Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8PFP1

Protein Details
Accession B8PFP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
410-432REVERERASRRLRRETSKFQSQTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
416-427RASRRLRRETSK
432-437TARRRR
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
KEGG ppl:POSPLDRAFT_22876  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences PSYPMALAPPPYPQQSTSIPARPQALHSTYASRLRTGTTLLMQPILASSSAIAVTTRSSRRGGAVNYAEPASGDEFPDAGAIDSEDSDFVASGGTRSAVRSARLSSKAPIGASVFHAGNATPVAQPAQAQQRNELDQSYLGMIPPSRFITARPVAPTKHEYFPPEAMEVQARRPTSLVPIRVEFETDTLRIRDCFVWNLHEDLIKPESFARAFCVDLDLPVNPWAETVANQIRAQLEEHEGVAAVDFGVPDPEMEEKLRAGEEMGECRVILSIDVQIATYHLCDTIEWDLLSSLTPEAFASKLCSELGLSGEAVPLVAHAMHEEIVKHKRDALEWGVIGGDAREADDERPRDKSGLSLLKDKTGLGLGWGRAPKDGRGPKPLRSVWRDWAEAEEFTTRFEVLTAEEVERREVERERASRRLRRETSKFQSQTARRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.33
3 0.38
4 0.4
5 0.43
6 0.42
7 0.44
8 0.47
9 0.44
10 0.44
11 0.46
12 0.41
13 0.37
14 0.37
15 0.38
16 0.38
17 0.44
18 0.41
19 0.34
20 0.32
21 0.31
22 0.3
23 0.28
24 0.26
25 0.22
26 0.25
27 0.24
28 0.24
29 0.22
30 0.2
31 0.18
32 0.16
33 0.12
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.09
42 0.16
43 0.19
44 0.21
45 0.22
46 0.23
47 0.26
48 0.32
49 0.32
50 0.34
51 0.36
52 0.35
53 0.36
54 0.35
55 0.31
56 0.25
57 0.25
58 0.18
59 0.14
60 0.13
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.12
85 0.14
86 0.16
87 0.18
88 0.22
89 0.28
90 0.32
91 0.33
92 0.31
93 0.34
94 0.34
95 0.31
96 0.29
97 0.23
98 0.21
99 0.21
100 0.22
101 0.17
102 0.14
103 0.15
104 0.12
105 0.12
106 0.11
107 0.1
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.13
114 0.22
115 0.25
116 0.25
117 0.29
118 0.32
119 0.34
120 0.35
121 0.31
122 0.21
123 0.18
124 0.18
125 0.16
126 0.12
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.2
137 0.22
138 0.25
139 0.27
140 0.28
141 0.28
142 0.32
143 0.37
144 0.32
145 0.33
146 0.32
147 0.31
148 0.32
149 0.33
150 0.31
151 0.27
152 0.22
153 0.2
154 0.21
155 0.19
156 0.19
157 0.21
158 0.19
159 0.18
160 0.18
161 0.18
162 0.21
163 0.25
164 0.26
165 0.24
166 0.26
167 0.27
168 0.27
169 0.27
170 0.2
171 0.16
172 0.14
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.12
177 0.11
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.15
182 0.15
183 0.17
184 0.17
185 0.19
186 0.17
187 0.16
188 0.15
189 0.15
190 0.16
191 0.13
192 0.12
193 0.11
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.13
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.1
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.12
215 0.13
216 0.15
217 0.15
218 0.16
219 0.16
220 0.17
221 0.17
222 0.13
223 0.13
224 0.11
225 0.11
226 0.09
227 0.09
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.04
239 0.05
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.08
257 0.07
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.08
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.08
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.09
288 0.09
289 0.11
290 0.1
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.12
312 0.18
313 0.21
314 0.21
315 0.24
316 0.25
317 0.25
318 0.3
319 0.29
320 0.28
321 0.25
322 0.25
323 0.22
324 0.2
325 0.19
326 0.13
327 0.1
328 0.04
329 0.05
330 0.06
331 0.07
332 0.09
333 0.16
334 0.19
335 0.21
336 0.25
337 0.26
338 0.26
339 0.25
340 0.26
341 0.29
342 0.34
343 0.35
344 0.39
345 0.39
346 0.41
347 0.41
348 0.38
349 0.31
350 0.24
351 0.21
352 0.16
353 0.19
354 0.16
355 0.21
356 0.24
357 0.23
358 0.25
359 0.27
360 0.26
361 0.32
362 0.4
363 0.4
364 0.49
365 0.52
366 0.56
367 0.64
368 0.67
369 0.67
370 0.65
371 0.66
372 0.65
373 0.67
374 0.61
375 0.52
376 0.52
377 0.45
378 0.38
379 0.34
380 0.29
381 0.23
382 0.23
383 0.23
384 0.18
385 0.15
386 0.15
387 0.13
388 0.1
389 0.14
390 0.15
391 0.16
392 0.19
393 0.19
394 0.21
395 0.22
396 0.22
397 0.23
398 0.25
399 0.29
400 0.36
401 0.43
402 0.47
403 0.56
404 0.63
405 0.67
406 0.73
407 0.77
408 0.76
409 0.79
410 0.82
411 0.83
412 0.82
413 0.85
414 0.78
415 0.73
416 0.75
417 0.74