FuNGI

A0A1Y1XJF2

Protein Details

Accession

A0A1Y1XJF2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
544-564	HLDWHFRQNRRLKNQFKQTLC	Hydrophilic
662-685	TDYISQKKLLNKIKEKKAKEEEAN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 14.666, mito_nucl 11.499, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006569 CID_dom IPR047415 CID_Pcf11 IPR008942 ENTH_VHS IPR045154 PCF11-like
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000993 F:RNA polymerase II complex binding GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation GO:0006369 P:termination of RNA polymerase II transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04818 CID
PROSITE	View protein in PROSITE PS51391 CID
CDD	cd16982 CID_Pcf11

Amino Acid Sequences

MDIKFMQQPAWTNFKMQDTTIYNKVNDQDLIQNFKSVLRQLTFNSKPIISELTDLAKRDISIAPLIVEAIENQLKNVPSHQKLPLMYLMDSICKNIGGIYLSLFSMNLTKIFGQTYNLVDSDTQMKLKRLVNTWKDYPKGPLFSQNILENLNSFINQFQKDENDVKKAILKKAINSIQNILLQKLNYKMQFPYDEKNNQDVQYFYNAMQTLQDPNVTDAQISKLNQELTVYFQTNTLPNNSNNNNNNNQQNNNNSMNNMMQNQMGMMMPNNMNGMNNMNGMNNMNNMNGMNNMNGMNNMNGMNNMNNMNNMNGMNGMNMNGMNGMNNMNNMNGMNNMNNMNGMNGMNNMNNMNNMNNMNNMNNMNGMNNMNNMNNMNNMNNMNGMTTMPGIIPNSMMMNSSMVTPTINTNIPISSSVPNGMQSAIVTSTIATSLPLLMNNLPNMINNTVTTSSTLTNSTIVTTNVEKESTKDDKEKEEEKPKSKYKKFSDFPLISLTDDAIHKPHPEYIESIYEFLSYQCKQCGRRYYKSEESDKDSEEKIYSHLDWHFRQNRRLKNQFKQTLCRGWQDISEEDWIDSKTVEAKFTSPTFFQFDATNPETENPENEEDEKEKIKYLPCDGTQQKCYVCNEEFEKHWHEDEEEWMLKNAISKEGKVFHPSCYTDYISQKKLLNKIKEKKAKEEEANSSDINSDNESKSSITSGEKRKLETEDDDPNENKDDNNKKIKLE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.41
3	0.35
4	0.38
5	0.35
6	0.4
7	0.45
8	0.45
9	0.4
10	0.42
11	0.44
12	0.39
13	0.35
14	0.31
15	0.32
16	0.32
17	0.4
18	0.36
19	0.35
20	0.32
21	0.34
22	0.35
23	0.3
24	0.32
25	0.26
26	0.29
27	0.3
28	0.4
29	0.41
30	0.41
31	0.42
32	0.36
33	0.34
34	0.34
35	0.34
36	0.25
37	0.24
38	0.22
39	0.25
40	0.27
41	0.28
42	0.27
43	0.25
44	0.23
45	0.24
46	0.23
47	0.19
48	0.19
49	0.18
50	0.17
51	0.15
52	0.15
53	0.12
54	0.11
55	0.09
56	0.12
57	0.15
58	0.14
59	0.14
60	0.18
61	0.2
62	0.2
63	0.27
64	0.31
65	0.32
66	0.37
67	0.41
68	0.43
69	0.42
70	0.45
71	0.43
72	0.37
73	0.34
74	0.32
75	0.28
76	0.26
77	0.26
78	0.23
79	0.18
80	0.15
81	0.15
82	0.12
83	0.13
84	0.1
85	0.1
86	0.11
87	0.11
88	0.11
89	0.11
90	0.11
91	0.09
92	0.1
93	0.1
94	0.09
95	0.1
96	0.11
97	0.12
98	0.14
99	0.14
100	0.14
101	0.16
102	0.18
103	0.19
104	0.18
105	0.18
106	0.16
107	0.17
108	0.19
109	0.18
110	0.19
111	0.19
112	0.21
113	0.27
114	0.32
115	0.35
116	0.38
117	0.47
118	0.51
119	0.56
120	0.62
121	0.63
122	0.61
123	0.57
124	0.57
125	0.53
126	0.5
127	0.45
128	0.46
129	0.43
130	0.44
131	0.45
132	0.4
133	0.35
134	0.31
135	0.3
136	0.21
137	0.2
138	0.17
139	0.14
140	0.12
141	0.12
142	0.16
143	0.17
144	0.18
145	0.17
146	0.2
147	0.24
148	0.31
149	0.32
150	0.32
151	0.32
152	0.32
153	0.35
154	0.38
155	0.37
156	0.39
157	0.37
158	0.35
159	0.44
160	0.49
161	0.47
162	0.44
163	0.43
164	0.38
165	0.4
166	0.38
167	0.3
168	0.26
169	0.22
170	0.23
171	0.24
172	0.25
173	0.22
174	0.23
175	0.23
176	0.25
177	0.32
178	0.32
179	0.35
180	0.38
181	0.42
182	0.43
183	0.47
184	0.46
185	0.41
186	0.39
187	0.33
188	0.28
189	0.27
190	0.25
191	0.2
192	0.21
193	0.2
194	0.19
195	0.19
196	0.18
197	0.16
198	0.15
199	0.16
200	0.12
201	0.14
202	0.16
203	0.15
204	0.14
205	0.12
206	0.14
207	0.16
208	0.16
209	0.15
210	0.16
211	0.17
212	0.17
213	0.17
214	0.15
215	0.15
216	0.19
217	0.19
218	0.16
219	0.16
220	0.18
221	0.19
222	0.19
223	0.19
224	0.18
225	0.19
226	0.26
227	0.28
228	0.35
229	0.38
230	0.43
231	0.43
232	0.44
233	0.49
234	0.45
235	0.45
236	0.41
237	0.41
238	0.41
239	0.41
240	0.37
241	0.3
242	0.28
243	0.27
244	0.25
245	0.22
246	0.17
247	0.12
248	0.11
249	0.11
250	0.1
251	0.08
252	0.07
253	0.06
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.09
260	0.09
261	0.11
262	0.08
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.09
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.09
276	0.09
277	0.08
278	0.08
279	0.09
280	0.08
281	0.09
282	0.09
283	0.08
284	0.08
285	0.08
286	0.07
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.09
291	0.1
292	0.09
293	0.1
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.07
314	0.07
315	0.06
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.08
321	0.08
322	0.09
323	0.1
324	0.09
325	0.1
326	0.09
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.06
331	0.07
332	0.08
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.09
338	0.09
339	0.08
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.11
344	0.11
345	0.11
346	0.12
347	0.12
348	0.11
349	0.11
350	0.11
351	0.09
352	0.1
353	0.1
354	0.09
355	0.1
356	0.11
357	0.1
358	0.11
359	0.11
360	0.1
361	0.11
362	0.11
363	0.1
364	0.11
365	0.11
366	0.1
367	0.1
368	0.1
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.06
382	0.05
383	0.06
384	0.05
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.05
391	0.06
392	0.06
393	0.08
394	0.09
395	0.09
396	0.09
397	0.09
398	0.1
399	0.1
400	0.12
401	0.1
402	0.1
403	0.11
404	0.11
405	0.11
406	0.11
407	0.1
408	0.08
409	0.07
410	0.07
411	0.07
412	0.06
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.04
419	0.04
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.08
425	0.09
426	0.09
427	0.1
