Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XJG3

Protein Details
Accession A0A1Y1XJG3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
527-549YIDKLVFKRHIQQKNNNAKRTKLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR017884  SANT_dom  
IPR032451  SMARCC_C  
IPR032450  SMARCC_N  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR000433  Znf_ZZ  
IPR043145  Znf_ZZ_sf  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0060255  P:regulation of macromolecule metabolic process  
GO:0051171  P:regulation of nitrogen compound metabolic process  
GO:0080090  P:regulation of primary metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00249  Myb_DNA-binding  
PF04433  SWIRM  
PF16495  SWIRM-assoc_1  
PF16496  SWIRM-assoc_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50090  MYB_LIKE  
PS51293  SANT  
PS50934  SWIRM  
PS01357  ZF_ZZ_1  
Amino Acid Sequences MDYKIINKFNDDNIVIHCLEHPDSYNKIVKVSDEYENCSFNENNDYLWNISINWLRKCLQFKDWISEQDFVVEKQEIDDEKERRLNKYPETVEEAKDYLINKSKKIIIPEYAKWFSFLKVHEREKKALPEFFNNKSKSKTEEIYKEYRNFIINTYRMNPSEYLTVTSCRRFLAGDICSIMRIHSFLEQWGLINYQINPETRPSKIGPSFTGHFRITANTPKGLVPFFPNIPASVATLSENNNQFQRNNNNNNNNNLNNKQVFCSTCKTECTQKRYHCLTQRSINLCPNCYSEGIFPIDLTSSNFIKLENTIIDQEIDERWTDQEILLLLEGIELYDDEWMKIAEYVGTKTHRQCISKFLELPIEDPFLENNTNLQDSSITENIKSSSPANIGPMKYSRIPFNQADNPVLSVVTFLASIADPKATKAAVKAAVEELEQPNSLKKYIQSYKESILKKDSLAVKNNDKKDDKNKQEDSEKPNESKTQKMLNKLIELKLKKFELKYKNFELLEKNIENEKKEFERQHQNLYIDKLVFKRHIQQKNNNAKRTKLY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.31
3 0.28
4 0.25
5 0.22
6 0.21
7 0.21
8 0.22
9 0.22
10 0.25
11 0.3
12 0.36
13 0.33
14 0.34
15 0.33
16 0.31
17 0.33
18 0.34
19 0.37
20 0.32
21 0.38
22 0.39
23 0.39
24 0.38
25 0.36
26 0.32
27 0.25
28 0.3
29 0.24
30 0.23
31 0.23
32 0.25
33 0.21
34 0.22
35 0.21
36 0.14
37 0.18
38 0.23
39 0.28
40 0.28
41 0.31
42 0.32
43 0.37
44 0.43
45 0.43
46 0.44
47 0.47
48 0.48
49 0.52
50 0.55
51 0.55
52 0.52
53 0.49
54 0.43
55 0.38
56 0.36
57 0.28
58 0.26
59 0.21
60 0.18
61 0.17
62 0.21
63 0.17
64 0.22
65 0.29
66 0.28
67 0.33
68 0.39
69 0.41
70 0.41
71 0.49
72 0.5
73 0.48
74 0.56
75 0.53
76 0.51
77 0.57
78 0.55
79 0.48
80 0.44
81 0.39
82 0.3
83 0.29
84 0.25
85 0.23
86 0.29
87 0.29
88 0.27
89 0.31
90 0.37
91 0.37
92 0.43
93 0.42
94 0.41
95 0.45
96 0.5
97 0.54
98 0.51
99 0.48
100 0.44
101 0.4
102 0.34
103 0.31
104 0.28
105 0.29
106 0.34
107 0.43
108 0.51
109 0.54
110 0.57
111 0.59
112 0.65
113 0.62
114 0.59
115 0.53
116 0.54
117 0.55
118 0.58
119 0.61
120 0.55
121 0.53
122 0.51
123 0.5
124 0.45
125 0.45
126 0.43
127 0.43
128 0.48
129 0.5
130 0.54
131 0.58
132 0.56
133 0.53
134 0.49
135 0.44
136 0.36
137 0.34
138 0.34
139 0.29
140 0.29
141 0.3
142 0.32
143 0.3
144 0.31
145 0.29
146 0.23
147 0.24
148 0.21
149 0.21
150 0.18
151 0.21
152 0.22
153 0.23
154 0.23
155 0.19
156 0.19
157 0.16
158 0.17
159 0.2
160 0.18
161 0.18
162 0.18
163 0.18
164 0.18
165 0.18
166 0.16
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.09
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.09
179 0.11
180 0.1
181 0.11
182 0.14
183 0.14
184 0.14
185 0.17
186 0.19
187 0.18
188 0.22
189 0.2
190 0.25
191 0.28
192 0.29
193 0.28
194 0.3
195 0.32
196 0.31
197 0.35
198 0.27
199 0.25
200 0.23
201 0.23
202 0.21
203 0.26
204 0.26
205 0.22
206 0.22
207 0.22
208 0.23
209 0.21
210 0.19
211 0.15
212 0.16
213 0.15
214 0.16
215 0.16
216 0.15
217 0.16
218 0.15
219 0.12
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.1
224 0.11
225 0.15
226 0.16
227 0.16
228 0.18
229 0.19
230 0.19
231 0.23
232 0.3
233 0.34
234 0.42
235 0.49
236 0.56
237 0.58
238 0.62
239 0.61
240 0.54
241 0.5
242 0.42
243 0.39
244 0.32
245 0.29
246 0.26
247 0.24
248 0.23
249 0.22
250 0.24
251 0.23
252 0.23
253 0.24
254 0.25
255 0.32
256 0.37
257 0.4
258 0.45
259 0.46
260 0.52
261 0.56
262 0.6
263 0.59
264 0.58
265 0.56
266 0.55
267 0.58
268 0.54
269 0.5
270 0.49
271 0.43
272 0.39
273 0.35
274 0.3
275 0.24
276 0.21
277 0.19
278 0.13
279 0.15
280 0.15
281 0.13
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.03
319 0.03
320 0.02
321 0.03
322 0.04
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.07
332 0.09
333 0.12
334 0.15
335 0.18
336 0.2
337 0.28
338 0.3
339 0.32
340 0.32
341 0.36
342 0.4
343 0.42
344 0.41
345 0.35
346 0.36
347 0.33
348 0.33
349 0.27
350 0.23
351 0.17
352 0.16
353 0.15
354 0.12
355 0.12
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.09
363 0.1
364 0.15
365 0.16
366 0.15
367 0.14
368 0.15
369 0.17
370 0.17
371 0.17
372 0.13
373 0.13
374 0.15
375 0.15
376 0.18
377 0.22
378 0.21
379 0.23
380 0.24
381 0.25
382 0.27
383 0.28
384 0.29
385 0.28
386 0.34
387 0.33
388 0.38
389 0.41
390 0.4
391 0.4
392 0.36
393 0.32
394 0.27
395 0.24
396 0.17
397 0.11
398 0.08
399 0.07
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.07
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.11
410 0.11
411 0.12
412 0.12
413 0.18
414 0.2
415 0.21
416 0.22
417 0.22
418 0.22
419 0.22
420 0.24
421 0.2
422 0.17
423 0.17
424 0.16
425 0.19
426 0.2
427 0.2
428 0.18
429 0.19
430 0.27
431 0.34
432 0.41
433 0.42
434 0.45
435 0.51
436 0.57
437 0.57
438 0.51
439 0.49
440 0.44
441 0.38
442 0.41
443 0.43
444 0.41
445 0.46
446 0.49
447 0.54
448 0.61
449 0.66
450 0.67
451 0.62
452 0.63
453 0.66
454 0.71
455 0.7
456 0.72
457 0.73
458 0.71
459 0.76
460 0.77
461 0.75
462 0.73
463 0.7
464 0.62
465 0.6
466 0.61
467 0.56
468 0.54
469 0.52
470 0.53
471 0.51
472 0.57
473 0.6
474 0.57
475 0.61
476 0.6
477 0.6
478 0.58
479 0.58
480 0.54
481 0.54
482 0.53
483 0.51
484 0.51
485 0.54
486 0.56
487 0.61
488 0.65
489 0.64
490 0.68
491 0.64
492 0.63
493 0.59
494 0.54
495 0.53
496 0.46
497 0.43
498 0.42
499 0.44
500 0.44
501 0.4
502 0.41
503 0.38
504 0.45
505 0.49
506 0.49
507 0.57
508 0.58
509 0.65
510 0.65
511 0.63
512 0.59
513 0.59
514 0.56
515 0.46
516 0.46
517 0.4
518 0.39
519 0.41
520 0.39
521 0.44
522 0.49
523 0.57
524 0.63
525 0.7
526 0.75
527 0.82
528 0.88
529 0.87
530 0.81