Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XDW5

Protein Details
Accession A0A1Y1XDW5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-32ATKLSNENKLKIKNNKKKQVDGDGLVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.333, cyto_mito 3.499, cyto 3, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MTNPDNATKLSNENKLKIKNNKKKQVDGDGLVIMSKGLGLRKVLLAFLNIYSHNKNLVILLNTSQQEIESLKAELAIVQKSRNGQSFLKVINNETPSSERHSIYINGGMLAITSRILVVDMLTKVIPTHLITGFLINHAHTITETSMEAFILRLFRQENKVGFIKAFSDSPESFIYGIWKLEKIMRTLFIRSVYFWPRFHLAISKELEKNRIRVIEIRVPLSPNMKTIQTSLIECLESTLLDVKKLTNYVDIDFNIENALFRSFDKIIRIQLDPIWYNISNRAKKVVNDLKTIRSLIDYLLSYDCVAFYSLLETILAENAPTSIFQQENSPWLLLDAANTVFSLAKNRVYINTTDPKELENCKVTAELKHLMPKNTLPILEELPKWKILKSIICEIFDEIDPIKKNKKILIMVNSRRTSIQLKMILSLFKKNEINGSYFLMNKLLENFFKWKKKMLYINKNSNTSNNNEKLNNSYFNTQKNTNNQKLGGRYSTLNNTSSSGGGRRRVRKSKIATNINFIQTHISNNAEELKMKLEEEEQEFGEYLPFDIKLEDEMENEDENIIIREYSNTRFFKQNTIEEDYKLLEDINPDYVIIYDPNLNFIRNLEIYCASLKKKKIPKVFMLIYDNSIEEQRYLSQIRREKYAFERLIREKSVMAIPIDQDGRIKLQPEDDFWREINSRIAGGQLEKGYKKQVIVDVREFRCSLPLLIHTKEINVKPCTLIVGDYILTPIHCVERKSINDLIQSFKSGRLYNQVESMTAYYKQPILLIEFNQDKSFLLQSVNKTDISNEDIQSKIVLLLLAFPNLKILWASSPYASSEMFEDIKKDQKEPDEEESISKGSELLDKNEKIHHYSAQQYNLTPQEMLLSIPGVYHKNYKIIMNNVENLYELSQMTIPQLEKLVGTESARLIYNFFNSTPKDKMN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.61
3 0.68
4 0.72
5 0.76
6 0.78
7 0.83
8 0.87
9 0.87
10 0.88
11 0.87
12 0.86
13 0.83
14 0.75
15 0.68
16 0.59
17 0.51
18 0.41
19 0.33
20 0.22
21 0.13
22 0.11
23 0.09
24 0.09
25 0.11
26 0.12
27 0.15
28 0.18
29 0.19
30 0.2
31 0.19
32 0.19
33 0.19
34 0.19
35 0.2
36 0.18
37 0.22
38 0.23
39 0.24
40 0.25
41 0.23
42 0.22
43 0.22
44 0.25
45 0.22
46 0.22
47 0.23
48 0.27
49 0.27
50 0.27
51 0.25
52 0.2
53 0.19
54 0.18
55 0.18
56 0.13
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.13
62 0.15
63 0.18
64 0.18
65 0.19
66 0.22
67 0.27
68 0.32
69 0.34
70 0.36
71 0.33
72 0.36
73 0.4
74 0.41
75 0.43
76 0.39
77 0.38
78 0.4
79 0.41
80 0.37
81 0.34
82 0.33
83 0.28
84 0.35
85 0.36
86 0.29
87 0.27
88 0.3
89 0.29
90 0.3
91 0.32
92 0.25
93 0.21
94 0.2
95 0.19
96 0.15
97 0.13
98 0.11
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.1
115 0.14
116 0.13
117 0.16
118 0.16
119 0.18
120 0.18
121 0.18
122 0.18
123 0.13
124 0.14
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.08
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.12
141 0.14
142 0.19
143 0.24
144 0.3
145 0.3
146 0.32
147 0.36
148 0.34
149 0.32
150 0.29
151 0.26
152 0.22
153 0.21
154 0.17
155 0.2
156 0.19
157 0.22
158 0.22
159 0.21
160 0.19
161 0.19
162 0.2
163 0.15
164 0.17
165 0.15
166 0.15
167 0.15
168 0.2
169 0.22
170 0.21
171 0.23
172 0.26
173 0.27
174 0.29
175 0.31
176 0.3
177 0.28
178 0.28
179 0.31
180 0.33
181 0.35
182 0.33
183 0.34
184 0.33
185 0.33
186 0.31
187 0.31
188 0.27
189 0.29
190 0.33
191 0.35
192 0.36
193 0.38
194 0.44
195 0.41
196 0.42
197 0.4
198 0.39
199 0.35
200 0.36
201 0.41
202 0.41
203 0.41
204 0.4
205 0.36
206 0.36
207 0.35
208 0.34
209 0.27
210 0.22
211 0.21
212 0.2
213 0.2
214 0.19
215 0.22
216 0.2
217 0.2
218 0.2
219 0.19
220 0.18
221 0.17
222 0.16
223 0.12
224 0.1
225 0.09
226 0.14
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.15
232 0.17
233 0.17
234 0.16
235 0.17
236 0.18
237 0.21
238 0.2
239 0.22
240 0.2
241 0.19
242 0.15
243 0.13
244 0.12
245 0.09
246 0.1
247 0.07
248 0.08
249 0.12
250 0.13
251 0.15
252 0.18
253 0.2
254 0.23
255 0.25
256 0.26
257 0.23
258 0.24
259 0.27
260 0.23
261 0.22
262 0.23
263 0.2
264 0.2
265 0.27
266 0.34
267 0.33
268 0.33
269 0.37
270 0.35
271 0.36
272 0.45
273 0.46
274 0.41
275 0.44
276 0.46
277 0.44
278 0.44
279 0.44
280 0.33
281 0.26
282 0.22
283 0.16
284 0.16
285 0.13
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.07
293 0.08
294 0.06
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.11
314 0.12
315 0.14
316 0.15
317 0.14
318 0.12
319 0.12
320 0.12
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.1
331 0.1
332 0.12
333 0.13
334 0.14
335 0.16
336 0.17
337 0.19
338 0.21
339 0.28
340 0.28
341 0.28
342 0.28
343 0.27
344 0.29
345 0.3
346 0.28
347 0.22
348 0.2
349 0.19
350 0.21
351 0.21
352 0.19
353 0.2
354 0.2
355 0.18
356 0.25
357 0.27
358 0.27
359 0.27
360 0.27
361 0.27
362 0.26
363 0.25
364 0.19
365 0.18
366 0.19
367 0.2
368 0.2
369 0.18
370 0.18
371 0.21
372 0.2
373 0.18
374 0.19
375 0.19
376 0.23
377 0.24
378 0.31
379 0.31
380 0.31
381 0.31
382 0.29
383 0.27
384 0.23
385 0.2
386 0.11
387 0.13
388 0.13
389 0.15
390 0.19
391 0.2
392 0.21
393 0.23
394 0.29
395 0.29
396 0.33
397 0.4
398 0.46
399 0.51
400 0.58
401 0.55
402 0.5
403 0.46
404 0.43
405 0.36
406 0.29
407 0.28
408 0.23
409 0.23
410 0.24
411 0.25
412 0.25
413 0.23
414 0.26
415 0.2
416 0.2
417 0.2
418 0.19
419 0.22
420 0.21
421 0.22
422 0.19
423 0.2
424 0.17
425 0.17
426 0.17
427 0.14
428 0.12
429 0.1
430 0.11
431 0.11
432 0.1
433 0.11
434 0.17
435 0.22
436 0.27
437 0.28
438 0.31
439 0.32
440 0.38
441 0.46
442 0.51
443 0.56
444 0.59
445 0.69
446 0.68
447 0.69
448 0.63
449 0.57
450 0.49
451 0.41
452 0.4
453 0.32
454 0.31
455 0.28
456 0.28
457 0.29
458 0.3
459 0.29
460 0.23
461 0.24
462 0.23
463 0.26
464 0.29
465 0.28
466 0.3
467 0.36
468 0.44
469 0.44
470 0.44
471 0.42
472 0.42
473 0.41
474 0.4
475 0.31
476 0.24
477 0.21
478 0.21
479 0.24
480 0.23
481 0.21
482 0.19
483 0.19
484 0.18
485 0.17
486 0.16
487 0.15
488 0.16
489 0.22
490 0.28
491 0.34
492 0.42
493 0.5
494 0.54
495 0.59
496 0.63
497 0.65
498 0.68
499 0.69
500 0.62
501 0.6
502 0.59
503 0.53
504 0.47
505 0.38
506 0.31
507 0.22
508 0.22
509 0.17
510 0.15
511 0.11
512 0.12
513 0.14
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.11
519 0.11
520 0.11
521 0.09
522 0.12
523 0.14
524 0.15
525 0.13
526 0.13
527 0.13
528 0.13
529 0.12
530 0.09
531 0.07
532 0.06
533 0.06
534 0.05
535 0.05
536 0.06
537 0.06
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.09
542 0.11
543 0.11
544 0.11
545 0.09
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.06
550 0.04
551 0.04
552 0.07
553 0.09
554 0.12
555 0.2
556 0.21
557 0.24
558 0.29
559 0.3
560 0.35
561 0.38
562 0.4
563 0.38
564 0.43
565 0.42
566 0.37
567 0.37
568 0.31
569 0.26
570 0.2
571 0.15
572 0.09
573 0.09
574 0.09
575 0.1
576 0.09
577 0.09
578 0.09
579 0.09
580 0.09
581 0.08
582 0.08
583 0.09
584 0.09
585 0.14
586 0.15
587 0.15
588 0.14
589 0.14
590 0.17
591 0.14
592 0.15
593 0.12
594 0.13
595 0.13
596 0.15
597 0.17
598 0.17
599 0.21
600 0.24
601 0.31
602 0.39
603 0.46
604 0.54
605 0.58
606 0.61
607 0.64
608 0.65
609 0.61
610 0.58
611 0.5
612 0.42
613 0.37
614 0.3
615 0.22
616 0.2
617 0.14
618 0.1
619 0.1
620 0.09
621 0.11
622 0.13
623 0.16
624 0.23
625 0.28
626 0.3
627 0.35
628 0.35
629 0.35
630 0.39
631 0.46
632 0.44
633 0.41
634 0.47
635 0.46
636 0.51
637 0.48
638 0.43
639 0.33
640 0.31
641 0.3
642 0.24
643 0.2
644 0.16
645 0.15
646 0.17
647 0.18
648 0.16
649 0.14
650 0.13
651 0.15
652 0.15
653 0.16
654 0.14
655 0.19
656 0.2
657 0.23
658 0.29
659 0.28
660 0.29
661 0.28
662 0.31
663 0.27
664 0.27
665 0.27
666 0.21
667 0.19
668 0.16
669 0.17
670 0.14
671 0.14
672 0.16
673 0.15
674 0.18
675 0.19
676 0.2
677 0.23
678 0.24
679 0.24
680 0.24
681 0.28
682 0.31
683 0.36
684 0.43
685 0.48
686 0.48
687 0.5
688 0.47
689 0.4
690 0.36
691 0.31
692 0.24
693 0.17
694 0.22
695 0.24
696 0.24
697 0.28
698 0.25
699 0.26
700 0.32
701 0.33
702 0.35
703 0.32
704 0.32
705 0.29
706 0.29
707 0.28
708 0.22
709 0.19
710 0.12
711 0.12
712 0.11
713 0.1
714 0.11
715 0.09
716 0.09
717 0.09
718 0.09
719 0.12
720 0.14
721 0.15
722 0.19
723 0.27
724 0.29
725 0.34
726 0.38
727 0.36
728 0.39
729 0.39
730 0.4
731 0.33
732 0.34
733 0.29
734 0.28
735 0.29
736 0.25
737 0.25
738 0.29
739 0.32
740 0.31
741 0.35
742 0.32
743 0.28
744 0.29
745 0.29
746 0.22
747 0.19
748 0.18
749 0.15
750 0.16
751 0.16
752 0.15
753 0.15
754 0.17
755 0.19
756 0.19
757 0.24
758 0.27
759 0.28
760 0.27
761 0.26
762 0.22
763 0.21
764 0.21
765 0.16
766 0.16
767 0.19
768 0.23
769 0.28
770 0.3
771 0.29
772 0.28
773 0.27
774 0.26
775 0.27
776 0.28
777 0.23
778 0.25
779 0.24
780 0.24
781 0.23
782 0.21
783 0.15
784 0.11
785 0.1
786 0.07
787 0.11
788 0.12
789 0.15
790 0.14
791 0.14
792 0.15
793 0.15
794 0.15
795 0.11
796 0.11
797 0.12
798 0.15
799 0.17
800 0.16
801 0.17
802 0.18
803 0.2
804 0.18
805 0.16
806 0.14
807 0.16
808 0.17
809 0.16
810 0.17
811 0.18
812 0.27
813 0.28
814 0.28
815 0.3
816 0.36
817 0.42
818 0.46
819 0.49
820 0.46
821 0.45
822 0.46
823 0.43
824 0.36
825 0.3
826 0.24
827 0.17
828 0.13
829 0.19
830 0.19
831 0.22
832 0.3
833 0.32
834 0.34
835 0.39
836 0.41
837 0.39
838 0.39
839 0.39
840 0.35
841 0.43
842 0.47
843 0.48
844 0.48
845 0.44
846 0.47
847 0.46
848 0.42
849 0.33
850 0.26
851 0.22
852 0.2
853 0.2
854 0.14
855 0.11
856 0.1
857 0.1
858 0.13
859 0.13
860 0.15
861 0.22
862 0.23
863 0.27
864 0.3
865 0.34
866 0.38
867 0.43
868 0.49
869 0.47
870 0.5
871 0.46
872 0.44
873 0.4
874 0.35
875 0.29
876 0.22
877 0.17
878 0.13
879 0.13
880 0.13
881 0.14
882 0.17
883 0.16
884 0.16
885 0.17
886 0.16
887 0.15
888 0.16
889 0.18
890 0.17
891 0.17
892 0.19
893 0.18
894 0.2
895 0.21
896 0.2
897 0.19
898 0.18
899 0.21
900 0.21
901 0.21
902 0.25
903 0.27
904 0.32