Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VUA4

Protein Details
Accession A0A1Y1VUA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
191-214ALAAAKKEKKDRSRSRSSSRVSCYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-204KKEKKDRSR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANRTVSDAKNIHGTNPQYLLEKIIRSRIYESLYWKEDCFGLTAESLIDKADQLPCIGGQYGNQKPTEFLCLTLKLLQLQPEKEIIIDFIRNEDSKYLRALGAFYFRLIGDSLEIYKYLEPLLYDFRKLRRRLPDGAYDIIHMDEFIDSLLRDERVCDTILPRILKRQVLEDNEELEPRVSFLEDELEQEALAAAKKEKKDRSRSRSSSRVSCYRNIKTINIYFYKCIINN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.33
3 0.35
4 0.35
5 0.29
6 0.29
7 0.32
8 0.28
9 0.3
10 0.27
11 0.32
12 0.32
13 0.32
14 0.35
15 0.34
16 0.35
17 0.35
18 0.38
19 0.38
20 0.4
21 0.39
22 0.36
23 0.33
24 0.29
25 0.26
26 0.22
27 0.15
28 0.13
29 0.11
30 0.11
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.08
35 0.07
36 0.06
37 0.08
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.1
43 0.11
44 0.12
45 0.1
46 0.1
47 0.18
48 0.22
49 0.25
50 0.26
51 0.25
52 0.25
53 0.26
54 0.3
55 0.22
56 0.2
57 0.2
58 0.2
59 0.22
60 0.23
61 0.23
62 0.18
63 0.19
64 0.23
65 0.24
66 0.23
67 0.23
68 0.21
69 0.21
70 0.19
71 0.18
72 0.13
73 0.1
74 0.11
75 0.09
76 0.09
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.14
84 0.13
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.13
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.12
110 0.12
111 0.14
112 0.16
113 0.23
114 0.31
115 0.33
116 0.38
117 0.42
118 0.46
119 0.5
120 0.52
121 0.53
122 0.49
123 0.49
124 0.42
125 0.33
126 0.29
127 0.23
128 0.19
129 0.11
130 0.07
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.1
142 0.11
143 0.12
144 0.11
145 0.12
146 0.16
147 0.21
148 0.23
149 0.21
150 0.27
151 0.3
152 0.32
153 0.31
154 0.33
155 0.34
156 0.36
157 0.4
158 0.35
159 0.35
160 0.33
161 0.32
162 0.27
163 0.21
164 0.17
165 0.12
166 0.11
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.11
171 0.1
172 0.12
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.16
183 0.21
184 0.29
185 0.39
186 0.48
187 0.58
188 0.68
189 0.74
190 0.8
191 0.84
192 0.85
193 0.85
194 0.83
195 0.81
196 0.78
197 0.78
198 0.72
199 0.71
200 0.71
201 0.68
202 0.68
203 0.63
204 0.59
205 0.58
206 0.59
207 0.58
208 0.55
209 0.51
210 0.46
211 0.45