FuNGI

A0A1Y1XK06

Protein Details

Accession

A0A1Y1XK06

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
704-723	LDRYEKKCILRKAKNKEILG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039766 Vps53 IPR031745 Vps53_C IPR038260 Vps53_C_sf IPR007234 Vps53_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0010008 C:endosome membrane GO:0000938 C:GARP complex GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF16854 VPS53_C PF04100 Vps53_N

Amino Acid Sequences

MINNNKYNELFPKEISEDDPLNQQDFDVVSYINKIFPHEQSLASIDNVLADLKSRINQLDKDIRDLLRTQTDAGQQAFIKLEETKKLITQLYDRLQNIKLKANNSERLVQDITKDIKSLDYAKTHLTISITVLKRLQMLGLAITQIKNMISTKQYKETAQLLDVIYELLKYFSTYRSISQIDKLYVTMNSIQNTLKSQIFNEFEYCFSQEDLTDANVSHLNDACLVIEKMQNNEKKELIDWYCKQLLQEYESIFRANDEITSVDSITQRYSWLKQNLRRYDEDHSKLFPKEWEVGKYLCSEFCDITREGLVLALEKSKELNSQMLLQIIQYTTNFETKLEKRFNNKNKNINGQVDYSFKRSISSCFEDFLHIYTNDQEKAISSMLNTYRMKPILENDESAMLLGSGTELYMYYRQALNQLSKMSNTKPLFDLYNIFGKYLLNYSSFMSSKLPKDDRKTAVENEIRICTLILNTSDYCYTTTSQLQSRVIELIDTKYKEKIDFSNQQDSFMNTITSSIKSLVRTIELLIDPYMITMAKINWSNIESVGDQSNYVTEIGNNIFNYIKKIKENINNNRYFKVFVDKFTESFLIKYLNNIYKCKPISTVGAEQLLLDILALKSIIQKIPNINKDKDSKQTSSTSFVKILNSGINKIESLLKVIMIPTDPADALFSNYELLYGENCNYTNLQKILELKGLKRSEQQPLLDRYEKKCILRKAKNKEILGETQSVKTNSNSNSSTKISAMNIISNIVGQTPNQLSNSISSASSTLANTFIPKHLLINKSDTDKSLSANGPMSASVLNSGMPPIFEGPRRGSSGGTGYMLKHEVNFSNSDSAPIITKQRTTSFSSPAPYTTTKSQTNKANHLNILTNVNNTNSSSNSNNNNINNNNNNNNSSNINSIENFFNQSRRNSTMSNSSASSMERTSKLINNKKSGFNSNTSSPTSNKLMMMNEKISKWIKRDL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.36
3	0.34
4	0.3
5	0.28
6	0.34
7	0.3
8	0.3
9	0.28
10	0.25
11	0.22
12	0.2
13	0.19
14	0.14
15	0.12
16	0.11
17	0.15
18	0.16
19	0.16
20	0.16
21	0.2
22	0.22
23	0.24
24	0.3
25	0.29
26	0.29
27	0.29
28	0.31
29	0.28
30	0.25
31	0.23
32	0.16
33	0.14
34	0.14
35	0.12
36	0.09
37	0.08
38	0.1
39	0.11
40	0.14
41	0.17
42	0.2
43	0.25
44	0.28
45	0.35
46	0.42
47	0.42
48	0.45
49	0.48
50	0.45
51	0.43
52	0.43
53	0.39
54	0.36
55	0.36
56	0.32
57	0.31
58	0.35
59	0.36
60	0.35
61	0.34
62	0.27
63	0.28
64	0.28
65	0.23
66	0.2
67	0.19
68	0.22
69	0.23
70	0.25
71	0.25
72	0.26
73	0.3
74	0.31
75	0.3
76	0.32
77	0.36
78	0.39
79	0.45
80	0.44
81	0.43
82	0.46
83	0.48
84	0.46
85	0.46
86	0.44
87	0.4
88	0.48
89	0.52
90	0.55
91	0.53
92	0.56
93	0.48
94	0.49
95	0.48
96	0.4
97	0.34
98	0.34
99	0.34
100	0.29
101	0.29
102	0.23
103	0.22
104	0.24
105	0.27
106	0.24
107	0.24
108	0.25
109	0.27
110	0.28
111	0.27
112	0.26
113	0.23
114	0.19
115	0.19
116	0.26
117	0.25
118	0.25
119	0.26
120	0.25
121	0.25
122	0.25
123	0.22
124	0.14
125	0.13
126	0.13
127	0.12
128	0.13
129	0.13
130	0.13
131	0.12
132	0.12
133	0.11
134	0.12
135	0.12
136	0.14
137	0.18
138	0.26
139	0.3
140	0.37
141	0.4
142	0.39
143	0.43
144	0.44
145	0.41
146	0.34
147	0.33
148	0.26
149	0.24
150	0.22
151	0.18
152	0.13
153	0.1
154	0.09
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.09
159	0.1
160	0.15
161	0.16
162	0.18
163	0.23
164	0.25
165	0.26
166	0.3
167	0.33
168	0.3
169	0.3
170	0.28
171	0.24
172	0.22
173	0.22
174	0.23
175	0.21
176	0.21
177	0.22
178	0.22
179	0.22
180	0.24
181	0.25
182	0.22
183	0.2
184	0.2
185	0.25
186	0.27
187	0.27
188	0.27
189	0.24
190	0.23
191	0.24
192	0.25
193	0.18
194	0.16
195	0.15
196	0.13
197	0.13
198	0.13
199	0.11
200	0.11
201	0.1
202	0.11
203	0.13
204	0.13
205	0.14
206	0.14
207	0.13
208	0.13
209	0.13
210	0.11
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.14
215	0.15
216	0.18
217	0.26
218	0.3
219	0.31
220	0.34
221	0.34
222	0.31
223	0.31
224	0.34
225	0.32
226	0.36
227	0.34
228	0.37
229	0.39
230	0.38
231	0.37
232	0.35
233	0.33
234	0.27
235	0.3
236	0.25
237	0.25
238	0.26
239	0.26
240	0.21
241	0.18
242	0.16
243	0.12
244	0.1
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.1
249	0.09
250	0.11
251	0.12
252	0.12
253	0.12
254	0.12
255	0.13
256	0.15
257	0.18
258	0.24
259	0.32
260	0.4
261	0.46
262	0.56
263	0.62
264	0.64
265	0.64
266	0.59
267	0.58
268	0.6
269	0.57
270	0.5
271	0.44
272	0.43
273	0.41
274	0.39
275	0.33
276	0.26
277	0.28
278	0.29
279	0.29
280	0.28
281	0.28
282	0.27
283	0.29
284	0.26
285	0.21
286	0.19
287	0.18
288	0.16
289	0.16
290	0.19
291	0.16
292	0.16
293	0.15
294	0.14
295	0.12
296	0.12
297	0.11
298	0.08
299	0.08
300	0.09
301	0.08
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.11
306	0.12
307	0.13
308	0.12
309	0.15
310	0.16
311	0.16
312	0.15
313	0.13
314	0.13
315	0.11
316	0.11
317	0.08
318	0.1
319	0.11
320	0.13
321	0.13
322	0.12
323	0.19
324	0.21
325	0.29
326	0.33
327	0.36
328	0.41
329	0.52
330	0.61
331	0.66
332	0.7
333	0.71
334	0.7
335	0.74
336	0.72
337	0.67
338	0.58
339	0.5
340	0.44
341	0.4
342	0.36
343	0.31
344	0.27
345	0.22
346	0.21
347	0.2
348	0.21
349	0.23
350	0.27
351	0.24
352	0.24
353	0.25
354	0.25
355	0.24
356	0.22
357	0.19
358	0.13
359	0.13
360	0.15
361	0.17
362	0.16
363	0.16
364	0.14
365	0.11
366	0.13
367	0.13
368	0.1
369	0.07
370	0.12
371	0.13
372	0.21
373	0.21
374	0.21
375	0.24
376	0.25
377	0.25
378	0.21
379	0.23
380	0.23
381	0.24
382	0.23
383	0.2
384	0.2
385	0.19
386	0.18
387	0.14
388	0.07
389	0.05
390	0.04
391	0.04
392	0.02
393	0.02
394	0.02
395	0.03
396	0.04
397	0.05
398	0.05
399	0.07
400	0.08
401	0.08
402	0.11
403	0.14
404	0.15
405	0.16
406	0.19
407	0.18
408	0.19
409	0.21
410	0.19
411	0.26
412	0.24
413	0.23
414	0.22
415	0.23
416	0.22
417	0.21
418	0.22
419	0.14
420	0.2
421	0.19
422	0.17
423	0.16
424	0.15
425	0.15
426	0.14
427	0.13
428	0.08
429	0.09
430	0.1
431	0.12
432	0.13
433	0.13
434	0.14
435	0.16
436	0.17
437	0.23
438	0.27
439	0.29
440	0.35
441	0.42
442	0.43
443	0.45
444	0.46
445	0.42
446	0.45
447	0.43
448	0.39
449	0.33
450	0.3
451	0.25
452	0.21
453	0.19
454	0.11
455	0.09
456	0.08
457	0.07
458	0.08
459	0.08
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.1
464	0.1
465	0.1
466	0.1
467	0.12
468	0.13
469	0.16
470	0.18
471	0.19
472	0.18
473	0.18
474	0.17
475	0.15
476	0.13
477	0.11
478	0.1
479	0.13
480	0.14
481	0.14
482	0.15
483	0.16
484	0.17
485	0.18
486	0.19
487	0.23
488	0.3
489	0.34
490	0.41
491	0.41
492	0.42
493	0.4
494	0.38
495	0.32
496	0.24
497	0.19
498	0.09
499	0.11
500	0.1
501	0.1
502	0.09
503	0.1
504	0.11
505	0.11
506	0.13
507	0.12
508	0.12
509	0.12
510	0.11
511	0.12
512	0.11
513	0.11
514	0.1
515	0.09
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.04
520	0.04
521	0.05
522	0.05
523	0.07
524	0.09
525	0.09
526	0.1
527	0.11
528	0.11
529	0.11
530	0.12
531	0.1
532	0.1
533	0.11
534	0.1
535	0.09
536	0.09
537	0.09
538	0.07
539	0.08
540	0.06
541	0.05
542	0.07
543	0.08
544	0.1
545	0.09
546	0.1
547	0.1
548	0.11
549	0.15
550	0.15
551	0.17
552	0.16
553	0.19
554	0.25
555	0.32
556	0.42
557	0.48
558	0.56
559	0.61
560	0.62
561	0.6
562	0.54
563	0.49
564	0.39
565	0.38
566	0.3
567	0.25
568	0.3
569	0.29
570	0.28
571	0.29
572	0.3
573	0.2
574	0.19
575	0.17
576	0.14
577	0.12
578	0.14
579	0.18
580	0.22
581	0.25
582	0.27
583	0.28
584	0.33
585	0.34
586	0.33
587	0.29
588	0.25
589	0.26
590	0.29
591	0.31
592	0.25
593	0.26
594	0.24
595	0.22
596	0.2
597	0.16
598	0.1
599	0.06
600	0.05
601	0.04
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.06
606	0.08
607	0.1
608	0.1
609	0.13
610	0.2
611	0.28
612	0.36
613	0.4
614	0.4
615	0.44
616	0.49
617	0.5
618	0.52
619	0.5
620	0.44
621	0.42
622	0.46
623	0.43
624	0.44
625	0.43
626	0.37
627	0.33
628	0.32
629	0.29
630	0.24
631	0.23
632	0.21
633	0.2
634	0.19
635	0.17
636	0.16
637	0.15
638	0.15
639	0.17
640	0.13
641	0.15
642	0.13
643	0.12
644	0.12
645	0.12
646	0.12
647	0.09
648	0.1
649	0.07
650	0.08
651	0.08
652	0.07
653	0.09
654	0.08
655	0.09
656	0.09
657	0.08
658	0.08
659	0.08
660	0.08
661	0.07
662	0.07
663	0.07
664	0.08
665	0.08
666	0.09
667	0.1
668	0.11
669	0.12
670	0.12
671	0.16
672	0.16
673	0.16
674	0.16
675	0.19
676	0.21
677	0.25
678	0.26
679	0.23
680	0.31
681	0.32
682	0.31
683	0.35
684	0.37
685	0.4
686	0.43
687	0.45
688	0.43
689	0.47
690	0.53
691	0.53
692	0.53
693	0.48
694	0.52
695	0.53
696	0.51
697	0.52
698	0.55
699	0.59
700	0.65
701	0.71
702	0.72
703	0.78
704	0.82
705	0.75
706	0.71
707	0.65
708	0.6
709	0.55
710	0.49
711	0.41
712	0.35
713	0.37
714	0.33
715	0.3
716	0.26
717	0.28
718	0.25
719	0.3
720	0.29
721	0.28
722	0.31
723	0.32
724	0.32
725	0.27
726	0.28
727	0.22
728	0.25
729	0.24
730	0.21
731	0.19
732	0.18
733	0.17
734	0.15
735	0.14
736	0.1
737	0.09
738	0.07
739	0.11
740	0.13
741	0.15
742	0.16
743	0.16
744	0.16
745	0.17
746	0.2
747	0.16
748	0.14
749	0.12
750	0.12
751	0.12
752	0.13
753	0.12
754	0.1
755	0.1
756	0.11
757	0.12
758	0.13
759	0.13
760	0.14
761	0.14
762	0.18
763	0.23
764	0.26
765	0.27
766	0.31
767	0.33
768	0.36
769	0.37
770	0.34
771	0.33
772	0.3
773	0.3
774	0.3
775	0.28
776	0.25
777	0.26
778	0.25
779	0.2
780	0.19
781	0.19
782	0.13
783	0.11
784	0.1
785	0.08
786	0.08
787	0.08
788	0.09
789	0.08
790	0.07
791	0.08
792	0.1
793	0.13
794	0.16
795	0.2
796	0.24
797	0.28
798	0.32
799	0.31
800	0.29
801	0.28
802	0.3
803	0.28
804	0.25
805	0.22
806	0.19
807	0.21
808	0.22
809	0.2
810	0.17
811	0.18
812	0.18
813	0.2
814	0.21
815	0.21
816	0.24
817	0.24
818	0.25
819	0.22
820	0.2
821	0.2
822	0.2
823	0.24
824	0.22
825	0.25
826	0.28
827	0.32
828	0.35
829	0.41
830	0.43
831	0.42
832	0.43
833	0.45
834	0.42
835	0.39
836	0.4
837	0.34
838	0.35
839	0.36
840	0.39
841	0.43
842	0.46
843	0.52
844	0.55
845	0.6
846	0.64
847	0.66
848	0.66
849	0.59
850	0.58
851	0.55
852	0.48
853	0.47
854	0.39
855	0.34
856	0.29
857	0.29
858	0.27
859	0.25
860	0.24
861	0.2
862	0.23
863	0.23
864	0.28
865	0.32
866	0.36
867	0.41
868	0.43
869	0.48
870	0.48
871	0.52
872	0.54
873	0.55
874	0.56
875	0.54
876	0.54
877	0.49
878	0.48
879	0.43
880	0.37
881	0.34
882	0.29
883	0.28
884	0.25
885	0.26
886	0.27
887	0.25
888	0.28
889	0.26
890	0.3
891	0.32
892	0.36
893	0.39
894	0.4
895	0.43
896	0.4
897	0.42
898	0.46
899	0.45
900	0.43
901	0.38
902	0.35
903	0.32
904	0.32
905	0.31
906	0.24
907	0.25
908	0.23
909	0.25
910	0.28
911	0.33
912	0.42
913	0.49
914	0.55
915	0.59
916	0.63
917	0.68
918	0.69
919	0.72
920	0.67
921	0.63
922	0.6
923	0.57
924	0.57
925	0.53
926	0.5
927	0.43
928	0.44
929	0.42
930	0.39
931	0.36
932	0.34
933	0.35
934	0.39
935	0.43
936	0.44
937	0.44
938	0.41
939	0.46
940	0.49
941	0.49

A0A1Y1XK06

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer