Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XKP1

Protein Details
Accession A0A1Y1XKP1    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-67NTMERSINYKQKRKIINKTQYNELMHydrophilic
96-119QVWFQNRRAKNKKGARNRANTPPFHydrophilic
301-327NTVPEPRQRGRPKGHPNKKEKDPNASSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
103-111RAKNKKGAR
307-321RQRGRPKGHPNKKEK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017970  Homeobox_CS  
IPR001356  Homeobox_dom  
IPR000047  HTH_motif  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00027  HOMEOBOX_1  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MNYNGDMNYNNGDMNQNDGQRNNKKFSFVNVTLNPPQKNGNNNTMERSINYKQKRKIINKTQYNELMRVFQITEKPSHDERARLARVLGMSVREVQVWFQNRRAKNKKGARNRANTPPFISYKPGGNGNGSNNGSNGSNYGSEADSDKSSKGSPSMQKVSSIYSSIADSNEYIKTTFSYNNNNININNNNNPTPSTYSSPIPNNNSSLTSSSELDHKKILPNPSQGKNSPTNSPSKPNMMSNNYQYQTPNNNNNNNNNNNWKNDQGQNSNSQPLSSMPDNENYPTPQPSPPHDMIPHDILNTVPEPRQRGRPKGHPNKKEKDPNASSSTFPKIYDSIFGKPNKRIKLEGGQDEEIMAAAEALTSLSSLFGDSPTNGMNMNKNEINNGPLSESNDSNETYESNHRRPW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.25
3 0.27
4 0.3
5 0.33
6 0.42
7 0.48
8 0.54
9 0.55
10 0.52
11 0.51
12 0.5
13 0.54
14 0.55
15 0.49
16 0.52
17 0.49
18 0.54
19 0.57
20 0.62
21 0.55
22 0.47
23 0.5
24 0.45
25 0.5
26 0.49
27 0.51
28 0.52
29 0.53
30 0.56
31 0.53
32 0.5
33 0.42
34 0.44
35 0.41
36 0.43
37 0.5
38 0.54
39 0.58
40 0.65
41 0.74
42 0.76
43 0.81
44 0.82
45 0.84
46 0.85
47 0.82
48 0.81
49 0.79
50 0.73
51 0.65
52 0.55
53 0.48
54 0.38
55 0.36
56 0.29
57 0.23
58 0.25
59 0.24
60 0.27
61 0.26
62 0.31
63 0.31
64 0.38
65 0.37
66 0.36
67 0.38
68 0.44
69 0.44
70 0.39
71 0.37
72 0.32
73 0.3
74 0.29
75 0.25
76 0.17
77 0.15
78 0.16
79 0.17
80 0.15
81 0.14
82 0.13
83 0.18
84 0.24
85 0.25
86 0.3
87 0.38
88 0.42
89 0.53
90 0.61
91 0.62
92 0.65
93 0.73
94 0.76
95 0.78
96 0.85
97 0.84
98 0.84
99 0.82
100 0.82
101 0.78
102 0.71
103 0.63
104 0.57
105 0.5
106 0.43
107 0.42
108 0.32
109 0.31
110 0.31
111 0.31
112 0.27
113 0.27
114 0.28
115 0.26
116 0.32
117 0.29
118 0.27
119 0.23
120 0.23
121 0.2
122 0.17
123 0.15
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.18
140 0.22
141 0.28
142 0.34
143 0.33
144 0.35
145 0.35
146 0.35
147 0.3
148 0.26
149 0.19
150 0.14
151 0.14
152 0.13
153 0.12
154 0.1
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.11
163 0.15
164 0.16
165 0.23
166 0.27
167 0.33
168 0.35
169 0.35
170 0.33
171 0.34
172 0.33
173 0.29
174 0.29
175 0.24
176 0.23
177 0.22
178 0.23
179 0.2
180 0.22
181 0.21
182 0.2
183 0.2
184 0.21
185 0.24
186 0.27
187 0.29
188 0.29
189 0.28
190 0.26
191 0.25
192 0.25
193 0.22
194 0.2
195 0.18
196 0.16
197 0.15
198 0.14
199 0.19
200 0.19
201 0.19
202 0.19
203 0.18
204 0.2
205 0.23
206 0.28
207 0.27
208 0.35
209 0.4
210 0.44
211 0.47
212 0.45
213 0.46
214 0.47
215 0.44
216 0.41
217 0.36
218 0.38
219 0.36
220 0.4
221 0.38
222 0.36
223 0.36
224 0.35
225 0.39
226 0.37
227 0.39
228 0.37
229 0.43
230 0.38
231 0.37
232 0.34
233 0.32
234 0.34
235 0.37
236 0.42
237 0.41
238 0.48
239 0.51
240 0.58
241 0.62
242 0.57
243 0.55
244 0.54
245 0.5
246 0.46
247 0.44
248 0.4
249 0.37
250 0.39
251 0.41
252 0.37
253 0.37
254 0.39
255 0.39
256 0.41
257 0.36
258 0.31
259 0.26
260 0.22
261 0.24
262 0.19
263 0.2
264 0.17
265 0.2
266 0.22
267 0.22
268 0.23
269 0.2
270 0.21
271 0.21
272 0.22
273 0.23
274 0.25
275 0.29
276 0.35
277 0.34
278 0.37
279 0.36
280 0.36
281 0.36
282 0.38
283 0.34
284 0.26
285 0.24
286 0.19
287 0.19
288 0.18
289 0.16
290 0.14
291 0.16
292 0.21
293 0.24
294 0.35
295 0.4
296 0.48
297 0.54
298 0.62
299 0.7
300 0.76
301 0.84
302 0.84
303 0.86
304 0.86
305 0.88
306 0.89
307 0.82
308 0.81
309 0.77
310 0.73
311 0.7
312 0.63
313 0.55
314 0.48
315 0.5
316 0.4
317 0.35
318 0.3
319 0.25
320 0.24
321 0.29
322 0.28
323 0.26
324 0.32
325 0.38
326 0.4
327 0.47
328 0.54
329 0.55
330 0.55
331 0.54
332 0.53
333 0.57
334 0.6
335 0.59
336 0.58
337 0.52
338 0.48
339 0.45
340 0.38
341 0.28
342 0.2
343 0.12
344 0.05
345 0.04
346 0.04
347 0.03
348 0.04
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.09
358 0.09
359 0.11
360 0.12
361 0.12
362 0.13
363 0.15
364 0.21
365 0.22
366 0.28
367 0.3
368 0.29
369 0.33
370 0.33
371 0.34
372 0.29
373 0.27
374 0.23
375 0.22
376 0.26
377 0.26
378 0.26
379 0.25
380 0.26
381 0.26
382 0.24
383 0.22
384 0.19
385 0.19
386 0.28
387 0.34