FuNGI

A0A1Y1XLC7

Protein Details

Accession

A0A1Y1XLC7

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
601-636	SSSTTKRQSNTSQHRRSRSRSRNRSRHRNRSASPSD	Hydrophilic
673-749	LNSSHNRRERLRERTREKERNGRHKRDNSTRHYSSSRHSSQSRRQRSRSRSHNNSRSKSKSRSRSPHSVHNNSRSRS	Hydrophilic
755-778	SRSPSRSRSTSKSENKKHNLSNGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
614-630	HRRSRSRSRNRSRHRNR
679-760	RRERLRERTREKERNGRHKRDNSTRHYSSSRHSSQSRRQRSRSRSHNNSRSKSKSRSRSPHSVHNNSRSRSRSFSHSRSPSR

Subcellular Location(s)

nucl 25, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034772 CPSF6/7 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12372 RRM_CFIm68_CFIm59

Amino Acid Sequences

MADDENFDLYGDDNFMNGDDGDMDNLYDDLLENEDMPEVTNNNTYDDDDLNYDDVDPGSNTDKKETEENKKKSNEDNNKNDNDNNTNDNDNSNSNNNNSNNNNNNQMDIDKKPSFNKNDMNNSSNHSNNNHNSHNIHSHPVQTLDTFENKVNQKMNDGQGYGKKNKNSNIFSMMRNNNGVTKAVYVGGLNWWTTDEDLRQVSQEAGVLNKLVAKEITFHEHKVNGKSRGIAYLEFEDIESAETFSKYVEANEIQGKKVEIRFVSPQQHGNPFRIIPKDPKEMRAEAAARNESLGNMNMSRMNHNNFQNMNMHPGRGRPYSKPGMSGRGNMSMMGPNGGNLRPPPFGPQPGFNFPDQDFYGPMNGYEPMHNSFGPRPFMGNSGMGRGFGRGQGVMPSPFPPPHNDGGFDQPFNGRNMNMNNNSSNSGNNMHGNNRMNNNSMNNGMHGNRMNNNSNNNFGGHNKYYDNQGGNNNNNNNNNNNNNNNNRDQMDYQMNDDNMSDSNKMGDNNRWEHNNHDNQEHWHGNGPRNYQGRNRQFNNSHNNNGKGSRDNNHQNQSSKSDNNSNFNNNNSNGGSNNNNNSNNNNNSNKSEKRESRSSKGSSSSTTKRQSNTSQHRRSRSRSRNRSRHRNRSASPSDDDESFNNNNNSSNNNSNNNRNGSDDGNDEEDDNINILNSSHNRRERLRERTREKERNGRHKRDNSTRHYSSSRHSSQSRRQRSRSRSHNNSRSKSKSRSRSPHSVHNNSRSRSRSFSHSRSPSRSRSTSKSENKKHNLSNGSGSGSGSNSSNTTNNKHYRSEHSRVSVRKHSSNVVNNSVTIAGIGSKDSKSRMMSDSKVSSGRDSTLERRRERHGK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.1
3	0.11
4	0.1
5	0.09
6	0.08
7	0.09
8	0.1
9	0.1
10	0.09
11	0.09
12	0.09
13	0.08
14	0.06
15	0.06
16	0.06
17	0.08
18	0.08
19	0.08
20	0.09
21	0.1
22	0.1
23	0.11
24	0.12
25	0.11
26	0.13
27	0.18
28	0.18
29	0.2
30	0.21
31	0.21
32	0.22
33	0.22
34	0.21
35	0.18
36	0.19
37	0.17
38	0.16
39	0.15
40	0.14
41	0.12
42	0.12
43	0.11
44	0.12
45	0.16
46	0.2
47	0.21
48	0.24
49	0.26
50	0.27
51	0.37
52	0.43
53	0.49
54	0.56
55	0.62
56	0.67
57	0.71
58	0.73
59	0.73
60	0.75
61	0.75
62	0.75
63	0.78
64	0.78
65	0.77
66	0.76
67	0.7
68	0.65
69	0.59
70	0.53
71	0.46
72	0.4
73	0.37
74	0.34
75	0.33
76	0.3
77	0.27
78	0.27
79	0.27
80	0.28
81	0.27
82	0.34
83	0.34
84	0.39
85	0.41
86	0.46
87	0.48
88	0.49
89	0.54
90	0.47
91	0.46
92	0.4
93	0.38
94	0.34
95	0.3
96	0.35
97	0.31
98	0.34
99	0.38
100	0.46
101	0.49
102	0.52
103	0.57
104	0.57
105	0.64
106	0.67
107	0.63
108	0.56
109	0.56
110	0.54
111	0.49
112	0.44
113	0.37
114	0.39
115	0.44
116	0.49
117	0.46
118	0.45
119	0.44
120	0.45
121	0.49
122	0.42
123	0.41
124	0.36
125	0.36
126	0.33
127	0.34
128	0.3
129	0.23
130	0.25
131	0.23
132	0.24
133	0.23
134	0.22
135	0.27
136	0.28
137	0.32
138	0.34
139	0.31
140	0.33
141	0.37
142	0.41
143	0.37
144	0.36
145	0.35
146	0.37
147	0.44
148	0.46
149	0.46
150	0.47
151	0.49
152	0.55
153	0.6
154	0.57
155	0.54
156	0.55
157	0.52
158	0.5
159	0.54
160	0.5
161	0.44
162	0.42
163	0.38
164	0.33
165	0.32
166	0.29
167	0.21
168	0.19
169	0.16
170	0.15
171	0.14
172	0.11
173	0.1
174	0.12
175	0.12
176	0.11
177	0.1
178	0.1
179	0.1
180	0.11
181	0.12
182	0.11
183	0.13
184	0.15
185	0.15
186	0.15
187	0.15
188	0.14
189	0.13
190	0.14
191	0.1
192	0.1
193	0.1
194	0.09
195	0.09
196	0.1
197	0.1
198	0.09
199	0.09
200	0.08
201	0.11
202	0.12
203	0.19
204	0.19
205	0.21
206	0.23
207	0.27
208	0.31
209	0.36
210	0.42
211	0.4
212	0.4
213	0.42
214	0.39
215	0.4
216	0.37
217	0.3
218	0.25
219	0.22
220	0.21
221	0.18
222	0.17
223	0.12
224	0.11
225	0.11
226	0.09
227	0.07
228	0.08
229	0.07
230	0.08
231	0.07
232	0.09
233	0.08
234	0.08
235	0.11
236	0.11
237	0.13
238	0.2
239	0.21
240	0.2
241	0.22
242	0.22
243	0.22
244	0.23
245	0.24
246	0.18
247	0.21
248	0.26
249	0.31
250	0.37
251	0.36
252	0.39
253	0.39
254	0.48
255	0.45
256	0.42
257	0.39
258	0.34
259	0.35
260	0.34
261	0.34
262	0.32
263	0.37
264	0.44
265	0.43
266	0.46
267	0.47
268	0.45
269	0.43
270	0.41
271	0.37
272	0.31
273	0.34
274	0.3
275	0.25
276	0.25
277	0.23
278	0.18
279	0.17
280	0.15
281	0.11
282	0.1
283	0.11
284	0.13
285	0.13
286	0.16
287	0.19
288	0.21
289	0.26
290	0.28
291	0.32
292	0.3
293	0.31
294	0.32
295	0.29
296	0.32
297	0.27
298	0.25
299	0.21
300	0.23
301	0.26
302	0.27
303	0.29
304	0.25
305	0.32
306	0.39
307	0.39
308	0.42
309	0.39
310	0.42
311	0.4
312	0.41
313	0.36
314	0.33
315	0.33
316	0.27
317	0.26
318	0.2
319	0.18
320	0.15
321	0.12
322	0.09
323	0.11
324	0.1
325	0.11
326	0.09
327	0.12
328	0.12
329	0.13
330	0.18
331	0.19
332	0.23
333	0.24
334	0.28
335	0.3
336	0.34
337	0.36
338	0.31
339	0.31
340	0.27
341	0.29
342	0.25
343	0.2
344	0.16
345	0.14
346	0.16
347	0.13
348	0.12
349	0.09
350	0.09
351	0.09
352	0.09
353	0.11
354	0.11
355	0.13
356	0.13
357	0.14
358	0.17
359	0.2
360	0.21
361	0.19
362	0.18
363	0.17
364	0.19
365	0.19
366	0.19
367	0.15
368	0.16
369	0.16
370	0.15
371	0.14
372	0.13
373	0.12
374	0.1
375	0.1
376	0.07
377	0.07
378	0.09
379	0.1
380	0.1
381	0.1
382	0.11
383	0.12
384	0.13
385	0.14
386	0.15
387	0.18
388	0.21
389	0.21
390	0.22
391	0.21
392	0.27
393	0.28
394	0.24
395	0.21
396	0.19
397	0.2
398	0.19
399	0.18
400	0.11
401	0.13
402	0.16
403	0.22
404	0.23
405	0.23
406	0.23
407	0.23
408	0.25
409	0.22
410	0.19
411	0.15
412	0.14
413	0.13
414	0.15
415	0.14
416	0.14
417	0.19
418	0.21
419	0.22
420	0.24
421	0.24
422	0.23
423	0.23
424	0.23
425	0.19
426	0.19
427	0.16
428	0.14
429	0.14
430	0.13
431	0.14
432	0.14
433	0.15
434	0.17
435	0.21
436	0.23
437	0.24
438	0.28
439	0.27
440	0.28
441	0.27
442	0.24
443	0.21
444	0.19
445	0.22
446	0.18
447	0.19
448	0.18
449	0.18
450	0.2
451	0.22
452	0.21
453	0.18
454	0.23
455	0.26
456	0.29
457	0.34
458	0.34
459	0.35
460	0.38
461	0.37
462	0.34
463	0.33
464	0.34
465	0.33
466	0.34
467	0.36
468	0.37
469	0.4
470	0.39
471	0.37
472	0.34
473	0.33
474	0.29
475	0.27
476	0.27
477	0.23
478	0.23
479	0.23
480	0.22
481	0.19
482	0.19
483	0.16
484	0.12
485	0.13
486	0.11
487	0.08
488	0.09
489	0.1
490	0.11
491	0.13
492	0.16
493	0.2
494	0.24
495	0.26
496	0.28
497	0.27
498	0.31
499	0.38
500	0.41
501	0.37
502	0.35
503	0.35
504	0.35
505	0.41
506	0.37
507	0.29
508	0.27
509	0.29
510	0.32
511	0.36
512	0.35
513	0.36
514	0.38
515	0.4
516	0.41
517	0.47
518	0.52
519	0.55
520	0.56
521	0.57
522	0.6
523	0.64
524	0.68
525	0.63
526	0.61
527	0.57
528	0.57
529	0.51
530	0.47
531	0.42
532	0.37
533	0.35
534	0.32
535	0.35
536	0.41
537	0.46
538	0.5
539	0.52
540	0.5
541	0.5
542	0.5
543	0.47
544	0.41
545	0.38
546	0.4
547	0.39
548	0.41
549	0.42
550	0.43
551	0.4
552	0.4
553	0.41
554	0.33
555	0.33
556	0.29
557	0.26
558	0.2
559	0.21
560	0.22
561	0.21
562	0.24
563	0.27
564	0.29
565	0.29
566	0.32
567	0.35
568	0.36
569	0.4
570	0.4
571	0.37
572	0.38
573	0.44
574	0.45
575	0.46
576	0.5
577	0.5
578	0.53
579	0.6
580	0.63
581	0.63
582	0.68
583	0.65
584	0.59
585	0.57
586	0.52
587	0.46
588	0.47
589	0.46
590	0.46
591	0.49
592	0.49
593	0.47
594	0.51
595	0.55
596	0.59
597	0.64
598	0.66
599	0.69
600	0.73
601	0.8
602	0.82
603	0.81
604	0.82
605	0.82
606	0.82
607	0.83
608	0.87
609	0.88
610	0.91
611	0.95
612	0.94
613	0.95
614	0.93
615	0.92
616	0.84
617	0.83
618	0.8
619	0.73
620	0.66
621	0.59
622	0.51
623	0.43
624	0.41
625	0.32
626	0.3
627	0.27
628	0.28
629	0.25
630	0.23
631	0.24
632	0.23
633	0.25
634	0.25
635	0.3
636	0.3
637	0.37
638	0.4
639	0.45
640	0.5
641	0.51
642	0.47
643	0.43
644	0.4
645	0.34
646	0.32
647	0.28
648	0.24
649	0.22
650	0.21
651	0.19
652	0.17
653	0.16
654	0.14
655	0.12
656	0.1
657	0.07
658	0.07
659	0.06
660	0.1
661	0.14
662	0.2
663	0.28
664	0.34
665	0.39
666	0.43
667	0.53
668	0.57
669	0.64
670	0.68
671	0.71
672	0.74
673	0.8
674	0.87
675	0.87
676	0.85
677	0.85
678	0.84
679	0.85
680	0.87
681	0.86
682	0.86
683	0.85
684	0.88
685	0.88
686	0.87
687	0.84
688	0.84
689	0.77
690	0.73
691	0.68
692	0.61
693	0.57
694	0.57
695	0.54
696	0.51
697	0.54
698	0.57
699	0.62
700	0.71
701	0.75
702	0.75
703	0.79
704	0.82
705	0.86
706	0.87
707	0.88
708	0.88
709	0.88
710	0.89
711	0.9
712	0.91
713	0.9
714	0.89
715	0.87
716	0.85
717	0.84
718	0.83
719	0.83
720	0.83
721	0.85
722	0.84
723	0.86
724	0.83
725	0.83
726	0.84
727	0.84
728	0.82
729	0.81
730	0.82
731	0.74
732	0.76
733	0.7
734	0.64
735	0.59
736	0.54
737	0.54
738	0.54
739	0.59
740	0.61
741	0.66
742	0.7
743	0.73
744	0.78
745	0.77
746	0.76
747	0.77
748	0.73
749	0.71
750	0.71
751	0.73
752	0.76
753	0.78
754	0.79
755	0.82
756	0.84
757	0.85
758	0.82
759	0.8
760	0.76
761	0.68
762	0.65
763	0.57
764	0.52
765	0.43
766	0.38
767	0.3
768	0.25
769	0.23
770	0.16
771	0.15
772	0.13
773	0.15
774	0.19
775	0.22
776	0.27
777	0.35
778	0.43
779	0.46
780	0.51
781	0.53
782	0.58
783	0.63
784	0.65
785	0.64
786	0.64
787	0.67
788	0.68
789	0.71
790	0.71
791	0.68
792	0.67
793	0.63
794	0.63
795	0.64
796	0.67
797	0.66
798	0.64
799	0.58
800	0.51
801	0.49
802	0.41
803	0.32
804	0.22
805	0.16
806	0.09
807	0.08
808	0.1
809	0.12
810	0.13
811	0.16
812	0.18
813	0.22
814	0.24
815	0.28
816	0.32
817	0.36
818	0.39
819	0.44
820	0.47
821	0.46
822	0.48
823	0.45
824	0.43
825	0.39
826	0.37
827	0.33
828	0.35
829	0.4
830	0.45
831	0.52
832	0.55
833	0.57

A0A1Y1XLC7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer