Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HSS0

Protein Details
Accession A0A397HSS0    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-38GMVPSHRSKHRHVRRGNPIDSAHydrophilic
110-132SASETDSKKKKKQNQNNSSNMAEHydrophilic
267-290DGAGGKKSKGKGKRPSRRDSDATEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-284GGKKSKGKGKRPSRR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MADHSDNSSDRLDSSAGMVPSHRSKHRHVRRGNPIDSAAHHTSSSLTAQRSSQPQQLGPKPSVPAQLGGSGHVPGELAPPWPFNPQETALIRSGYIPAFKPEVPAAQEDSASETDSKKKKKQNQNNSSNMAEPRARAARHKGQMNFASELRLLLLAYGDPSPHPSFPSEPLPETVRVLDEIVTDFVLEMCHNAAQYASYSRRQKIKVDDFRFALRRDPNKLGRVQELLRMERELKEARKAFDQNDDQVGNLKDAGKKGLEELGEGADGAGGKKSKGKGKRPSRRDSDATEDTVLKKRKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.19
3 0.17
4 0.17
5 0.18
6 0.21
7 0.27
8 0.33
9 0.37
10 0.37
11 0.45
12 0.56
13 0.66
14 0.71
15 0.73
16 0.77
17 0.82
18 0.87
19 0.82
20 0.75
21 0.67
22 0.6
23 0.53
24 0.51
25 0.42
26 0.34
27 0.3
28 0.26
29 0.24
30 0.23
31 0.24
32 0.2
33 0.18
34 0.19
35 0.2
36 0.25
37 0.31
38 0.33
39 0.35
40 0.34
41 0.37
42 0.45
43 0.5
44 0.5
45 0.46
46 0.45
47 0.42
48 0.42
49 0.43
50 0.35
51 0.3
52 0.26
53 0.28
54 0.25
55 0.24
56 0.22
57 0.17
58 0.15
59 0.13
60 0.11
61 0.07
62 0.09
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.13
68 0.16
69 0.16
70 0.16
71 0.19
72 0.19
73 0.25
74 0.25
75 0.27
76 0.25
77 0.25
78 0.24
79 0.21
80 0.2
81 0.15
82 0.14
83 0.11
84 0.12
85 0.15
86 0.15
87 0.16
88 0.15
89 0.17
90 0.17
91 0.18
92 0.18
93 0.16
94 0.16
95 0.14
96 0.16
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.11
101 0.18
102 0.25
103 0.32
104 0.36
105 0.45
106 0.54
107 0.64
108 0.74
109 0.78
110 0.82
111 0.86
112 0.85
113 0.81
114 0.72
115 0.64
116 0.53
117 0.45
118 0.34
119 0.25
120 0.21
121 0.21
122 0.2
123 0.2
124 0.27
125 0.32
126 0.37
127 0.42
128 0.4
129 0.42
130 0.45
131 0.45
132 0.4
133 0.32
134 0.28
135 0.22
136 0.2
137 0.14
138 0.11
139 0.07
140 0.05
141 0.05
142 0.03
143 0.04
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.14
153 0.17
154 0.23
155 0.21
156 0.2
157 0.22
158 0.24
159 0.23
160 0.22
161 0.19
162 0.14
163 0.12
164 0.12
165 0.1
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.11
184 0.14
185 0.21
186 0.25
187 0.3
188 0.37
189 0.39
190 0.43
191 0.49
192 0.56
193 0.6
194 0.6
195 0.61
196 0.56
197 0.6
198 0.58
199 0.49
200 0.45
201 0.42
202 0.43
203 0.44
204 0.5
205 0.5
206 0.52
207 0.55
208 0.52
209 0.48
210 0.47
211 0.42
212 0.4
213 0.38
214 0.35
215 0.32
216 0.31
217 0.29
218 0.26
219 0.3
220 0.3
221 0.28
222 0.35
223 0.37
224 0.37
225 0.43
226 0.44
227 0.41
228 0.45
229 0.46
230 0.4
231 0.42
232 0.4
233 0.33
234 0.35
235 0.34
236 0.25
237 0.22
238 0.22
239 0.19
240 0.2
241 0.23
242 0.19
243 0.18
244 0.19
245 0.22
246 0.19
247 0.17
248 0.17
249 0.15
250 0.14
251 0.14
252 0.12
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.1
257 0.09
258 0.1
259 0.16
260 0.21
261 0.29
262 0.39
263 0.49
264 0.56
265 0.67
266 0.78
267 0.82
268 0.87
269 0.87
270 0.86
271 0.82
272 0.78
273 0.76
274 0.7
275 0.64
276 0.57
277 0.51
278 0.46
279 0.49