FuNGI

A0A1Y1WR14

Protein Details

Accession

A0A1Y1WR14

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
152-174	APFGHARKNKQNLFKKRTKQVYL	Hydrophilic
454-486	TSTPNPHKSDKKKDSEHKKHKHQTKDGLTKVKK	Basic
491-528	KSKSESKSKSLSKKRLNDESSPKKESIKKIKIKREDGT	Hydrophilic
542-561	SAIKQEKKIKKEHTIKEEKT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
461-555	KSDKKKDSEHKKHKHQTKDGLTKVKKESGLKSKSESKSKSLSKKRLNDESSPKKESIKKIKIKREDGTIAGVEPKKHKHDTSAIKQEKKIKKEHT

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 15

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MNNNNQGLVNNFLLQQQQQQQLQQQQLQQQQQQQQQQQQKKQASSIEEQAYRLVSAIPERPHHVLKFSGSRNKFDLNSFTKPIKLVRDIPQSYLDRHNFRNRNNLNNSSNSQEDGSGNKTVQSGTNGNDANTANGTATIGGVDNKLDTSKIAPFGHARKNKQNLFKKRTKQVYLGADDSTRDKTIQEIKKEKEAERYPWLLTDFDNNNTYGGVLEGGQHANYVLFMFSDDGFRVIPAAKWYKFTPKLPYKTLTIEEAESKLATKKIEEDRWMMRRKMKTEEEEAKKEDYPKPNEFKITDRDDMKREMEEDDDDQPKRKTNNADEEDLDFDEEFQDDEEPLFGIDNDEETRESEKKQNEQIKSFTRKDDDIFEEDDESENENEEKLTSTGKEMKKIVKRIEKSAMFDSDDEKNPYASSESSDSSDFEEEENQNENPDGQNEDNKNNSKSNANSATSTPNPHKSDKKKDSEHKKHKHQTKDGLTKVKKESGLKSKSESKSKSLSKKRLNDESSPKKESIKKIKIKREDGTIAGVEPKKHKHDTSAIKQEKKIKKEHTIKEEKTATASSKVSKKTDNTDQSKKKEMGDITEIELVHIIRELQPINTRSLIAKLRPTILKRNPANIKAFPKMLAKLIKKNEDDTIELRQKIMEQYKNK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.27
3	0.3
4	0.35
5	0.37
6	0.41
7	0.46
8	0.51
9	0.57
10	0.55
11	0.52
12	0.53
13	0.58
14	0.61
15	0.6
16	0.6
17	0.62
18	0.65
19	0.69
20	0.68
21	0.69
22	0.72
23	0.76
24	0.77
25	0.78
26	0.78
27	0.72
28	0.7
29	0.66
30	0.62
31	0.57
32	0.57
33	0.55
34	0.49
35	0.46
36	0.43
37	0.38
38	0.32
39	0.27
40	0.19
41	0.13
42	0.15
43	0.21
44	0.24
45	0.26
46	0.3
47	0.35
48	0.39
49	0.39
50	0.38
51	0.35
52	0.37
53	0.43
54	0.46
55	0.52
56	0.49
57	0.52
58	0.53
59	0.55
60	0.51
61	0.45
62	0.46
63	0.43
64	0.46
65	0.46
66	0.44
67	0.42
68	0.41
69	0.42
70	0.4
71	0.39
72	0.4
73	0.44
74	0.53
75	0.52
76	0.53
77	0.56
78	0.52
79	0.5
80	0.53
81	0.5
82	0.45
83	0.5
84	0.58
85	0.57
86	0.58
87	0.66
88	0.61
89	0.65
90	0.68
91	0.69
92	0.63
93	0.62
94	0.6
95	0.53
96	0.49
97	0.41
98	0.33
99	0.27
100	0.24
101	0.21
102	0.22
103	0.2
104	0.19
105	0.19
106	0.19
107	0.18
108	0.19
109	0.21
110	0.2
111	0.2
112	0.26
113	0.25
114	0.25
115	0.28
116	0.26
117	0.22
118	0.2
119	0.19
120	0.12
121	0.11
122	0.11
123	0.07
124	0.07
125	0.06
126	0.06
127	0.06
128	0.06
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.08
133	0.07
134	0.07
135	0.09
136	0.12
137	0.18
138	0.18
139	0.2
140	0.25
141	0.32
142	0.41
143	0.46
144	0.5
145	0.53
146	0.62
147	0.67
148	0.72
149	0.76
150	0.77
151	0.78
152	0.82
153	0.81
154	0.81
155	0.84
156	0.78
157	0.73
158	0.7
159	0.69
160	0.64
161	0.57
162	0.48
163	0.39
164	0.35
165	0.32
166	0.27
167	0.19
168	0.15
169	0.13
170	0.16
171	0.26
172	0.31
173	0.38
174	0.44
175	0.46
176	0.53
177	0.58
178	0.56
179	0.56
180	0.54
181	0.51
182	0.49
183	0.49
184	0.41
185	0.39
186	0.38
187	0.29
188	0.24
189	0.26
190	0.22
191	0.22
192	0.23
193	0.21
194	0.19
195	0.19
196	0.18
197	0.11
198	0.09
199	0.06
200	0.05
201	0.05
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.05
214	0.06
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.08
221	0.07
222	0.08
223	0.12
224	0.18
225	0.18
226	0.2
227	0.22
228	0.31
229	0.35
230	0.38
231	0.43
232	0.46
233	0.51
234	0.53
235	0.54
236	0.48
237	0.46
238	0.44
239	0.37
240	0.29
241	0.24
242	0.22
243	0.2
244	0.17
245	0.14
246	0.13
247	0.12
248	0.13
249	0.12
250	0.11
251	0.16
252	0.23
253	0.27
254	0.29
255	0.31
256	0.36
257	0.43
258	0.48
259	0.45
260	0.45
261	0.46
262	0.46
263	0.5
264	0.49
265	0.45
266	0.48
267	0.54
268	0.54
269	0.53
270	0.52
271	0.47
272	0.43
273	0.43
274	0.41
275	0.39
276	0.39
277	0.42
278	0.45
279	0.44
280	0.46
281	0.43
282	0.41
283	0.39
284	0.38
285	0.36
286	0.34
287	0.35
288	0.34
289	0.35
290	0.33
291	0.27
292	0.22
293	0.19
294	0.17
295	0.15
296	0.15
297	0.16
298	0.19
299	0.19
300	0.2
301	0.2
302	0.23
303	0.23
304	0.25
305	0.28
306	0.3
307	0.4
308	0.41
309	0.42
310	0.39
311	0.39
312	0.36
313	0.3
314	0.24
315	0.13
316	0.1
317	0.08
318	0.07
319	0.05
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.06
335	0.07
336	0.1
337	0.11
338	0.13
339	0.18
340	0.21
341	0.25
342	0.33
343	0.4
344	0.4
345	0.42
346	0.46
347	0.49
348	0.53
349	0.51
350	0.46
351	0.41
352	0.39
353	0.37
354	0.36
355	0.31
356	0.26
357	0.25
358	0.22
359	0.2
360	0.19
361	0.18
362	0.14
363	0.13
364	0.1
365	0.09
366	0.08
367	0.08
368	0.07
369	0.07
370	0.08
371	0.06
372	0.08
373	0.07
374	0.1
375	0.19
376	0.2
377	0.24
378	0.26
379	0.34
380	0.39
381	0.45
382	0.5
383	0.51
384	0.53
385	0.54
386	0.6
387	0.55
388	0.52
389	0.49
390	0.44
391	0.36
392	0.33
393	0.31
394	0.26
395	0.26
396	0.25
397	0.22
398	0.19
399	0.18
400	0.18
401	0.17
402	0.13
403	0.13
404	0.13
405	0.13
406	0.14
407	0.15
408	0.15
409	0.15
410	0.15
411	0.13
412	0.11
413	0.14
414	0.13
415	0.15
416	0.17
417	0.15
418	0.15
419	0.15
420	0.15
421	0.11
422	0.12
423	0.13
424	0.11
425	0.18
426	0.21
427	0.24
428	0.29
429	0.33
430	0.35
431	0.33
432	0.34
433	0.32
434	0.31
435	0.36
436	0.36
437	0.34
438	0.33
439	0.32
440	0.36
441	0.33
442	0.37
443	0.33
444	0.35
445	0.37
446	0.41
447	0.49
448	0.52
449	0.62
450	0.67
451	0.72
452	0.73
453	0.79
454	0.85
455	0.87
456	0.89
457	0.88
458	0.9
459	0.9
460	0.89
461	0.9
462	0.87
463	0.86
464	0.85
465	0.85
466	0.81
467	0.81
468	0.75
469	0.72
470	0.68
471	0.63
472	0.57
473	0.52
474	0.53
475	0.53
476	0.57
477	0.52
478	0.53
479	0.57
480	0.59
481	0.63
482	0.58
483	0.53
484	0.56
485	0.62
486	0.68
487	0.68
488	0.72
489	0.73
490	0.78
491	0.81
492	0.82
493	0.79
494	0.77
495	0.77
496	0.78
497	0.75
498	0.71
499	0.64
500	0.61
501	0.63
502	0.64
503	0.64
504	0.64
505	0.66
506	0.72
507	0.81
508	0.84
509	0.84
510	0.78
511	0.75
512	0.68
513	0.6
514	0.55
515	0.45
516	0.36
517	0.35
518	0.33
519	0.28
520	0.29
521	0.33
522	0.36
523	0.4
524	0.41
525	0.41
526	0.48
527	0.55
528	0.61
529	0.66
530	0.68
531	0.69
532	0.73
533	0.76
534	0.75
535	0.71
536	0.7
537	0.67
538	0.69
539	0.74
540	0.78
541	0.79
542	0.81
543	0.77
544	0.78
545	0.74
546	0.64
547	0.57
548	0.51
549	0.43
550	0.37
551	0.37
552	0.34
553	0.36
554	0.41
555	0.42
556	0.45
557	0.47
558	0.49
559	0.57
560	0.61
561	0.63
562	0.68
563	0.73
564	0.73
565	0.77
566	0.72
567	0.64
568	0.61
569	0.55
570	0.5
571	0.47
572	0.43
573	0.37
574	0.38
575	0.35
576	0.28
577	0.28
578	0.21
579	0.15
580	0.14
581	0.12
582	0.1
583	0.14
584	0.15
585	0.17
586	0.24
587	0.26
588	0.29
589	0.3
590	0.29
591	0.26
592	0.32
593	0.35
594	0.32
595	0.37
596	0.36
597	0.42
598	0.48
599	0.52
600	0.56
601	0.58
602	0.64
603	0.62
604	0.69
605	0.71
606	0.71
607	0.73
608	0.7
609	0.68
610	0.64
611	0.61
612	0.54
613	0.51
614	0.46
615	0.46
616	0.48
617	0.47
618	0.51
619	0.58
620	0.64
621	0.61
622	0.62
623	0.61
624	0.55
625	0.53
626	0.47
627	0.48
628	0.47
629	0.45
630	0.42
631	0.36
632	0.35
633	0.39
634	0.45

A0A1Y1WR14

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer