FuNGI

A0A1Y1WS28

Protein Details

Accession

A0A1Y1WS28

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
130-152	SEKEEIKKEEKKEEKKEEKSSDS	Acidic
330-354	ESEKEEKKEEKKEEKKEENKEEKKE	Acidic
821-854	TTNNKRKREDEPAPPKEKKKRTQNVPFKRIKDED	Basic
885-913	LIVTRGKGFRNEKNKKKRGSYRGGKIDLE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
336-349	KKEEKKEEKKEENK
825-842	KRKREDEPAPPKEKKKRT
889-906	RGKGFRNEKNKKKRGSYR

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MGKSKKEIEVEKKLKEMKEDSSSESSSSESSEEEINSKKRKSEFTDKEDESKSKKIKVDSDSDSDSDSDSDDSDSSDSSDSSDSDSSDSDSSDSSDSDSSDSDSSDSDSSDSDSSDSSDSDSSDSDSSESEKEEIKKEEKKEEKKEEKSSDSDSSSDSDSSDSDSSSDSDSSDSDSSSDSDSSDSDSSSDSDSSDSDSSSDSDSSDSDSSSDSDSSDSDSSSDSDSSDSDSSSDSDSSESEKEEEKKEESSDSNSDSESSDSDSSDSDSSDSDSSDSDSSESEKEEKKEEKKEEKKEESSDSNSDSESSDSDSSDSDSSDSDSSDSDSSESEKEEKKEEKKEEKKEENKEEKKEESSDSDSSDSDSSDSDSDSDSDSSSDSSDSSDSDSDSDSDSDSSDDEEDKMDVDKKEEEKKEESSDNSDSDSSDSSDSDSSDSSDSDSSDSSDSDSSDSSDSDSSDSSDSDSSDSSDSDSSDSSDSDSSDSSDSDSSDSSDSDSSSEEEKEDKMDVDKKEESSDSSDSSDSDTDSDSSDSDSDEEEKKEEKKEESSDSSDSDSSDSDSSDSDSSDSDSSDSDSSDSDSSDSDSSDSDSDSDSSESEKEEEKKEESTSDSSDSDSDSSESDSDSESSEEEEKKEESSESSDSDFSDSDSDSDSSSSDSDSSDSSSDSDSDSDSSEEEEKEEKKEESSDSSDSSDSDSDSSDSSSDSDSDSDSDSDSSEEEEKKEETKEESSSGSDSSEEEKSEEKNESSDSSDSDSSDSDSDSSDSSEEEEKNEEKKESSDSSDSDSDSDSSEEEKEEKKESSESSELNVSSSNEEETTNNKRKREDEPAPPKEKKKRTQNVPFKRIKDEDVVFLDERLKDNSFMAKGGAVGSYGEKAHRDLIVTRGKGFRNEKNKKKRGSYRGGKIDLESHSIKFNLD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.62
3	0.57
4	0.53
5	0.53
6	0.53
7	0.51
8	0.51
9	0.49
10	0.43
11	0.39
12	0.33
13	0.25
14	0.23
15	0.17
16	0.12
17	0.13
18	0.15
19	0.15
20	0.17
21	0.24
22	0.3
23	0.37
24	0.39
25	0.44
26	0.47
27	0.54
28	0.59
29	0.64
30	0.66
31	0.67
32	0.74
33	0.71
34	0.73
35	0.71
36	0.68
37	0.62
38	0.61
39	0.59
40	0.56
41	0.58
42	0.58
43	0.6
44	0.6
45	0.63
46	0.59
47	0.6
48	0.56
49	0.52
50	0.46
51	0.39
52	0.33
53	0.25
54	0.2
55	0.15
56	0.11
57	0.12
58	0.11
59	0.11
60	0.11
61	0.11
62	0.11
63	0.12
64	0.11
65	0.11
66	0.12
67	0.11
68	0.14
69	0.15
70	0.14
71	0.15
72	0.15
73	0.16
74	0.15
75	0.16
76	0.13
77	0.12
78	0.14
79	0.13
80	0.13
81	0.12
82	0.13
83	0.13
84	0.14
85	0.14
86	0.14
87	0.14
88	0.14
89	0.13
90	0.12
91	0.14
92	0.14
93	0.13
94	0.11
95	0.11
96	0.14
97	0.14
98	0.13
99	0.12
100	0.11
101	0.13
102	0.13
103	0.13
104	0.12
105	0.13
106	0.13
107	0.14
108	0.14
109	0.14
110	0.14
111	0.14
112	0.12
113	0.12
114	0.14
115	0.14
116	0.15
117	0.14
118	0.19
119	0.22
120	0.26
121	0.31
122	0.36
123	0.43
124	0.46
125	0.55
126	0.6
127	0.67
128	0.72
129	0.77
130	0.8
131	0.82
132	0.87
133	0.83
134	0.79
135	0.73
136	0.69
137	0.63
138	0.54
139	0.46
140	0.38
141	0.32
142	0.29
143	0.25
144	0.19
145	0.15
146	0.13
147	0.16
148	0.15
149	0.13
150	0.11
151	0.12
152	0.13
153	0.14
154	0.14
155	0.11
156	0.11
157	0.11
158	0.14
159	0.14
160	0.13
161	0.11
162	0.12
163	0.13
164	0.14
165	0.14
166	0.11
167	0.11
168	0.11
169	0.14
170	0.14
171	0.13
172	0.11
173	0.12
174	0.13
175	0.14
176	0.14
177	0.11
178	0.11
179	0.11
180	0.14
181	0.14
182	0.13
183	0.11
184	0.12
185	0.13
186	0.14
187	0.14
188	0.11
189	0.11
190	0.11
191	0.14
192	0.14
193	0.13
194	0.11
195	0.12
196	0.13
197	0.14
198	0.14
199	0.11
200	0.11
201	0.11
202	0.14
203	0.14
204	0.13
205	0.11
206	0.12
207	0.13
208	0.14
209	0.14
210	0.11
211	0.11
212	0.11
213	0.14
214	0.14
215	0.13
216	0.11
217	0.12
218	0.13
219	0.14
220	0.14
221	0.11
222	0.11
223	0.11
224	0.14
225	0.14
226	0.14
227	0.13
228	0.18
229	0.21
230	0.24
231	0.27
232	0.26
233	0.27
234	0.27
235	0.29
236	0.26
237	0.28
238	0.27
239	0.26
240	0.25
241	0.23
242	0.22
243	0.2
244	0.18
245	0.14
246	0.14
247	0.12
248	0.11
249	0.12
250	0.11
251	0.13
252	0.13
253	0.12
254	0.1
255	0.1
256	0.12
257	0.12
258	0.13
259	0.11
260	0.11
261	0.14
262	0.13
263	0.13
264	0.11
265	0.11
266	0.13
267	0.14
268	0.15
269	0.17
270	0.2
271	0.21
272	0.27
273	0.33
274	0.38
275	0.45
276	0.53
277	0.6
278	0.65
279	0.73
280	0.77
281	0.78
282	0.76
283	0.71
284	0.68
285	0.62
286	0.58
287	0.5
288	0.43
289	0.36
290	0.31
291	0.28
292	0.23
293	0.18
294	0.14
295	0.14
296	0.12
297	0.11
298	0.12
299	0.11
300	0.13
301	0.13
302	0.12
303	0.1
304	0.1
305	0.12
306	0.12
307	0.13
308	0.11
309	0.11
310	0.14
311	0.13
312	0.13
313	0.11
314	0.11
315	0.13
316	0.14
317	0.15
318	0.17
319	0.2
320	0.21
321	0.27
322	0.33
323	0.38
324	0.45
325	0.53
326	0.6
327	0.65
328	0.73
329	0.77
330	0.8
331	0.82
332	0.83
333	0.84
334	0.84
335	0.82
336	0.78
337	0.73
338	0.66
339	0.6
340	0.53
341	0.45
342	0.38
343	0.36
344	0.31
345	0.28
346	0.26
347	0.22
348	0.22
349	0.2
350	0.16
351	0.12
352	0.12
353	0.11
354	0.1
355	0.1
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.07
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.09
376	0.08
377	0.09
378	0.09
