Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8PJZ9

Protein Details
Accession B8PJZ9    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-47QGEMKPRKTVSDKKKATKRIGKMQKKLGEWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-43GEMKPRKTVSDKKKATKRIGKMQKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ppl:POSPLDRAFT_101281  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
CDD cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MRVQRAEFGHKHEKEGGQGEMKPRKTVSDKKKATKRIGKMQKKLGEWDDEDGFGPAITEEDKVPLVNKARVVVLKHMFTLQELEEDASLLLDLKEDVRDECSSLGEVTNVVLYDKEPEGVMTVKFRDLLGAQACVIKMNGRFFAGRRIEASLYSGKQRFKRSDDDKFDVEGGDEGESRRLDDFAQWLMTEGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.46
3 0.42
4 0.36
5 0.38
6 0.43
7 0.45
8 0.45
9 0.43
10 0.4
11 0.42
12 0.46
13 0.53
14 0.55
15 0.57
16 0.65
17 0.72
18 0.81
19 0.83
20 0.85
21 0.85
22 0.83
23 0.82
24 0.85
25 0.85
26 0.83
27 0.84
28 0.8
29 0.73
30 0.7
31 0.62
32 0.57
33 0.48
34 0.44
35 0.35
36 0.29
37 0.27
38 0.21
39 0.18
40 0.12
41 0.1
42 0.06
43 0.06
44 0.05
45 0.06
46 0.05
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.08
51 0.12
52 0.15
53 0.17
54 0.17
55 0.17
56 0.19
57 0.21
58 0.22
59 0.24
60 0.24
61 0.23
62 0.22
63 0.22
64 0.2
65 0.18
66 0.18
67 0.11
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.05
75 0.04
76 0.04
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.04
82 0.05
83 0.05
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.12
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.11
124 0.13
125 0.15
126 0.16
127 0.16
128 0.17
129 0.18
130 0.27
131 0.27
132 0.26
133 0.24
134 0.27
135 0.26
136 0.25
137 0.28
138 0.24
139 0.22
140 0.28
141 0.3
142 0.33
143 0.38
144 0.46
145 0.48
146 0.48
147 0.57
148 0.58
149 0.65
150 0.68
151 0.68
152 0.62
153 0.58
154 0.54
155 0.43
156 0.36
157 0.26
158 0.18
159 0.14
160 0.12
161 0.11
162 0.14
163 0.14
164 0.15
165 0.15
166 0.14
167 0.14
168 0.16
169 0.18
170 0.17
171 0.19
172 0.17