FuNGI

A0A1Y1VR40

Protein Details

Accession

A0A1Y1VR40

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
318-344	SSKDKEEKEKKEEKKKIVKTNQKAGLL	Basic
965-987	DRDENSNTTKRRKERERGLEVID	Hydrophilic
996-1018	QSENNKKVLARLKKEKNYWFANC	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
318-335	SSKDKEEKEKKEEKKKIV

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR040007 Tho2 IPR021418 THO_THOC2_C IPR021726 THO_THOC2_N IPR032302 THOC2_N
Gene Ontology	GO:0000347 C:THO complex GO:0006406 P:mRNA export from nucleus GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF11262 Tho2 PF11732 Thoc2 PF16134 THOC2_N

Amino Acid Sequences

MDNNLNNNKNNTSVNVDFQNIFKNWKTEQNTYKTLLKIYIIKYWIWLIDQETDGINTNLNDQVEDAKFKSEQKTKIIALTKELMTKNFIPAGLMKERFEVEMLEAIGLINSSKQFTKKSARINTSLLYKQTKFNLLREESEGYAKLITEITTNMYTYHPYGLSKEEIEKKDIILNERVHLVLTNIKSLIGYFDLDPNRVLDIIFDIFIANLDLKGRTSNGQILGNKFAYYQDPESPDNASFPLYVVTALLIKNNLVNINDLYPHLAPENDSMDEEYSQYLKEVKKNTEKETEPNPLLSAGSLSDDTVPSDHKKSKDDSSKDKEEKEKKEEKKKIVKTNQKAGLLAALLSIGDLKNSKIILDVSPRLGIMYQEIVHLISRIIHVSIQPLYKKVMKIPDTEESLEPKPYLTIHYELCNPLYEANLVIPRKKGYRVSSVIRYMFFYQQWKNDIPICNTFDDLLNYIPKFLKYVGIQIHQELTVLTKLVRLAKAHIKEKNVSEEYNNMWLSIISTYFLPSVSLLYSNPGFVMELWGLIKQYPYQVRYSLYSNWKNKSYRINQELAIVKISALKEIRRLMRRLSKDNTKQIGRMFGKLVHSNPVIAFDKMLEMIEGYENMTNPLVDGCKYLTHLEFDILSFVLIERLATSFKERIKEDGTSLAQWLSNLATFMGTVYKKYASMELSGILRYIIYQLKCNNVIDLVILKELIQKMSGIEITENLSDSQLDALAGGETLKREASTTRLIHTLTNYNLITPLFISLCQQRSICVYNTNLTHLKLIGNMFDQTNDTMIQYAEFLMANIDKHNYSKYIPSIKELCNNYYIDPETAFYIIRPKLNYLMRKAEQRESSNSIIVNNNTENSNSERVEKTEKLIENSNSMDIDEKPSESMEIDNNNNNNIETLNIWHKGLLTTIEEVSSILPNNVWDGISPQFYVTFWQLSLYDIYIPQSRYQEQIKKEKQIIHNLENDRDENSNTTKRRKERERGLEVIDRLENELNVQSENNKKVLARLKKEKNYWFANCTNIYNIISYLIQYCLYPR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.35
3	0.36
4	0.33
5	0.32
6	0.36
7	0.3
8	0.32
9	0.31
10	0.32
11	0.32
12	0.41
13	0.47
14	0.48
15	0.56
16	0.59
17	0.61
18	0.62
19	0.65
20	0.57
21	0.53
22	0.46
23	0.41
24	0.4
25	0.38
26	0.4
27	0.36
28	0.33
29	0.33
30	0.33
31	0.3
32	0.24
33	0.23
34	0.19
35	0.21
36	0.22
37	0.2
38	0.19
39	0.19
40	0.2
41	0.18
42	0.17
43	0.13
44	0.15
45	0.17
46	0.16
47	0.15
48	0.14
49	0.2
50	0.2
51	0.24
52	0.22
53	0.22
54	0.24
55	0.29
56	0.37
57	0.39
58	0.43
59	0.46
60	0.52
61	0.51
62	0.56
63	0.59
64	0.52
65	0.49
66	0.48
67	0.44
68	0.44
69	0.43
70	0.37
71	0.35
72	0.35
73	0.34
74	0.31
75	0.29
76	0.23
77	0.24
78	0.29
79	0.31
80	0.32
81	0.29
82	0.29
83	0.3
84	0.29
85	0.27
86	0.22
87	0.15
88	0.16
89	0.16
90	0.13
91	0.12
92	0.12
93	0.11
94	0.1
95	0.08
96	0.06
97	0.07
98	0.09
99	0.12
100	0.16
101	0.19
102	0.26
103	0.36
104	0.41
105	0.5
106	0.58
107	0.62
108	0.64
109	0.65
110	0.62
111	0.59
112	0.57
113	0.52
114	0.49
115	0.44
116	0.45
117	0.45
118	0.5
119	0.46
120	0.46
121	0.5
122	0.46
123	0.48
124	0.47
125	0.46
126	0.38
127	0.38
128	0.33
129	0.25
130	0.22
131	0.19
132	0.15
133	0.13
134	0.12
135	0.1
136	0.1
137	0.13
138	0.13
139	0.14
140	0.14
141	0.14
142	0.16
143	0.16
144	0.18
145	0.16
146	0.15
147	0.17
148	0.19
149	0.21
150	0.21
151	0.28
152	0.33
153	0.34
154	0.37
155	0.36
156	0.33
157	0.35
158	0.36
159	0.33
160	0.32
161	0.31
162	0.29
163	0.3
164	0.29
165	0.24
166	0.22
167	0.19
168	0.18
169	0.17
170	0.18
171	0.17
172	0.17
173	0.16
174	0.16
175	0.17
176	0.11
177	0.12
178	0.1
179	0.17
180	0.18
181	0.19
182	0.2
183	0.18
184	0.18
185	0.16
186	0.15
187	0.09
188	0.11
189	0.11
190	0.1
191	0.09
192	0.08
193	0.08
194	0.09
195	0.09
196	0.06
197	0.06
198	0.07
199	0.07
200	0.08
201	0.09
202	0.1
203	0.11
204	0.14
205	0.18
206	0.2
207	0.26
208	0.29
209	0.3
210	0.34
211	0.33
212	0.3
213	0.26
214	0.24
215	0.21
216	0.22
217	0.22
218	0.22
219	0.26
220	0.27
221	0.28
222	0.29
223	0.26
224	0.23
225	0.2
226	0.17
227	0.12
228	0.11
229	0.11
230	0.09
231	0.08
232	0.07
233	0.07
234	0.08
235	0.08
236	0.09
237	0.08
238	0.08
239	0.09
240	0.11
241	0.12
242	0.11
243	0.13
244	0.12
245	0.13
246	0.14
247	0.13
248	0.15
249	0.13
250	0.13
251	0.12
252	0.11
253	0.11
254	0.13
255	0.15
256	0.13
257	0.14
258	0.14
259	0.14
260	0.14
261	0.14
262	0.12
263	0.1
264	0.09
265	0.09
266	0.13
267	0.15
268	0.2
269	0.26
270	0.33
271	0.42
272	0.47
273	0.52
274	0.55
275	0.55
276	0.55
277	0.55
278	0.55
279	0.47
280	0.42
281	0.37
282	0.29
283	0.27
284	0.21
285	0.15
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.08
294	0.11
295	0.12
296	0.17
297	0.22
298	0.24
299	0.27
300	0.31
301	0.4
302	0.47
303	0.51
304	0.56
305	0.59
306	0.67
307	0.67
308	0.69
309	0.69
310	0.69
311	0.69
312	0.69
313	0.7
314	0.69
315	0.76
316	0.79
317	0.79
318	0.81
319	0.82
320	0.84
321	0.84
322	0.86
323	0.82
324	0.84
325	0.81
326	0.72
327	0.63
328	0.53
329	0.44
330	0.33
331	0.25
332	0.15
333	0.08
334	0.06
335	0.05
336	0.06
337	0.04
338	0.04
339	0.05
340	0.05
341	0.07
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.1
346	0.11
347	0.16
348	0.18
349	0.17
350	0.18
351	0.17
352	0.16
353	0.15
354	0.13
355	0.09
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.09
371	0.12
372	0.14
373	0.15
374	0.15
375	0.18
376	0.21
377	0.22
378	0.23
379	0.29
380	0.28
381	0.3
382	0.34
383	0.35
384	0.35
385	0.36
386	0.34
387	0.3
388	0.29
389	0.27
390	0.22
391	0.18
392	0.15
393	0.13
394	0.14
395	0.13
396	0.14
397	0.14
398	0.16
399	0.18
400	0.18
401	0.19
402	0.17
403	0.14
404	0.12
405	0.12
406	0.1
407	0.08
408	0.09
409	0.13
410	0.13
411	0.14
412	0.15
413	0.17
414	0.19
415	0.22
416	0.26
417	0.25
418	0.33
419	0.37
420	0.4
421	0.44
422	0.47
423	0.45
424	0.4
425	0.38
426	0.32
427	0.29
428	0.26
429	0.25
430	0.23
431	0.24
432	0.27
433	0.26
434	0.25
