Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397IAU2

Protein Details
Accession A0A397IAU2    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-65TEEFRRVKRKSKPAAGPSNAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-56KRKSK
Subcellular Location(s) mito 23.5, cyto_mito 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR005336  MPC  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006850  P:mitochondrial pyruvate transmembrane transport  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PF03650  MPC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01717  Sm_B  
Amino Acid Sequences MAAKTQGKMQNLINYRMRITLTDGRQMTGQMLAFDKHMNLVLADTEEFRRVKRKSKPAAGPSNAPLVEAEEKRTLGLTIVRGTHVVSCSVDGPPPAEPSARLGTGVPGAAAAAATLAAGPGISKPAGRGLPVGLGGPVAGVGGPPPPPGGFGGFPPGGFPGAPPPGFAGRGGPPGGPPGFGPPPGFAPQGGPPGAFQPPPGFQPPGQGRGFPPPGFGDFWGPASNFGIPIAAVMDTQKDPEIISGQMTAALTVYSATFMRYALAVSPKNYLLFACHAINFSAQLTQGYRYLNYWNWGGREAQLAEAAKQGKEVTEAGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.45
3 0.44
4 0.41
5 0.33
6 0.35
7 0.37
8 0.34
9 0.4
10 0.39
11 0.37
12 0.37
13 0.36
14 0.29
15 0.24
16 0.21
17 0.14
18 0.16
19 0.15
20 0.16
21 0.16
22 0.15
23 0.13
24 0.14
25 0.12
26 0.11
27 0.11
28 0.1
29 0.11
30 0.11
31 0.12
32 0.12
33 0.16
34 0.17
35 0.18
36 0.26
37 0.28
38 0.37
39 0.45
40 0.54
41 0.6
42 0.7
43 0.78
44 0.79
45 0.86
46 0.81
47 0.76
48 0.67
49 0.64
50 0.54
51 0.44
52 0.34
53 0.27
54 0.29
55 0.25
56 0.27
57 0.21
58 0.22
59 0.21
60 0.22
61 0.18
62 0.13
63 0.16
64 0.14
65 0.15
66 0.16
67 0.16
68 0.16
69 0.17
70 0.18
71 0.15
72 0.14
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.13
77 0.13
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.13
82 0.13
83 0.12
84 0.12
85 0.15
86 0.18
87 0.17
88 0.16
89 0.14
90 0.14
91 0.14
92 0.14
93 0.09
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.03
99 0.02
100 0.02
101 0.02
102 0.02
103 0.02
104 0.02
105 0.02
106 0.02
107 0.02
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.11
118 0.12
119 0.11
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.03
126 0.02
127 0.02
128 0.02
129 0.03
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.12
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.1
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.13
162 0.14
163 0.12
164 0.1
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.15
169 0.13
170 0.16
171 0.18
172 0.18
173 0.13
174 0.14
175 0.16
176 0.19
177 0.18
178 0.15
179 0.13
180 0.15
181 0.17
182 0.14
183 0.13
184 0.12
185 0.13
186 0.15
187 0.18
188 0.18
189 0.17
190 0.26
191 0.28
192 0.32
193 0.31
194 0.3
195 0.28
196 0.34
197 0.39
198 0.29
199 0.28
200 0.23
201 0.25
202 0.25
203 0.24
204 0.2
205 0.16
206 0.18
207 0.18
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.14
212 0.11
213 0.1
214 0.09
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.11
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.11
234 0.11
235 0.09
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.1
250 0.16
251 0.18
252 0.19
253 0.22
254 0.23
255 0.24
256 0.23
257 0.2
258 0.17
259 0.18
260 0.2
261 0.19
262 0.19
263 0.19
264 0.2
265 0.2
266 0.18
267 0.15
268 0.13
269 0.12
270 0.13
271 0.14
272 0.15
273 0.17
274 0.18
275 0.18
276 0.18
277 0.23
278 0.24
279 0.26
280 0.28
281 0.28
282 0.28
283 0.29
284 0.29
285 0.25
286 0.28
287 0.26
288 0.23
289 0.25
290 0.24
291 0.23
292 0.27
293 0.28
294 0.22
295 0.23
296 0.22
297 0.17
298 0.19