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.08
392	0.11
393	0.1
394	0.12
395	0.15
396	0.18
397	0.26
398	0.28
399	0.31
400	0.31
401	0.33
402	0.36
403	0.35
404	0.33
405	0.29
406	0.29
407	0.25
408	0.24
409	0.21
410	0.17
411	0.15
412	0.15
413	0.11
414	0.09
415	0.09
416	0.1
417	0.11
418	0.11
419	0.11
420	0.11
421	0.12
422	0.13
423	0.13
424	0.13
425	0.13
426	0.13
427	0.13
428	0.13
429	0.13
430	0.13
431	0.13
432	0.13
433	0.13
434	0.13
435	0.13
436	0.13
437	0.13
438	0.13
439	0.13
440	0.13
441	0.13
442	0.13
443	0.13
444	0.13
445	0.13
446	0.13
447	0.13
448	0.13
449	0.13
450	0.13
451	0.13
452	0.13
453	0.13
454	0.13
455	0.13
456	0.13
457	0.13
458	0.13
459	0.13
460	0.13
461	0.13
462	0.13
463	0.13
464	0.13
465	0.13
466	0.13
467	0.13
468	0.13
469	0.13
470	0.13
471	0.13
472	0.13
473	0.13
474	0.13
475	0.13
476	0.13
477	0.13
478	0.13
479	0.13
480	0.13
481	0.12
482	0.11
483	0.11
484	0.11
485	0.1
486	0.1
487	0.1
488	0.09
489	0.09
490	0.09
491	0.1
492	0.1
493	0.09
494	0.11
495	0.16
496	0.17
497	0.21
498	0.22
499	0.22
500	0.23
501	0.23
502	0.21
503	0.2
504	0.2
505	0.17
506	0.16
507	0.16
508	0.14
509	0.16
510	0.14
511	0.1
512	0.09
513	0.09
514	0.08
515	0.09
516	0.09
517	0.07
518	0.08
519	0.08
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.09
524	0.11
525	0.11
526	0.12
527	0.14
528	0.16
529	0.2
530	0.22
531	0.22
532	0.26
533	0.29
534	0.33
535	0.34
536	0.36
537	0.33
538	0.31
539	0.31
540	0.26
541	0.22
542	0.18
543	0.15
544	0.14
545	0.13
546	0.13
547	0.11
548	0.12
549	0.14
550	0.14
551	0.13
552	0.11
553	0.11
554	0.14
555	0.14
556	0.13
557	0.11
558	0.11
559	0.14
560	0.14
561	0.13
562	0.11
563	0.11
564	0.14
565	0.14
566	0.13
567	0.11
568	0.11
569	0.14
570	0.14
571	0.13
572	0.11
573	0.11
574	0.12
575	0.12
576	0.11
577	0.09
578	0.09
579	0.09
580	0.09
581	0.09
582	0.08
583	0.09
584	0.09
585	0.1
586	0.11
587	0.15
588	0.18
589	0.21
590	0.24
591	0.25
592	0.27
593	0.26
594	0.26
595	0.25
596	0.24
597	0.22
598	0.21
599	0.2
600	0.19
601	0.18
602	0.17
603	0.14
604	0.12
605	0.11
606	0.08
607	0.09
608	0.09
609	0.08
610	0.08
611	0.09
612	0.08
613	0.09
614	0.09
615	0.08
616	0.09
617	0.13
618	0.13
619	0.13
620	0.15
621	0.14
622	0.15
623	0.16
624	0.14
625	0.12
626	0.15
627	0.16
628	0.16
629	0.17
630	0.17
631	0.16
632	0.17
633	0.15
634	0.12
635	0.12
636	0.1
637	0.09
638	0.11
639	0.11
640	0.1
641	0.1
642	0.1
643	0.09
644	0.09
645	0.09
646	0.07
647	0.07
648	0.08
649	0.08
650	0.1
651	0.09
652	0.09
653	0.1
654	0.1
655	0.1
656	0.1
657	0.1
658	0.09
659	0.1
660	0.1
661	0.1
662	0.09
663	0.11
664	0.12
665	0.11
666	0.12
667	0.15
668	0.16
669	0.18
670	0.21
671	0.19
672	0.19
673	0.21
674	0.22
675	0.22
676	0.24
677	0.24
678	0.22
679	0.23
680	0.21
681	0.19
682	0.18
683	0.14
684	0.12
685	0.1
686	0.1
687	0.09
688	0.1
689	0.1
690	0.09
691	0.09
692	0.09
693	0.09
694	0.09
695	0.09
696	0.09
697	0.09
698	0.1
699	0.1
700	0.1
701	0.09
702	0.09
703	0.09
704	0.09
705	0.08
706	0.09
707	0.12
708	0.13
709	0.14
710	0.16
711	0.17
712	0.19
713	0.21
714	0.21
715	0.21
716	0.23
717	0.24
718	0.24
719	0.24
720	0.24
721	0.23
722	0.21
723	0.18
724	0.14
725	0.13
726	0.15
727	0.15
728	0.14
729	0.14
730	0.16
731	0.17
732	0.19
733	0.21
734	0.19
735	0.19
736	0.2
737	0.21
738	0.22
739	0.22
740	0.2
741	0.21
742	0.21
743	0.2
744	0.19
745	0.18
746	0.16
747	0.15
748	0.14
749	0.1
750	0.1
751	0.1
752	0.1
753	0.1
754	0.09
755	0.09
756	0.11
757	0.15
758	0.15
759	0.15
760	0.19
761	0.21
762	0.24
763	0.27
764	0.26
765	0.23
766	0.24
767	0.29
768	0.28
769	0.31
770	0.31
771	0.29
772	0.34
773	0.35
774	0.33
775	0.28
776	0.25
777	0.2
778	0.17
779	0.16
780	0.11
781	0.1
782	0.11
783	0.12
784	0.14
785	0.18
786	0.2
787	0.23
788	0.24
789	0.24
790	0.27
791	0.28
792	0.32
793	0.33
794	0.31
795	0.3
796	0.33
797	0.31
798	0.27
799	0.27
800	0.21
801	0.19
802	0.19
803	0.18
804	0.14
805	0.15
806	0.15
807	0.19
808	0.28
809	0.36
810	0.41
811	0.43
812	0.47
813	0.51
814	0.57
815	0.62
816	0.61
817	0.62
818	0.68
819	0.74
820	0.78
821	0.82
822	0.83
823	0.83
824	0.85
825	0.84
826	0.84
827	0.84
828	0.86
829	0.9
830	0.92
831	0.92
832	0.93
833	0.92
834	0.85
835	0.83
836	0.76
837	0.68
838	0.66
839	0.57
840	0.52
841	0.47
842	0.48
843	0.39
844	0.37
845	0.36
846	0.3
847	0.3
848	0.27
849	0.25
850	0.21
851	0.23
852	0.28
853	0.25
854	0.24
855	0.23
856	0.19
857	0.18
858	0.18
859	0.16
860	0.1
861	0.1
862	0.1
863	0.12
864	0.12
865	0.14
866	0.14
867	0.16
868	0.18
869	0.19
870	0.2
871	0.2
872	0.28
873	0.35
874	0.35
875	0.38
876	0.41
877	0.42
878	0.49
879	0.54
880	0.55
881	0.57
882	0.67
883	0.73
884	0.78
885	0.85
886	0.86
887	0.89
888	0.9
889	0.9
890	0.9
891	0.9
892	0.89
893	0.9
894	0.86
895	0.77
896	0.69
897	0.64
898	0.56
899	0.51
900	0.43
901	0.34
902	0.32

A0A1Y1WS28

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer