Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3R7J8I7

Protein Details
Accession A0A3R7J8I7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-38TEESEEKSPRPAKKPRRNSSSVDDRAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-29RPAKKPRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024526  DUF3807  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12720  DUF3807  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MALVQYSDTESDTEESEEKSPRPAKKPRRNSSSVDDRASSLPPLPTAFHDLYASSTRVSVRDDPSLHGGRKRVIPHVEGNWPTHIYLEWYPSKGELAVLDDILSQVEAKLGGHAREIHSLLRSDLGVQLPLHISLSRPVVLRTEQRQPFLDMFQTALQESTVPAFSVNPYSLDWVSNYERTRWFLVLRVTKPANDNLNRLLGLSNRFLAHFGQPPLYADTQHEDLSHCFHVSLAWSLTEPSPEKKKQIEAIDLRGLRSLVIRFDCVKAKIGNNISSIPLSTEDLQAFQAKHFPSSQQVTSVNYTYSETVDEEFDDDDGLGYYPDGVKRTLTDEQIRIFRHSEIHSLLRAKQLREEELAEEARELTPVGRVAEGVTEGQERTPSGVPDGQQEKIPEAKEDTGLEPNEAQDSSIMEQSNETGSRGRLDYDDDATVQWEAHSRGSNFAGRRIISYDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.2
4 0.24
5 0.23
6 0.31
7 0.37
8 0.43
9 0.51
10 0.6
11 0.67
12 0.74
13 0.84
14 0.86
15 0.88
16 0.86
17 0.83
18 0.82
19 0.82
20 0.78
21 0.71
22 0.62
23 0.55
24 0.51
25 0.46
26 0.38
27 0.3
28 0.24
29 0.21
30 0.22
31 0.2
32 0.21
33 0.26
34 0.26
35 0.23
36 0.23
37 0.21
38 0.24
39 0.26
40 0.24
41 0.17
42 0.18
43 0.18
44 0.18
45 0.23
46 0.26
47 0.26
48 0.32
49 0.33
50 0.34
51 0.4
52 0.45
53 0.44
54 0.42
55 0.41
56 0.38
57 0.43
58 0.44
59 0.44
60 0.42
61 0.43
62 0.44
63 0.46
64 0.5
65 0.47
66 0.46
67 0.42
68 0.38
69 0.34
70 0.29
71 0.24
72 0.2
73 0.19
74 0.23
75 0.23
76 0.23
77 0.23
78 0.23
79 0.24
80 0.19
81 0.18
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.05
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.09
97 0.11
98 0.11
99 0.13
100 0.16
101 0.18
102 0.21
103 0.22
104 0.2
105 0.2
106 0.21
107 0.19
108 0.17
109 0.15
110 0.13
111 0.14
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.14
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.13
123 0.14
124 0.14
125 0.14
126 0.16
127 0.19
128 0.25
129 0.26
130 0.34
131 0.35
132 0.37
133 0.38
134 0.39
135 0.37
136 0.33
137 0.3
138 0.2
139 0.19
140 0.17
141 0.16
142 0.13
143 0.12
144 0.1
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.14
162 0.16
163 0.2
164 0.21
165 0.21
166 0.23
167 0.25
168 0.27
169 0.24
170 0.22
171 0.21
172 0.27
173 0.31
174 0.3
175 0.34
176 0.32
177 0.33
178 0.34
179 0.35
180 0.35
181 0.3
182 0.31
183 0.27
184 0.28
185 0.26
186 0.25
187 0.21
188 0.15
189 0.16
190 0.14
191 0.14
192 0.12
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.14
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.16
202 0.18
203 0.17
204 0.15
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.14
209 0.13
210 0.11
211 0.11
212 0.14
213 0.14
214 0.11
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.11
227 0.13
228 0.2
229 0.21
230 0.25
231 0.26
232 0.3
233 0.33
234 0.35
235 0.4
236 0.35
237 0.38
238 0.41
239 0.39
240 0.36
241 0.31
242 0.27
243 0.19
244 0.18
245 0.14
246 0.11
247 0.11
248 0.13
249 0.14
250 0.16
251 0.19
252 0.18
253 0.21
254 0.2
255 0.21
256 0.26
257 0.28
258 0.29
259 0.27
260 0.27
261 0.25
262 0.22
263 0.21
264 0.15
265 0.13
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.14
273 0.14
274 0.12
275 0.16
276 0.15
277 0.16
278 0.16
279 0.16
280 0.19
281 0.23
282 0.23
283 0.22
284 0.23
285 0.24
286 0.26
287 0.26
288 0.21
289 0.17
290 0.18
291 0.15
292 0.14
293 0.12
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.04
308 0.05
309 0.06
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.16
316 0.2
317 0.23
318 0.27
319 0.28
320 0.32
321 0.37
322 0.38
323 0.35
324 0.33
325 0.3
326 0.29
327 0.28
328 0.28
329 0.26
330 0.27
331 0.28
332 0.29
333 0.3
334 0.34
335 0.36
336 0.33
337 0.35
338 0.37
339 0.36
340 0.36
341 0.36
342 0.28
343 0.29
344 0.29
345 0.23
346 0.2
347 0.18
348 0.15
349 0.13
350 0.12
351 0.08
352 0.09
353 0.11
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.11
358 0.11
359 0.12
360 0.1
361 0.1
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.12
366 0.11
367 0.14
368 0.16
369 0.15
370 0.17
371 0.2
372 0.2
373 0.27
374 0.3
375 0.28
376 0.29
377 0.29
378 0.29
379 0.3
380 0.31
381 0.25
382 0.26
383 0.27
384 0.26
385 0.28
386 0.27
387 0.29
388 0.28
389 0.27
390 0.24
391 0.22
392 0.22
393 0.2
394 0.17
395 0.12
396 0.13
397 0.14
398 0.17
399 0.16
400 0.14
401 0.15
402 0.16
403 0.2
404 0.18
405 0.17
406 0.16
407 0.17
408 0.21
409 0.21
410 0.22
411 0.18
412 0.23
413 0.25
414 0.26
415 0.26
416 0.23
417 0.22
418 0.22
419 0.21
420 0.16
421 0.13
422 0.15
423 0.15
424 0.18
425 0.24
426 0.24
427 0.28
428 0.32
429 0.38
430 0.35
431 0.4
432 0.42
433 0.36
434 0.37