435	0.28
436	0.3
437	0.28
438	0.3
439	0.29
440	0.26
441	0.25
442	0.24
443	0.2
444	0.17
445	0.15
446	0.11
447	0.12
448	0.11
449	0.12
450	0.12
451	0.11
452	0.11
453	0.11
454	0.13
455	0.11
456	0.16
457	0.18
458	0.2
459	0.21
460	0.2
461	0.21
462	0.17
463	0.17
464	0.11
465	0.09
466	0.07
467	0.07
468	0.06
469	0.06
470	0.08
471	0.1
472	0.12
473	0.11
474	0.15
475	0.21
476	0.26
477	0.31
478	0.33
479	0.34
480	0.35
481	0.37
482	0.4
483	0.36
484	0.31
485	0.26
486	0.25
487	0.24
488	0.26
489	0.24
490	0.16
491	0.14
492	0.14
493	0.13
494	0.11
495	0.1
496	0.05
497	0.05
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.05
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.06
506	0.05
507	0.07
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.06
512	0.06
513	0.05
514	0.07
515	0.05
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.07
521	0.07
522	0.05
523	0.1
524	0.13
525	0.14
526	0.16
527	0.17
528	0.18
529	0.2
530	0.22
531	0.24
532	0.29
533	0.36
534	0.39
535	0.41
536	0.46
537	0.45
538	0.46
539	0.5
540	0.49
541	0.5
542	0.49
543	0.48
544	0.43
545	0.47
546	0.45
547	0.37
548	0.3
549	0.21
550	0.16
551	0.16
552	0.16
553	0.13
554	0.12
555	0.12
556	0.15
557	0.2
558	0.26
559	0.28
560	0.29
561	0.33
562	0.4
563	0.45
564	0.47
565	0.49
566	0.53
567	0.55
568	0.63
569	0.62
570	0.55
571	0.53
572	0.48
573	0.51
574	0.43
575	0.37
576	0.3
577	0.27
578	0.29
579	0.28
580	0.28
581	0.23
582	0.21
583	0.2
584	0.19
585	0.21
586	0.19
587	0.17
588	0.16
589	0.11
590	0.12
591	0.11
592	0.11
593	0.06
594	0.04
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.05
599	0.06
600	0.06
601	0.07
602	0.07
603	0.06
604	0.06
605	0.07
606	0.06
607	0.06
608	0.07
609	0.07
610	0.08
611	0.09
612	0.11
613	0.11
614	0.12
615	0.12
616	0.12
617	0.11
618	0.1
619	0.1
620	0.08
621	0.07
622	0.06
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.04
627	0.04
628	0.05
629	0.06
630	0.06
631	0.09
632	0.13
633	0.16
634	0.2
635	0.21
636	0.24
637	0.26
638	0.27
639	0.25
640	0.27
641	0.26
642	0.22
643	0.22
644	0.19
645	0.16
646	0.14
647	0.14
648	0.08
649	0.07
650	0.07
651	0.06
652	0.05
653	0.05
654	0.05
655	0.09
656	0.09
657	0.09
658	0.11
659	0.11
660	0.12
661	0.13
662	0.15
663	0.12
664	0.14
665	0.14
666	0.14
667	0.14
668	0.14
669	0.13
670	0.1
671	0.08
672	0.07
673	0.09
674	0.12
675	0.12
676	0.16
677	0.17
678	0.22
679	0.24
680	0.24
681	0.22
682	0.18
683	0.17
684	0.14
685	0.13
686	0.1
687	0.08
688	0.07
689	0.07
690	0.1
691	0.11
692	0.1
693	0.09
694	0.09
695	0.09
696	0.11
697	0.11
698	0.08
699	0.08
700	0.08
701	0.1
702	0.1
703	0.11
704	0.09
705	0.09
706	0.08
707	0.08
708	0.08
709	0.06
710	0.05
711	0.05
712	0.05
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.05
717	0.05
718	0.06
719	0.06
720	0.06
721	0.07
722	0.08
