Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XHU5

Protein Details
Accession A0A1Y1XHU5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
162-189LINYNDCKHNIKKKKRKDKTNEDEEAEKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-179KKKKRKD
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 11, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001646  5peptide_repeat  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00805  Pentapeptide  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MTPIRTVKKRTSPFPLLEKVTPSLIVNLYNNYFTFNNKDVTFTYNGSLKTFIESLNEHTIPSGLLDILDNQKCKFYNGHIAVEVRNHCLNDQSELSSAEITKVWLRMTPEALWMDLCLLNEQIGQSKWPKEASLELESKILVSTEKDICLDPSLEVSKIKNLINYNDCKHNIKKKKRKDKTNEDEEAEKKAQQQQLLLLFSDHKGKKETRSRFNRINFIEEWRKKKVMADSEPLICINPSKKLLNQKISPTSKTLLHNLNRVVRTLRFENITRGIKTYTVLNIYELPNGENEAVLRWGTVPNTSINGGLLKYPIGNNAAAEYYIANFILFYSLTNKLVSDDVDKDKESSYSVIYQPDNNNSSMISPIQINNNKNTAKVKSPQTVYSNSVSNSSSYVNSPHIAKKAKIQNNKSSKTPPTATSISSYSPVNKPTQTAILNNALQQKLQQQQQQPQQQPQQQQQSQQQSQQQSQQQPQLQTQHQIRQTQTQTQLQQQQAKLKQQQTQAQLQLQTQLQQQQQAQLQQVQLQQAQLQQAKLQQAQLQQAKLQQAQLQQAKLQQLQQLQQAKLQQQQQQQRLQQLQAAQAQVKAQEQMQYQLQTQGTPPLKATPTIQNKPLPNAATASQVKTNITPSIPTKPISTPNSVPQSQISIKQSPVSKVNQKIPSTGSNQLPGTQTTPIMKTPSHPAQPLPQQAQQTTPVLSSQNHIKTTPNIPYKSSPPLNLRQPGVSASAVNNIKYFPENATNAAVAAQAKLISGSPPTMLNNQLKVANSGFIQQPAGIQTSLLTPQQQQQLLIQQQYALQQQNTGVPIHLLQGARTIPQAYSEASLEQAYNIQAQKNALEYVRRQQYAQAANGMAYQQMSFNPQLANPNLMNPRAATNVQQQLYQLYQSRQAAALQQQYDLKNKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.72
3 0.68
4 0.63
5 0.6
6 0.52
7 0.46
8 0.4
9 0.33
10 0.29
11 0.24
12 0.25
13 0.23
14 0.25
15 0.25
16 0.26
17 0.25
18 0.25
19 0.24
20 0.23
21 0.27
22 0.26
23 0.29
24 0.27
25 0.3
26 0.28
27 0.32
28 0.33
29 0.28
30 0.28
31 0.28
32 0.29
33 0.28
34 0.28
35 0.23
36 0.24
37 0.23
38 0.2
39 0.19
40 0.2
41 0.24
42 0.3
43 0.3
44 0.26
45 0.26
46 0.25
47 0.21
48 0.2
49 0.16
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.12
54 0.19
55 0.23
56 0.25
57 0.24
58 0.29
59 0.29
60 0.31
61 0.31
62 0.29
63 0.36
64 0.39
65 0.42
66 0.41
67 0.42
68 0.41
69 0.45
70 0.41
71 0.35
72 0.33
73 0.29
74 0.26
75 0.3
76 0.29
77 0.27
78 0.28
79 0.25
80 0.24
81 0.24
82 0.25
83 0.21
84 0.2
85 0.16
86 0.14
87 0.14
88 0.15
89 0.16
90 0.16
91 0.17
92 0.21
93 0.23
94 0.26
95 0.25
96 0.28
97 0.27
98 0.27
99 0.24
100 0.2
101 0.19
102 0.17
103 0.16
104 0.12
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.14
110 0.13
111 0.16
112 0.2
113 0.23
114 0.25
115 0.26
116 0.26
117 0.24
118 0.29
119 0.32
120 0.34
121 0.33
122 0.31
123 0.31
124 0.3
125 0.27
126 0.22
127 0.16
128 0.1
129 0.09
130 0.13
131 0.15
132 0.16
133 0.17
134 0.17
135 0.18
136 0.2
137 0.19
138 0.15
139 0.16
140 0.17
141 0.17
142 0.18
143 0.18
144 0.21
145 0.24
146 0.25
147 0.25
148 0.27
149 0.32
150 0.38
151 0.43
152 0.42
153 0.47
154 0.49
155 0.49
156 0.55
157 0.59
158 0.62
159 0.67
160 0.74
161 0.77
162 0.86
163 0.9
164 0.93
165 0.94
166 0.94
167 0.93
168 0.93
169 0.89
170 0.81
171 0.77
172 0.67
173 0.63
174 0.53
175 0.44
176 0.37
177 0.38
178 0.37
179 0.32
180 0.32
181 0.3
182 0.33
183 0.33
184 0.29
185 0.23
186 0.22
187 0.21
188 0.29
189 0.25
190 0.22
191 0.26
192 0.29
193 0.37
194 0.46
195 0.55
196 0.56
197 0.65
198 0.71
199 0.75
200 0.79
201 0.78
202 0.7
203 0.66
204 0.57
205 0.55
206 0.58
207 0.56
208 0.55
209 0.52
210 0.51
211 0.46
212 0.49
213 0.49
214 0.48
215 0.47
216 0.48
217 0.46
218 0.46
219 0.46
220 0.41
221 0.34
222 0.24
223 0.21
224 0.17
225 0.17
226 0.19
227 0.2
228 0.25
229 0.35
230 0.44
231 0.49
232 0.52
233 0.55
234 0.61
235 0.63
236 0.61
237 0.54
238 0.48
239 0.45
240 0.43
241 0.41
242 0.4
243 0.39
244 0.42
245 0.43
246 0.48
247 0.43
248 0.42
249 0.39
250 0.33
251 0.34
252 0.32
253 0.3
254 0.26
255 0.27
256 0.3
257 0.34
258 0.37
259 0.32
260 0.32
261 0.3
262 0.27
263 0.26
264 0.23
265 0.19
266 0.17
267 0.16
268 0.16
269 0.18
270 0.19
271 0.2
272 0.18
273 0.15
274 0.13
275 0.14
276 0.12
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.11
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.08
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.12
325 0.13
326 0.12
327 0.15
328 0.17
329 0.19
330 0.19
331 0.19
332 0.19
333 0.19
334 0.17
335 0.14
336 0.12
337 0.14
338 0.15
339 0.18
340 0.18
341 0.22
342 0.23
343 0.27
344 0.27
345 0.24
346 0.23
347 0.19
348 0.19
349 0.16
350 0.14
351 0.09
352 0.08
353 0.09
354 0.17
355 0.22
356 0.23
357 0.25
358 0.31
359 0.3
360 0.31
361 0.33
362 0.28
363 0.28
364 0.32
365 0.36
366 0.36
367 0.38
368 0.4
369 0.41
370 0.41
371 0.4
372 0.36
373 0.32
374 0.26
375 0.26
376 0.21
377 0.18
378 0.16
379 0.14
380 0.12
381 0.11
382 0.12
383 0.12
384 0.12
385 0.14
386 0.16
387 0.2
388 0.22
389 0.22
390 0.28
391 0.37
392 0.43
393 0.5
394 0.53
395 0.58
396 0.65
397 0.67
398 0.62
399 0.58
400 0.53
401 0.5
402 0.46
403 0.38
404 0.35
405 0.34
406 0.31
407 0.28
408 0.26
409 0.21
410 0.2
411 0.19
412 0.16
413 0.16
414 0.18
415 0.18
416 0.17
417 0.17
418 0.17
419 0.21
420 0.2
421 0.19
422 0.2
423 0.21
424 0.21
425 0.23
426 0.25
427 0.21
428 0.19
429 0.19
430 0.21
431 0.21
432 0.25
433 0.27
434 0.28
435 0.35
436 0.43
437 0.51
438 0.49
439 0.5
440 0.52
441 0.53
442 0.54
443 0.53
444 0.54
445 0.48
446 0.5
447 0.52
448 0.54
449 0.51
450 0.5
451 0.49
452 0.42
453 0.42
454 0.43
455 0.42
456 0.38
457 0.39
458 0.41
459 0.39
460 0.38
461 0.39
462 0.38
463 0.34
464 0.35
465 0.35
466 0.35
467 0.36
468 0.37
469 0.35
470 0.37
471 0.38
472 0.38
473 0.4
474 0.38
475 0.36
476 0.38
477 0.44
478 0.4
479 0.43
480 0.39
481 0.42
482 0.41
483 0.46
484 0.48
485 0.45
486 0.47
487 0.47
488 0.51
489 0.48
490 0.5
491 0.46
492 0.42
493 0.39
494 0.34
495 0.32
496 0.26
497 0.23
498 0.19
499 0.22
500 0.2
501 0.22
502 0.22
503 0.23
504 0.25
505 0.26
506 0.25
507 0.22
508 0.22
509 0.22
510 0.23
511 0.21
512 0.2
513 0.17
514 0.17
515 0.16
516 0.2
517 0.18
518 0.16
519 0.16
520 0.18
521 0.21
522 0.21
523 0.2
524 0.19
525 0.21
526 0.28
527 0.29
528 0.27
529 0.25
530 0.27
531 0.29
532 0.27
533 0.25
534 0.21
535 0.21
536 0.28
537 0.29
538 0.27
539 0.25
540 0.27
541 0.29
542 0.28
543 0.27
544 0.23
545 0.23
546 0.25
547 0.3
548 0.33
549 0.31
550 0.32
551 0.33
552 0.32
553 0.35
554 0.38
555 0.38
556 0.39
557 0.47
558 0.51
559 0.54
560 0.55
561 0.56
562 0.53
563 0.47
564 0.42
565 0.36
566 0.33
567 0.3
568 0.28
569 0.22
570 0.2
571 0.2
572 0.19
573 0.17
574 0.14
575 0.11
576 0.14
577 0.14
578 0.16
579 0.19
580 0.19
581 0.19
582 0.23
583 0.22
584 0.19
585 0.19
586 0.24
587 0.23
588 0.22
589 0.22
590 0.21
591 0.22
592 0.22
593 0.25
594 0.26
595 0.34
596 0.37
597 0.41
598 0.42
599 0.43
600 0.46
601 0.47
602 0.39
603 0.3
604 0.29
605 0.25
606 0.27
607 0.27
608 0.25
609 0.23
610 0.23
611 0.23
612 0.22
613 0.23
614 0.18
615 0.16
616 0.17
617 0.18
618 0.24
619 0.25
620 0.25
621 0.26
622 0.27
623 0.34
624 0.36
625 0.38
626 0.34
627 0.4
628 0.45
629 0.43
630 0.41
631 0.34
632 0.36
633 0.32
634 0.35
635 0.32
636 0.28
637 0.28
638 0.31
639 0.34
640 0.31
641 0.34
642 0.35
643 0.38
644 0.41
645 0.5
646 0.53
647 0.51
648 0.5
649 0.49
650 0.48
651 0.45
652 0.44
653 0.37
654 0.34
655 0.34
656 0.34
657 0.32
658 0.28
659 0.25
660 0.2
661 0.2
662 0.18
663 0.19
664 0.19
665 0.2
666 0.19
667 0.19
668 0.26
669 0.32
670 0.34
671 0.33
672 0.33
673 0.38
674 0.45
675 0.5
676 0.47
677 0.44
678 0.43
679 0.42
680 0.43
681 0.39
682 0.33
683 0.27
684 0.22
685 0.2
686 0.19
687 0.19
688 0.18
689 0.24
690 0.27
691 0.28
692 0.29
693 0.29
694 0.32
695 0.37
696 0.43
697 0.43
698 0.39
699 0.41
700 0.44
701 0.46
702 0.51
703 0.48
704 0.45
705 0.43
706 0.5
707 0.54
708 0.56
709 0.53
710 0.45
711 0.43
712 0.39
713 0.35
714 0.28
715 0.21
716 0.16
717 0.22
718 0.23
719 0.22
720 0.21
721 0.18
722 0.19
723 0.19
724 0.19
725 0.15
726 0.2
727 0.21
728 0.22
729 0.24
730 0.23
731 0.21
732 0.2
733 0.18
734 0.12
735 0.11
736 0.1
737 0.08
738 0.07
739 0.08
740 0.08
741 0.07
742 0.08
743 0.09
744 0.09
745 0.11
746 0.14
747 0.16
748 0.22
749 0.25
750 0.27
751 0.28
752 0.3
753 0.29
754 0.29
755 0.27
756 0.23
757 0.19
758 0.2
759 0.19
760 0.17
761 0.17
762 0.14
763 0.15
764 0.15
765 0.17
766 0.13
767 0.12
768 0.11
769 0.13
770 0.15
771 0.15
772 0.15
773 0.15
774 0.2
775 0.27
776 0.28
777 0.27
778 0.27
779 0.35
780 0.38
781 0.38
782 0.32
783 0.26
784 0.27
785 0.29
786 0.32
787 0.27
788 0.22
789 0.22
790 0.23
791 0.26
792 0.26
793 0.23
794 0.18
795 0.15
796 0.15
797 0.15
798 0.18
799 0.15
800 0.13
801 0.17
802 0.18
803 0.18
804 0.19
805 0.18
806 0.14
807 0.16
808 0.18
809 0.15
810 0.16
811 0.16
812 0.15
813 0.15
814 0.16
815 0.14
816 0.13
817 0.13
818 0.12
819 0.16
820 0.17
821 0.17
822 0.19
823 0.2
824 0.21
825 0.21
826 0.23
827 0.2
828 0.24
829 0.26
830 0.34
831 0.42
832 0.41
833 0.39
834 0.41
835 0.48
836 0.49
837 0.48
838 0.43
839 0.34
840 0.33
841 0.34
842 0.3
843 0.22
844 0.16
845 0.14
846 0.1
847 0.1
848 0.15
849 0.14
850 0.17
851 0.17
852 0.18
853 0.25
854 0.26
855 0.3
856 0.26
857 0.33
858 0.35
859 0.35
860 0.34
861 0.29
862 0.3
863 0.29
864 0.3
865 0.27
866 0.31
867 0.39
868 0.39
869 0.39
870 0.36
871 0.35
872 0.36
873 0.36
874 0.32
875 0.26
876 0.33
877 0.34
878 0.35
879 0.32
880 0.32
881 0.33
882 0.35
883 0.4
884 0.33
885 0.35
886 0.38
887 0.4
888 0.48