FuNGI

A0A397HYZ8

Protein Details

Accession

A0A397HYZ8

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
113-134	ETQFTRPVRLQRRDPRAKTQDM	Hydrophilic
498-520	GTDTSRKKAKSKHPSSQPTPQPT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-19	PKAADPLVRPKKKA
390-413	EKREREARRILGKQVRKALKKREK
466-488	PSGRPKHTEPLKKGPGAASRKRL
504-507	KKAK

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MRFRRPKAADPLVRPKKKATARPAVASATSAGTTTKPTTARPVISNIAPAIQAEKAASGSAQNDFSVNGFSGPLLSETYVDYPIVITKRSLREGLKHHIARFASKKTIDPRDETQFTRPVRLQRRDPRAKTQDMNQDKAQTQKLTPQSSHQLGDAEREELEARKAAREKERAENLAQIAPSIGSAPKRANAPKQKTQQVSKTDMTPEEVARARIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFIPENGRMRMIPVEKWYKFGAKNQFKALTIEEAERFMAKKIKDPRWFMEKQQEQAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGTPAGADGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEETKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKDYEEEELREKREREARRILGKQVRKALKKREKNYDYSSGSDVNPYSDEESSDDSEAERLREEERKAEEDKNKKDSAPSTRGNVTPSGRPKHTEPLKKGPGAASRKRLGSPNVSDASGTDTSRKKAKSKHPSSQPTPQPTSRALSPTVPSGQVGKKRIRNVAGGAGSASDADGGAASGGEMSESGKIKKLKLNPPAATSQGGTPQGSRAGSPTPIGSKGLTASRASSPESLRGQNRISTPVPSGALSFPTPAEIHAAIPQTGILSSDLLRIFRPRIGESKENHRKFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGVLKDGQR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.71
3	0.71
4	0.71
5	0.72
6	0.71
7	0.71
8	0.71
9	0.74
10	0.72
11	0.65
12	0.56
13	0.48
14	0.39
15	0.29
16	0.23
17	0.18
18	0.14
19	0.12
20	0.15
21	0.17
22	0.2
23	0.2
24	0.22
25	0.31
26	0.36
27	0.4
28	0.39
29	0.43
30	0.42
31	0.41
32	0.42
33	0.34
34	0.29
35	0.25
36	0.22
37	0.19
38	0.14
39	0.14
40	0.11
41	0.11
42	0.1
43	0.1
44	0.1
45	0.1
46	0.11
47	0.13
48	0.14
49	0.14
50	0.14
51	0.14
52	0.14
53	0.14
54	0.13
55	0.1
56	0.09
57	0.09
58	0.09
59	0.09
60	0.1
61	0.09
62	0.09
63	0.09
64	0.11
65	0.13
66	0.13
67	0.13
68	0.12
69	0.11
70	0.15
71	0.16
72	0.15
73	0.15
74	0.21
75	0.27
76	0.31
77	0.36
78	0.34
79	0.4
80	0.46
81	0.53
82	0.57
83	0.56
84	0.53
85	0.54
86	0.52
87	0.53
88	0.52
89	0.49
90	0.46
91	0.43
92	0.48
93	0.51
94	0.59
95	0.55
96	0.54
97	0.54
98	0.56
99	0.58
100	0.55
101	0.52
102	0.49
103	0.47
104	0.48
105	0.46
106	0.47
107	0.53
108	0.58
109	0.63
110	0.66
111	0.76
112	0.8
113	0.81
114	0.83
115	0.8
116	0.8
117	0.73
118	0.71
119	0.71
120	0.66
121	0.66
122	0.58
123	0.55
124	0.5
125	0.52
126	0.49
127	0.41
128	0.35
129	0.38
130	0.43
131	0.42
132	0.41
133	0.41
134	0.44
135	0.45
136	0.45
137	0.38
138	0.33
139	0.28
140	0.32
141	0.27
142	0.21
143	0.17
144	0.17
145	0.17
146	0.15
147	0.16
148	0.14
149	0.14
150	0.19
151	0.23
152	0.27
153	0.35
154	0.41
155	0.44
156	0.5
157	0.56
158	0.53
159	0.51
160	0.5
161	0.44
162	0.39
163	0.34
164	0.25
165	0.19
166	0.15
167	0.14
168	0.1
169	0.1
170	0.08
171	0.11
172	0.13
173	0.15
174	0.21
175	0.25
176	0.34
177	0.43
178	0.5
179	0.57
180	0.64
181	0.7
182	0.71
183	0.73
184	0.71
185	0.67
186	0.65
187	0.58
188	0.53
189	0.48
190	0.42
191	0.38
192	0.32
193	0.26
194	0.24
195	0.24
196	0.23
197	0.22
198	0.22
199	0.19
200	0.18
201	0.19
202	0.16
203	0.18
204	0.2
205	0.2
206	0.23
207	0.23
208	0.23
209	0.22
210	0.21
211	0.19
212	0.17
213	0.19
214	0.19
215	0.19
216	0.18
217	0.19
218	0.19
219	0.18
220	0.16
221	0.13
222	0.1
223	0.09
224	0.09
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.08
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.08
234	0.07
235	0.08
236	0.1
237	0.12
238	0.14
239	0.13
240	0.14
241	0.13
242	0.15
243	0.18
244	0.19
245	0.17
246	0.21
247	0.3
248	0.29
249	0.32
250	0.32
251	0.32
252	0.32
253	0.38
254	0.43
255	0.42
256	0.45
257	0.47
258	0.48
259	0.44
260	0.44
261	0.38
262	0.3
263	0.23
264	0.22
265	0.17
266	0.15
267	0.15
268	0.14
269	0.13
270	0.11
271	0.15
272	0.13
273	0.2
274	0.28
275	0.37
276	0.44
277	0.48
278	0.51
279	0.55
280	0.56
281	0.53
282	0.54
283	0.49
284	0.44
285	0.49
286	0.53
287	0.48
288	0.49
289	0.52
290	0.43
291	0.39
292	0.41
293	0.36
294	0.31
295	0.32
296	0.38
297	0.4
298	0.46
299	0.45
300	0.43
301	0.43
302	0.45
303	0.43
304	0.44
305	0.42
306	0.38
307	0.41
308	0.4
309	0.36
310	0.31
311	0.28
312	0.18
313	0.12
314	0.09
315	0.06
316	0.05
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.03
321	0.03
322	0.04
323	0.04
324	0.03
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.07
333	0.08
334	0.09
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.07
346	0.08
347	0.09
348	0.12
349	0.14
350	0.19
351	0.27
352	0.34
353	0.35
354	0.42
355	0.48
356	0.54
357	0.55
358	0.5
359	0.43
360	0.4
361	0.37
362	0.31
363	0.26
364	0.19
365	0.17
366	0.17
367	0.16
368	0.13
369	0.14
370	0.15
371	0.15
372	0.14
373	0.16
374	0.18
375	0.19
376	0.23
377	0.23
378	0.26
379	0.31
380	0.35
381	0.38
382	0.45
383	0.49
384	0.52
385	0.54
386	0.57
387	0.57
388	0.58
389	0.56
390	0.56
391	0.57
392	0.56
393	0.6
394	0.64
395	0.66
396	0.71
397	0.73
398	0.75
399	0.73
400	0.72
401	0.72
402	0.69
403	0.61
404	0.54
405	0.49
406	0.4
407	0.36
408	0.31
409	0.25
410	0.17
411	0.15
412	0.13
413	0.13
414	0.11
415	0.11
416	0.11
417	0.13
418	0.14
419	0.13
420	0.12
421	0.11
422	0.12
423	0.12
424	0.12
425	0.09
426	0.09
427	0.11
428	0.16
429	0.17
430	0.21
431	0.24
432	0.27
433	0.3
434	0.37
435	0.42
436	0.46
437	0.52
438	0.53
439	0.51
440	0.48
441	0.48
442	0.47
443	0.48
444	0.46
445	0.42
446	0.4
447	0.42
448	0.43
449	0.4
450	0.39
451	0.32
452	0.32
453	0.37
454	0.39
455	0.37
456	0.38
457	0.4
458	0.46
459	0.52
460	0.54
461	0.54
462	0.58
463	0.63
464	0.62
465	0.6
466	0.54
467	0.54
468	0.54
469	0.53
470	0.5
471	0.47
472	0.49
473	0.49
474	0.49
475	0.44
476	0.44
477	0.41
478	0.41
479	0.38
480	0.36
481	0.34
482	0.3
483	0.31
484	0.25
485	0.21
486	0.2
487	0.21
488	0.24
489	0.3
490	0.33
491	0.34
492	0.41
493	0.52
494	0.57
495	0.64
496	0.72
497	0.76
498	0.82
499	0.83
500	0.83
501	0.81
502	0.78
503	0.75
504	0.68
505	0.61
506	0.54
507	0.52
508	0.45
509	0.39
510	0.33
511	0.3
512	0.29
513	0.29
514	0.28
515	0.25
516	0.22
517	0.24
518	0.27
519	0.31
520	0.36
521	0.4
522	0.44
523	0.49
524	0.55
525	0.53
526	0.51
527	0.47
528	0.49
529	0.42
530	0.36
531	0.3
532	0.24
533	0.2
534	0.17
535	0.13
536	0.06
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.03
541	0.03
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.03
546	0.03
547	0.03
548	0.04
549	0.08
550	0.1
551	0.11
552	0.17
553	0.2
554	0.24
555	0.3
556	0.39
557	0.45
558	0.52
559	0.61
560	0.59
561	0.6
562	0.61
563	0.57
564	0.49
565	0.41
566	0.33
567	0.29
568	0.29
569	0.25
570	0.22
571	0.21
572	0.23
573	0.23
574	0.21
575	0.17
576	0.18
577	0.18
578	0.19
579	0.2
580	0.19
581	0.2
582	0.22
583	0.2
584	0.18
585	0.19
586	0.22
587	0.22
588	0.2
589	0.21
590	0.23
591	0.25
592	0.26
593	0.28
594	0.26
595	0.31
596	0.35
597	0.38
598	0.38
599	0.41
600	0.41
601	0.42
602	0.42
603	0.41
604	0.38
605	0.34
606	0.34
607	0.32
608	0.31
609	0.26
610	0.26
611	0.21
612	0.23
613	0.2
614	0.19
615	0.15
616	0.16
617	0.16
618	0.14
619	0.17
620	0.15
621	0.15
622	0.18
623	0.2
624	0.18
625	0.18
626	0.17
627	0.14
628	0.13
629	0.13
630	0.09
631	0.09
632	0.09
633	0.14
634	0.16
635	0.16
636	0.17
637	0.2
638	0.22
639	0.23
640	0.27
641	0.26
642	0.32
643	0.39
644	0.45
645	0.46
646	0.55
647	0.64
648	0.63
649	0.62
650	0.55
651	0.49
652	0.44
653	0.48
654	0.45
655	0.38
656	0.36
657	0.35
658	0.35
659	0.34
660	0.33
661	0.25
662	0.19
663	0.18
664	0.19
665	0.21
666	0.22
667	0.23
668	0.27
669	0.29
670	0.28
671	0.32
672	0.32
673	0.34

A0A397HYZ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer