Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XQT1

Protein Details
Accession A0A1Y1XQT1    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-40EEEMEEEGKRKRKRKRSGKDSKLSEENGBasic
552-571YPSDRQKKFTGTRNRKKRILHydrophilic
834-854RKELEVKKYLREKQRGLRDGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-33GKRKRKRKRSGKDS
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039340  Tfc4/TFIIIC-102/Sfc4  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MDQDQEDDLKDLEEEMEEEGKRKRKRKRSGKDSKLSEENGKLLGKANVAYSNKQYQEAIQYLHSIIQSAPNANQAWFLLAIIHEELGEELKAFQFYLVAAHITKKDGSLWKRLGLMAKNLNQIEEAIYCYTKAIHTDNKDFDAVWDRSYLYYEQGNYKKAINGYIYILKYCPNNTHVIKELSKLYLKTNNVEKAIILFENAIKASDEEQELYRQHLIEKEKMKAQQALQQTTQVNGASSSERGFFDDVPRLQPIETSDDEEDSFQFECSIGYEEINMLAELYMEINEYEKAINTIRKRCRILQGRETPIKENIMDDSEFDEDENTPERLRLPMELRVRLGICRLYLNQINLAVHHFYYLYKYEVQYYPELYFDVGEAYIERKLYTKALAIFNVMEECEQTNVPITWSKLAYCYHQLGNLEAAVDLYKHVLKYLPDDHDLKLSLAEVYGDMGEEEKALALINEVDAATSKDNNEEKDEQEKNESEKLSIFVDTQKTPFKKQEDESVKIRDNKLYYQKIGLLYPKIGKDEGSQNEFLNTAFKLVQRFQNTKEFYPSDRQKKFTGTRNRKKRILPSFTDNDEIISHENKEKLPESFQGLSFNEWFEVIVKYAIGLAKSGNANEAQEVLWNASKANVYYHDKERSRVLRYYMLGIALYSKNYIKACEICRWFINTYPNNLDSYRLYMVVFTSGNPIIQAYASSSSQKFFSRFIKNMKYDETSKEFNNPLVYVIYGHILHSARSYMQALNYYSKAFKIAPVDPIINLSLGLVHLHRAMQRQADNRHLQIIQGLTFIFRYFKIMKGNQEACYNVARAFHQIGLLYLAVQYYEKVLKMPSRKELEVKKYLREKQRGLRDGSFKIDQEFELYMEEQEDDTDLKSEAAYNLSLIYVASGSYGLSQQLLRKYCTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.15
4 0.15
5 0.18
6 0.25
7 0.34
8 0.42
9 0.5
10 0.58
11 0.64
12 0.75
13 0.84
14 0.88
15 0.9
16 0.93
17 0.95
18 0.95
19 0.92
20 0.89
21 0.86
22 0.79
23 0.75
24 0.67
25 0.58
26 0.52
27 0.44
28 0.37
29 0.33
30 0.3
31 0.25
32 0.22
33 0.23
34 0.26
35 0.29
36 0.32
37 0.34
38 0.4
39 0.4
40 0.4
41 0.38
42 0.33
43 0.38
44 0.37
45 0.34
46 0.27
47 0.27
48 0.26
49 0.28
50 0.25
51 0.18
52 0.16
53 0.2
54 0.21
55 0.21
56 0.22
57 0.24
58 0.25
59 0.24
60 0.26
61 0.19
62 0.19
63 0.16
64 0.15
65 0.11
66 0.1
67 0.12
68 0.11
69 0.1
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.13
88 0.15
89 0.17
90 0.17
91 0.16
92 0.21
93 0.28
94 0.32
95 0.38
96 0.4
97 0.41
98 0.43
99 0.45
100 0.45
101 0.4
102 0.44
103 0.43
104 0.45
105 0.49
106 0.47
107 0.44
108 0.38
109 0.35
110 0.29
111 0.21
112 0.18
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.12
119 0.14
120 0.17
121 0.23
122 0.3
123 0.37
124 0.4
125 0.42
126 0.42
127 0.38
128 0.36
129 0.36
130 0.31
131 0.24
132 0.22
133 0.2
134 0.2
135 0.23
136 0.21
137 0.15
138 0.18
139 0.19
140 0.26
141 0.3
142 0.32
143 0.31
144 0.32
145 0.33
146 0.31
147 0.33
148 0.26
149 0.24
150 0.25
151 0.3
152 0.29
153 0.26
154 0.25
155 0.24
156 0.24
157 0.25
158 0.25
159 0.21
160 0.28
161 0.29
162 0.33
163 0.36
164 0.39
165 0.38
166 0.36
167 0.37
168 0.33
169 0.34
170 0.31
171 0.31
172 0.33
173 0.33
174 0.36
175 0.41
176 0.42
177 0.4
178 0.39
179 0.35
180 0.29
181 0.29
182 0.24
183 0.16
184 0.12
185 0.11
186 0.13
187 0.13
188 0.11
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.14
196 0.18
197 0.18
198 0.2
199 0.2
200 0.17
201 0.18
202 0.22
203 0.25
204 0.28
205 0.33
206 0.34
207 0.37
208 0.41
209 0.43
210 0.43
211 0.4
212 0.39
213 0.42
214 0.43
215 0.39
216 0.41
217 0.38
218 0.33
219 0.33
220 0.27
221 0.2
222 0.15
223 0.16
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.16
233 0.23
234 0.23
235 0.23
236 0.24
237 0.23
238 0.21
239 0.22
240 0.2
241 0.19
242 0.19
243 0.2
244 0.19
245 0.2
246 0.2
247 0.19
248 0.17
249 0.13
250 0.13
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.11
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.05
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.08
278 0.1
279 0.16
280 0.21
281 0.3
282 0.37
283 0.45
284 0.49
285 0.52
286 0.59
287 0.63
288 0.66
289 0.67
290 0.69
291 0.7
292 0.72
293 0.69
294 0.62
295 0.54
296 0.48
297 0.38
298 0.29
299 0.22
300 0.19
301 0.17
302 0.14
303 0.14
304 0.13
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.08
309 0.1
310 0.12
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.14
318 0.15
319 0.21
320 0.26
321 0.28
322 0.28
323 0.29
324 0.29
325 0.25
326 0.24
327 0.18
328 0.14
329 0.14
330 0.14
331 0.16
332 0.18
333 0.19
334 0.18
335 0.18
336 0.18
337 0.16
338 0.17
339 0.14
340 0.11
341 0.11
342 0.09
343 0.08
344 0.1
345 0.11
346 0.11
347 0.12
348 0.13
349 0.16
350 0.18
351 0.2
352 0.19
353 0.2
354 0.18
355 0.17
356 0.17
357 0.13
358 0.11
359 0.08
360 0.08
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.09
370 0.1
371 0.11
372 0.12
373 0.15
374 0.17
375 0.17
376 0.17
377 0.16
378 0.15
379 0.15
380 0.12
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.1
391 0.1
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.13
396 0.14
397 0.16
398 0.17
399 0.19
400 0.17
401 0.19
402 0.19
403 0.17
404 0.16
405 0.14
406 0.11
407 0.08
408 0.08
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.05
415 0.06
416 0.07
417 0.08
418 0.12
419 0.17
420 0.18
421 0.21
422 0.22
423 0.23
424 0.23
425 0.23
426 0.19
427 0.14
428 0.12
429 0.09
430 0.07
431 0.06
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.03
437 0.04
438 0.04
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.04
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.1
457 0.12
458 0.13
459 0.17
460 0.18
461 0.19
462 0.27
463 0.28
464 0.24
465 0.27
466 0.27
467 0.25
468 0.27
469 0.26
470 0.19
471 0.18
472 0.19
473 0.16
474 0.15
475 0.13
476 0.12
477 0.14
478 0.15
479 0.16
480 0.21
481 0.22
482 0.25
483 0.3
484 0.31
485 0.33
486 0.34
487 0.42
488 0.42
489 0.45
490 0.46
491 0.45
492 0.47
493 0.46
494 0.46
495 0.39
496 0.33
497 0.35
498 0.4
499 0.38
500 0.34
501 0.32
502 0.34
503 0.31
504 0.31
505 0.28
506 0.21
507 0.19
508 0.21
509 0.2
510 0.19
511 0.17
512 0.16
513 0.16
514 0.23
515 0.24
516 0.25
517 0.25
518 0.24
519 0.24
520 0.24
521 0.21
522 0.15
523 0.11
524 0.09
525 0.09
526 0.1
527 0.12
528 0.15
529 0.21
530 0.25
531 0.28
532 0.3
533 0.38
534 0.39
535 0.38
536 0.41
537 0.37
538 0.34
539 0.41
540 0.46
541 0.48
542 0.49
543 0.51
544 0.47
545 0.54
546 0.57
547 0.56
548 0.59
549 0.6
550 0.67
551 0.75
552 0.8
553 0.79
554 0.79
555 0.79
556 0.78
557 0.74
558 0.69
559 0.65
560 0.63
561 0.58
562 0.55
563 0.45
564 0.35
565 0.27
566 0.24
567 0.18
568 0.14
569 0.14
570 0.14
571 0.16
572 0.15
573 0.18
574 0.19
575 0.18
576 0.2
577 0.21
578 0.24
579 0.24
580 0.25
581 0.26
582 0.25
583 0.25
584 0.23
585 0.21
586 0.15
587 0.13
588 0.12
589 0.09
590 0.09
591 0.08
592 0.07
593 0.06
594 0.06
595 0.08
596 0.09
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.1
601 0.11
602 0.11
603 0.1
604 0.1
605 0.1
606 0.1
607 0.11
608 0.08
609 0.08
610 0.09
611 0.09
612 0.1
613 0.1
614 0.09
615 0.1
616 0.11
617 0.1
618 0.12
619 0.16
620 0.21
621 0.26
622 0.32
623 0.39
624 0.4
625 0.41
626 0.48
627 0.48
628 0.47
629 0.46
630 0.44
631 0.41
632 0.41
633 0.42
634 0.35
635 0.29
636 0.24
637 0.2
638 0.2
639 0.14
640 0.14
641 0.12
642 0.12
643 0.15
644 0.15
645 0.17
646 0.16
647 0.21
648 0.25
649 0.31
650 0.34
651 0.33
652 0.34
653 0.37
654 0.35
655 0.34
656 0.4
657 0.35
658 0.38
659 0.4
660 0.39
661 0.37
662 0.36
663 0.33
664 0.25
665 0.26
666 0.22
667 0.18
668 0.17
669 0.15
670 0.15
671 0.15
672 0.14
673 0.1
674 0.13
675 0.12
676 0.12
677 0.12
678 0.12
679 0.09
680 0.09
681 0.09
682 0.07
683 0.1
684 0.11
685 0.14
686 0.15
687 0.16
688 0.18
689 0.21
690 0.2
691 0.22
692 0.29
693 0.34
694 0.39
695 0.46
696 0.54
697 0.55
698 0.56
699 0.57
700 0.54
701 0.49
702 0.5
703 0.47
704 0.4
705 0.37
706 0.4
707 0.37
708 0.34
709 0.33
710 0.27
711 0.23
712 0.21
713 0.19
714 0.15
715 0.14
716 0.14
717 0.11
718 0.11
719 0.14
720 0.14
721 0.14
722 0.14
723 0.15
724 0.12
725 0.15
726 0.17
727 0.14
728 0.16
729 0.2
730 0.21
731 0.24
732 0.25
733 0.25
734 0.23
735 0.22
736 0.23
737 0.19
738 0.2
739 0.22
740 0.23
741 0.25
742 0.28
743 0.29
744 0.26
745 0.28
746 0.25
747 0.19
748 0.16
749 0.12
750 0.09
751 0.08
752 0.09
753 0.07
754 0.08
755 0.08
756 0.11
757 0.13
758 0.17
759 0.2
760 0.25
761 0.31
762 0.38
763 0.42
764 0.49
765 0.52
766 0.49
767 0.51
768 0.45
769 0.39
770 0.35
771 0.32
772 0.23
773 0.19
774 0.17
775 0.13
776 0.13
777 0.14
778 0.12
779 0.09
780 0.15
781 0.16
782 0.2
783 0.28
784 0.33
785 0.39
786 0.48
787 0.52
788 0.49
789 0.51
790 0.48
791 0.41
792 0.4
793 0.34
794 0.26
795 0.23
796 0.21
797 0.22
798 0.23
799 0.21
800 0.2
801 0.19
802 0.18
803 0.18
804 0.16
805 0.12
806 0.1
807 0.09
808 0.08
809 0.08
810 0.08
811 0.09
812 0.11
813 0.11
814 0.13
815 0.16
816 0.23
817 0.32
818 0.38
819 0.43
820 0.48
821 0.51
822 0.58
823 0.64
824 0.66
825 0.68
826 0.66
827 0.66
828 0.69
829 0.74
830 0.76
831 0.76
832 0.75
833 0.75
834 0.82
835 0.8
836 0.78
837 0.77
838 0.74
839 0.68
840 0.66
841 0.61
842 0.51
843 0.46
844 0.41
845 0.33
846 0.29
847 0.27
848 0.21
849 0.19
850 0.19
851 0.16
852 0.15
853 0.16
854 0.12
855 0.12
856 0.12
857 0.1
858 0.1
859 0.11
860 0.11
861 0.1
862 0.1
863 0.12
864 0.12
865 0.13
866 0.13
867 0.12
868 0.12
869 0.11
870 0.11
871 0.09
872 0.09
873 0.06
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.06
878 0.07
879 0.08
880 0.08
881 0.1
882 0.12
883 0.17
884 0.25
885 0.28