Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1WVV6

Protein Details
Accession A0A1Y1WVV6    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-42KEITGSKKLSQKERRLERLKKFKKLQERLDDSIHydrophilic
54-76SKSKENPKEEARQERKRRKAEILBasic
99-121IEDVERWEKKQKKKAKRADTGFTHydrophilic
193-216LEKQVERRNKFSRRRRWDDDAELHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-33KLSQKERRLERLKKFKK
58-72ENPKEEARQERKRRK
107-115KKQKKKAKR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MSDKESDDNKEITGSKKLSQKERRLERLKKFKKLQERLDDSINENRKDVYEEHSKSKENPKEEARQERKRRKAEILLDKKLAEENDIDYERKRALEYTIEDVERWEKKQKKKAKRADTGFTDYAQIAAKKYKKQINEFKPNLQEYNKQKQMALLSSLNTGDTSDFYRDANSTAYASIDSKPSTEAVNRLVKDLEKQVERRNKFSRRRRWDDDAELHILTKEICVSTKNYQELMINIQRKLKLTWREELHYKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.33
3 0.38
4 0.44
5 0.51
6 0.59
7 0.66
8 0.68
9 0.76
10 0.81
11 0.85
12 0.88
13 0.88
14 0.89
15 0.89
16 0.89
17 0.87
18 0.85
19 0.86
20 0.86
21 0.86
22 0.85
23 0.83
24 0.76
25 0.73
26 0.66
27 0.59
28 0.58
29 0.55
30 0.45
31 0.38
32 0.35
33 0.3
34 0.31
35 0.29
36 0.25
37 0.29
38 0.31
39 0.37
40 0.41
41 0.42
42 0.44
43 0.53
44 0.53
45 0.47
46 0.5
47 0.49
48 0.55
49 0.6
50 0.67
51 0.66
52 0.7
53 0.78
54 0.81
55 0.85
56 0.83
57 0.81
58 0.77
59 0.76
60 0.75
61 0.75
62 0.74
63 0.7
64 0.64
65 0.59
66 0.52
67 0.45
68 0.35
69 0.26
70 0.17
71 0.14
72 0.16
73 0.18
74 0.18
75 0.16
76 0.18
77 0.17
78 0.17
79 0.15
80 0.11
81 0.12
82 0.16
83 0.18
84 0.21
85 0.23
86 0.22
87 0.22
88 0.22
89 0.24
90 0.21
91 0.21
92 0.25
93 0.3
94 0.38
95 0.48
96 0.57
97 0.63
98 0.72
99 0.8
100 0.82
101 0.84
102 0.82
103 0.79
104 0.75
105 0.7
106 0.6
107 0.5
108 0.41
109 0.31
110 0.26
111 0.2
112 0.15
113 0.09
114 0.14
115 0.17
116 0.19
117 0.26
118 0.29
119 0.33
120 0.42
121 0.52
122 0.56
123 0.64
124 0.63
125 0.62
126 0.63
127 0.59
128 0.54
129 0.46
130 0.44
131 0.41
132 0.48
133 0.48
134 0.43
135 0.41
136 0.41
137 0.41
138 0.34
139 0.31
140 0.22
141 0.18
142 0.18
143 0.18
144 0.16
145 0.13
146 0.11
147 0.07
148 0.07
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.19
173 0.26
174 0.26
175 0.26
176 0.27
177 0.26
178 0.27
179 0.31
180 0.3
181 0.29
182 0.32
183 0.4
184 0.49
185 0.52
186 0.57
187 0.6
188 0.65
189 0.7
190 0.77
191 0.79
192 0.79
193 0.85
194 0.85
195 0.85
196 0.83
197 0.81
198 0.78
199 0.71
200 0.64
201 0.55
202 0.47
203 0.39
204 0.31
205 0.21
206 0.15
207 0.12
208 0.09
209 0.09
210 0.11
211 0.16
212 0.22
213 0.3
214 0.32
215 0.31
216 0.32
217 0.33
218 0.33
219 0.36
220 0.38
221 0.35
222 0.35
223 0.39
224 0.4
225 0.41
226 0.43
227 0.44
228 0.45
229 0.45
230 0.52
231 0.53
232 0.57