Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1X8X0

Protein Details
Accession A0A1Y1X8X0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-155EIERRKKRSVRPQVSWLRRTHydrophilic
356-382FYNIVRSKLSLKKKRARSKYVTQVEFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
367-372KKKRAR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.833, mito_nucl 11.832, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences MASMASTSSSRHHHSHSHSHSHSHSHSHSARKPVPVRPGSGFLCRQRFQNNLPELPFNPKLVEFPFPRDRLYSYKTSQLIENTPYKMLPPDTELGIPLNLIDMKVFEEGPENKTFNPTEPPPVHEDDKILLISNDEIERRKKRSVRPQVSWLRRTEYISNEISNKFLKNNEFTEVKMGLSIAKDSAIKDVDLSVNGQIKSISRTFKIINETDLFNIKHPTKAHLKAVEIFPIFPDFVRWPNVYSHVQYNSSPISNEVKENLEKVDEVTNTQLSNAILKPMQNPLDPSETFLSYFQPSVETAKKINLKRKHEDSDDEEIDNETQEYNFVRDFEYDTSNDSKNKKVFFTFNPEQGGAFYNIVRSKLSLKKKRARSKYVTQVEFDKPNHIKLTKREFTSSEEQERHDKLSQILTKDKLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.56
3 0.6
4 0.65
5 0.62
6 0.64
7 0.63
8 0.63
9 0.58
10 0.55
11 0.49
12 0.48
13 0.51
14 0.55
15 0.58
16 0.6
17 0.63
18 0.64
19 0.68
20 0.66
21 0.71
22 0.65
23 0.64
24 0.58
25 0.59
26 0.53
27 0.54
28 0.54
29 0.52
30 0.56
31 0.52
32 0.52
33 0.52
34 0.54
35 0.51
36 0.54
37 0.53
38 0.5
39 0.51
40 0.5
41 0.46
42 0.48
43 0.46
44 0.37
45 0.32
46 0.28
47 0.28
48 0.26
49 0.32
50 0.26
51 0.31
52 0.39
53 0.39
54 0.4
55 0.39
56 0.4
57 0.4
58 0.43
59 0.43
60 0.37
61 0.43
62 0.44
63 0.43
64 0.42
65 0.4
66 0.38
67 0.36
68 0.38
69 0.33
70 0.31
71 0.3
72 0.28
73 0.27
74 0.24
75 0.2
76 0.19
77 0.19
78 0.2
79 0.2
80 0.2
81 0.18
82 0.16
83 0.14
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.07
91 0.09
92 0.09
93 0.07
94 0.13
95 0.15
96 0.19
97 0.23
98 0.23
99 0.22
100 0.27
101 0.27
102 0.23
103 0.28
104 0.26
105 0.31
106 0.31
107 0.34
108 0.34
109 0.38
110 0.38
111 0.32
112 0.32
113 0.24
114 0.24
115 0.21
116 0.17
117 0.13
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.1
123 0.13
124 0.2
125 0.26
126 0.3
127 0.38
128 0.43
129 0.51
130 0.61
131 0.69
132 0.72
133 0.71
134 0.77
135 0.79
136 0.81
137 0.77
138 0.68
139 0.61
140 0.54
141 0.52
142 0.45
143 0.39
144 0.35
145 0.31
146 0.31
147 0.29
148 0.27
149 0.26
150 0.24
151 0.21
152 0.17
153 0.19
154 0.2
155 0.21
156 0.22
157 0.24
158 0.23
159 0.22
160 0.25
161 0.22
162 0.19
163 0.15
164 0.13
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.12
186 0.15
187 0.17
188 0.17
189 0.13
190 0.16
191 0.17
192 0.2
193 0.24
194 0.22
195 0.22
196 0.21
197 0.21
198 0.2
199 0.22
200 0.19
201 0.15
202 0.19
203 0.16
204 0.19
205 0.19
206 0.22
207 0.26
208 0.29
209 0.33
210 0.32
211 0.33
212 0.33
213 0.33
214 0.34
215 0.26
216 0.23
217 0.18
218 0.17
219 0.15
220 0.11
221 0.13
222 0.09
223 0.11
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.17
228 0.22
229 0.21
230 0.22
231 0.24
232 0.23
233 0.24
234 0.23
235 0.24
236 0.21
237 0.2
238 0.18
239 0.16
240 0.18
241 0.17
242 0.18
243 0.17
244 0.18
245 0.18
246 0.19
247 0.17
248 0.14
249 0.13
250 0.13
251 0.16
252 0.13
253 0.13
254 0.14
255 0.15
256 0.14
257 0.14
258 0.15
259 0.1
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.13
265 0.14
266 0.18
267 0.2
268 0.19
269 0.2
270 0.21
271 0.26
272 0.25
273 0.27
274 0.24
275 0.22
276 0.22
277 0.21
278 0.2
279 0.15
280 0.16
281 0.13
282 0.11
283 0.12
284 0.16
285 0.19
286 0.18
287 0.18
288 0.25
289 0.32
290 0.37
291 0.46
292 0.5
293 0.55
294 0.61
295 0.69
296 0.69
297 0.66
298 0.66
299 0.63
300 0.63
301 0.57
302 0.49
303 0.41
304 0.35
305 0.31
306 0.25
307 0.18
308 0.1
309 0.07
310 0.08
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.12
317 0.15
318 0.16
319 0.19
320 0.18
321 0.2
322 0.24
323 0.26
324 0.3
325 0.3
326 0.35
327 0.36
328 0.39
329 0.39
330 0.39
331 0.43
332 0.43
333 0.5
334 0.49
335 0.49
336 0.5
337 0.47
338 0.42
339 0.37
340 0.35
341 0.27
342 0.22
343 0.17
344 0.18
345 0.2
346 0.21
347 0.2
348 0.19
349 0.24
350 0.31
351 0.42
352 0.47
353 0.56
354 0.65
355 0.75
356 0.84
357 0.87
358 0.89
359 0.86
360 0.87
361 0.87
362 0.88
363 0.81
364 0.73
365 0.69
366 0.65
367 0.64
368 0.54
369 0.53
370 0.45
371 0.47
372 0.51
373 0.48
374 0.48
375 0.5
376 0.6
377 0.57
378 0.59
379 0.59
380 0.54
381 0.58
382 0.61
383 0.6
384 0.58
385 0.54
386 0.53
387 0.56
388 0.56
389 0.54
390 0.49
391 0.44
392 0.38
393 0.44
394 0.46
395 0.44
396 0.49