Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1X646

Protein Details
Accession A0A1Y1X646    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-26NQNKAFNTKKNMNKGKFQDKNAHydrophilic
29-51KKNNNFSKDFTKKNNNNSKKAYAHydrophilic
68-88NSIFGKRNNNYQRNNNKNSNFHydrophilic
129-154NYFKNKGGNSFNKNNRPRNNNKYFYQHydrophilic
768-791EKFWALLHYRKDKRKLNIKPELEEHydrophilic
800-821EEFRKLRKYYPRHGGNNNGMNSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006607  DM15  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MEGDNQNKAFNTKKNMNKGKFQDKNAGAKKNNNFSKDFTKKNNNNSKKAYAVTTNAVATGTTTSPSVNSIFGKRNNNYQRNNNKNSNFFNSSNNSNNAFTGSYNNNDSPFSKNSFGSNKSPFSSSYDRNYFKNKGGNSFNKNNRPRNNNKYFYQQNSGSNVEGLVDINSLDASKLDMDTIKTYLKEQIEYYFSVENLCKDIYMRQQMDEEGFVNLSTLLKFKRTKSLINVAQEVDKKTNTTAKYDDTWSTDLIVNALTDSETVEIKKDDGNIKLRKKYDWKNWMNPDLNWKAEDKKDDKKEIDDDLDVLGGGDDNEWTTITSRKQKKSSKSISEKEKQNNDDDLFQFDEEWNDEVDNDKDNKKSAIEWSDDENDDINLNENDEDDDSEYEIDDDQINGLMLVLPRPRPNGIQNSSGSFSSSYNRKQYGSSFRKNNSTDYQVINDGLVFYENNLNRKGSNNQFKGGSSINSSFKIEDTKNKAFSSIQQQRSNLSSNLKKSSLSSSFTDKKNMNNNLNNDSKDHSFNSKKDYFNKYSSSPKNINGKKNQKRLFVPESPAVHSEYLGSTPSPIGYLMTNEAPAKSARSSRNNNAISGPPPSTSVPIAYSLTRPGTSSGLDIPRNSLTNNSLGKNGSISSSLGASFKEFPAFQHPSYEILKENGFIQHKYTKFHAKAIKERQLAGIGHSQEMNTMFRFWSHFLRERFNRNMYNEFKKLALEDAEAGYRYGLECLFRFYSYGLEVHYRSDIFDDFQTVTLEDYLEKDKLYGLEKFWALLHYRKDKRKLNIKPELEEILKKFPTIEEFRKLRKYYPRHGGNNNGMNSSNPAPISSSYNNNNTSQLTLDMNMNLNTINMDPTLSSADLLGTSNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.73
3 0.74
4 0.78
5 0.8
6 0.82
7 0.81
8 0.77
9 0.77
10 0.73
11 0.78
12 0.76
13 0.76
14 0.7
15 0.72
16 0.75
17 0.75
18 0.75
19 0.69
20 0.64
21 0.6
22 0.66
23 0.65
24 0.64
25 0.63
26 0.68
27 0.71
28 0.79
29 0.84
30 0.82
31 0.83
32 0.82
33 0.78
34 0.72
35 0.67
36 0.61
37 0.55
38 0.5
39 0.45
40 0.41
41 0.35
42 0.3
43 0.27
44 0.22
45 0.18
46 0.16
47 0.13
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.16
56 0.21
57 0.28
58 0.35
59 0.44
60 0.44
61 0.54
62 0.61
63 0.68
64 0.7
65 0.73
66 0.78
67 0.79
68 0.85
69 0.84
70 0.8
71 0.78
72 0.77
73 0.74
74 0.7
75 0.61
76 0.59
77 0.54
78 0.54
79 0.52
80 0.5
81 0.45
82 0.39
83 0.38
84 0.33
85 0.29
86 0.23
87 0.23
88 0.22
89 0.22
90 0.26
91 0.27
92 0.26
93 0.27
94 0.28
95 0.28
96 0.29
97 0.3
98 0.29
99 0.28
100 0.33
101 0.38
102 0.42
103 0.44
104 0.46
105 0.46
106 0.44
107 0.45
108 0.4
109 0.41
110 0.43
111 0.4
112 0.43
113 0.48
114 0.49
115 0.51
116 0.57
117 0.54
118 0.52
119 0.55
120 0.48
121 0.47
122 0.54
123 0.59
124 0.6
125 0.66
126 0.7
127 0.73
128 0.79
129 0.81
130 0.8
131 0.81
132 0.83
133 0.83
134 0.84
135 0.8
136 0.75
137 0.75
138 0.74
139 0.7
140 0.68
141 0.61
142 0.56
143 0.54
144 0.53
145 0.44
146 0.36
147 0.3
148 0.23
149 0.18
150 0.14
151 0.09
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.1
165 0.12
166 0.14
167 0.16
168 0.15
169 0.17
170 0.22
171 0.22
172 0.22
173 0.22
174 0.23
175 0.24
176 0.25
177 0.26
178 0.21
179 0.19
180 0.2
181 0.2
182 0.17
183 0.16
184 0.15
185 0.13
186 0.12
187 0.17
188 0.22
189 0.3
190 0.3
191 0.29
192 0.3
193 0.31
194 0.32
195 0.29
196 0.22
197 0.13
198 0.12
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.07
204 0.09
205 0.09
206 0.15
207 0.19
208 0.21
209 0.31
210 0.34
211 0.39
212 0.43
213 0.53
214 0.53
215 0.53
216 0.54
217 0.45
218 0.46
219 0.44
220 0.4
221 0.33
222 0.27
223 0.23
224 0.23
225 0.28
226 0.25
227 0.26
228 0.26
229 0.26
230 0.29
231 0.31
232 0.31
233 0.29
234 0.29
235 0.25
236 0.24
237 0.22
238 0.19
239 0.16
240 0.14
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.06
245 0.04
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.14
255 0.17
256 0.21
257 0.3
258 0.37
259 0.44
260 0.5
261 0.5
262 0.52
263 0.58
264 0.62
265 0.63
266 0.66
267 0.67
268 0.7
269 0.76
270 0.78
271 0.72
272 0.64
273 0.62
274 0.55
275 0.48
276 0.39
277 0.34
278 0.3
279 0.3
280 0.36
281 0.32
282 0.37
283 0.43
284 0.49
285 0.49
286 0.48
287 0.48
288 0.45
289 0.42
290 0.33
291 0.26
292 0.2
293 0.18
294 0.14
295 0.11
296 0.07
297 0.04
298 0.04
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.06
306 0.09
307 0.14
308 0.23
309 0.32
310 0.38
311 0.48
312 0.55
313 0.63
314 0.7
315 0.75
316 0.76
317 0.78
318 0.78
319 0.79
320 0.8
321 0.79
322 0.76
323 0.74
324 0.66
325 0.6
326 0.58
327 0.49
328 0.45
329 0.38
330 0.32
331 0.25
332 0.23
333 0.19
334 0.14
335 0.14
336 0.11
337 0.11
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.09
343 0.12
344 0.13
345 0.14
346 0.15
347 0.16
348 0.17
349 0.16
350 0.17
351 0.18
352 0.2
353 0.2
354 0.21
355 0.23
356 0.26
357 0.25
358 0.24
359 0.19
360 0.15
361 0.13
362 0.12
363 0.1
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.06
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.06
389 0.08
390 0.09
391 0.11
392 0.12
393 0.14
394 0.15
395 0.2
396 0.27
397 0.28
398 0.32
399 0.31
400 0.32
401 0.32
402 0.3
403 0.26
404 0.18
405 0.15
406 0.14
407 0.18
408 0.19
409 0.22
410 0.24
411 0.24
412 0.24
413 0.29
414 0.37
415 0.4
416 0.44
417 0.46
418 0.47
419 0.54
420 0.54
421 0.52
422 0.44
423 0.41
424 0.36
425 0.31
426 0.3
427 0.23
428 0.22
429 0.18
430 0.15
431 0.1
432 0.07
433 0.06
434 0.04
435 0.04
436 0.1
437 0.11
438 0.13
439 0.14
440 0.15
441 0.15
442 0.18
443 0.23
444 0.26
445 0.35
446 0.35
447 0.36
448 0.36
449 0.36
450 0.36
451 0.31
452 0.24
453 0.17
454 0.18
455 0.18
456 0.19
457 0.19
458 0.17
459 0.16
460 0.2
461 0.18
462 0.21
463 0.28
464 0.31
465 0.34
466 0.33
467 0.34
468 0.3
469 0.33
470 0.36
471 0.38
472 0.41
473 0.42
474 0.42
475 0.43
476 0.45
477 0.44
478 0.35
479 0.32
480 0.29
481 0.29
482 0.33
483 0.31
484 0.29
485 0.28
486 0.32
487 0.29
488 0.27
489 0.25
490 0.29
491 0.34
492 0.35
493 0.39
494 0.34
495 0.36
496 0.42
497 0.48
498 0.48
499 0.48
500 0.5
501 0.51
502 0.53
503 0.48
504 0.4
505 0.36
506 0.3
507 0.27
508 0.25
509 0.27
510 0.29
511 0.3
512 0.36
513 0.39
514 0.41
515 0.46
516 0.52
517 0.5
518 0.49
519 0.51
520 0.46
521 0.5
522 0.51
523 0.51
524 0.46
525 0.47
526 0.53
527 0.56
528 0.61
529 0.62
530 0.68
531 0.71
532 0.77
533 0.77
534 0.73
535 0.7
536 0.7
537 0.67
538 0.61
539 0.56
540 0.52
541 0.48
542 0.44
543 0.41
544 0.35
545 0.28
546 0.23
547 0.19
548 0.13
549 0.12
550 0.1
551 0.09
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.07
560 0.09
561 0.09
562 0.11
563 0.11
564 0.11
565 0.11
566 0.11
567 0.12
568 0.12
569 0.19
570 0.24
571 0.33
572 0.4
573 0.45
574 0.55
575 0.54
576 0.53
577 0.49
578 0.44
579 0.38
580 0.34
581 0.28
582 0.19
583 0.2
584 0.19
585 0.18
586 0.16
587 0.16
588 0.14
589 0.15
590 0.16
591 0.14
592 0.14
593 0.16
594 0.17
595 0.16
596 0.15
597 0.15
598 0.15
599 0.14
600 0.15
601 0.17
602 0.2
603 0.22
604 0.21
605 0.23
606 0.23
607 0.23
608 0.22
609 0.2
610 0.16
611 0.22
612 0.25
613 0.23
614 0.23
615 0.23
616 0.23
617 0.22
618 0.2
619 0.14
620 0.12
621 0.12
622 0.1
623 0.1
624 0.1
625 0.1
626 0.09
627 0.11
628 0.11
629 0.12
630 0.13
631 0.13
632 0.14
633 0.22
634 0.26
635 0.24
636 0.27
637 0.27
638 0.29
639 0.31
640 0.31
641 0.24
642 0.21
643 0.21
644 0.18
645 0.18
646 0.2
647 0.21
648 0.2
649 0.23
650 0.28
651 0.3
652 0.32
653 0.36
654 0.4
655 0.39
656 0.46
657 0.49
658 0.49
659 0.57
660 0.64
661 0.69
662 0.61
663 0.6
664 0.55
665 0.53
666 0.46
667 0.39
668 0.35
669 0.27
670 0.26
671 0.25
672 0.22
673 0.19
674 0.2
675 0.19
676 0.13
677 0.13
678 0.12
679 0.13
680 0.16
681 0.17
682 0.22
683 0.27
684 0.34
685 0.36
686 0.45
687 0.51
688 0.56
689 0.6
690 0.6
691 0.6
692 0.56
693 0.62
694 0.59
695 0.61
696 0.56
697 0.5
698 0.44
699 0.38
700 0.35
701 0.29
702 0.24
703 0.17
704 0.17
705 0.17
706 0.17
707 0.17
708 0.16
709 0.13
710 0.11
711 0.1
712 0.09
713 0.09
714 0.1
715 0.09
716 0.15
717 0.17
718 0.16
719 0.17
720 0.16
721 0.18
722 0.17
723 0.18
724 0.14
725 0.17
726 0.17
727 0.18
728 0.2
729 0.18
730 0.17
731 0.19
732 0.18
733 0.16
734 0.16
735 0.17
736 0.15
737 0.17
738 0.17
739 0.15
740 0.15
741 0.13
742 0.13
743 0.1
744 0.12
745 0.14
746 0.14
747 0.13
748 0.13
749 0.14
750 0.16
751 0.2
752 0.2
753 0.19
754 0.24
755 0.24
756 0.25
757 0.24
758 0.24
759 0.24
760 0.27
761 0.33
762 0.38
763 0.47
764 0.55
765 0.64
766 0.7
767 0.76
768 0.81
769 0.83
770 0.83
771 0.85
772 0.82
773 0.76
774 0.72
775 0.68
776 0.61
777 0.56
778 0.48
779 0.46
780 0.41
781 0.37
782 0.33
783 0.29
784 0.33
785 0.36
786 0.39
787 0.41
788 0.47
789 0.54
790 0.63
791 0.63
792 0.63
793 0.66
794 0.68
795 0.68
796 0.73
797 0.75
798 0.74
799 0.8
800 0.81
801 0.81
802 0.8
803 0.72
804 0.64
805 0.54
806 0.46
807 0.44
808 0.37
809 0.31
810 0.23
811 0.21
812 0.21
813 0.23
814 0.29
815 0.28
816 0.32
817 0.35
818 0.42
819 0.44
820 0.43
821 0.45
822 0.39
823 0.36
824 0.31
825 0.27
826 0.22
827 0.2
828 0.21
829 0.2
830 0.22
831 0.21
832 0.19
833 0.17
834 0.15
835 0.15
836 0.13
837 0.12
838 0.09
839 0.1
840 0.09
841 0.11
842 0.14
843 0.13
844 0.13
845 0.11
846 0.12
847 0.12