Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VU62

Protein Details
Accession A0A1Y1VU62    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-350FEQIDRKVKKRMEEQERKNKKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
334-350RKVKKRMEEQERKNKKK
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10.5, cyto 9.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017351  PINCH_1-4-like  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0110165  C:cellular anatomical entity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
CDD cd08368  LIM  
Amino Acid Sequences MATTVASGTDQIANGKKVCPVCKETIVDDYFETEKSFYHKECFVCHQCLMPFPEGIYFETDEGLYCEYDNSVLFGNRCGKCGQIILGKCLTAMNLTWHPEHFTCEECGNLLANMTFINRNGKPYCKPCNTMLKLQEEKMKKEACGKCKKPIAQEDLLVLKGIRYHAYHFPCTICKAILGADCVEYEGKLYCPKDYEIVTAPVCYTCRRPIFGASITALGREFHTEHFVCFKCEKRFDDSMFYEYQDKPYCITHYNELTQSNCGRCKHPASGKVITAMNKKWCEHHFSCFGCDLDFNIQREPYFEWDLKPMCKNCYDQLPSSVKKSIEKFEQIDRKVKKRMEEQERKNKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.28
4 0.32
5 0.36
6 0.39
7 0.41
8 0.43
9 0.49
10 0.5
11 0.48
12 0.51
13 0.47
14 0.42
15 0.36
16 0.33
17 0.27
18 0.25
19 0.23
20 0.15
21 0.15
22 0.18
23 0.22
24 0.21
25 0.24
26 0.28
27 0.29
28 0.34
29 0.42
30 0.43
31 0.43
32 0.42
33 0.43
34 0.39
35 0.42
36 0.42
37 0.35
38 0.29
39 0.24
40 0.27
41 0.23
42 0.23
43 0.21
44 0.18
45 0.16
46 0.16
47 0.15
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.11
60 0.11
61 0.15
62 0.24
63 0.24
64 0.25
65 0.25
66 0.24
67 0.23
68 0.24
69 0.24
70 0.22
71 0.23
72 0.26
73 0.26
74 0.26
75 0.24
76 0.22
77 0.19
78 0.12
79 0.11
80 0.12
81 0.15
82 0.17
83 0.18
84 0.19
85 0.22
86 0.21
87 0.24
88 0.2
89 0.19
90 0.18
91 0.18
92 0.17
93 0.15
94 0.15
95 0.12
96 0.11
97 0.09
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.14
105 0.14
106 0.2
107 0.22
108 0.26
109 0.31
110 0.38
111 0.46
112 0.45
113 0.48
114 0.49
115 0.57
116 0.57
117 0.58
118 0.56
119 0.54
120 0.52
121 0.5
122 0.52
123 0.44
124 0.43
125 0.42
126 0.39
127 0.32
128 0.39
129 0.43
130 0.46
131 0.53
132 0.53
133 0.55
134 0.6
135 0.63
136 0.6
137 0.62
138 0.59
139 0.5
140 0.48
141 0.42
142 0.36
143 0.33
144 0.26
145 0.18
146 0.11
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.11
152 0.18
153 0.22
154 0.23
155 0.23
156 0.23
157 0.23
158 0.24
159 0.22
160 0.15
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.12
179 0.13
180 0.15
181 0.15
182 0.17
183 0.15
184 0.18
185 0.18
186 0.16
187 0.16
188 0.14
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.18
193 0.2
194 0.21
195 0.22
196 0.24
197 0.28
198 0.28
199 0.27
200 0.21
201 0.22
202 0.2
203 0.19
204 0.16
205 0.12
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.09
210 0.15
211 0.15
212 0.15
213 0.21
214 0.21
215 0.23
216 0.25
217 0.3
218 0.32
219 0.37
220 0.4
221 0.4
222 0.45
223 0.44
224 0.49
225 0.44
226 0.41
227 0.36
228 0.34
229 0.32
230 0.27
231 0.3
232 0.26
233 0.24
234 0.22
235 0.24
236 0.25
237 0.24
238 0.27
239 0.27
240 0.28
241 0.3
242 0.32
243 0.32
244 0.3
245 0.31
246 0.32
247 0.31
248 0.32
249 0.31
250 0.31
251 0.34
252 0.38
253 0.43
254 0.47
255 0.49
256 0.51
257 0.55
258 0.53
259 0.52
260 0.49
261 0.45
262 0.43
263 0.41
264 0.42
265 0.41
266 0.41
267 0.43
268 0.43
269 0.48
270 0.45
271 0.47
272 0.47
273 0.44
274 0.47
275 0.44
276 0.41
277 0.32
278 0.3
279 0.26
280 0.26
281 0.29
282 0.27
283 0.27
284 0.28
285 0.27
286 0.29
287 0.29
288 0.26
289 0.27
290 0.27
291 0.25
292 0.31
293 0.35
294 0.38
295 0.43
296 0.4
297 0.39
298 0.42
299 0.44
300 0.42
301 0.48
302 0.49
303 0.44
304 0.5
305 0.54
306 0.52
307 0.53
308 0.54
309 0.46
310 0.47
311 0.49
312 0.48
313 0.47
314 0.52
315 0.51
316 0.55
317 0.63
318 0.61
319 0.66
320 0.67
321 0.66
322 0.68
323 0.69
324 0.67
325 0.68
326 0.74
327 0.75
328 0.78
329 0.81
330 0.84