Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XJH2

Protein Details
Accession A0A1Y1XJH2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
336-364VKVVENQPKTKAKTKKKTPKPTPTGDDLFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-355TKAKTKKKTPK
Subcellular Location(s) cyto 17, cyto_nucl 13.5, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR018391  PQQ_beta_propeller_repeat  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MNANVSNQASDFFETDAEIEKRLAKDKKSKEVENLGEPIKITSKVLNMTLVRGENPKYAYVAESGFLIRKINLESGKTVKLFKGHTGPVTCVEIIYNSQGEDEFILTGSWDKTIKKWDVKTKEIVKEYTVHTDFIKCIAYEPIHNTFISGSSDKTIRHVEVDSGNQIKYLTEHTRAVEDICFEDYTYTTFYTCSSDSTIKKWNLETGECLYTFAGHLTSVYKILCDVEENNLWSVSADKTVRRWDLDTLKNDLTIDQEDFVKTCIKVGGNIITGSRDDKIRIYDISTGKLIKVVDFHFDEVTSLFNIKSIVFSGSLDCTVKRFDLLDNTSKFITEVKVVENQPKTKAKTKKKTPKPTPTGDDLFTAEELAELEELMNDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.19
4 0.17
5 0.17
6 0.17
7 0.21
8 0.23
9 0.32
10 0.37
11 0.38
12 0.48
13 0.56
14 0.65
15 0.69
16 0.71
17 0.71
18 0.75
19 0.72
20 0.67
21 0.64
22 0.54
23 0.47
24 0.42
25 0.36
26 0.29
27 0.25
28 0.2
29 0.18
30 0.21
31 0.22
32 0.23
33 0.27
34 0.25
35 0.26
36 0.28
37 0.27
38 0.25
39 0.26
40 0.27
41 0.25
42 0.26
43 0.25
44 0.23
45 0.22
46 0.21
47 0.2
48 0.18
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.13
55 0.11
56 0.13
57 0.15
58 0.19
59 0.21
60 0.21
61 0.24
62 0.27
63 0.31
64 0.31
65 0.31
66 0.27
67 0.29
68 0.29
69 0.3
70 0.32
71 0.31
72 0.35
73 0.35
74 0.35
75 0.33
76 0.34
77 0.29
78 0.22
79 0.2
80 0.15
81 0.14
82 0.15
83 0.12
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.08
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.1
98 0.1
99 0.13
100 0.2
101 0.27
102 0.33
103 0.39
104 0.48
105 0.53
106 0.57
107 0.63
108 0.64
109 0.65
110 0.61
111 0.56
112 0.47
113 0.44
114 0.42
115 0.41
116 0.34
117 0.27
118 0.24
119 0.25
120 0.23
121 0.21
122 0.2
123 0.11
124 0.12
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.18
129 0.21
130 0.21
131 0.21
132 0.2
133 0.17
134 0.18
135 0.19
136 0.15
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.13
141 0.16
142 0.17
143 0.14
144 0.15
145 0.15
146 0.16
147 0.16
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.17
152 0.16
153 0.15
154 0.13
155 0.11
156 0.15
157 0.14
158 0.16
159 0.17
160 0.17
161 0.18
162 0.19
163 0.19
164 0.14
165 0.12
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.11
182 0.16
183 0.17
184 0.2
185 0.27
186 0.26
187 0.28
188 0.27
189 0.28
190 0.26
191 0.25
192 0.25
193 0.2
194 0.21
195 0.19
196 0.19
197 0.15
198 0.13
199 0.12
200 0.1
201 0.07
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.12
216 0.13
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.11
221 0.12
222 0.09
223 0.11
224 0.12
225 0.12
226 0.15
227 0.21
228 0.23
229 0.24
230 0.25
231 0.27
232 0.34
233 0.39
234 0.39
235 0.39
236 0.38
237 0.37
238 0.35
239 0.29
240 0.23
241 0.19
242 0.16
243 0.11
244 0.12
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.11
250 0.11
251 0.13
252 0.13
253 0.14
254 0.16
255 0.19
256 0.18
257 0.18
258 0.17
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.15
263 0.12
264 0.12
265 0.13
266 0.16
267 0.17
268 0.18
269 0.19
270 0.25
271 0.25
272 0.27
273 0.27
274 0.25
275 0.22
276 0.24
277 0.22
278 0.15
279 0.17
280 0.15
281 0.19
282 0.2
283 0.21
284 0.19
285 0.19
286 0.18
287 0.15
288 0.15
289 0.11
290 0.1
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.12
301 0.13
302 0.15
303 0.15
304 0.14
305 0.14
306 0.16
307 0.16
308 0.15
309 0.15
310 0.15
311 0.23
312 0.28
313 0.35
314 0.35
315 0.37
316 0.36
317 0.35
318 0.33
319 0.26
320 0.22
321 0.18
322 0.17
323 0.18
324 0.25
325 0.27
326 0.35
327 0.4
328 0.41
329 0.45
330 0.52
331 0.55
332 0.57
333 0.65
334 0.68
335 0.73
336 0.81
337 0.84
338 0.87
339 0.93
340 0.95
341 0.95
342 0.93
343 0.92
344 0.87
345 0.85
346 0.79
347 0.69
348 0.6
349 0.51
350 0.44
351 0.34
352 0.27
353 0.18
354 0.14
355 0.12
356 0.1
357 0.08
358 0.06
359 0.06