Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1UXD2

Protein Details
Accession A0A1Y1UXD2    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-221FVGKGNEKSHRVKKQKEKTYVYEIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-108KRGGFAGKSSRPARSSEGSSNRRRGGRGEYKGRGREFDRHSGSARRDSQKK
230-234GRGGR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MTDVRSKNPFDLLGEEEEATQTTTKLTRNEKKVIKNNTYVDNSRATPGENRLRNDYPKRGGFAGKSSRPARSSEGSSNRRRGGRGEYKGRGREFDRHSGSARRDSQKKDVAGKGSWGKPTENLEEVVEVEQENNANGEEEVKETKPEEKLMTLNDYLASQAKKAIVNENTIRTANEGVDESKWGETVELSKDEEAYFVGKGNEKSHRVKKQKEKTYVYEIEQRFNDGRRGRGGRQNRGSNSKRPTSKVNVDDTNDFPSLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.22
4 0.21
5 0.19
6 0.17
7 0.14
8 0.1
9 0.1
10 0.13
11 0.17
12 0.23
13 0.33
14 0.41
15 0.48
16 0.58
17 0.63
18 0.71
19 0.76
20 0.79
21 0.76
22 0.75
23 0.72
24 0.7
25 0.69
26 0.61
27 0.54
28 0.48
29 0.42
30 0.36
31 0.33
32 0.27
33 0.24
34 0.3
35 0.37
36 0.38
37 0.4
38 0.45
39 0.5
40 0.56
41 0.6
42 0.6
43 0.58
44 0.55
45 0.55
46 0.5
47 0.48
48 0.42
49 0.43
50 0.44
51 0.4
52 0.45
53 0.44
54 0.46
55 0.44
56 0.45
57 0.42
58 0.37
59 0.38
60 0.39
61 0.47
62 0.51
63 0.56
64 0.6
65 0.6
66 0.58
67 0.54
68 0.48
69 0.48
70 0.5
71 0.51
72 0.53
73 0.55
74 0.6
75 0.65
76 0.63
77 0.56
78 0.49
79 0.5
80 0.46
81 0.48
82 0.46
83 0.42
84 0.44
85 0.46
86 0.46
87 0.45
88 0.47
89 0.45
90 0.46
91 0.48
92 0.53
93 0.53
94 0.54
95 0.52
96 0.48
97 0.45
98 0.39
99 0.39
100 0.37
101 0.34
102 0.33
103 0.29
104 0.26
105 0.25
106 0.28
107 0.26
108 0.22
109 0.2
110 0.17
111 0.16
112 0.16
113 0.13
114 0.1
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.13
132 0.13
133 0.15
134 0.14
135 0.14
136 0.15
137 0.16
138 0.19
139 0.16
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.13
145 0.12
146 0.09
147 0.1
148 0.12
149 0.13
150 0.14
151 0.21
152 0.2
153 0.25
154 0.28
155 0.29
156 0.29
157 0.28
158 0.27
159 0.21
160 0.21
161 0.15
162 0.13
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.1
174 0.12
175 0.12
176 0.14
177 0.13
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.12
182 0.1
183 0.08
184 0.09
185 0.11
186 0.14
187 0.16
188 0.2
189 0.27
190 0.31
191 0.39
192 0.47
193 0.56
194 0.62
195 0.7
196 0.77
197 0.8
198 0.85
199 0.87
200 0.84
201 0.8
202 0.81
203 0.75
204 0.69
205 0.67
206 0.59
207 0.54
208 0.48
209 0.46
210 0.39
211 0.36
212 0.4
213 0.34
214 0.36
215 0.39
216 0.45
217 0.47
218 0.54
219 0.61
220 0.64
221 0.7
222 0.75
223 0.73
224 0.77
225 0.77
226 0.76
227 0.74
228 0.73
229 0.7
230 0.65
231 0.66
232 0.66
233 0.7
234 0.68
235 0.68
236 0.65
237 0.63
238 0.63
239 0.58
240 0.54