Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y1XNJ4

Protein Details
Accession A0A1Y1XNJ4    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MAKSKKSKNVEIQPRKKSKALRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-23KKSKNVEIQPRKKSKALRE
305-335EKKRNELAELRRKFEEDKKRIAELKSSRRFK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR040447  RRM_Rrp7  
IPR040446  RRP7  
IPR024326  RRP7_C  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17799  RRM_Rrp7  
PF12923  RRP7  
CDD cd12951  RRP7_Rrp7A  
Amino Acid Sequences MAKSKKSKNVEIQPRKKSKALRELKSGFKILKIEMPPLNIFSSLNSNKIQTIPVSHYIYFKKHESYRNDEDTPTDCTIFVCNLPIDTTIPHLKHIFKHCGPIVNCKMNKNPVDLLENSEEIFIEDEEMENVFGRETYTTGITAHVVFSSEEGVENALNMKQKIRVWKPDNSFEDEDEEEENEASDMEADEDTLDFEEDSNAMPIGYKKWMQQYKYIRPRPKALKTRVDNYMVNFSRMEEIEKLELDKKINLVDEDGFTLVTRRARRNTNVSKDGASVTAARLEDVKDLKPKKKELQDFYRFQMKEKKRNELAELRRKFEEDKKRIAELKSSRRFKPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.86
3 0.82
4 0.8
5 0.79
6 0.78
7 0.78
8 0.74
9 0.75
10 0.76
11 0.78
12 0.74
13 0.69
14 0.59
15 0.52
16 0.48
17 0.4
18 0.41
19 0.35
20 0.35
21 0.33
22 0.36
23 0.34
24 0.33
25 0.33
26 0.26
27 0.24
28 0.19
29 0.26
30 0.24
31 0.26
32 0.25
33 0.25
34 0.25
35 0.26
36 0.26
37 0.18
38 0.21
39 0.23
40 0.28
41 0.31
42 0.31
43 0.35
44 0.37
45 0.39
46 0.39
47 0.37
48 0.37
49 0.39
50 0.47
51 0.49
52 0.54
53 0.58
54 0.61
55 0.6
56 0.53
57 0.49
58 0.44
59 0.42
60 0.35
61 0.27
62 0.2
63 0.19
64 0.2
65 0.18
66 0.16
67 0.13
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.11
74 0.15
75 0.18
76 0.18
77 0.21
78 0.23
79 0.24
80 0.3
81 0.37
82 0.41
83 0.36
84 0.43
85 0.42
86 0.47
87 0.46
88 0.5
89 0.5
90 0.51
91 0.52
92 0.48
93 0.51
94 0.51
95 0.51
96 0.45
97 0.4
98 0.34
99 0.35
100 0.32
101 0.32
102 0.26
103 0.25
104 0.21
105 0.19
106 0.16
107 0.12
108 0.12
109 0.07
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.06
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.12
148 0.14
149 0.23
150 0.27
151 0.35
152 0.38
153 0.45
154 0.49
155 0.54
156 0.55
157 0.52
158 0.48
159 0.39
160 0.38
161 0.3
162 0.27
163 0.19
164 0.16
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.06
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.1
193 0.11
194 0.13
195 0.23
196 0.28
197 0.29
198 0.37
199 0.45
200 0.54
201 0.63
202 0.69
203 0.68
204 0.67
205 0.74
206 0.75
207 0.76
208 0.75
209 0.72
210 0.74
211 0.71
212 0.73
213 0.69
214 0.65
215 0.56
216 0.48
217 0.5
218 0.41
219 0.37
220 0.31
221 0.27
222 0.24
223 0.23
224 0.23
225 0.14
226 0.15
227 0.16
228 0.16
229 0.17
230 0.18
231 0.2
232 0.19
233 0.19
234 0.18
235 0.18
236 0.19
237 0.18
238 0.17
239 0.16
240 0.15
241 0.15
242 0.14
243 0.12
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.16
248 0.21
249 0.26
250 0.31
251 0.38
252 0.45
253 0.54
254 0.62
255 0.66
256 0.67
257 0.63
258 0.59
259 0.53
260 0.48
261 0.38
262 0.29
263 0.2
264 0.15
265 0.17
266 0.15
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.18
271 0.19
272 0.22
273 0.27
274 0.34
275 0.42
276 0.48
277 0.55
278 0.59
279 0.67
280 0.73
281 0.74
282 0.78
283 0.8
284 0.77
285 0.74
286 0.75
287 0.64
288 0.59
289 0.6
290 0.59
291 0.59
292 0.62
293 0.67
294 0.64
295 0.7
296 0.73
297 0.73
298 0.74
299 0.75
300 0.73
301 0.68
302 0.63
303 0.6
304 0.57
305 0.57
306 0.57
307 0.54
308 0.59
309 0.59
310 0.64
311 0.67
312 0.64
313 0.65
314 0.64
315 0.67
316 0.68
317 0.7