FuNGI

Q4PDT1

Protein Details

Accession

Q4PDT1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
9-31	ALEDRAKSLHKKEKKASAKAAAA	Hydrophilic
42-99	GSPSPASPAKKDKKDKKDKKDKKRSADDADADDDEKAAKKRRKEEKKAKKAAAKSGAA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
15-29	KSLHKKEKKASAKAA
46-66	PASPAKKDKKDKKDKKDKKRS
77-95	KAAKKRRKEEKKAKKAAAK

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR000629 RNA-helicase_DEAD-box_CS
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0030687 C:preribosome, large subunit precursor GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0000464 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 upstream of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	uma:UMAG_01732 -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS00039 DEAD_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51195 Q_MOTIF
CDD	cd00268 DEADc cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MTTSATEKALEDRAKSLHKKEKKASAKAAAAAGASASTSLEGSPSPASPAKKDKKDKKDKKDKKRSADDADADDDEKAAKKRRKEEKKAKKAAAKSGAATSLESTPAASPAPAASSSASAASFTPTNPAAARAFVESHNITIEAPEESNERPPLPMVDFRELDGKVDAAVKKTLDSQGFSTPTPIQACCWPVLLQNKDVVGIAETGSGKTFAFGLPALQHLVTKHKVLDSGKKKAKGAQVNVLVIAPTRELAIQTEENMAKLGKSMGIGMICLYGGVSKQEQVRLLNQSPPVRIVVGTPGRVLDMARDGSLDLSGVTYLVLDEADRMLDKGFEPDIRAIIGMCKSREEGRHTSMFSATWPPAVRGLAESFMNGPVRVTVGSDELSANRRVEQTVEVLADGYAKERRLNDFLRSVNAQRSKDKILIFALYKKEAQRIEQTLRRGGFKVSGIHGDLGQNERIASLERFKSAETPLLVATDVAARGLDIPNVEHVVNYTFPLTIEDYVHRIGRTGRGGKTGKSLTFFTEMDKAHAGELIRVLKDADQKVPDALTKFPTTIKKKTHSSYGDHFKELVPGKAKKITFDDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.47
3	0.52
4	0.55
5	0.61
6	0.69
7	0.74
8	0.8
9	0.81
10	0.84
11	0.83
12	0.82
13	0.78
14	0.71
15	0.64
16	0.55
17	0.44
18	0.35
19	0.26
20	0.16
21	0.11
22	0.08
23	0.06
24	0.05
25	0.05
26	0.05
27	0.06
28	0.06
29	0.09
30	0.1
31	0.11
32	0.15
33	0.19
34	0.22
35	0.28
36	0.38
37	0.46
38	0.55
39	0.65
40	0.72
41	0.78
42	0.87
43	0.92
44	0.93
45	0.94
46	0.95
47	0.95
48	0.96
49	0.95
50	0.94
51	0.94
52	0.92
53	0.89
54	0.88
55	0.8
56	0.73
57	0.67
58	0.57
59	0.47
60	0.38
61	0.29
62	0.21
63	0.21
64	0.21
65	0.27
66	0.31
67	0.39
68	0.49
69	0.6
70	0.7
71	0.77
72	0.84
73	0.86
74	0.91
75	0.94
76	0.93
77	0.9
78	0.86
79	0.84
80	0.82
81	0.73
82	0.64
83	0.57
84	0.51
85	0.43
86	0.37
87	0.28
88	0.21
89	0.18
90	0.16
91	0.14
92	0.11
93	0.11
94	0.11
95	0.09
96	0.08
97	0.08
98	0.1
99	0.09
100	0.1
101	0.09
102	0.1
103	0.11
104	0.11
105	0.11
106	0.09
107	0.09
108	0.11
109	0.11
110	0.1
111	0.13
112	0.12
113	0.14
114	0.13
115	0.16
116	0.15
117	0.15
118	0.16
119	0.14
120	0.16
121	0.14
122	0.19
123	0.17
124	0.17
125	0.16
126	0.16
127	0.14
128	0.12
129	0.13
130	0.09
131	0.08
132	0.09
133	0.1
134	0.11
135	0.16
136	0.17
137	0.17
138	0.16
139	0.16
140	0.18
141	0.19
142	0.24
143	0.24
144	0.28
145	0.27
146	0.28
147	0.32
148	0.29
149	0.27
150	0.22
151	0.17
152	0.13
153	0.17
154	0.17
155	0.14
156	0.16
157	0.15
158	0.16
159	0.18
160	0.22
161	0.19
162	0.2
163	0.2
164	0.25
165	0.26
166	0.26
167	0.26
168	0.22
169	0.24
170	0.24
171	0.22
172	0.17
173	0.19
174	0.2
175	0.18
176	0.19
177	0.16
178	0.19
179	0.27
180	0.28
181	0.26
182	0.26
183	0.26
184	0.24
185	0.24
186	0.19
187	0.12
188	0.1
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.08
193	0.09
194	0.09
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.05
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.07
203	0.08
204	0.09
205	0.08
206	0.09
207	0.09
208	0.15
209	0.15
210	0.16
211	0.16
212	0.15
213	0.2
214	0.21
215	0.31
216	0.33
217	0.41
218	0.46
219	0.49
220	0.49
221	0.5
222	0.56
223	0.53
224	0.5
225	0.48
226	0.46
227	0.42
228	0.42
229	0.36
230	0.28
231	0.2
232	0.17
233	0.09
234	0.05
235	0.05
236	0.04
237	0.05
238	0.06
239	0.09
240	0.09
241	0.1
242	0.13
243	0.13
244	0.13
245	0.13
246	0.12
247	0.09
248	0.09
249	0.08
250	0.05
251	0.05
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.04
260	0.04
261	0.03
262	0.03
263	0.05
264	0.05
265	0.07
266	0.09
267	0.11
268	0.12
269	0.13
270	0.16
271	0.21
272	0.22
273	0.23
274	0.26
275	0.27
276	0.25
277	0.25
278	0.22
279	0.17
280	0.16
281	0.13
282	0.15
283	0.15
284	0.15
285	0.14
286	0.14
287	0.13
288	0.14
289	0.13
290	0.07
291	0.08
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.04
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.04
314	0.04
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.07
319	0.08
320	0.09
321	0.1
322	0.1
323	0.09
324	0.09
325	0.08
326	0.09
327	0.11
328	0.13
329	0.12
330	0.13
331	0.14
332	0.18
333	0.22
334	0.26
335	0.28
336	0.3
337	0.33
338	0.33
339	0.33
340	0.3
341	0.26
342	0.21
343	0.2
344	0.16
345	0.15
346	0.15
347	0.14
348	0.15
349	0.15
350	0.14
351	0.12
352	0.13
353	0.11
354	0.11
355	0.11
356	0.1
357	0.12
358	0.12
359	0.1
360	0.09
361	0.08
362	0.09
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.07
367	0.08
368	0.09
369	0.09
370	0.1
371	0.13
372	0.14
373	0.14
374	0.14
375	0.15
376	0.14
377	0.15
378	0.15
379	0.14
380	0.14
381	0.14
382	0.12
383	0.11
384	0.11
385	0.1
386	0.09
387	0.09
388	0.09
389	0.1
390	0.13
391	0.14
392	0.18
393	0.23
394	0.26
395	0.28
396	0.32
397	0.32
398	0.33
399	0.34
400	0.33
401	0.36
402	0.4
403	0.38
404	0.36
405	0.4
406	0.4
407	0.42
408	0.4
409	0.34
410	0.3
411	0.31
412	0.29
413	0.31
414	0.3
415	0.27
416	0.3
417	0.28
418	0.32
419	0.3
420	0.31
421	0.33
422	0.36
423	0.41
424	0.43
425	0.45
426	0.46
427	0.46
428	0.45
429	0.39
430	0.34
431	0.3
432	0.28
433	0.28
434	0.24
435	0.25
436	0.24
437	0.23
438	0.23
439	0.2
440	0.2
441	0.19
442	0.17
443	0.15
444	0.13
445	0.12
446	0.12
447	0.14
448	0.13
449	0.17
450	0.18
451	0.2
452	0.21
453	0.21
454	0.24
455	0.23
456	0.26
457	0.21
458	0.2
459	0.19
460	0.19
461	0.18
462	0.15
463	0.13
464	0.1
465	0.09
466	0.07
467	0.07
468	0.06
469	0.08
470	0.09
471	0.09
472	0.08
473	0.09
474	0.11
475	0.13
476	0.13
477	0.11
478	0.12
479	0.13
480	0.13
481	0.13
482	0.12
483	0.1
484	0.11
485	0.13
486	0.14
487	0.13
488	0.15
489	0.16
490	0.18
491	0.21
492	0.23
493	0.2
494	0.19
495	0.2
496	0.24
497	0.31
498	0.34
499	0.34
500	0.41
501	0.44
502	0.44
503	0.5
504	0.49
505	0.43
506	0.41
507	0.39
508	0.34
509	0.37
510	0.35
511	0.3
512	0.31
513	0.29
514	0.29
515	0.3
516	0.26
517	0.22
518	0.24
519	0.21
520	0.16
521	0.21
522	0.22
523	0.2
524	0.2
525	0.2
526	0.22
527	0.29
528	0.3
529	0.31
530	0.29
531	0.3
532	0.32
533	0.33
534	0.33
535	0.27
536	0.27
537	0.26
538	0.26
539	0.26
540	0.31
541	0.39
542	0.42
543	0.49
544	0.55
545	0.58
546	0.64
547	0.68
548	0.72
549	0.68
550	0.68
551	0.7
552	0.72
553	0.68
554	0.62
555	0.58
556	0.48
557	0.5
558	0.46
559	0.43
560	0.4
561	0.4
562	0.43
563	0.5
564	0.5
565	0.47

Q4PDT1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer