Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1X7Q9

Protein Details
Accession A0A1Y1X7Q9    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
359-407HKDHDYKSSRHREHREHREENESERKAKERDNLRRERQKQREREMRLSHBasic
535-557PYELEKFLKNKRNHENNNDERGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-210KFKHKKMPRGPPS
300-309AKEKKEKEER
370-401REHREHREENESERKAKERDNLRRERQKQRER
559-562KRRR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MSLASFLPKPRNQQLKTDSIFDSKSIISNDVVGPPSYRHRKGFIPKTVEDFGNGGAFPEIHIVQYPLDMGRKKSIRTSTKTLPLQVDKDGKIRYDAILKQGHSNNRIIHSQLKDIVPMEKNEFNVRPSEEDIKKTAEKTQAALQAILEGRSKSSQGVQNKDKKNGPSFVKYTPASKSTVGSRIIRMVEAPVDPMEPPKFKHKKMPRGPPSPPAPVLHSPPRKVSAEEQSNWVIPPCISNWKNAKGYTIPLDKRLAADGRGIQDIQINPKFASFSEALSIADRHAREEVRLRANMQAKLAAKEKKEKEERLRMLAQRAREERAGLIHNEEKRNERDDSDTDSGTESSSSESSRSSFERSHKDHDYKSSRHREHREHREENESERKAKERDNLRRERQKQREREMRLSHMGQETKSKVMRKLGDRDISEKIALGLAQPTTSRESMYDQRLFNRSEGLSSGFGSEDSYNIYDKPLFAERSSNSIYRPKKIVSDDNYDIEAIEKIVSNKTGGEGSRGFKGTDGTSQRSGPVQFEKEEDPYELEKFLKNKRNHENNNDERGSEKRRRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.68
3 0.67
4 0.64
5 0.57
6 0.51
7 0.49
8 0.4
9 0.36
10 0.27
11 0.28
12 0.25
13 0.24
14 0.19
15 0.21
16 0.22
17 0.23
18 0.24
19 0.2
20 0.2
21 0.21
22 0.31
23 0.37
24 0.41
25 0.41
26 0.43
27 0.52
28 0.61
29 0.68
30 0.68
31 0.66
32 0.63
33 0.66
34 0.66
35 0.57
36 0.49
37 0.39
38 0.31
39 0.25
40 0.22
41 0.16
42 0.13
43 0.12
44 0.1
45 0.13
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.11
54 0.17
55 0.19
56 0.21
57 0.3
58 0.34
59 0.35
60 0.42
61 0.5
62 0.53
63 0.58
64 0.63
65 0.62
66 0.68
67 0.7
68 0.67
69 0.64
70 0.61
71 0.56
72 0.55
73 0.53
74 0.46
75 0.47
76 0.44
77 0.38
78 0.35
79 0.34
80 0.29
81 0.3
82 0.3
83 0.31
84 0.34
85 0.34
86 0.39
87 0.44
88 0.48
89 0.44
90 0.47
91 0.44
92 0.42
93 0.43
94 0.38
95 0.39
96 0.35
97 0.36
98 0.36
99 0.32
100 0.31
101 0.3
102 0.33
103 0.29
104 0.28
105 0.29
106 0.27
107 0.28
108 0.32
109 0.33
110 0.28
111 0.29
112 0.29
113 0.27
114 0.28
115 0.35
116 0.32
117 0.34
118 0.35
119 0.36
120 0.37
121 0.35
122 0.37
123 0.35
124 0.34
125 0.33
126 0.37
127 0.37
128 0.36
129 0.35
130 0.29
131 0.26
132 0.25
133 0.24
134 0.19
135 0.14
136 0.14
137 0.15
138 0.16
139 0.12
140 0.17
141 0.23
142 0.28
143 0.37
144 0.44
145 0.53
146 0.58
147 0.63
148 0.63
149 0.62
150 0.61
151 0.6
152 0.56
153 0.54
154 0.52
155 0.48
156 0.49
157 0.44
158 0.41
159 0.38
160 0.34
161 0.3
162 0.27
163 0.26
164 0.24
165 0.29
166 0.29
167 0.28
168 0.27
169 0.28
170 0.28
171 0.26
172 0.22
173 0.17
174 0.15
175 0.13
176 0.13
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.13
181 0.15
182 0.14
183 0.16
184 0.26
185 0.33
186 0.34
187 0.45
188 0.51
189 0.59
190 0.68
191 0.77
192 0.76
193 0.78
194 0.79
195 0.77
196 0.72
197 0.66
198 0.59
199 0.49
200 0.45
201 0.39
202 0.4
203 0.42
204 0.42
205 0.39
206 0.39
207 0.42
208 0.38
209 0.37
210 0.37
211 0.37
212 0.38
213 0.37
214 0.37
215 0.35
216 0.34
217 0.32
218 0.27
219 0.18
220 0.11
221 0.12
222 0.1
223 0.18
224 0.18
225 0.24
226 0.29
227 0.34
228 0.38
229 0.37
230 0.38
231 0.3
232 0.31
233 0.31
234 0.34
235 0.29
236 0.28
237 0.3
238 0.28
239 0.27
240 0.27
241 0.22
242 0.15
243 0.16
244 0.15
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.12
249 0.14
250 0.14
251 0.18
252 0.18
253 0.17
254 0.16
255 0.17
256 0.17
257 0.14
258 0.17
259 0.12
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.07
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.18
274 0.23
275 0.24
276 0.25
277 0.25
278 0.29
279 0.33
280 0.33
281 0.28
282 0.27
283 0.24
284 0.25
285 0.3
286 0.28
287 0.25
288 0.33
289 0.35
290 0.4
291 0.46
292 0.5
293 0.54
294 0.6
295 0.61
296 0.58
297 0.61
298 0.54
299 0.55
300 0.5
301 0.45
302 0.41
303 0.4
304 0.37
305 0.32
306 0.3
307 0.23
308 0.23
309 0.22
310 0.16
311 0.18
312 0.19
313 0.23
314 0.25
315 0.26
316 0.27
317 0.28
318 0.31
319 0.29
320 0.26
321 0.26
322 0.25
323 0.31
324 0.3
325 0.27
326 0.23
327 0.23
328 0.22
329 0.18
330 0.16
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.12
339 0.13
340 0.15
341 0.19
342 0.25
343 0.33
344 0.37
345 0.43
346 0.48
347 0.51
348 0.51
349 0.56
350 0.58
351 0.54
352 0.6
353 0.64
354 0.63
355 0.68
356 0.73
357 0.74
358 0.77
359 0.82
360 0.82
361 0.78
362 0.74
363 0.73
364 0.67
365 0.63
366 0.62
367 0.54
368 0.47
369 0.43
370 0.44
371 0.39
372 0.42
373 0.43
374 0.43
375 0.51
376 0.58
377 0.66
378 0.72
379 0.8
380 0.83
381 0.86
382 0.87
383 0.86
384 0.85
385 0.86
386 0.86
387 0.83
388 0.84
389 0.79
390 0.74
391 0.7
392 0.62
393 0.56
394 0.52
395 0.46
396 0.37
397 0.38
398 0.34
399 0.33
400 0.36
401 0.35
402 0.33
403 0.39
404 0.45
405 0.45
406 0.52
407 0.54
408 0.57
409 0.55
410 0.55
411 0.51
412 0.46
413 0.4
414 0.32
415 0.24
416 0.17
417 0.15
418 0.12
419 0.1
420 0.08
421 0.09
422 0.09
423 0.11
424 0.14
425 0.14
426 0.14
427 0.13
428 0.19
429 0.25
430 0.32
431 0.36
432 0.34
433 0.39
434 0.43
435 0.44
436 0.39
437 0.37
438 0.29
439 0.25
440 0.25
441 0.23
442 0.19
443 0.18
444 0.18
445 0.13
446 0.13
447 0.14
448 0.12
449 0.1
450 0.11
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.14
455 0.13
456 0.13
457 0.17
458 0.2
459 0.21
460 0.21
461 0.28
462 0.27
463 0.32
464 0.36
465 0.33
466 0.31
467 0.38
468 0.41
469 0.4
470 0.44
471 0.4
472 0.43
473 0.48
474 0.54
475 0.51
476 0.55
477 0.54
478 0.52
479 0.5
480 0.43
481 0.37
482 0.29
483 0.23
484 0.14
485 0.11
486 0.1
487 0.11
488 0.14
489 0.15
490 0.14
491 0.14
492 0.15
493 0.18
494 0.17
495 0.21
496 0.22
497 0.23
498 0.29
499 0.3
500 0.28
501 0.25
502 0.28
503 0.24
504 0.29
505 0.33
506 0.33
507 0.35
508 0.35
509 0.36
510 0.37
511 0.37
512 0.33
513 0.35
514 0.33
515 0.32
516 0.34
517 0.36
518 0.36
519 0.36
520 0.33
521 0.3
522 0.29
523 0.29
524 0.27
525 0.25
526 0.27
527 0.3
528 0.38
529 0.43
530 0.47
531 0.56
532 0.65
533 0.74
534 0.79
535 0.84
536 0.85
537 0.85
538 0.88
539 0.79
540 0.69
541 0.6
542 0.58
543 0.56