FuNGI

A0A1Y1XG86

Protein Details

Accession

A0A1Y1XG86

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
272-291	WAAVRKFKKSQKNEKKEEFY	Hydrophilic
500-559	ARNRNETKEEKKARKEMVKNAKKERREAKKATKKAFKKEHMKQEKIQKRKEMQERTMKIE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
502-549	NRNETKEEKKARKEMVKNAKKERREAKKATKKAFKKEHMKQEKIQKRK

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MGKKPFIDRKTARYYEVVHRSQRDPLLADENASRFVLKQTAPSLNLLKKGKYKLRPEDDEIGYVEDFSDNEVNYDYESVDEEFSETDIFDVSSGDEEEKEPLKDAKGNVIEREAGVAALYGIDFDDTKYDYMQHLKVIGEDPTAVFIPSKEEAKKDSKKSGIQFIDDSINLDEKVTQKKRVTFQLPEEALPSKYEEEVGLMNREDSDILTANPYVREVLYSLDDPTTIDENMEDDFILQLNAEPGSDEEEFDMNAAMYGLDEEEDDDDDDEWAAVRKFKKSQKNEKKEEFYEEDDWDDRHTATTGFSMSSSAMFRNKHLTLLDDRFERVINQYDDDNIGELDPDAPNVRGNIDDNDLPEHYDKLFDEFLDSKDVLGKKVIEKFAGGIPSEQIAELREELKTEGFDILKYEEKESQKKEKIEMVERELSKNEKRERNNWDCETIITTYTNIYNHPKMIKEENVKKIHVTRKGLPIVEKDISEEEEEGEEEEYEVRVNKGVARNRNETKEEKKARKEMVKNAKKERREAKKATKKAFKKEHMKQEKIQKRKEMQERTMKIE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.58
3	0.62
4	0.6
5	0.57
6	0.59
7	0.58
8	0.61
9	0.59
10	0.52
11	0.44
12	0.41
13	0.41
14	0.35
15	0.35
16	0.33
17	0.3
18	0.29
19	0.27
20	0.23
21	0.17
22	0.19
23	0.23
24	0.19
25	0.23
26	0.27
27	0.32
28	0.34
29	0.37
30	0.42
31	0.4
32	0.47
33	0.46
34	0.45
35	0.47
36	0.54
37	0.59
38	0.61
39	0.68
40	0.7
41	0.77
42	0.78
43	0.78
44	0.77
45	0.7
46	0.63
47	0.54
48	0.46
49	0.36
50	0.29
51	0.22
52	0.14
53	0.12
54	0.12
55	0.13
56	0.1
57	0.11
58	0.12
59	0.12
60	0.12
61	0.13
62	0.1
63	0.08
64	0.1
65	0.11
66	0.1
67	0.1
68	0.1
69	0.09
70	0.1
71	0.09
72	0.07
73	0.06
74	0.06
75	0.06
76	0.06
77	0.06
78	0.06
79	0.07
80	0.08
81	0.08
82	0.09
83	0.09
84	0.13
85	0.15
86	0.15
87	0.16
88	0.17
89	0.19
90	0.22
91	0.23
92	0.28
93	0.33
94	0.35
95	0.34
96	0.34
97	0.33
98	0.28
99	0.29
100	0.2
101	0.13
102	0.1
103	0.09
104	0.06
105	0.06
106	0.05
107	0.03
108	0.03
109	0.04
110	0.04
111	0.04
112	0.06
113	0.07
114	0.08
115	0.09
116	0.1
117	0.12
118	0.17
119	0.18
120	0.17
121	0.18
122	0.18
123	0.19
124	0.19
125	0.18
126	0.14
127	0.13
128	0.12
129	0.12
130	0.12
131	0.1
132	0.09
133	0.08
134	0.11
135	0.13
136	0.17
137	0.17
138	0.18
139	0.23
140	0.33
141	0.41
142	0.43
143	0.49
144	0.51
145	0.56
146	0.58
147	0.62
148	0.55
149	0.49
150	0.44
151	0.39
152	0.35
153	0.29
154	0.27
155	0.18
156	0.17
157	0.14
158	0.13
159	0.13
160	0.14
161	0.24
162	0.26
163	0.32
164	0.35
165	0.41
166	0.46
167	0.53
168	0.55
169	0.5
170	0.52
171	0.55
172	0.51
173	0.46
174	0.43
175	0.36
176	0.3
177	0.26
178	0.22
179	0.13
180	0.12
181	0.12
182	0.1
183	0.1
184	0.11
185	0.12
186	0.12
187	0.11
188	0.11
189	0.1
190	0.1
191	0.09
192	0.08
193	0.08
194	0.07
195	0.07
196	0.08
197	0.08
198	0.09
199	0.09
200	0.09
201	0.08
202	0.07
203	0.08
204	0.07
205	0.08
206	0.09
207	0.09
208	0.1
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.11
213	0.11
214	0.09
215	0.08
216	0.07
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.06
221	0.04
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.08
233	0.08
234	0.08
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.08
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.04
252	0.04
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.04
258	0.04
259	0.05
260	0.05
261	0.08
262	0.1
263	0.12
264	0.19
265	0.27
266	0.37
267	0.46
268	0.57
269	0.65
270	0.74
271	0.8
272	0.8
273	0.79
274	0.71
275	0.67
276	0.59
277	0.52
278	0.44
279	0.36
280	0.3
281	0.25
282	0.23
283	0.18
284	0.15
285	0.11
286	0.09
287	0.09
288	0.08
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.12
300	0.12
301	0.13
302	0.19
303	0.19
304	0.19
305	0.19
306	0.2
307	0.22
308	0.25
309	0.27
310	0.22
311	0.22
312	0.21
313	0.21
314	0.19
315	0.15
316	0.18
317	0.16
318	0.16
319	0.16
320	0.16
321	0.17
322	0.16
323	0.14
324	0.08
325	0.07
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.05
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.09
338	0.11
339	0.12
340	0.13
341	0.13
342	0.15
343	0.14
344	0.15
345	0.14
346	0.13
347	0.11
348	0.12
349	0.11
350	0.12
351	0.13
352	0.11
353	0.14
354	0.14
355	0.15
356	0.17
357	0.17
358	0.14
359	0.18
360	0.19
361	0.16
362	0.17
363	0.18
364	0.19
365	0.25
366	0.26
367	0.22
368	0.22
369	0.22
370	0.23
371	0.24
372	0.2
373	0.14
374	0.13
375	0.13
376	0.13
377	0.12
378	0.09
379	0.08
380	0.09
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.1
386	0.11
387	0.1
388	0.1
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.12
393	0.13
394	0.18
395	0.19
396	0.2
397	0.24
398	0.29
399	0.37
400	0.41
401	0.49
402	0.51
403	0.53
404	0.54
405	0.53
406	0.54
407	0.55
408	0.55
409	0.51
410	0.51
411	0.5
412	0.49
413	0.45
414	0.44
415	0.41
416	0.44
417	0.46
418	0.47
419	0.52
420	0.58
421	0.66
422	0.69
423	0.74
424	0.68
425	0.63
426	0.55
427	0.5
428	0.45
429	0.36
430	0.29
431	0.2
432	0.17
433	0.15
434	0.16
435	0.16
436	0.16
437	0.21
438	0.22
439	0.25
440	0.27
441	0.29
442	0.31
443	0.36
444	0.42
445	0.46
446	0.52
447	0.58
448	0.6
449	0.59
450	0.58
451	0.6
452	0.6
453	0.58
454	0.56
455	0.53
456	0.57
457	0.62
458	0.61
459	0.57
460	0.53
461	0.51
462	0.46
463	0.4
464	0.33
465	0.29
466	0.28
467	0.25
468	0.21
469	0.16
470	0.14
471	0.15
472	0.13
473	0.12
474	0.1
475	0.09
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.09
480	0.09
481	0.1
482	0.11
483	0.16
484	0.23
485	0.31
486	0.39
487	0.45
488	0.53
489	0.59
490	0.66
491	0.66
492	0.65
493	0.65
494	0.67
495	0.71
496	0.72
497	0.74
498	0.75
499	0.79
500	0.82
501	0.82
502	0.82
503	0.83
504	0.83
505	0.82
506	0.85
507	0.85
508	0.8
509	0.82
510	0.81
511	0.81
512	0.82
513	0.83
514	0.84
515	0.85
516	0.89
517	0.9
518	0.9
519	0.88
520	0.88
521	0.89
522	0.88
523	0.88
524	0.88
525	0.89
526	0.89
527	0.88
528	0.85
529	0.85
530	0.85
531	0.84
532	0.83
533	0.82
534	0.8
535	0.83
536	0.86
537	0.85
538	0.84
539	0.85

A0A1Y1XG86

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer