FuNGI

A0A3R7J9K8

Protein Details

Accession

A0A3R7J9K8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
56-88	STGFPQHRRRVNQSTFKQRRANKQQEPSPPPPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MAFRGQRFTLNLDDDDLNLDSSQPSLDSSPFGLIGEIRERSPSAAIPPAPKPPTGSTGFPQHRRRVNQSTFKQRRANKQQEPSPPPPSTPATTLSDEKKTIDEENRRQLASMSPAQIQQEREELMSSLNPSLLERFLRRARIDDDTTPSDKSSSQPEPTPSSSSAAQDAPTAKPKKSVSFDVDEDAKTATEKQDRSQLKKTPPAVTSSVLTPEDLPPAQPPADLHPASEFPSHEAFHFPTPPRQDMPPNLDPSSPSFLSDLQAHYFPEMSHDPSALSWLQPPSADPEDPDSTSAYHPASSAEAVHPSALRFSLIGNVLSPATSLSLPTTLGLHHHGKDPHAAGYTIPELAILSRSSFPAQRCIAWQVLGRILFRLGKGQFGERGSPLVEGLWSVIEREGVVAGMLAEADAAPSGPTRSAAARHSAAADPNDPPSQTQGTPGPKGATGIGRHASASAWAMEGVWLWQTGGGGDRGILKENAIRSQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.28
3	0.25
4	0.2
5	0.15
6	0.15
7	0.11
8	0.11
9	0.11
10	0.08
11	0.09
12	0.1
13	0.11
14	0.12
15	0.14
16	0.15
17	0.15
18	0.15
19	0.13
20	0.12
21	0.15
22	0.19
23	0.19
24	0.18
25	0.2
26	0.2
27	0.21
28	0.23
29	0.21
30	0.19
31	0.24
32	0.27
33	0.3
34	0.33
35	0.4
36	0.41
37	0.4
38	0.4
39	0.37
40	0.4
41	0.39
42	0.4
43	0.35
44	0.44
45	0.51
46	0.55
47	0.6
48	0.63
49	0.67
50	0.7
51	0.75
52	0.75
53	0.77
54	0.78
55	0.79
56	0.82
57	0.83
58	0.84
59	0.83
60	0.8
61	0.82
62	0.82
63	0.84
64	0.82
65	0.83
66	0.82
67	0.84
68	0.86
69	0.82
70	0.79
71	0.69
72	0.61
73	0.56
74	0.52
75	0.45
76	0.38
77	0.36
78	0.32
79	0.34
80	0.38
81	0.37
82	0.37
83	0.35
84	0.33
85	0.31
86	0.28
87	0.3
88	0.34
89	0.4
90	0.43
91	0.52
92	0.54
93	0.53
94	0.51
95	0.46
96	0.41
97	0.37
98	0.34
99	0.27
100	0.25
101	0.27
102	0.29
103	0.32
104	0.29
105	0.25
106	0.23
107	0.21
108	0.2
109	0.19
110	0.16
111	0.14
112	0.14
113	0.14
114	0.11
115	0.11
116	0.11
117	0.11
118	0.12
119	0.12
120	0.14
121	0.14
122	0.2
123	0.24
124	0.3
125	0.3
126	0.32
127	0.34
128	0.37
129	0.4
130	0.37
131	0.38
132	0.37
133	0.38
134	0.35
135	0.32
136	0.27
137	0.23
138	0.21
139	0.23
140	0.23
141	0.24
142	0.27
143	0.3
144	0.35
145	0.37
146	0.39
147	0.33
148	0.31
149	0.29
150	0.26
151	0.25
152	0.2
153	0.18
154	0.17
155	0.17
156	0.17
157	0.24
158	0.26
159	0.24
160	0.3
161	0.31
162	0.36
163	0.38
164	0.41
165	0.37
166	0.39
167	0.4
168	0.37
169	0.37
170	0.3
171	0.26
172	0.21
173	0.16
174	0.11
175	0.12
176	0.13
177	0.16
178	0.17
179	0.18
180	0.27
181	0.31
182	0.38
183	0.44
184	0.47
185	0.48
186	0.55
187	0.58
188	0.55
189	0.51
190	0.49
191	0.43
192	0.38
193	0.32
194	0.25
195	0.24
196	0.18
197	0.17
198	0.14
199	0.12
200	0.13
201	0.12
202	0.12
203	0.09
204	0.11
205	0.11
206	0.1
207	0.1
208	0.13
209	0.2
210	0.19
211	0.19
212	0.18
213	0.19
214	0.2
215	0.21
216	0.16
217	0.12
218	0.14
219	0.14
220	0.13
221	0.15
222	0.14
223	0.14
224	0.19
225	0.17
226	0.2
227	0.23
228	0.25
229	0.25
230	0.25
231	0.28
232	0.28
233	0.34
234	0.35
235	0.35
236	0.34
237	0.32
238	0.31
239	0.3
240	0.31
241	0.23
242	0.19
243	0.16
244	0.15
245	0.16
246	0.17
247	0.15
248	0.11
249	0.12
250	0.11
251	0.11
252	0.11
253	0.09
254	0.12
255	0.12
256	0.13
257	0.13
258	0.13
259	0.13
260	0.12
261	0.15
262	0.11
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.11
267	0.1
268	0.11
269	0.14
270	0.16
271	0.16
272	0.14
273	0.19
274	0.2
275	0.21
276	0.21
277	0.16
278	0.15
279	0.15
280	0.17
281	0.12
282	0.1
283	0.1
284	0.1
285	0.1
286	0.09
287	0.1
288	0.08
289	0.1
290	0.09
291	0.1
292	0.1
293	0.09
294	0.09
295	0.08
296	0.08
297	0.06
298	0.06
299	0.09
300	0.1
301	0.1
302	0.1
303	0.1
304	0.1
305	0.1
306	0.1
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.08
316	0.06
317	0.08
318	0.13
319	0.15
320	0.16
321	0.21
322	0.22
323	0.23
324	0.27
325	0.27
326	0.25
327	0.23
328	0.22
329	0.16
330	0.18
331	0.18
332	0.14
333	0.12
334	0.1
335	0.08
336	0.08
337	0.1
338	0.07
339	0.08
340	0.09
341	0.11
342	0.13
343	0.17
344	0.17
345	0.23
346	0.24
347	0.24
348	0.25
349	0.28
350	0.28
351	0.26
352	0.27
353	0.22
354	0.25
355	0.26
356	0.23
357	0.2
358	0.21
359	0.2
360	0.18
361	0.22
362	0.18
363	0.2
364	0.22
365	0.24
366	0.26
367	0.26
368	0.29
369	0.23
370	0.24
371	0.21
372	0.2
373	0.17
374	0.13
375	0.11
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.07
380	0.07
381	0.08
382	0.08
383	0.07
384	0.08
385	0.07
386	0.06
387	0.06
388	0.05
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.04
399	0.05
400	0.06
401	0.06
402	0.08
403	0.09
404	0.12
405	0.16
406	0.18
407	0.23
408	0.24
409	0.25
410	0.27
411	0.27
412	0.29
413	0.28
414	0.28
415	0.23
416	0.26
417	0.27
418	0.25
419	0.23
420	0.25
421	0.26
422	0.24
423	0.26
424	0.3
425	0.34
426	0.37
427	0.39
428	0.36
429	0.32
430	0.33
431	0.32
432	0.3
433	0.26
434	0.29
435	0.29
436	0.27
437	0.27
438	0.26
439	0.23
440	0.19
441	0.19
442	0.13
443	0.11
444	0.1
445	0.1
446	0.1
447	0.1
448	0.09
449	0.08
450	0.08
451	0.07
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.1
456	0.1
457	0.09
458	0.1
459	0.15
460	0.15
461	0.19
462	0.18
463	0.18
464	0.21

A0A3R7J9K8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer