Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VRC3

Protein Details
Accession A0A1Y1VRC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-288NNNYKNTKFNKFNNNNNKYKNKNNYNKNNHDNNNKIHydrophilic
298-326GHTIYTCRFKNYKKNNKNFKQNNGRQENKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5cyto_nucl 12.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MSNKEGNGTKDLLDGFNFKTWKQQLYLLLKEEDLTQFIYDKKLKKISKDNIAEDDLKKHIPVDGINNLFYEKSVTKDMVKKDAKTKKILMNSIKNDLAVNIDFISSTAYEIYNLIKGINLSDDNDRIEEIKNYLNSMRFNENQDIPLSIFISNMNMKFNELEQLKSPLKDSEKFDYLYNSIPEELAIKTNIIDHQENWEETTNYLIKTHQQLKRLKEKKLKQLDVESNSVNVSSNKKYSNYNSNYNNNYNNYNNNYKNTKFNKFNNNNNKYKNKNNYNKNNHDNNNKIIKCKNCGKLGHTIYTCRFKNYKKNNKNFKQNNGRQENK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.21
3 0.26
4 0.26
5 0.23
6 0.31
7 0.33
8 0.36
9 0.35
10 0.37
11 0.41
12 0.48
13 0.53
14 0.47
15 0.45
16 0.41
17 0.39
18 0.36
19 0.28
20 0.21
21 0.17
22 0.14
23 0.14
24 0.16
25 0.22
26 0.25
27 0.29
28 0.35
29 0.43
30 0.47
31 0.53
32 0.63
33 0.65
34 0.7
35 0.72
36 0.7
37 0.65
38 0.66
39 0.62
40 0.53
41 0.47
42 0.4
43 0.33
44 0.28
45 0.23
46 0.21
47 0.18
48 0.19
49 0.21
50 0.26
51 0.27
52 0.28
53 0.28
54 0.26
55 0.24
56 0.22
57 0.2
58 0.13
59 0.14
60 0.16
61 0.17
62 0.22
63 0.28
64 0.31
65 0.37
66 0.41
67 0.42
68 0.49
69 0.56
70 0.56
71 0.57
72 0.6
73 0.57
74 0.59
75 0.63
76 0.62
77 0.63
78 0.62
79 0.61
80 0.55
81 0.48
82 0.4
83 0.33
84 0.27
85 0.18
86 0.15
87 0.1
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.06
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.11
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.12
113 0.11
114 0.12
115 0.11
116 0.11
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.16
121 0.17
122 0.17
123 0.2
124 0.23
125 0.22
126 0.25
127 0.27
128 0.26
129 0.24
130 0.23
131 0.21
132 0.16
133 0.15
134 0.12
135 0.09
136 0.08
137 0.07
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.19
151 0.2
152 0.19
153 0.2
154 0.18
155 0.21
156 0.24
157 0.27
158 0.26
159 0.28
160 0.28
161 0.28
162 0.26
163 0.24
164 0.23
165 0.19
166 0.15
167 0.13
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.09
177 0.1
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.16
182 0.18
183 0.18
184 0.19
185 0.19
186 0.16
187 0.16
188 0.19
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.13
193 0.14
194 0.2
195 0.29
196 0.29
197 0.36
198 0.42
199 0.48
200 0.59
201 0.62
202 0.64
203 0.65
204 0.7
205 0.73
206 0.77
207 0.75
208 0.69
209 0.71
210 0.71
211 0.65
212 0.6
213 0.5
214 0.39
215 0.35
216 0.3
217 0.22
218 0.16
219 0.17
220 0.17
221 0.2
222 0.22
223 0.24
224 0.28
225 0.33
226 0.41
227 0.42
228 0.48
229 0.51
230 0.56
231 0.6
232 0.6
233 0.6
234 0.52
235 0.51
236 0.45
237 0.44
238 0.42
239 0.45
240 0.44
241 0.44
242 0.48
243 0.45
244 0.53
245 0.54
246 0.57
247 0.56
248 0.61
249 0.67
250 0.69
251 0.77
252 0.79
253 0.81
254 0.8
255 0.8
256 0.82
257 0.77
258 0.79
259 0.79
260 0.79
261 0.8
262 0.83
263 0.85
264 0.87
265 0.9
266 0.89
267 0.88
268 0.85
269 0.85
270 0.79
271 0.76
272 0.76
273 0.68
274 0.64
275 0.61
276 0.59
277 0.57
278 0.61
279 0.61
280 0.58
281 0.6
282 0.59
283 0.63
284 0.62
285 0.63
286 0.56
287 0.55
288 0.54
289 0.59
290 0.56
291 0.53
292 0.54
293 0.53
294 0.61
295 0.66
296 0.71
297 0.73
298 0.83
299 0.87
300 0.9
301 0.94
302 0.92
303 0.92
304 0.92
305 0.9
306 0.9