723	0.12
724	0.19
725	0.2
726	0.21
727	0.23
728	0.24
729	0.25
730	0.27
731	0.28
732	0.21
733	0.25
734	0.23
735	0.21
736	0.21
737	0.2
738	0.17
739	0.12
740	0.13
741	0.08
742	0.08
743	0.1
744	0.14
745	0.16
746	0.19
747	0.18
748	0.18
749	0.21
750	0.24
751	0.24
752	0.23
753	0.23
754	0.24
755	0.26
756	0.3
757	0.28
758	0.26
759	0.25
760	0.22
761	0.2
762	0.19
763	0.19
764	0.15
765	0.14
766	0.15
767	0.14
768	0.14
769	0.14
770	0.12
771	0.13
772	0.11
773	0.1
774	0.09
775	0.09
776	0.08
777	0.07
778	0.07
779	0.07
780	0.07
781	0.06
782	0.07
783	0.08
784	0.08
785	0.09
786	0.11
787	0.1
788	0.12
789	0.14
790	0.14
791	0.15
792	0.2
793	0.25
794	0.32
795	0.32
796	0.37
797	0.41
798	0.42
799	0.49
800	0.47
801	0.43
802	0.38
803	0.38
804	0.34
805	0.31
806	0.3
807	0.23
808	0.2
809	0.19
810	0.16
811	0.15
812	0.15
813	0.11
814	0.16
815	0.18
816	0.21
817	0.21
818	0.22
819	0.29
820	0.36
821	0.41
822	0.4
823	0.47
824	0.47
825	0.54
826	0.57
827	0.57
828	0.57
829	0.56
830	0.56
831	0.53
832	0.51
833	0.46
834	0.42
835	0.37
836	0.34
837	0.3
838	0.28
839	0.24
840	0.22
841	0.21
842	0.21
843	0.21
844	0.21
845	0.26
846	0.22
847	0.25
848	0.25
849	0.28
850	0.35
851	0.33
852	0.32
853	0.35
854	0.37
855	0.36
856	0.42
857	0.4
858	0.37
859	0.37
860	0.36
861	0.28
862	0.25
863	0.23
864	0.17
865	0.21
866	0.19
867	0.18
868	0.17
869	0.17
870	0.17
871	0.16
872	0.17
873	0.15
874	0.19
875	0.22
876	0.27
877	0.28
878	0.29
879	0.29
880	0.27
881	0.23
882	0.18
883	0.16
884	0.11
885	0.14
886	0.18
887	0.19
888	0.19
889	0.19
890	0.19
891	0.19
892	0.19
893	0.17
894	0.14
895	0.15
896	0.15
897	0.15
898	0.14
899	0.14
900	0.14
901	0.13
902	0.12
903	0.1
904	0.1
905	0.1
906	0.12
907	0.12
908	0.11
909	0.09
910	0.11
911	0.14
912	0.15
913	0.15
914	0.14
915	0.14
916	0.14
917	0.17
918	0.17
919	0.16
920	0.14
921	0.15
922	0.15
923	0.16
924	0.17
925	0.15
926	0.14
927	0.13
928	0.16
929	0.19
930	0.2
931	0.23
932	0.27
933	0.27
934	0.31
935	0.39
936	0.43
937	0.47
938	0.56
939	0.6
940	0.64
941	0.68
942	0.72
943	0.7
944	0.74
945	0.74
946	0.69
947	0.7
948	0.66
949	0.65
950	0.6
951	0.53
952	0.45
953	0.39
954	0.35
955	0.3
956	0.33
957	0.37
958	0.4
959	0.48
960	0.55
961	0.62
962	0.7
963	0.76
964	0.8
965	0.82
966	0.87
967	0.86
968	0.82
969	0.8
970	0.76
971	0.67
972	0.61
973	0.52
974	0.42
975	0.36
976	0.33
977	0.26
978	0.2
979	0.22
980	0.19
981	0.18
982	0.18
983	0.21
984	0.27
985	0.31
986	0.3
987	0.29
988	0.29
989	0.35
990	0.44
991	0.49
992	0.51
993	0.58
994	0.68
995	0.75
996	0.84
997	0.85
998	0.83
999	0.82
1000	0.78
1001	0.74
1002	0.67
1003	0.65
1004	0.59
1005	0.53
1006	0.48
1007	0.42
1008	0.37
1009	0.31
1010	0.28
1011	0.23
1012	0.2
1013	0.18
1014	0.17
1015	0.14
1016	0.14

A0A1Y1VR40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer