Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VVY9

Protein Details
Accession A0A1Y1VVY9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-84DYVITEKVKKIKRNKINNPEDYIIHydrophilic
253-276LAATIRNHKKRNGKCYICKKFGHFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MSVRTNNRRTRDGETYEPENRHNISFNYTDSFTHTVTLNTENYNSWKTNMLYLLDINNLVDYVITEKVKKIKRNKINNPEDYIIDKLDPSVAYHKSTKLPDIKNDNTTKWIILNSLNEETRKIIENRGKTAYEVWKILENSFTKGKEQLKTELKEKLEKLKFDTSVDINIFISYIENIFDELELLDHNIPDEAKVGFLNRSLPENLRWINVFQFRDNWKNCITYITKVIPDIIYSYRKENRLLKINSDNKEVLAATIRNHKKRNGKCYICKKFGHFAYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.61
3 0.62
4 0.6
5 0.54
6 0.5
7 0.46
8 0.4
9 0.37
10 0.32
11 0.3
12 0.29
13 0.29
14 0.29
15 0.28
16 0.26
17 0.27
18 0.29
19 0.24
20 0.23
21 0.21
22 0.18
23 0.19
24 0.23
25 0.19
26 0.18
27 0.19
28 0.19
29 0.22
30 0.25
31 0.24
32 0.22
33 0.25
34 0.24
35 0.27
36 0.27
37 0.25
38 0.22
39 0.22
40 0.22
41 0.18
42 0.18
43 0.14
44 0.11
45 0.1
46 0.08
47 0.06
48 0.05
49 0.06
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.14
54 0.23
55 0.29
56 0.37
57 0.45
58 0.53
59 0.62
60 0.73
61 0.81
62 0.84
63 0.87
64 0.85
65 0.8
66 0.71
67 0.63
68 0.54
69 0.45
70 0.34
71 0.25
72 0.19
73 0.13
74 0.13
75 0.11
76 0.1
77 0.14
78 0.15
79 0.18
80 0.2
81 0.22
82 0.25
83 0.26
84 0.31
85 0.34
86 0.36
87 0.4
88 0.46
89 0.48
90 0.51
91 0.52
92 0.47
93 0.42
94 0.4
95 0.33
96 0.26
97 0.22
98 0.16
99 0.15
100 0.16
101 0.16
102 0.18
103 0.19
104 0.18
105 0.18
106 0.18
107 0.17
108 0.18
109 0.15
110 0.19
111 0.23
112 0.26
113 0.29
114 0.31
115 0.3
116 0.27
117 0.31
118 0.29
119 0.26
120 0.24
121 0.21
122 0.22
123 0.22
124 0.22
125 0.22
126 0.18
127 0.18
128 0.21
129 0.21
130 0.17
131 0.22
132 0.26
133 0.25
134 0.27
135 0.32
136 0.36
137 0.38
138 0.4
139 0.4
140 0.38
141 0.4
142 0.39
143 0.41
144 0.38
145 0.36
146 0.39
147 0.38
148 0.38
149 0.34
150 0.35
151 0.26
152 0.26
153 0.25
154 0.2
155 0.15
156 0.13
157 0.12
158 0.09
159 0.09
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.13
186 0.12
187 0.16
188 0.17
189 0.19
190 0.19
191 0.25
192 0.25
193 0.23
194 0.23
195 0.22
196 0.25
197 0.3
198 0.3
199 0.25
200 0.31
201 0.34
202 0.43
203 0.44
204 0.42
205 0.38
206 0.37
207 0.36
208 0.36
209 0.34
210 0.28
211 0.31
212 0.31
213 0.3
214 0.29
215 0.3
216 0.24
217 0.22
218 0.22
219 0.2
220 0.21
221 0.22
222 0.28
223 0.33
224 0.35
225 0.41
226 0.45
227 0.49
228 0.54
229 0.56
230 0.56
231 0.6
232 0.66
233 0.63
234 0.62
235 0.54
236 0.44
237 0.44
238 0.36
239 0.27
240 0.24
241 0.22
242 0.19
243 0.29
244 0.38
245 0.43
246 0.48
247 0.55
248 0.6
249 0.68
250 0.76
251 0.76
252 0.78
253 0.8
254 0.87
255 0.9
256 0.87
257 0.83
258 0.78
259 0.77