428	0.09
429	0.09
430	0.12
431	0.11
432	0.11
433	0.09
434	0.12
435	0.11
436	0.12
437	0.12
438	0.11
439	0.11
440	0.12
441	0.13
442	0.11
443	0.11
444	0.11
445	0.11
446	0.11
447	0.1
448	0.11
449	0.11
450	0.13
451	0.13
452	0.14
453	0.12
454	0.13
455	0.19
456	0.21
457	0.24
458	0.27
459	0.28
460	0.33
461	0.38
462	0.42
463	0.43
464	0.49
465	0.54
466	0.54
467	0.61
468	0.64
469	0.7
470	0.72
471	0.74
472	0.72
473	0.75
474	0.72
475	0.71
476	0.72
477	0.63
478	0.57
479	0.53
480	0.45
481	0.34
482	0.32
483	0.24
484	0.15
485	0.15
486	0.14
487	0.1
488	0.11
489	0.12
490	0.13
491	0.15
492	0.15
493	0.16
494	0.18
495	0.19
496	0.24
497	0.23
498	0.23
499	0.2
500	0.19
501	0.17
502	0.16
503	0.18
504	0.13
505	0.14
506	0.18
507	0.23
508	0.27
509	0.34
510	0.44
511	0.47
512	0.55
513	0.6
514	0.65
515	0.69
516	0.72
517	0.73
518	0.67
519	0.66
520	0.6
521	0.55
522	0.5
523	0.41
524	0.36
525	0.29
526	0.25
527	0.19
528	0.2
529	0.18
530	0.19
531	0.22
532	0.26
533	0.27
534	0.37
535	0.44
536	0.45
537	0.54
538	0.58
539	0.64
540	0.69
541	0.77
542	0.76
543	0.77
544	0.83
545	0.83
546	0.8
547	0.78
548	0.75
549	0.74
550	0.68
551	0.63
552	0.55
553	0.47
554	0.44
555	0.4
556	0.35
557	0.28
558	0.27
559	0.23
560	0.2
561	0.2
562	0.18
563	0.15
564	0.13
565	0.11
566	0.14
567	0.14
568	0.16
569	0.15
570	0.16
571	0.2
572	0.22
573	0.24
574	0.19
575	0.21
576	0.25
577	0.25
578	0.25
579	0.22
580	0.22
581	0.27
582	0.28
583	0.26
584	0.21
585	0.22
586	0.24
587	0.24
588	0.24
589	0.21
590	0.21
591	0.22
592	0.23
593	0.25
594	0.24
595	0.27
596	0.28
597	0.24
598	0.24
599	0.26
600	0.3
601	0.31
602	0.35
603	0.38
604	0.36
605	0.45
606	0.49
607	0.53
608	0.51
609	0.52
610	0.48
611	0.46
612	0.48
613	0.44
614	0.39
615	0.38
616	0.4
617	0.38
618	0.38
619	0.38
620	0.41
621	0.37
622	0.37
623	0.33
624	0.29
625	0.27
626	0.29
627	0.31
628	0.27
629	0.25
630	0.25
631	0.24
632	0.22
633	0.26
634	0.24
635	0.24
636	0.24
637	0.25
638	0.29
639	0.34
640	0.36
641	0.39
642	0.39
643	0.35
644	0.41
645	0.42
646	0.39
647	0.39
648	0.4
649	0.38
650	0.46
651	0.49
652	0.45
653	0.48
654	0.51
655	0.52
656	0.58
657	0.61
658	0.63
659	0.66
660	0.73
661	0.78
662	0.83
663	0.82
664	0.83
665	0.83
666	0.82
667	0.8
668	0.78
669	0.76
670	0.7
671	0.69
672	0.58
673	0.49
674	0.41
675	0.34
676	0.28
677	0.22
678	0.23
679	0.2
680	0.21
681	0.22
682	0.21
683	0.2
684	0.2
685	0.19
686	0.22
687	0.29
688	0.37
689	0.45
690	0.47
691	0.49
692	0.52
693	0.54
694	0.53
695	0.49
696	0.47
697	0.48
698	0.48
699	0.51
700	0.48
701	0.46
702	0.44
703	0.39
704	0.35
705	0.34
706	0.4
707	0.43
708	0.52

A0A1Y1XJF2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer