acid Sequences MSHVDHQSPRSKRRKIDHGNETENVAPITSHTQLCSLLAFQQNVVESKHGIRQFKEFLTSIGQTEKEGEKAKNFRILKAYCDTQISRNGAEDEAICFPDLIQTWSFADSSNNESLLTVVPSVLALFLKTISTQLDLRDFGLALCKHLMHKDQLRLFNRGLTALKSKEHLISPCLRLLTEIVSFDGGAVARQVYMARYITFKRLDVFLTPNKAQLEDAGESQKSTLRRNAQKYVLANLRVQHVNAKSDFIEQHKVIKAFLEFVRKDPRDIVLEIIKSIDKDIVQDTALPRSAKTKFFSRWNLERFVTLYGYDRESEEPNPAGVSIADEVHKILMNICTDSALGVLLPETGWYPNRTDPESLPTEDDSSIEMGLDSAVYVDKYKGSVPVRNGTLSYLIQALRPDMDRLQIELLVAIFKKAPELVADYFTKKTMFISDPKPTSSWMAESALLFSIVSLPIPPNCGWNDKLPAMPPPVSVVIENILPRPLTQKIMSRCLNLNAEIVTLFAVRILTIAFNKLRAALKIFNADHGSNQPFWTQAAGKLVAEFCRRCPVVKDIVVLFRRTGKEDLQQQEAVSELLACFYEIVPDAAFDENFDVSLVLVDILKRLESSDLQAEDAESLLSQLQNVLKIAQLSASMRWWQQPGSMQYSAFTSILKVLIETSDNDSSKEIEKLLTTILTENSIIQSSSAFFSLRSSFDATESESIHHQLAFFDNCACRIAKKPVHYDDLLSSLTEGENKPTSLIVAAITEQWPFVAKNGNAAAELAVSTWIARVLGQLKQAGEDPKTLKAARDSVLQTVESKQLKSTLKKALKDTDEAANNDGRSQDGVTRSEAHAQKDKAVQVDLREIFGTLPTESKTHNELHKWEKEELEVAVEQGRISDLMLCLCSEHEEVRRQAFANLNRFMAKLRESKYAEWRSVYILTGELLETVKQIGLETPVPWIVGECATCCLSVLTDPMHKLYGKVNKFLQKAPAWEVEKIPSYWIDKILLHEPELDDGYFEETSWLLDLLIEGLRTETDMDIYRRANVFERVLSFYDSPSVGASARRKILHLLYRSTQVGGSTTLITRAGVVSWIQTQIPVVNAKEAATFAAMADTLRQAADQDRVTKWSGGAVAQVIEHIVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.84
3 0.86
4 0.87
5 0.86
6 0.85
7 0.77
8 0.71
9 0.61
10 0.52
11 0.41
12 0.31
13 0.21
14 0.16
15 0.19
16 0.19
17 0.19
18 0.18
19 0.19
20 0.2
21 0.21
22 0.2
23 0.16
24 0.19
25 0.23
26 0.23
27 0.21
28 0.24
29 0.26
30 0.26
31 0.27
32 0.22
33 0.19
34 0.22
35 0.29
36 0.32
37 0.34
38 0.34
39 0.39
40 0.43
41 0.44
42 0.46
43 0.39
44 0.35
45 0.37
46 0.36
47 0.31
48 0.29
49 0.27
50 0.23
51 0.26
52 0.26
53 0.25
54 0.29
55 0.3
56 0.35
57 0.41
58 0.45
59 0.5
60 0.5
61 0.49
62 0.53
63 0.52
64 0.49
65 0.48
66 0.47
67 0.4
68 0.45
69 0.42
70 0.38
71 0.44
72 0.42
73 0.37
74 0.36
75 0.35
76 0.3
77 0.29
78 0.25
79 0.2
80 0.18
81 0.18
82 0.15
83 0.13
84 0.13
85 0.16
86 0.16
87 0.16
88 0.14
89 0.15
90 0.16
91 0.18
92 0.18
93 0.14
94 0.16
95 0.16
96 0.21
97 0.21
98 0.2
99 0.19
100 0.19
101 0.19
102 0.18
103 0.17
104 0.12
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.09
117 0.09
118 0.12
119 0.13
120 0.15
121 0.19
122 0.19
123 0.2
124 0.2
125 0.19
126 0.16
127 0.23
128 0.2
129 0.18
130 0.19
131 0.19
132 0.2
133 0.25
134 0.29
135 0.29
136 0.36
137 0.43
138 0.48
139 0.57
140 0.59
141 0.59
142 0.56
143 0.52
144 0.45
145 0.39
146 0.34
147 0.28
148 0.31
149 0.29
150 0.29
151 0.27
152 0.29
153 0.29
154 0.32
155 0.3
156 0.29
157 0.33
158 0.35
159 0.36
160 0.34
161 0.3
162 0.27
163 0.26
164 0.24
165 0.19
166 0.16
167 0.14
168 0.14
169 0.14
170 0.12
171 0.13
172 0.09
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.1
181 0.11
182 0.12
183 0.15
184 0.18
185 0.24
186 0.25
187 0.26
188 0.24
189 0.25
190 0.25
191 0.25
192 0.29
193 0.29
194 0.34
195 0.33
196 0.36
197 0.35
