Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1X1V4

Protein Details
Accession A0A1Y1X1V4    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-45LIDEAKTDNKNKKKYIKRSEIENLEKKKHydrophilic
47-74YENLEKEKYDKEKKNKKNKDSDKYYSSNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-17KRK
22-37AKTDNKNKKKYIKRSE
54-64KYDKEKKNKKN
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR014906  PRP4-like  
IPR036285  PRP4-like_sf  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
PF08799  PRP4  
Amino Acid Sequences MDFLKSIIDEEISKKRKLIDEAKTDNKNKKKYIKRSEIENLEKKKYYENLEKEKYDKEKKNKKNKDSDKYYSSNLSSNKVDELNNDDFKSKNNYEDDDNDNLSKIFENISQDEVIKRLRSHGEPIRYFGETDQERIIRLRHLEAAEEKTEGQRNEFMHALEDTDRNLDLETLRKQAGLDNEDDKNKKKKDYSDVDTSSISLELIQKDIDRAYFLLYVYFKRLLDAWEDDLNQRSEEVKRSYKGKRETAIQRQTRDYLKPFFKELKRKTLQADVLARVSEIAQFMQEREYMKANESYLQLSIGNAPWPIGVTMVGIHERSAREKIFASQVAHVLNDESQRKWIQSIKRIMTWAQDKYKPSDYAKRVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.38
3 0.43
4 0.5
5 0.54
6 0.53
7 0.59
8 0.66
9 0.73
10 0.77
11 0.78
12 0.79
13 0.79
14 0.78
15 0.76
16 0.78
17 0.8
18 0.82
19 0.86
20 0.87
21 0.83
22 0.83
23 0.84
24 0.84
25 0.83
26 0.81
27 0.76
28 0.72
29 0.7
30 0.62
31 0.59
32 0.54
33 0.53
34 0.54
35 0.56
36 0.6
37 0.64
38 0.66
39 0.62
40 0.65
41 0.66
42 0.66
43 0.66
44 0.67
45 0.71
46 0.78
47 0.87
48 0.9
49 0.9
50 0.91
51 0.92
52 0.92
53 0.91
54 0.88
55 0.84
56 0.77
57 0.71
58 0.64
59 0.56
60 0.51
61 0.43
62 0.4
63 0.34
64 0.31
65 0.3
66 0.27
67 0.26
68 0.21
69 0.26
70 0.28
71 0.3
72 0.29
73 0.28
74 0.26
75 0.28
76 0.35
77 0.29
78 0.28
79 0.28
80 0.29
81 0.32
82 0.36
83 0.38
84 0.34
85 0.35
86 0.29
87 0.27
88 0.24
89 0.21
90 0.17
91 0.12
92 0.1
93 0.1
94 0.14
95 0.14
96 0.16
97 0.16
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.18
102 0.16
103 0.15
104 0.17
105 0.21
106 0.22
107 0.29
108 0.34
109 0.41
110 0.39
111 0.43
112 0.41
113 0.37
114 0.36
115 0.29
116 0.3
117 0.21
118 0.22
119 0.22
120 0.2
121 0.2
122 0.2
123 0.21
124 0.16
125 0.17
126 0.16
127 0.17
128 0.17
129 0.18
130 0.2
131 0.23
132 0.21
133 0.2
134 0.18
135 0.17
136 0.21
137 0.19
138 0.18
139 0.19
140 0.18
141 0.2
142 0.21
143 0.18
144 0.15
145 0.15
146 0.15
147 0.12
148 0.12
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.1
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.15
163 0.19
164 0.17
165 0.17
166 0.18
167 0.2
168 0.23
169 0.25
170 0.26
171 0.31
172 0.31
173 0.34
174 0.35
175 0.39
176 0.45
177 0.51
178 0.53
179 0.54
180 0.54
181 0.51
182 0.47
183 0.41
184 0.32
185 0.24
186 0.18
187 0.09
188 0.09
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.14
205 0.16
206 0.14
207 0.13
208 0.14
209 0.13
210 0.15
211 0.16
212 0.16
213 0.17
214 0.18
215 0.18
216 0.2
217 0.2
218 0.17
219 0.15
220 0.14
221 0.14
222 0.19
223 0.23
224 0.25
225 0.28
226 0.34
227 0.4
228 0.47
229 0.53
230 0.54
231 0.52
232 0.55
233 0.62
234 0.66
235 0.7
236 0.67
237 0.63
238 0.59
239 0.6
240 0.56
241 0.51
242 0.45
243 0.43
244 0.43
245 0.42
246 0.43
247 0.48
248 0.51
249 0.57
250 0.58
251 0.61
252 0.59
253 0.6
254 0.59
255 0.59
256 0.55
257 0.51
258 0.51
259 0.42
260 0.4
261 0.36
262 0.32
263 0.24
264 0.21
265 0.15
266 0.11
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.11
272 0.13
273 0.13
274 0.15
275 0.19
276 0.18
277 0.2
278 0.23
279 0.22
280 0.24
281 0.23
282 0.22
283 0.19
284 0.19
285 0.16
286 0.14
287 0.15
288 0.13
289 0.13
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.11
294 0.1
295 0.09
296 0.07
297 0.06
298 0.07
299 0.09
300 0.11
301 0.1
302 0.11
303 0.14
304 0.16
305 0.19
306 0.23
307 0.22
308 0.23
309 0.24
310 0.27
311 0.31
312 0.34
313 0.33
314 0.31
315 0.33
316 0.32
317 0.3
318 0.27
319 0.21
320 0.19
321 0.24
322 0.24
323 0.21
324 0.26
325 0.28
326 0.29
327 0.31
328 0.36
329 0.38
330 0.45
331 0.54
332 0.54
333 0.57
334 0.58
335 0.56
336 0.58
337 0.56
338 0.55
339 0.54
340 0.54
341 0.53
342 0.57
343 0.63
344 0.6
345 0.59
346 0.61