Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397H878

Protein Details
Accession A0A397H878    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-94ATPRPLVSRAKRTREGKKRPLNSFIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-87RAKRTREGKKR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006856  MATalpha_HMGbox  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008301  F:DNA binding, bending  
GO:0045895  P:positive regulation of mating-type specific transcription, DNA-templated  
Pfam View protein in Pfam  
PF04769  MATalpha_HMGbox  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51325  ALPHA_BOX  
Amino Acid Sequences MDAAISPLERAFNTFLMTMPAEQLEELLQYLQDTKAQENNALQLADATPAAAANYALDNHHGAAVPVAATPRPLVSRAKRTREGKKRPLNSFIAFRSFYSVIFPDLTQKAKSGILRFLWQNDPFKAKWAILAKAYSIIRDDHGTEGSLDRFLELTTKFIGIIEPTRYLDAMGWQLNFDDQGQYTMAKVKIITIPEADVATNYSVDDVVKHCYETGYVSEKPRKHTAGNRNNTSTMAFAAQPTFVVKAENGIQITGDDATVTDDAFATPEMETPPPEETNATQTPDPIEAEPVVDDYALDFVNVPGMPDGQQLELALFQGNDFDLDNMEHPFLNEINALPLFDPAIINPMMMDYDPLVEPPFGVFDIDQYINV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.19
4 0.2
5 0.17
6 0.16
7 0.15
8 0.14
9 0.13
10 0.13
11 0.1
12 0.09
13 0.09
14 0.08
15 0.07
16 0.07
17 0.09
18 0.1
19 0.12
20 0.14
21 0.16
22 0.21
23 0.22
24 0.26
25 0.26
26 0.28
27 0.28
28 0.26
29 0.23
30 0.18
31 0.18
32 0.15
33 0.13
34 0.1
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.06
39 0.05
40 0.05
41 0.06
42 0.07
43 0.08
44 0.09
45 0.1
46 0.1
47 0.12
48 0.11
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.1
59 0.11
60 0.14
61 0.21
62 0.28
63 0.39
64 0.48
65 0.56
66 0.62
67 0.69
68 0.78
69 0.8
70 0.84
71 0.83
72 0.84
73 0.85
74 0.82
75 0.81
76 0.77
77 0.69
78 0.65
79 0.57
80 0.52
81 0.44
82 0.38
83 0.37
84 0.31
85 0.27
86 0.24
87 0.21
88 0.17
89 0.17
90 0.17
91 0.17
92 0.19
93 0.22
94 0.19
95 0.19
96 0.19
97 0.22
98 0.25
99 0.22
100 0.24
101 0.24
102 0.27
103 0.28
104 0.3
105 0.32
106 0.33
107 0.34
108 0.31
109 0.34
110 0.3
111 0.33
112 0.32
113 0.26
114 0.27
115 0.27
116 0.27
117 0.25
118 0.25
119 0.21
120 0.24
121 0.24
122 0.19
123 0.17
124 0.15
125 0.14
126 0.14
127 0.15
128 0.11
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.12
133 0.11
134 0.1
135 0.09
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.07
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.08
165 0.06
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.11
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.13
177 0.13
178 0.14
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.09
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.13
203 0.16
204 0.21
205 0.28
206 0.3
207 0.35
208 0.39
209 0.39
210 0.39
211 0.46
212 0.52
213 0.56
214 0.63
215 0.63
216 0.6
217 0.58
218 0.54
219 0.45
220 0.35
221 0.25
222 0.17
223 0.12
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.09
234 0.12
235 0.14
236 0.13
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.12
241 0.1
242 0.07
243 0.04
244 0.04
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.07
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.12
260 0.15
261 0.14
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.21
266 0.23
267 0.24
268 0.21
269 0.21
270 0.22
271 0.22
272 0.23
273 0.16
274 0.15
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.12
279 0.1
280 0.08
281 0.08
282 0.06
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.13
296 0.1
297 0.11
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.12
321 0.11
322 0.14
323 0.14
324 0.14
325 0.12
326 0.13
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.07
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.1
338 0.11
339 0.07
340 0.1
341 0.1
342 0.11
343 0.12
344 0.11
345 0.12
346 0.11
347 0.12
348 0.1
349 0.12
350 0.11
351 0.1
352 0.16