Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VSS4

Protein Details
Accession A0A1Y1VSS4    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-36MLKIFKKKSSKKQIVDDKPVERSFRVRRPQTQEEIEHydrophilic
126-158SIATSTHSHRHRHKHHHKHHHHHHKNNNNTSTMBasic
447-469TTTTSIRSRKGKKTKKSLVPESDHydrophilic
587-611TVSKASSSSKTKKQKQKPLIELIPSHydrophilic
750-788SNSNSSTVSKKGKKKGKKNGKKKGTKKGDKKNKDDLESVBasic
805-833RSVMSKRSTKSNKSTKSGKKTKAKKQVTQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
455-462RKGKKTKK
759-782KKGKKKGKKNGKKKGTKKGDKKNK
811-829RSTKSNKSTKSGKKTKAKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008160  Collagen  
Pfam View protein in Pfam  
PF01391  Collagen  
Amino Acid Sequences MLKIFKKKSSKKQIVDDKPVERSFRVRRPQTQEEIEAIAAAKARREAEQRAAESKQNEQLPQPQIVQPQPQPVIPQRLHVTNPTTAIVENSQATINNAEEDSDDDKPLQSLPQINNVVKREDDQESIATSTHSHRHRHKHHHKHHHHHHKNNNNTSTMNINVSDKSKDPDNLHSSNIDIQSFMFGGDREETNTSSISKPTGTSSLFDDIMQSFSTLHDTGVIDTSSSSNNMSMTQRNKYVLNDSSNTSYSTSRTYNTNNETSTYGGKRVYKLGSSNDTSSTYNSSSVRNNDNQDDDRVTTSDIARILLGQSDLFSSDNKYESSYTSKPKYSLGDNSSKYESKYESRYDTKYESKYSSNSNYSSNNNSYSYKYGSNNTYDDPEDPKTQIKPEEVRGKSPAEILKAIRERNLANVKGKQSDEENDADSQKEQTNDEDNNASTTAADNQTTTTSIRSRKGKKTKKSLVPESDSEEDESESEFTDSEEEKPKQNEQQTPMVPPMVPPVMPQNPRNSILNMPPMINPMMNNMAPMNPLVKPMAPLSPMLNPLMKPMNPMSPRQSLIIPPAPTPLGLPGAAAPVCPPSPSLSTVSKASSSSKTKKQKQKPLIELIPSQPKEDPVDIESKDEDDDDDDSPIGSHRDSIISSNSQALPPPAIPNPLPNMPGLPGTPGMPGLPGMPGMPGMPGLPGMPGMPGMPGMPGLPGMPGLPGMPGTPGMPGMIMGPNGQPMIVPQARPMFMDQFAMQNPGLGRSNSNSSTVSKKGKKKGKKNGKKKGTKKGDKKNKDDLESVQDTESLVSESVIDDDNRSVMSKRSTKSNKSTKSGKKTKAKKQVTQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.9
3 0.87
4 0.81
5 0.79
6 0.75
7 0.68
8 0.6
9 0.58
10 0.58
11 0.59
12 0.64
13 0.64
14 0.7
15 0.75
16 0.82
17 0.81
18 0.78
19 0.72
20 0.64
21 0.58
22 0.48
23 0.39
24 0.31
25 0.23
26 0.2
27 0.16
28 0.15
29 0.16
30 0.18
31 0.22
32 0.26
33 0.31
34 0.37
35 0.45
36 0.47
37 0.49
38 0.51
39 0.51
40 0.49
41 0.49
42 0.46
43 0.43
44 0.41
45 0.39
46 0.44
47 0.43
48 0.45
49 0.43
50 0.39
51 0.41
52 0.44
53 0.48
54 0.43
55 0.47
56 0.45
57 0.43
58 0.45
59 0.45
60 0.5
61 0.44
62 0.46
63 0.42
64 0.45
65 0.46
66 0.46
67 0.43
68 0.37
69 0.38
70 0.33
71 0.29
72 0.25
73 0.25
74 0.21
75 0.19
76 0.17
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.16
81 0.15
82 0.15
83 0.14
84 0.13
85 0.12
86 0.12
87 0.15
88 0.17
89 0.17
90 0.17
91 0.16
92 0.16
93 0.16
94 0.17
95 0.15
96 0.15
97 0.2
98 0.21
99 0.3
100 0.36
101 0.38
102 0.44
103 0.45
104 0.43
105 0.37
106 0.37
107 0.33
108 0.3
109 0.3
110 0.25
111 0.24
112 0.23
113 0.23
114 0.21
115 0.17
116 0.15
117 0.17
118 0.22
119 0.27
120 0.33
121 0.41
122 0.51
123 0.61
124 0.71
125 0.79
126 0.83
127 0.88
128 0.92
129 0.94
130 0.94
131 0.95
132 0.96
133 0.95
134 0.93
135 0.93
136 0.91
137 0.91
138 0.9
139 0.83
140 0.74
141 0.64
142 0.56
143 0.49
144 0.41
145 0.32
146 0.24
147 0.21
148 0.21
149 0.22
150 0.23
151 0.21
152 0.21
153 0.23
154 0.28
155 0.29
156 0.36
157 0.41
158 0.4
159 0.4
160 0.38
161 0.35
162 0.35
163 0.34
164 0.25
165 0.18
166 0.16
167 0.16
168 0.15
169 0.14
170 0.09
171 0.07
172 0.09
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.16
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.16
187 0.19
188 0.18
189 0.18
190 0.2
191 0.22
192 0.22
193 0.21
194 0.2
195 0.16
196 0.16
197 0.15
198 0.12
199 0.09
200 0.09
201 0.12
202 0.11
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.08
216 0.09
217 0.11
218 0.14
219 0.19
220 0.22
221 0.26
222 0.28
223 0.3
224 0.31
225 0.3
226 0.34
227 0.33
228 0.33
229 0.31
230 0.3
231 0.32
232 0.31
233 0.3
234 0.26
235 0.21
236 0.18
237 0.2
238 0.19
239 0.17
240 0.2
241 0.23
242 0.29
243 0.33
244 0.36
245 0.32
246 0.33
247 0.32
248 0.3
249 0.31
250 0.25
251 0.22
252 0.22
253 0.23
254 0.23
255 0.26
256 0.27
257 0.24
258 0.26
259 0.29
260 0.31
261 0.31
262 0.31
263 0.29
264 0.3
265 0.28
266 0.26
267 0.24
268 0.19
269 0.19
270 0.19
271 0.19
272 0.21
273 0.25
274 0.29
275 0.3
276 0.32
277 0.32
278 0.35
279 0.34
280 0.33
281 0.31
282 0.27
283 0.24
284 0.21
285 0.19
286 0.16
287 0.15
288 0.15
289 0.13
290 0.12
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.08
295 0.08
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.1
306 0.12
307 0.12
308 0.13
309 0.2
310 0.22
311 0.27
312 0.3
313 0.32
314 0.32
315 0.33
316 0.34
317 0.31
318 0.34
319 0.33
320 0.38
321 0.38
322 0.4
323 0.4
324 0.39
325 0.35
326 0.3
327 0.28
328 0.23
329 0.26
330 0.26
331 0.29
332 0.32
333 0.33
334 0.34
335 0.36
336 0.39
337 0.38
338 0.38
339 0.35
340 0.33
341 0.33
342 0.34
343 0.35
344 0.32
345 0.3
346 0.3
347 0.3
348 0.3
349 0.33
350 0.3
351 0.27
352 0.26
353 0.26
354 0.25
355 0.24
356 0.24
357 0.23
358 0.22
359 0.23
360 0.24
361 0.25
362 0.25
363 0.23
364 0.23
365 0.2
366 0.19
367 0.2
368 0.2
369 0.18
370 0.18
371 0.2
372 0.19
373 0.2
374 0.22
375 0.22
376 0.22
377 0.27
378 0.36
379 0.35
380 0.36
381 0.36
382 0.35
383 0.31
384 0.32
385 0.27
386 0.19
387 0.2
388 0.18
389 0.22
390 0.24
391 0.24
392 0.23
393 0.23
394 0.21
395 0.26
396 0.31
397 0.27
398 0.27
399 0.31
400 0.31
401 0.33
402 0.33
403 0.27
404 0.23
405 0.23
406 0.22
407 0.19
408 0.18
409 0.16
410 0.16
411 0.16
412 0.14
413 0.14
414 0.12
415 0.12
416 0.11
417 0.12
418 0.15
419 0.15
420 0.17
421 0.16
422 0.14
423 0.14
424 0.14
425 0.12
426 0.08
427 0.08
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.08
433 0.09
434 0.1
435 0.1
436 0.09
437 0.13
438 0.16
439 0.22
440 0.3
441 0.37
442 0.46
443 0.57
444 0.65
445 0.7
446 0.77
447 0.81
448 0.82
449 0.84
450 0.83
451 0.79
452 0.74
453 0.66
454 0.61
455 0.53
456 0.44
457 0.35
458 0.27
459 0.19
460 0.15
461 0.14
462 0.09
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.07
468 0.08
469 0.1
470 0.17
471 0.18
472 0.21
473 0.24
474 0.27
475 0.31
476 0.36
477 0.39
478 0.36
479 0.43
480 0.41
481 0.41
482 0.39
483 0.34
484 0.28
485 0.22
486 0.21
487 0.14
488 0.12
489 0.11
490 0.16
491 0.22
492 0.26
493 0.28
494 0.31
495 0.34
496 0.36
497 0.37
498 0.33
499 0.29
500 0.29
501 0.33
502 0.27
503 0.24
504 0.22
505 0.23
506 0.21
507 0.19
508 0.15
509 0.12
510 0.14
511 0.13
512 0.13
513 0.12
514 0.11
515 0.11
516 0.12
517 0.11
518 0.08
519 0.09
520 0.1
521 0.09
522 0.1
523 0.11
524 0.13
525 0.12
526 0.13
527 0.14
528 0.15
529 0.17
530 0.17
531 0.17
532 0.15
533 0.17
534 0.2
535 0.18
536 0.19
537 0.19
538 0.26
539 0.26
540 0.3
541 0.32
542 0.32
543 0.34
544 0.32
545 0.32
546 0.25
547 0.29
548 0.32
549 0.28
550 0.24
551 0.24
552 0.23
553 0.22
554 0.2
555 0.16
556 0.11
557 0.1
558 0.1
559 0.08
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.09
564 0.09
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.1
569 0.13
570 0.15
571 0.19
572 0.19
573 0.22
574 0.23
575 0.24
576 0.22
577 0.21
578 0.23
579 0.26
580 0.31
581 0.36
582 0.44
583 0.53
584 0.62
585 0.71
586 0.78
587 0.82
588 0.84
589 0.88
590 0.86
591 0.86
592 0.81
593 0.74
594 0.67
595 0.62
596 0.61
597 0.51
598 0.45
599 0.36
600 0.33
601 0.32
602 0.3
603 0.27
604 0.19
605 0.24
606 0.23
607 0.24
608 0.23
609 0.2
610 0.19
611 0.17
612 0.15
613 0.11
614 0.12
615 0.11
616 0.11
617 0.1
618 0.1
619 0.1
620 0.1
621 0.1
622 0.08
623 0.08
624 0.08
625 0.1
626 0.11
627 0.13
628 0.16
629 0.17
630 0.18
631 0.21
632 0.21
633 0.2
634 0.2
635 0.19
636 0.17
637 0.16
638 0.19
639 0.16
640 0.19
641 0.19
642 0.22
643 0.26
644 0.26
645 0.26
646 0.23
647 0.22
648 0.2
649 0.21
650 0.17
651 0.15
652 0.13
653 0.13
654 0.13
655 0.12
656 0.11
657 0.1
658 0.1
659 0.08
660 0.08
661 0.07
662 0.07
663 0.06
664 0.07
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.06
683 0.06
684 0.06
685 0.06
686 0.06
687 0.06
688 0.06
689 0.06
690 0.06
691 0.06
692 0.06
693 0.06
694 0.06
695 0.06
696 0.07
697 0.08
698 0.08
699 0.08
700 0.08
701 0.08
702 0.07
703 0.07
704 0.08
705 0.09
706 0.09
707 0.1
708 0.1
709 0.12
710 0.12
711 0.11
712 0.09
713 0.08
714 0.17
715 0.18
716 0.18
717 0.21
718 0.27
719 0.27
720 0.29
721 0.31
722 0.26
723 0.24
724 0.27
725 0.23
726 0.22
727 0.22
728 0.25
729 0.21
730 0.21
731 0.2
732 0.21
733 0.23
734 0.2
735 0.21
736 0.22
737 0.28
738 0.27
739 0.29
740 0.27
741 0.27
742 0.33
743 0.37
744 0.44
745 0.46
746 0.54
747 0.61
748 0.7
749 0.78
750 0.83
751 0.87
752 0.89
753 0.91
754 0.93
755 0.94
756 0.95
757 0.95
758 0.94
759 0.94
760 0.94
761 0.94
762 0.93
763 0.94
764 0.94
765 0.93
766 0.92
767 0.91
768 0.89
769 0.83
770 0.76
771 0.69
772 0.67
773 0.61
774 0.54
775 0.43
776 0.35
777 0.3
778 0.26
779 0.22
780 0.14
781 0.1
782 0.09
783 0.08
784 0.08
785 0.1
786 0.11
787 0.11
788 0.11
789 0.12
790 0.13
791 0.13
792 0.15
793 0.14
794 0.17
795 0.26
796 0.32
797 0.34
798 0.44
799 0.53
800 0.6
801 0.7
802 0.75
803 0.76
804 0.76
805 0.84
806 0.84
807 0.86
808 0.87
809 0.86
810 0.86
811 0.88
812 0.91
813 0.91