Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VXF1

Protein Details
Accession A0A1Y1VXF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MNRYRNKRNNDRKKKLGNKKSNADIRKTFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-20NKRNNDRKKKLGNKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF06552  TOM20_plant  
Amino Acid Sequences MNRYRNKRNNDRKKKLGNKKSNADIRKTFGELMEEAIEQEEKGERYGDGKKARNFYENACNLYEKAHNKEKQDFTCLYNWARVTYILATFSKPAFSTQKKISLLQLAIERFRSALNLNPRALDAMFNLKQALSSFGEICLDEVSEQAAIPFFKEACELGDQVFSFQEDIYKNLIKNNTEHEHEHEHENEQEHEHNHDHHHEQEDSTETAVNKEEKIEDMYDEEGDIITINSLIETLTTSAEDLNNLSSITDDPTESENLFNQALEKLKKAEELAKEAEEYNKNKNNNNNNNNNDNDNDEDDEIDLSSIDSTYATILSSRGEHLFNTLGVFDPSFFENALNHQNKVIQRIPETSNSQGVYQQKAQELCNKGDILCSFAETLINNGEEIDEHSPSQEMYREALTTYEKALTFEDSNNSIICKIGDLKLTLAHNYLLLSENKEDESYKSMLQLIRQGLDVYKMALKNNVEQPVEPEIYLRIAKGLSYYDDLTKQCQGMLQKFVQMGGNLDLLEDDLQYVNFDFCDDVKDKSWFINGMKQLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.95
2 0.95
3 0.94
4 0.94
5 0.92
6 0.91
7 0.91
8 0.89
9 0.85
10 0.82
11 0.76
12 0.71
13 0.65
14 0.6
15 0.51
16 0.42
17 0.39
18 0.31
19 0.29
20 0.25
21 0.2
22 0.18
23 0.17
24 0.16
25 0.12
26 0.13
27 0.14
28 0.12
29 0.13
30 0.14
31 0.13
32 0.17
33 0.24
34 0.31
35 0.36
36 0.44
37 0.49
38 0.55
39 0.58
40 0.6
41 0.56
42 0.54
43 0.56
44 0.52
45 0.49
46 0.44
47 0.42
48 0.36
49 0.37
50 0.38
51 0.33
52 0.36
53 0.42
54 0.45
55 0.49
56 0.58
57 0.63
58 0.6
59 0.62
60 0.56
61 0.5
62 0.51
63 0.5
64 0.43
65 0.39
66 0.36
67 0.3
68 0.29
69 0.25
70 0.23
71 0.21
72 0.2
73 0.18
74 0.18
75 0.19
76 0.2
77 0.2
78 0.19
79 0.17
80 0.2
81 0.25
82 0.29
83 0.34
84 0.38
85 0.46
86 0.46
87 0.48
88 0.47
89 0.45
90 0.41
91 0.37
92 0.37
93 0.31
94 0.31
95 0.3
96 0.26
97 0.2
98 0.19
99 0.18
100 0.13
101 0.18
102 0.26
103 0.31
104 0.31
105 0.31
106 0.32
107 0.31
108 0.3
109 0.25
110 0.17
111 0.19
112 0.2
113 0.19
114 0.2
115 0.18
116 0.18
117 0.18
118 0.2
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.15
124 0.14
125 0.14
126 0.1
127 0.09
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.11
144 0.12
145 0.11
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.11
151 0.09
152 0.08
153 0.12
154 0.1
155 0.12
156 0.15
157 0.18
158 0.18
159 0.22
160 0.26
161 0.23
162 0.25
163 0.3
164 0.3
165 0.3
166 0.31
167 0.31
168 0.34
169 0.34
170 0.36
171 0.3
172 0.28
173 0.28
174 0.28
175 0.25
176 0.2
177 0.21
178 0.19
179 0.21
180 0.2
181 0.2
182 0.2
183 0.23
184 0.23
185 0.23
186 0.26
187 0.23
188 0.22
189 0.21
190 0.22
191 0.18
192 0.17
193 0.16
194 0.13
195 0.13
196 0.15
197 0.14
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.13
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.07
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.09
250 0.12
251 0.12
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.14
256 0.14
257 0.18
258 0.17
259 0.2
260 0.21
261 0.2
262 0.2
263 0.19
264 0.23
265 0.22
266 0.22
267 0.26
268 0.29
269 0.31
270 0.34
271 0.42
272 0.48
273 0.54
274 0.6
275 0.61
276 0.6
277 0.62
278 0.61
279 0.54
280 0.44
281 0.35
282 0.29
283 0.21
284 0.18
285 0.13
286 0.12
287 0.11
288 0.1
289 0.08
290 0.06
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.07
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.1
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.1
325 0.19
326 0.2
327 0.2
328 0.2
329 0.24
330 0.25
331 0.31
332 0.32
333 0.25
334 0.26
335 0.3
336 0.32
337 0.33
338 0.36
339 0.31
340 0.31
341 0.29
342 0.27
343 0.27
344 0.27
345 0.26
346 0.25
347 0.27
348 0.26
349 0.27
350 0.29
351 0.32
352 0.33
353 0.3
354 0.31
355 0.28
356 0.25
357 0.26
358 0.24
359 0.2
360 0.16
361 0.15
362 0.12
363 0.12
364 0.13
365 0.09
366 0.11
367 0.1
368 0.1
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.07
373 0.1
374 0.11
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.11
379 0.11
380 0.12
381 0.12
382 0.11
383 0.12
384 0.13
385 0.13
386 0.13
387 0.15
388 0.16
389 0.14
390 0.14
391 0.16
392 0.15
393 0.16
394 0.17
395 0.18
396 0.18
397 0.19
398 0.2
399 0.19
400 0.19
401 0.18
402 0.18
403 0.15
404 0.14
405 0.12
406 0.11
407 0.11
408 0.13
409 0.15
410 0.16
411 0.17
412 0.2
413 0.22
414 0.21
415 0.2
416 0.17
417 0.15
418 0.14
419 0.14
420 0.13
421 0.13
422 0.15
423 0.16
424 0.17
425 0.17
426 0.18
427 0.18
428 0.16
429 0.2
430 0.19
431 0.18
432 0.18
433 0.22
434 0.22
435 0.23
436 0.27
437 0.25
438 0.24
439 0.24
440 0.24
441 0.2
442 0.21
443 0.2
444 0.15
445 0.18
446 0.19
447 0.19
448 0.24
449 0.25
450 0.29
451 0.35
452 0.4
453 0.36
454 0.35
455 0.38
456 0.39
457 0.38
458 0.31
459 0.25
460 0.2
461 0.22
462 0.22
463 0.18
464 0.13
465 0.12
466 0.12
467 0.13
468 0.14
469 0.14
470 0.17
471 0.18
472 0.2
473 0.25
474 0.26
475 0.28
476 0.3
477 0.27
478 0.24
479 0.26
480 0.3
481 0.3
482 0.36
483 0.34
484 0.34
485 0.35
486 0.36
487 0.34
488 0.28
489 0.26
490 0.21
491 0.21
492 0.16
493 0.15
494 0.14
495 0.12
496 0.12
497 0.09
498 0.08
499 0.07
500 0.07
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.08
505 0.09
506 0.09
507 0.09
508 0.15
509 0.15
510 0.18
511 0.22
512 0.26
513 0.26
514 0.27
515 0.31
516 0.3
517 0.32
518 0.37