FuNGI

Q4PDF6

Protein Details

Accession

Q4PDF6

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
27-52	TTYIGSTPAPPRRKRQHNGHLTQGAY	Hydrophilic
120-146	SLTPGQTRWGRPKKRMARPPSSPNARL	Hydrophilic
296-317	NTDLTKKSKRAKKLSDKARPSA	Hydrophilic
633-652	GAGKDTKKNTTQKAKSNETS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
130-138	RPKKRMARP
301-311	KKSKRAKKLSD

Subcellular Location(s)

mito 13, nucl 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000305 GIY-YIG_endonuc IPR035901 GIY-YIG_endonuc_sf IPR027520 Slx1 IPR013083 Znf_RING/FYVE/PHD
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0008821 F:crossover junction DNA endonuclease activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
KEGG	uma:UMAG_01857 -
Pfam	View protein in Pfam PF01541 GIY-YIG
PROSITE	View protein in PROSITE PS50164 GIY_YIG
CDD	cd10455 GIY-YIG_SLX1

Amino Acid Sequences

MPSSVTKHTIPPFYACYFLRSLSTPGTTYIGSTPAPPRRKRQHNGHLTQGAYKTSRARPWEMECIVYGFSSKIAALQFEWAWAKPHLSRHLKFLTTEHSVDGTPKNTSDWAGMSLFPSTSLTPGQTRWGRPKKRMARPPSSPNARLLAMRALLRSEPFCGWGLKLAFFTEWSWLAYQRLDACDPGLVAKSALSTLQNRYSRSGKPLHALYPVAVCDFSGVDGKREPLVHVSEPYRLDAGVAEHPVKKRQTSSRQKPHTEETSAWPETLPRSANLKGLDACMQDFATFPIPQPAAPNTDLTKKSKRAKKLSDKARPSALEDHDAENGVDDDDTEVEVVATDAANGSDLALSRPLYRMRFDDLNMEESEWKRFAESIAANVGASRSTTQAMSEFLHTCVQRHIAAQDARTANTALPAPTSLCSLCSIPIDLSQQLDFVLCPNPHASTLPLISSSSTASHETISECRETGCDSIFHLSCLARSFLEQQLGDQKATASSASTVLPTHGTCPCHRGEHKEPTMWADVVRAMYRRHERFERLIQFLIRSGRSLEQHLHPPLEVEMTVKGSKIKERVKASVKATEDAQVDIGDQRQVISGTTSRTKAALTRKRRQPTTSSVNAIQVDPLARNGSKIDGDGAGKDTKKNTTQKAKSNETSEVIDLT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.37
3	0.35
4	0.32
5	0.31
6	0.29
7	0.26
8	0.27
9	0.26
10	0.28
11	0.25
12	0.25
13	0.26
14	0.23
15	0.22
16	0.2
17	0.19
18	0.17
19	0.2
20	0.27
21	0.34
22	0.43
23	0.47
24	0.56
25	0.64
26	0.75
27	0.81
28	0.83
29	0.85
30	0.87
31	0.87
32	0.86
33	0.81
34	0.72
35	0.68
36	0.59
37	0.53
38	0.43
39	0.4
40	0.38
41	0.39
42	0.44
43	0.44
44	0.47
45	0.49
46	0.54
47	0.6
48	0.55
49	0.49
50	0.43
51	0.4
52	0.34
53	0.28
54	0.22
55	0.13
56	0.11
57	0.1
58	0.09
59	0.1
60	0.1
61	0.12
62	0.11
63	0.15
64	0.15
65	0.18
66	0.2
67	0.18
68	0.2
69	0.2
70	0.23
71	0.23
72	0.31
73	0.37
74	0.45
75	0.46
76	0.5
77	0.56
78	0.54
79	0.52
80	0.47
81	0.44
82	0.39
83	0.39
84	0.32
85	0.27
86	0.25
87	0.27
88	0.28
89	0.23
90	0.2
91	0.19
92	0.2
93	0.19
94	0.2
95	0.19
96	0.16
97	0.17
98	0.16
99	0.16
100	0.15
101	0.15
102	0.14
103	0.13
104	0.13
105	0.1
106	0.11
107	0.12
108	0.13
109	0.14
110	0.15
111	0.23
112	0.27
113	0.33
114	0.42
115	0.51
116	0.57
117	0.63
118	0.73
119	0.75
120	0.8
121	0.85
122	0.83
123	0.83
124	0.83
125	0.85
126	0.84
127	0.82
128	0.74
129	0.67
130	0.61
131	0.52
132	0.44
133	0.37
134	0.3
135	0.24
136	0.23
137	0.2
138	0.18
139	0.18
140	0.19
141	0.18
142	0.17
143	0.15
144	0.16
145	0.17
146	0.16
147	0.15
148	0.19
149	0.2
150	0.18
151	0.18
152	0.17
153	0.15
154	0.16
155	0.16
156	0.13
157	0.13
158	0.12
159	0.13
160	0.13
161	0.14
162	0.13
163	0.15
164	0.15
165	0.17
166	0.16
167	0.16
168	0.15
169	0.14
170	0.14
171	0.13
172	0.11
173	0.09
174	0.08
175	0.08
176	0.08
177	0.07
178	0.08
179	0.09
180	0.11
181	0.15
182	0.24
183	0.27
184	0.28
185	0.32
186	0.36
187	0.36
188	0.39
189	0.41
190	0.35
191	0.37
192	0.38
193	0.37
194	0.35
195	0.33
196	0.28
197	0.23
198	0.21
199	0.17
200	0.14
201	0.11
202	0.09
203	0.08
204	0.08
205	0.11
206	0.11
207	0.12
208	0.13
209	0.14
210	0.16
211	0.16
212	0.16
213	0.15
214	0.18
215	0.18
216	0.21
217	0.21
218	0.23
219	0.24
220	0.24
221	0.21
222	0.17
223	0.15
224	0.12
225	0.13
226	0.11
227	0.13
228	0.14
229	0.17
230	0.18
231	0.23
232	0.25
233	0.24
234	0.28
235	0.35
236	0.44
237	0.52
238	0.62
239	0.68
240	0.75
241	0.78
242	0.76
243	0.73
244	0.68
245	0.6
246	0.51
247	0.45
248	0.44
249	0.39
250	0.35
251	0.28
252	0.24
253	0.22
254	0.23
255	0.18
256	0.12
257	0.16
258	0.17
259	0.2
260	0.2
261	0.21
262	0.18
263	0.19
264	0.2
265	0.16
266	0.15
267	0.13
268	0.12
269	0.1
270	0.09
271	0.09
272	0.1
273	0.09
274	0.09
275	0.13
276	0.13
277	0.13
278	0.15
279	0.15
280	0.16
281	0.17
282	0.19
283	0.16
284	0.22
285	0.25
286	0.27
287	0.33
288	0.37
289	0.45
290	0.49
291	0.57
292	0.6
293	0.68
294	0.74
295	0.77
296	0.8
297	0.81
298	0.8
299	0.74
300	0.7
301	0.6
302	0.52
303	0.48
304	0.39
305	0.33
306	0.29
307	0.28
308	0.23
309	0.22
310	0.19
311	0.13
312	0.11
313	0.07
314	0.06
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.02
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.07
338	0.09
339	0.12
340	0.13
341	0.15
342	0.16
343	0.19
344	0.2
345	0.2
346	0.24
347	0.22
348	0.24
349	0.22
350	0.21
351	0.2
352	0.18
353	0.2
354	0.15
355	0.13
356	0.11
357	0.11
358	0.1
359	0.13
360	0.13
361	0.12
362	0.13
363	0.13
364	0.13
365	0.13
366	0.12
367	0.07
368	0.07
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.08
375	0.1
376	0.1
377	0.12
378	0.12
379	0.13
380	0.17
381	0.16
382	0.16
383	0.16
384	0.17
385	0.15
386	0.15
387	0.14
388	0.17
389	0.19
390	0.19
391	0.24
392	0.23
393	0.22
394	0.22
395	0.23
396	0.16
397	0.16
398	0.16
399	0.1
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.11
405	0.09
406	0.09
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.11
412	0.1
413	0.12
414	0.13
415	0.13
416	0.13
417	0.12
418	0.12
419	0.11
420	0.11
421	0.08
422	0.07
423	0.12
424	0.1
425	0.12
426	0.13
427	0.13
428	0.14
429	0.15
430	0.15
431	0.12
432	0.13
433	0.13
434	0.12
435	0.12
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.1
440	0.11
441	0.12
442	0.12
443	0.12
444	0.12
445	0.13
446	0.15
447	0.15
448	0.14
449	0.13
450	0.13
451	0.13
452	0.14
453	0.13
454	0.12
455	0.11
456	0.11
457	0.16
458	0.16
459	0.16
460	0.16
461	0.15
462	0.15
463	0.16
464	0.16
465	0.11
466	0.12
467	0.16
468	0.17
469	0.21
470	0.2
471	0.2
472	0.27
473	0.28
474	0.27
475	0.23
476	0.2
477	0.16
478	0.17
479	0.16
480	0.08
481	0.08
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.11
488	0.11
489	0.13
490	0.16
491	0.19
492	0.19
493	0.23
494	0.24
495	0.31
496	0.33
497	0.39
498	0.43
499	0.51
500	0.55
501	0.55
502	0.53
503	0.5
504	0.51
505	0.43
506	0.34
507	0.25
508	0.22
509	0.2
510	0.21
511	0.19
512	0.17
513	0.25
514	0.34
515	0.36
516	0.41
517	0.45
518	0.48
519	0.53
520	0.62
521	0.6
522	0.55
523	0.55
524	0.5
525	0.45
526	0.43
527	0.41
528	0.31
529	0.25
530	0.24
531	0.25
532	0.26
533	0.28
534	0.29
535	0.28
536	0.36
537	0.38
538	0.36
539	0.32
540	0.31
541	0.28
542	0.25
543	0.21
544	0.14
545	0.13
546	0.15
547	0.16
548	0.15
549	0.18
550	0.19
551	0.24
552	0.32
553	0.37
554	0.42
555	0.47
556	0.56
557	0.59
558	0.65
559	0.63
560	0.62
561	0.58
562	0.52
563	0.47
564	0.44
565	0.37
566	0.31
567	0.27
568	0.19
569	0.17
570	0.17
571	0.17
572	0.12
573	0.11
574	0.11
575	0.12
576	0.12
577	0.11
578	0.14
579	0.15
580	0.19
581	0.24
582	0.25
583	0.24
584	0.25
585	0.25
586	0.28
587	0.37
588	0.41
589	0.47
590	0.56
591	0.65
592	0.74
593	0.8
594	0.79
595	0.76
596	0.75
597	0.74
598	0.72
599	0.68
600	0.61
601	0.6
602	0.56
603	0.49
604	0.4
605	0.32
606	0.26
607	0.2
608	0.2
609	0.19
610	0.18
611	0.18
612	0.19
613	0.21
614	0.2
615	0.2
616	0.2
617	0.18
618	0.2
619	0.2
620	0.22
621	0.25
622	0.25
623	0.28
624	0.29
625	0.33
626	0.4
627	0.47
628	0.54
629	0.59
630	0.66
631	0.73
632	0.78
633	0.81
634	0.79
635	0.76
636	0.71
637	0.63
638	0.58

Q4PDF6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer