Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XIH7

Protein Details
Accession A0A1Y1XIH7    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MTRELKRVTKDKLNLKRKLNNNYELTHydrophilic
82-114DDNNNNKNNNNNKKTKYSKRFLNKNKKDDSPIEHydrophilic
132-160IEFENVFEKKNKNKKRNRNKLKSENEFIEHydrophilic
180-226FEEPKKYNFRKRNSNVYNNKVNITKENQLKKNKNKNNKLNNVANKTTHydrophilic
238-270KTLIKNRKNEGKKSIRKNTKRKRNEINETTEKNHydrophilic
273-298NEKIENKKIDKEKKKVKENKIVEPENBasic
366-391TISFDKLEKKKQKKKGINKQDRLLRKBasic
473-498TTNHNQSTNKKKKNNDKKVLDSKNNKHydrophilic
890-923ILSKYNSFEKERQRKLQEKKERRIYSNWRRLIKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-152KKNKNKKRNRNKL
241-290IKNRKNEGKKSIRKNTKRKRNEINETTEKNNKNEKIENKKIDKEKKKVKE
373-385EKKKQKKKGINKQ
906-912QEKKERR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.833, cyto_mito 3.833, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MTRELKRVTKDKLNLKRKLNNNYELTTTDKSQNLNNDSIAFGVKRRRKELEIKQLLPLENKKNKYEILKIETQKEKDNNTNDDNNNNKNNNNNKKTKYSKRFLNKNKKDDSPIEEEIIIIDSESDKESDNIIEFENVFEKKNKNKKRNRNKLKSENEFIEIDSNEEEEEEEKEKEKEEIFEEPKKYNFRKRNSNVYNNKVNITKENQLKKNKNKNNKLNNVANKTTNDIKEEKEEEEKTLIKNRKNEGKKSIRKNTKRKRNEINETTEKNNKNEKIENKKIDKEKKKVKENKIVEPENELNLSSEEDKTETSNILNDINISENITIEDNLSEDSENDEDWEQIEISEEKSELSSSDKLLSDKRSITISFDKLEKKKQKKKGINKQDRLLRKDTHKTQILCFLSSCQIWNLWCCSNLIKNLALSVLPEYLLKYNEKNIKSGNIKQLTEIIEELCEWFNDFFGKENIKEIMKLQTTNHNQSTNKKKKNNDKKVLDSKNNKNESDDNVISMDKKNIIKRFEVKNTKILSLFFQKPYWIKEFENSENIYIIIFILFARIIGFQCRFVASLYPIPISFSKKKVNTNEAIKLWCEIYCNKEKKWITVNPLYSPFIYTKAKNYKIKCPKPINYIVTINEDGFIKDRTKLYDKNFYLSTWKLRIEEEWISDMLNNVFNKNCKDDKLKEIIPEDEDPDKQLVFPTSIGGFVNHPLYALERHVKQYEILFSKEPILGYIRNEPIYPRSNVRPVSTEGHWIREGLQIKKGEKPLKYAKSKAYMIKQFRLDYLVKNNMALPKDYELGEEMVPLYGKWQTELYVPAPIIDGKIPKSKYGNIDLFKPHMLPKGAVHLNYNGIIQIAKKLNIDYAEAVTDIDIAGHHYVPVISGIVVTKENAEIILSKYNSFEKERQRKLQEKKERRIYSNWRRLIKKLVTREHLIMKYGYGNKNTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.82
3 0.83
4 0.83
5 0.85
6 0.83
7 0.81
8 0.76
9 0.71
10 0.64
11 0.57
12 0.54
13 0.47
14 0.42
15 0.38
16 0.36
17 0.35
18 0.36
19 0.43
20 0.42
21 0.41
22 0.39
23 0.34
24 0.31
25 0.31
26 0.28
27 0.2
28 0.2
29 0.27
30 0.32
31 0.38
32 0.45
33 0.5
34 0.55
35 0.64
36 0.71
37 0.72
38 0.76
39 0.71
40 0.7
41 0.7
42 0.65
43 0.62
44 0.59
45 0.58
46 0.57
47 0.59
48 0.57
49 0.55
50 0.57
51 0.57
52 0.57
53 0.55
54 0.54
55 0.59
56 0.6
57 0.65
58 0.68
59 0.64
60 0.64
61 0.61
62 0.6
63 0.59
64 0.62
65 0.6
66 0.58
67 0.64
68 0.58
69 0.61
70 0.61
71 0.6
72 0.62
73 0.58
74 0.54
75 0.55
76 0.63
77 0.65
78 0.68
79 0.7
80 0.67
81 0.74
82 0.81
83 0.83
84 0.83
85 0.81
86 0.82
87 0.83
88 0.88
89 0.9
90 0.91
91 0.9
92 0.9
93 0.88
94 0.84
95 0.8
96 0.75
97 0.71
98 0.67
99 0.6
100 0.53
101 0.45
102 0.39
103 0.32
104 0.27
105 0.2
106 0.11
107 0.08
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.13
121 0.14
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.22
126 0.27
127 0.35
128 0.46
129 0.55
130 0.62
131 0.72
132 0.81
133 0.87
134 0.93
135 0.94
136 0.95
137 0.95
138 0.95
139 0.95
140 0.92
141 0.88
142 0.8
143 0.72
144 0.61
145 0.51
146 0.44
147 0.34
148 0.26
149 0.19
150 0.16
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.08
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.14
159 0.15
160 0.16
161 0.18
162 0.19
163 0.19
164 0.19
165 0.27
166 0.3
167 0.37
168 0.39
169 0.39
170 0.44
171 0.5
172 0.53
173 0.55
174 0.58
175 0.6
176 0.68
177 0.72
178 0.78
179 0.78
180 0.83
181 0.82
182 0.81
183 0.81
184 0.72
185 0.68
186 0.6
187 0.53
188 0.48
189 0.43
190 0.43
191 0.43
192 0.51
193 0.56
194 0.62
195 0.7
196 0.76
197 0.82
198 0.84
199 0.86
200 0.88
201 0.9
202 0.91
203 0.9
204 0.88
205 0.86
206 0.86
207 0.82
208 0.74
209 0.68
210 0.58
211 0.53
212 0.51
213 0.43
214 0.38
215 0.33
216 0.31
217 0.33
218 0.34
219 0.33
220 0.33
221 0.32
222 0.3
223 0.32
224 0.32
225 0.28
226 0.35
227 0.39
228 0.37
229 0.43
230 0.48
231 0.55
232 0.6
233 0.64
234 0.66
235 0.7
236 0.74
237 0.78
238 0.82
239 0.83
240 0.85
241 0.9
242 0.91
243 0.91
244 0.92
245 0.9
246 0.9
247 0.9
248 0.9
249 0.86
250 0.85
251 0.83
252 0.76
253 0.72
254 0.69
255 0.62
256 0.56
257 0.57
258 0.51
259 0.47
260 0.51
261 0.56
262 0.58
263 0.64
264 0.68
265 0.66
266 0.7
267 0.74
268 0.77
269 0.78
270 0.77
271 0.78
272 0.79
273 0.83
274 0.86
275 0.86
276 0.86
277 0.82
278 0.82
279 0.81
280 0.75
281 0.65
282 0.62
283 0.54
284 0.44
285 0.39
286 0.29
287 0.21
288 0.17
289 0.18
290 0.13
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.11
298 0.09
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.07
329 0.06
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.08
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.1
340 0.1
341 0.11
342 0.14
343 0.15
344 0.16
345 0.19
346 0.22
347 0.22
348 0.22
349 0.22
350 0.21
351 0.2
352 0.24
353 0.26
354 0.25
355 0.23
356 0.26
357 0.32
358 0.32
359 0.42
360 0.47
361 0.53
362 0.6
363 0.68
364 0.75
365 0.79
366 0.87
367 0.89
368 0.9
369 0.91
370 0.88
371 0.85
372 0.82
373 0.79
374 0.73
375 0.67
376 0.61
377 0.56
378 0.59
379 0.57
380 0.57
381 0.56
382 0.52
383 0.48
384 0.52
385 0.46
386 0.38
387 0.32
388 0.26
389 0.22
390 0.2
391 0.19
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.12
396 0.14
397 0.12
398 0.13
399 0.13
400 0.14
401 0.16
402 0.17
403 0.18
404 0.16
405 0.15
406 0.14
407 0.14
408 0.12
409 0.09
410 0.09
411 0.07
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.08
416 0.09
417 0.1
418 0.1
419 0.16
420 0.23
421 0.23
422 0.24
423 0.24
424 0.29
425 0.32
426 0.37
427 0.4
428 0.38
429 0.37
430 0.36
431 0.39
432 0.34
433 0.3
434 0.24
435 0.15
436 0.11
437 0.1
438 0.11
439 0.08
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.07
447 0.09
448 0.1
449 0.1
450 0.12
451 0.13
452 0.13
453 0.13
454 0.13
455 0.17
456 0.16
457 0.17
458 0.17
459 0.24
460 0.28
461 0.33
462 0.35
463 0.33
464 0.33
465 0.4
466 0.5
467 0.52
468 0.56
469 0.58
470 0.63
471 0.69
472 0.8
473 0.83
474 0.82
475 0.78
476 0.79
477 0.82
478 0.83
479 0.8
480 0.78
481 0.76
482 0.75
483 0.73
484 0.64
485 0.56
486 0.51
487 0.46
488 0.45
489 0.35
490 0.26
491 0.22
492 0.22
493 0.21
494 0.19
495 0.16
496 0.13
497 0.16
498 0.2
499 0.24
500 0.26
501 0.29
502 0.35
503 0.41
504 0.47
505 0.52
506 0.49
507 0.52
508 0.52
509 0.49
510 0.44
511 0.37
512 0.31
513 0.29
514 0.3
515 0.25
516 0.23
517 0.24
518 0.25
519 0.28
520 0.28
521 0.25
522 0.21
523 0.24
524 0.29
525 0.29
526 0.32
527 0.29
528 0.26
529 0.23
530 0.23
531 0.18
532 0.12
533 0.1
534 0.05
535 0.04
536 0.03
537 0.04
538 0.03
539 0.03
540 0.04
541 0.05
542 0.05
543 0.08
544 0.09
545 0.09
546 0.1
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.12
551 0.11
552 0.14
553 0.14
554 0.15
555 0.14
556 0.15
557 0.17
558 0.22
559 0.23
560 0.25
561 0.31
562 0.35
563 0.42
564 0.47
565 0.52
566 0.52
567 0.54
568 0.55
569 0.5
570 0.47
571 0.4
572 0.35
573 0.29
574 0.22
575 0.18
576 0.14
577 0.18
578 0.26
579 0.29
580 0.29
581 0.37
582 0.38
583 0.4
584 0.47
585 0.46
586 0.44
587 0.47
588 0.5
589 0.44
590 0.47
591 0.44
592 0.36
593 0.32
594 0.26
595 0.23
596 0.23
597 0.21
598 0.26
599 0.34
600 0.42
601 0.47
602 0.5
603 0.56
604 0.64
605 0.71
606 0.72
607 0.72
608 0.71
609 0.72
610 0.77
611 0.7
612 0.63
613 0.58
614 0.5
615 0.46
616 0.41
617 0.33
618 0.25
619 0.21
620 0.17
621 0.15
622 0.15
623 0.11
624 0.13
625 0.15
626 0.19
627 0.24
628 0.3
629 0.34
630 0.42
631 0.42
632 0.43
633 0.42
634 0.38
635 0.38
636 0.35
637 0.35
638 0.28
639 0.29
640 0.27
641 0.26
642 0.26
643 0.27
644 0.27
645 0.23
646 0.21
647 0.19
648 0.18
649 0.18
650 0.18
651 0.14
652 0.15
653 0.14
654 0.13
655 0.15
656 0.18
657 0.2
658 0.24
659 0.26
660 0.26
661 0.33
662 0.36
663 0.41
664 0.46
665 0.47
666 0.46
667 0.46
668 0.44
669 0.4
670 0.37
671 0.33
672 0.28
673 0.25
674 0.22
675 0.2
676 0.18
677 0.15
678 0.15
679 0.14
680 0.12
681 0.12
682 0.12
683 0.11
684 0.12
685 0.12
686 0.11
687 0.11
688 0.11
689 0.13
690 0.1
691 0.1
692 0.1
693 0.11
694 0.12
695 0.15
696 0.18
697 0.19
698 0.23
699 0.24
700 0.24
701 0.24
702 0.26
703 0.3
704 0.28
705 0.28
706 0.26
707 0.25
708 0.28
709 0.28
710 0.24
711 0.18
712 0.18
713 0.17
714 0.19
715 0.25
716 0.25
717 0.24
718 0.25
719 0.25
720 0.28
721 0.31
722 0.31
723 0.29
724 0.32
725 0.38
726 0.41
727 0.41
728 0.39
729 0.38
730 0.4
731 0.37
732 0.41
733 0.35
734 0.37
735 0.35
736 0.31
737 0.29
738 0.3
739 0.34
740 0.27
741 0.32
742 0.33
743 0.34
744 0.41
745 0.47
746 0.47
747 0.44
748 0.49
749 0.54
750 0.58
751 0.64
752 0.63
753 0.62
754 0.64
755 0.67
756 0.66
757 0.66
758 0.65
759 0.64
760 0.65
761 0.64
762 0.57
763 0.53
764 0.51
765 0.43
766 0.39
767 0.41
768 0.42
769 0.36
770 0.36
771 0.38
772 0.37
773 0.37
774 0.33
775 0.28
776 0.23
777 0.24
778 0.24
779 0.22
780 0.19
781 0.19
782 0.17
783 0.15
784 0.12
785 0.11
786 0.11
787 0.1
788 0.09
789 0.1
790 0.1
791 0.11
792 0.12
793 0.12
794 0.14
795 0.18
796 0.18
797 0.2
798 0.2
799 0.18
800 0.19
801 0.18
802 0.17
803 0.16
804 0.18
805 0.18
806 0.26
807 0.27
808 0.3
809 0.34
810 0.38
811 0.41
812 0.47
813 0.52
814 0.46
815 0.51
816 0.5
817 0.49
818 0.45
819 0.41
820 0.35
821 0.33
822 0.34
823 0.29
824 0.27
825 0.34
826 0.36
827 0.35
828 0.34
829 0.31
830 0.31
831 0.3
832 0.28
833 0.19
834 0.15
835 0.15
836 0.13
837 0.18
838 0.19
839 0.2
840 0.21
841 0.22
842 0.25
843 0.25
844 0.27
845 0.22
846 0.2
847 0.19
848 0.17
849 0.17
850 0.13
851 0.12
852 0.09
853 0.07
854 0.05
855 0.07
856 0.08
857 0.09
858 0.08
859 0.09
860 0.09
861 0.09
862 0.1
863 0.08
864 0.07
865 0.08
866 0.09
867 0.1
868 0.11
869 0.11
870 0.11
871 0.11
872 0.11
873 0.1
874 0.1
875 0.1
876 0.12
877 0.2
878 0.2
879 0.2
880 0.22
881 0.26
882 0.3
883 0.34
884 0.39
885 0.43
886 0.53
887 0.61
888 0.69
889 0.75
890 0.81
891 0.85
892 0.88
893 0.88
894 0.89
895 0.9
896 0.91
897 0.9
898 0.85
899 0.85
900 0.85
901 0.85
902 0.85
903 0.83
904 0.8
905 0.76
906 0.75
907 0.75
908 0.73
909 0.71
910 0.71
911 0.72
912 0.7
913 0.71
914 0.72
915 0.71
916 0.64
917 0.57
918 0.48
919 0.4
920 0.41
921 0.44
922 0.44