Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397IMC6

Protein Details
Accession A0A397IMC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-141GPSTAPSKQPPVKRHRRKKSEPVPDPVETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-133KQPPVKRHRRKKSE
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MSGRKRRIDDVGNSDNDNRKKQARDSNLGSGANSGQSSSVLNAEAVAKAPKTTAAVPSQTVSGEALGTKTAPAEAEQSRDKGKQRQEQVQEAKEAAKEAAGGIPVNNKESAAGPSTAPSKQPPVKRHRRKKSEPVPDPVETARAKIKNNPRTRVDRACDNCRMSTQTDTHYKLKCDNNADGCAECAKRNMRCTRTFVSGETHTRGETERLNREVERLRAEVNLLRQENMQLRLALARYQRLFPNFNQVVWNPPPADQASNPPRVEQAPPPLLLKRAWNPPSPVQAPLYVQHGAYPQAQQAGQEAGHFQPSQNAPQVVGQGAGHFQPSQNAPQVVGQGAGHFQPSQNAPQAVGQGAGHFQPSENARLTGQGAGSMLPLVNPLGQRAGYPAQNRPLTGPGPFNFPPALKLPPVTQEPANFPPTAKAPPPVQGSAYLAAHPAALSPSSSSSSGSSPYRQSPPDASADNDDTNSRAANNDPALANQVTPPMTEQGGGQPAPTARASLDVVMTGLGNDSLDSFEAEPANPDDANRLYVPTDPNGYNGDNGYNGGNGYNGGIGFNGDNGGIVFNGDNGDNGGNGYNGGIGFNGDNGDNGGNGYNGDNGYNGDNGFNSGIGFNGGIGFNGDNGDNGDNGYNGGNGFNGGIGFNGGIGFNGGNGFNGGIGFNGGIGFNGGIGFNGGIGFNGDNGDNGGIPASDMLMSPADRASLLAYTNEPLDPNAAIAAGPATEPLTIDPSRLNLEPVNYPQVGNPATTLAPWELQNGRNNDGPQQN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.57
4 0.54
5 0.51
6 0.5
7 0.53
8 0.59
9 0.64
10 0.65
11 0.68
12 0.69
13 0.72
14 0.71
15 0.65
16 0.57
17 0.48
18 0.4
19 0.33
20 0.26
21 0.18
22 0.12
23 0.12
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.11
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.13
37 0.14
38 0.16
39 0.18
40 0.22
41 0.25
42 0.28
43 0.29
44 0.3
45 0.29
46 0.26
47 0.24
48 0.19
49 0.14
50 0.11
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.14
61 0.15
62 0.21
63 0.24
64 0.27
65 0.31
66 0.36
67 0.41
68 0.44
69 0.52
70 0.55
71 0.61
72 0.67
73 0.7
74 0.75
75 0.77
76 0.73
77 0.66
78 0.58
79 0.52
80 0.43
81 0.37
82 0.27
83 0.19
84 0.14
85 0.12
86 0.13
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.16
91 0.17
92 0.19
93 0.18
94 0.16
95 0.16
96 0.18
97 0.19
98 0.17
99 0.17
100 0.15
101 0.17
102 0.21
103 0.21
104 0.22
105 0.22
106 0.28
107 0.33
108 0.41
109 0.48
110 0.56
111 0.66
112 0.76
113 0.84
114 0.86
115 0.9
116 0.92
117 0.94
118 0.94
119 0.94
120 0.9
121 0.88
122 0.83
123 0.74
124 0.67
125 0.56
126 0.52
127 0.4
128 0.35
129 0.34
130 0.32
131 0.32
132 0.38
133 0.48
134 0.51
135 0.6
136 0.65
137 0.64
138 0.68
139 0.74
140 0.75
141 0.69
142 0.69
143 0.67
144 0.68
145 0.68
146 0.63
147 0.57
148 0.49
149 0.48
150 0.41
151 0.39
152 0.34
153 0.33
154 0.38
155 0.42
156 0.46
157 0.46
158 0.46
159 0.48
160 0.51
161 0.51
162 0.49
163 0.5
164 0.48
165 0.48
166 0.47
167 0.4
168 0.34
169 0.32
170 0.27
171 0.21
172 0.22
173 0.25
174 0.28
175 0.36
176 0.44
177 0.47
178 0.51
179 0.57
180 0.56
181 0.56
182 0.53
183 0.47
184 0.43
185 0.42
186 0.41
187 0.38
188 0.34
189 0.27
190 0.27
191 0.26
192 0.24
193 0.24
194 0.27
195 0.3
196 0.31
197 0.34
198 0.33
199 0.37
200 0.4
201 0.37
202 0.34
203 0.29
204 0.28
205 0.25
206 0.27
207 0.25
208 0.24
209 0.28
210 0.25
211 0.24
212 0.23
213 0.27
214 0.29
215 0.29
216 0.26
217 0.18
218 0.18
219 0.2
220 0.2
221 0.2
222 0.18
223 0.21
224 0.21
225 0.23
226 0.26
227 0.28
228 0.31
229 0.28
230 0.36
231 0.32
232 0.31
233 0.32
234 0.28
235 0.31
236 0.3
237 0.32
238 0.22
239 0.22
240 0.24
241 0.22
242 0.24
243 0.18
244 0.26
245 0.3
246 0.36
247 0.36
248 0.33
249 0.34
250 0.33
251 0.36
252 0.3
253 0.31
254 0.27
255 0.28
256 0.29
257 0.29
258 0.29
259 0.27
260 0.28
261 0.25
262 0.31
263 0.34
264 0.36
265 0.39
266 0.41
267 0.47
268 0.44
269 0.41
270 0.33
271 0.31
272 0.29
273 0.25
274 0.24
275 0.18
276 0.16
277 0.15
278 0.15
279 0.15
280 0.15
281 0.15
282 0.12
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.14
296 0.15
297 0.18
298 0.2
299 0.2
300 0.18
301 0.19
302 0.2
303 0.14
304 0.14
305 0.11
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.08
313 0.1
314 0.12
315 0.15
316 0.15
317 0.15
318 0.16
319 0.17
320 0.15
321 0.14
322 0.11
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.06
329 0.08
330 0.1
331 0.12
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.16
337 0.13
338 0.13
339 0.1
340 0.07
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.07
347 0.09
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.13
353 0.14
354 0.12
355 0.11
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.05
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.09
372 0.11
373 0.13
374 0.15
375 0.18
376 0.23
377 0.24
378 0.24
379 0.23
380 0.24
381 0.21
382 0.21
383 0.22
384 0.16
385 0.21
386 0.21
387 0.22
388 0.2
389 0.19
390 0.19
391 0.18
392 0.19
393 0.13
394 0.14
395 0.13
396 0.16
397 0.18
398 0.18
399 0.17
400 0.17
401 0.21
402 0.24
403 0.25
404 0.21
405 0.19
406 0.19
407 0.2
408 0.21
409 0.18
410 0.17
411 0.16
412 0.22
413 0.25
414 0.24
415 0.22
416 0.21
417 0.21
418 0.2
419 0.19
420 0.14
421 0.11
422 0.1
423 0.09
424 0.08
425 0.06
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.06
431 0.08
432 0.08
433 0.09
434 0.1
435 0.1
436 0.13
437 0.14
438 0.16
439 0.17
440 0.21
441 0.24
442 0.24
443 0.25
444 0.25
445 0.26
446 0.27
447 0.25
448 0.22
449 0.22
450 0.23
451 0.21
452 0.19
453 0.17
454 0.14
455 0.13
456 0.12
457 0.09
458 0.07
459 0.08
460 0.11
461 0.11
462 0.12
463 0.12
464 0.12
465 0.16
466 0.15
467 0.14
468 0.11
469 0.13
470 0.11
471 0.11
472 0.12
473 0.1
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.13
479 0.13
480 0.12
481 0.12
482 0.12
483 0.14
484 0.14
485 0.12
486 0.08
487 0.11
488 0.11
489 0.1
490 0.1
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.07
495 0.05
496 0.05
497 0.04
498 0.04
499 0.03
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.06
505 0.07
506 0.08
507 0.08
508 0.09
509 0.1
510 0.12
511 0.11
512 0.1
513 0.12
514 0.12
515 0.15
516 0.13
517 0.13
518 0.12
519 0.15
520 0.17
521 0.16
522 0.19
523 0.17
524 0.18
525 0.2
526 0.2
527 0.18
528 0.17
529 0.16
530 0.12
531 0.13
532 0.11
533 0.09
534 0.08
535 0.07
536 0.07
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.05
542 0.05
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.04
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.06
556 0.05
557 0.05
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.07
562 0.07
563 0.06
564 0.06
565 0.06
566 0.06
567 0.05
568 0.06
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.06
573 0.06
574 0.05
575 0.06
576 0.07
577 0.07
578 0.06
579 0.07
580 0.07
581 0.06
582 0.07
583 0.07
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.08
588 0.09
589 0.1
590 0.11
591 0.11
592 0.09
593 0.09
594 0.1
595 0.1
596 0.09
597 0.08
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.05
603 0.07
604 0.06
605 0.06
606 0.07
607 0.07
608 0.07
609 0.08
610 0.08
611 0.06
612 0.08
613 0.09
614 0.08
615 0.09
616 0.09
617 0.08
618 0.09
619 0.09
620 0.08
621 0.07
622 0.08
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.06
627 0.06
628 0.05
629 0.05
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.06
640 0.06
641 0.06
642 0.07
643 0.07
644 0.06
645 0.06
646 0.06
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.04
660 0.05
661 0.05
662 0.05
663 0.05
664 0.05
665 0.05
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.07
670 0.06
671 0.06
672 0.07
673 0.08
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.06
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.06
683 0.07
684 0.09
685 0.09
686 0.1
687 0.1
688 0.1
689 0.09
690 0.1
691 0.1
692 0.1
693 0.1
694 0.11
695 0.12
696 0.13
697 0.14
698 0.15
699 0.14
700 0.13
701 0.14
702 0.12
703 0.11
704 0.1
705 0.09
706 0.08
707 0.08
708 0.08
709 0.06
710 0.06
711 0.06
712 0.06
713 0.06
714 0.07
715 0.08
716 0.13
717 0.13
718 0.14
719 0.15
720 0.17
721 0.21
722 0.21
723 0.23
724 0.2
725 0.23
726 0.28
727 0.31
728 0.35
729 0.31
730 0.31
731 0.29
732 0.34
733 0.32
734 0.27
735 0.23
736 0.19
737 0.19
738 0.18
739 0.2
740 0.15
741 0.16
742 0.16
743 0.21
744 0.23
745 0.28
746 0.36
747 0.37
748 0.39
749 0.42
750 0.42