198 0.34
199 0.3
200 0.26
201 0.25
202 0.19
203 0.21
204 0.2
205 0.2
206 0.19
207 0.2
208 0.22
209 0.19
210 0.22
211 0.27
212 0.33
213 0.42
214 0.49
215 0.56
216 0.58
217 0.61
218 0.59
219 0.59
220 0.56
221 0.49
222 0.44
223 0.39
224 0.39
225 0.34
226 0.32
227 0.31
228 0.27
229 0.29
230 0.28
231 0.28
232 0.24
233 0.26
234 0.28
235 0.26
236 0.3
237 0.26
238 0.31
239 0.34
240 0.34
241 0.3
242 0.3
243 0.26
244 0.24
245 0.27
246 0.3
247 0.25
248 0.3
249 0.4
250 0.38
251 0.39
252 0.37
253 0.37
254 0.31
255 0.32
256 0.31
257 0.26
258 0.25
259 0.24
260 0.23
261 0.21
262 0.17
263 0.17
264 0.15
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.14
271 0.15
272 0.17
273 0.2
274 0.19
275 0.18
276 0.23
277 0.27
278 0.28
279 0.31
280 0.34
281 0.36
282 0.45
283 0.53
284 0.55
285 0.6
286 0.6
287 0.62
288 0.55
289 0.51
290 0.43
291 0.37
292 0.29
293 0.21
294 0.2
295 0.17
296 0.18
297 0.17
298 0.17
299 0.17
300 0.18
301 0.19
302 0.19
303 0.17
304 0.16
305 0.16
306 0.14
307 0.12
308 0.1
309 0.1
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.11
320 0.11
321 0.12
322 0.11
323 0.11
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.06
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.03
332 0.03
333 0.04
334 0.04
335 0.06
336 0.08
337 0.09
338 0.12
339 0.16
340 0.19
341 0.21
342 0.23
343 0.23
344 0.27
345 0.29
346 0.28
347 0.26
348 0.24
349 0.23
350 0.21
351 0.2
352 0.15
353 0.12
354 0.11
355 0.08
356 0.07
357 0.05
358 0.05
359 0.04
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.14
370 0.16
371 0.21
372 0.24
373 0.29
374 0.31
375 0.31
376 0.3
377 0.25
378 0.25
379 0.2
380 0.17
381 0.14
382 0.12
383 0.13
384 0.13
385 0.12
386 0.11
387 0.12
388 0.12
389 0.11
390 0.14
391 0.13
392 0.14
393 0.14
394 0.13
395 0.12
396 0.11
397 0.1
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.06
407 0.11
408 0.11
409 0.14
410 0.16
411 0.18
412 0.18
413 0.19
414 0.18
415 0.14
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.18
420 0.23
421 0.3
422 0.31
423 0.32
424 0.32
425 0.29
426 0.29
427 0.25
428 0.2
429 0.16
430 0.16
431 0.15
432 0.15
433 0.14
434 0.12
435 0.11
436 0.09
437 0.07
438 0.06
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.09
445 0.09
446 0.11
447 0.12
448 0.16
449 0.17
450 0.19
451 0.23
452 0.21
453 0.22
454 0.21
455 0.22
456 0.23
457 0.22
458 0.18
459 0.17
460 0.17
461 0.16
462 0.15
463 0.12
464 0.1
465 0.11
466 0.11
467 0.09
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.11
472 0.11
473 0.13
474 0.14
475 0.2
476 0.23
477 0.31
478 0.33
479 0.32
480 0.32
481 0.33
482 0.33
483 0.27
484 0.24
485 0.16
486 0.15
487 0.12
488 0.11
489 0.07
490 0.06
491 0.05
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.05
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.11
504 0.12
505 0.12
506 0.15
507 0.15
508 0.16
509 0.22
510 0.22
511 0.21
512 0.23
513 0.22
514 0.2
515 0.21
516 0.21
517 0.15
518 0.16
519 0.14
520 0.12
521 0.12
522 0.13
523 0.1
524 0.09
525 0.12
526 0.12
527 0.11
528 0.12
529 0.12
530 0.13
531 0.16
532 0.15
533 0.13
534 0.19
535 0.19
536 0.19
537 0.21
538 0.22
539 0.26
540 0.27
541 0.27
542 0.23
543 0.29
544 0.3
545 0.28
546 0.24
547 0.22
548 0.21
549 0.22
550 0.22
551 0.18
552 0.21
553 0.28
554 0.31
555 0.3
556 0.29
557 0.27
558 0.25
559 0.23
560 0.18
561 0.1
562 0.08
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.03
569 0.04
570 0.04
571 0.05
572 0.04
573 0.05
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.05
578 0.06
579 0.05
580 0.06
581 0.06
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.03
587 0.03
588 0.03
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.05
594 0.06
595 0.06
596 0.08
597 0.11
598 0.11
599 0.12
600 0.12
601 0.11
602 0.1
603 0.1
604 0.08
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.04
610 0.05
611 0.06
612 0.07
613 0.07
614 0.07
615 0.07
616 0.08
617 0.08
618 0.06
619 0.07
620 0.07
621 0.08
622 0.09
623 0.1
624 0.11
625 0.13
626 0.13
627 0.12
628 0.13
629 0.18
630 0.2
631 0.24
632 0.25
633 0.23
634 0.22
635 0.23
636 0.23
637 0.17
638 0.14
639 0.08
640 0.08
641 0.09
642 0.08
643 0.07
644 0.06
645 0.06
646 0.07
647 0.08
648 0.11
649 0.15
650 0.15
651 0.16
652 0.16
653 0.17
654 0.17
655 0.17
656 0.13
657 0.1
658 0.1
659 0.1
660 0.1
661 0.09
662 0.08
663 0.08
664 0.08
665 0.08
666 0.08
667 0.08
668 0.08
669 0.08
670 0.08
671 0.06
672 0.06
673 0.06
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.06
678 0.09
679 0.11
680 0.11
681 0.12
682 0.14
683 0.13
684 0.14
685 0.15
686 0.15
687 0.15
688 0.15
689 0.14
690 0.12
691 0.13
692 0.13
693 0.12
694 0.11
695 0.09
696 0.11
697 0.11
698 0.11
699 0.12
700 0.12
701 0.12
702 0.14
703 0.13
704 0.12
705 0.16
706 0.24
707 0.27
708 0.32
709 0.39
710 0.42
711 0.47
712 0.46
713 0.43
714 0.36
715 0.34
716 0.29
717 0.21
718 0.16
719 0.12
720 0.11
721 0.12
722 0.11
723 0.11
724 0.12
725 0.12
726 0.12
727 0.12
728 0.12
729 0.09
730 0.1
731 0.07
732 0.06
733 0.06
734 0.07
735 0.08
736 0.07
737 0.07
738 0.07
739 0.08
740 0.07
741 0.08
742 0.14
743 0.13
744 0.18
745 0.19
746 0.2
747 0.19
748 0.19
749 0.18
750 0.11
751 0.11
752 0.06
753 0.05
754 0.04
755 0.04
756 0.04
757 0.04
758 0.04
759 0.04
760 0.06
761 0.09
762 0.11
763 0.13
764 0.15
765 0.15
766 0.16
767 0.19
768 0.2
769 0.19
770 0.21
771 0.21
772 0.22
773 0.25
774 0.25
775 0.24
776 0.24
777 0.27
778 0.24
779 0.28
780 0.27
781 0.25
782 0.27
783 0.25
784 0.23
785 0.22
786 0.27
787 0.23
788 0.22
789 0.2
790 0.25
791 0.31
792 0.33
793 0.38
794 0.41
795 0.46
796 0.5
797 0.54
798 0.55
799 0.53
800 0.51
801 0.48
802 0.44
803 0.42
804 0.39
805 0.36
806 0.31
807 0.28
808 0.25
809 0.23
810 0.16
811 0.13
812 0.12
813 0.14
814 0.15
815 0.16
816 0.18
817 0.21
818 0.21
819 0.29
820 0.31
821 0.31
822 0.35
823 0.35
824 0.37
825 0.38
826 0.39
827 0.33
828 0.32
829 0.29
830 0.24
831 0.31
832 0.28
833 0.24
834 0.22
835 0.21
836 0.18
837 0.18
838 0.17
839 0.1
840 0.11
841 0.11
842 0.12
843 0.13
844 0.15
845 0.17
846 0.21
847 0.26
848 0.29
849 0.33
850 0.41
851 0.46
852 0.48
853 0.47
854 0.43
855 0.39
856 0.36
857 0.31
858 0.26
859 0.19
860 0.15
861 0.15
862 0.14
863 0.12
864 0.11
865 0.11
866 0.07
867 0.08
868 0.09
869 0.07
870 0.08
871 0.09
872 0.09
873 0.09
874 0.09
875 0.11
876 0.11
877 0.13
878 0.17
879 0.23
880 0.26
881 0.28
882 0.3
883 0.28
884 0.31
885 0.35
886 0.38
887 0.39
888 0.39
889 0.38
890 0.37
891 0.36
892 0.34
893 0.3
894 0.28
895 0.27
896 0.29
897 0.36
898 0.38
899 0.43
900 0.52
901 0.55
902 0.53
903 0.48
904 0.45
905 0.4
906 0.38
907 0.34
908 0.24
909 0.17
910 0.15
911 0.13
912 0.12
913 0.09
914 0.08
915 0.08
916 0.07
917 0.07
918 0.08
919 0.07
920 0.07
921 0.08
922 0.1
923 0.12
924 0.12
925 0.13
926 0.13
927 0.13
928 0.13
929 0.12
930 0.11
931 0.11
932 0.12
933 0.1
934 0.12
935 0.13
936 0.13
937 0.13
938 0.12
939 0.1
940 0.11
941 0.12
942 0.13
943 0.16
944 0.17
945 0.19
946 0.21
947 0.21
948 0.21
949 0.27
950 0.33
951 0.32
952 0.37
953 0.42
954 0.48
955 0.51
956 0.53
957 0.53
958 0.47
959 0.48
960 0.48
961 0.49
962 0.45
963 0.44
964 0.43
965 0.39
966 0.38
967 0.34
968 0.31
969 0.26
970 0.26
971 0.26
972 0.26
973 0.25
974 0.22
975 0.26
976 0.31
977 0.29
978 0.26
979 0.27
980 0.25
981 0.25
982 0.25
983 0.21
984 0.15
985 0.13
986 0.16
987 0.13
988 0.13
989 0.11
990 0.09
991 0.1
992 0.1
993 0.1
994 0.06
995 0.06
996 0.06
997 0.07
998 0.08
999 0.08
1000 0.07
1001 0.07
1002 0.07
1003 0.08
1004 0.09
1005 0.08
1006 0.09
1007 0.14
1008 0.16
1009 0.2
1010 0.21
1011 0.26
1012 0.26
1013 0.28
1014 0.29
1015 0.3
1016 0.31
1017 0.3
1018 0.32
1019 0.31
1020 0.32
1021 0.34
1022 0.3
1023 0.26
1024 0.26
1025 0.23
1026 0.2
1027 0.17
1028 0.16
1029 0.13
1030 0.19
1031 0.24
1032 0.27
1033 0.32
1034 0.33
1035 0.33
1036 0.37
1037 0.44
1038 0.46
1039 0.47
1040 0.47
1041 0.45
1042 0.49
1043 0.49
1044 0.45
1045 0.38
1046 0.3
1047 0.26
1048 0.21
1049 0.2
1050 0.16
1051 0.16
1052 0.16
1053 0.16
1054 0.15
1055 0.14
1056 0.12
1057 0.11
1058 0.1
1059 0.1
1060 0.11
1061 0.13
1062 0.15
1063 0.14
1064 0.14
1065 0.15
1066 0.15
1067 0.17
1068 0.2
1069 0.18
1070 0.2
1071 0.2
1072 0.21
1073 0.21
1074 0.2
1075 0.17
1076 0.14
1077 0.13
1078 0.09
1079 0.1
1080 0.1
1081 0.09
1082 0.1
1083 0.1
1084 0.1
1085 0.1
1086 0.1
1087 0.1
1088 0.13
1089 0.19
1090 0.21
1091 0.25
1092 0.27
1093 0.3
1094 0.33
1095 0.33
1096 0.3
1097 0.28
1098 0.26
1099 0.21
1100 0.22
1101 0.2
1102 0.17
1103 0.16
1104 0.16